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丙型肝炎病毒核心蛋白反式激活基因HCTP4的克隆化研究 被引量:10
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作者 刘敏 成军 +1 位作者 王琳 张树林 《胃肠病学和肝病学杂志》 CAS 2003年第3期233-236,共4页
目的 探索丙型肝炎病毒 (HCV)核心 (core)蛋白反式激活作用的新的靶基因 ,以有助于阐明HCV感染相关疾病的发病机制。方法 应用表达谱芯片分析等分子生物学技术 ,结合生物信息学 (bioinformatics)技术 ,筛选、克隆HCV核心蛋白反式激活... 目的 探索丙型肝炎病毒 (HCV)核心 (core)蛋白反式激活作用的新的靶基因 ,以有助于阐明HCV感染相关疾病的发病机制。方法 应用表达谱芯片分析等分子生物学技术 ,结合生物信息学 (bioinformatics)技术 ,筛选、克隆HCV核心蛋白反式激活作用的新的靶基因。结果 构建了真核表达载体pcDNA3 core ,经过限制性内切酶作图分析和核苷酸序列分析证实正确无误。以pcDNA3 core转染HepG2后提取总RNA ,逆转录后进行表达谱基因芯片技术分析。应用分子克隆技术结合生物信息学技术克隆核心蛋白反式激活的新型靶基因 ,命名为HCTP4,新基因的编码基因序列全长为 2 2 44个核苷酸 (nt) ,编码产物由 748个氨基酸残基(aa)组成。结论 HCV核心蛋白是具有反式激活作用的蛋白。DNA微矩阵技术 (DNAmicroarray)是分析基因表达谱变化的有效和高通量技术。发现了HCV核心蛋白反式激活作用的新的靶基因 。 展开更多
关键词 丙型肝炎病毒 核心蛋白 反式激活 HCTP4 基因克隆化 dna矩阵
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HIV基因芯片的初步研究 被引量:4
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作者 李凌 马文丽 +2 位作者 毛向明 祝骥 郑文岭 《第一军医大学学报》 CSCD 北大核心 2002年第8期724-727,共4页
目的建立HIV基因检测芯片的分析技术。方法分离HIV1U26942基因限制性显示片段作探针,应用PixSys 5500点样仪将探针打印在氨基包被的玻片上制作基因芯片。然后与随机引物荧光标记的HIV样品进行杂交,以分析限制性显示基因片段的杂交动力... 目的建立HIV基因检测芯片的分析技术。方法分离HIV1U26942基因限制性显示片段作探针,应用PixSys 5500点样仪将探针打印在氨基包被的玻片上制作基因芯片。然后与随机引物荧光标记的HIV样品进行杂交,以分析限制性显示基因片段的杂交动力学。经杂交后清洗和干燥,扫描芯片进行检测。结果对基因检测芯片的制作与检测的实验条件进行了初步研究并筛选了12个限制性显示基因探针。结论建立的检测芯片的实验方法可行且较特异。 展开更多
关键词 基因芯片 dna矩阵 HIV感染 限制性显示
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基因芯片及其应用 被引量:1
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作者 张鸿鸣 《金华职业技术学院学报》 2002年第1期18-21,88,共5页
基因芯片又称DNA微矩阵,是一种分析大量复杂生物样品的有效工具。它可以通过光引导聚合技术、电压打印或人工直接点样制备。光蚀刻技术可以使探针密度达到106/cm2。它们可以被广泛地应用于DNA序列测定、新基因的检测和突变基因的分析。... 基因芯片又称DNA微矩阵,是一种分析大量复杂生物样品的有效工具。它可以通过光引导聚合技术、电压打印或人工直接点样制备。光蚀刻技术可以使探针密度达到106/cm2。它们可以被广泛地应用于DNA序列测定、新基因的检测和突变基因的分析。在医学上,基因芯片可以被用于癌症的诊断,传染病疾病如AIDS和肝炎等的早期检测。它在新药开发上也有巨大的市场。 展开更多
关键词 基因芯片 dna矩阵 生物样品 光蚀刻技术 探针 密度 基因 疾病
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玻璃介质寡核苷酸DNA Microarrays的研制
4
作者 汪进 王世平 +3 位作者 周高波 张震 周鲁卫 毛裕民 《复旦学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 1999年第5期597-600,共4页
建立了一种快速、简便的寡核苷酸链固定在普通玻璃介质上的DNA 微矩阵并通过荧光检测的方法.首先将2种不同的寡核苷酸链固定在普通玻璃介质上,使寡核苷酸共价结合在经过处理的普通玻璃片表面形成点直径大约3 m m 的DNA 微... 建立了一种快速、简便的寡核苷酸链固定在普通玻璃介质上的DNA 微矩阵并通过荧光检测的方法.首先将2种不同的寡核苷酸链固定在普通玻璃介质上,使寡核苷酸共价结合在经过处理的普通玻璃片表面形成点直径大约3 m m 的DNA 微矩阵,然后先后分别与其对应互补的红黄不同颜色的荧光寡核苷酸链进行杂交实验.通过不同的波长激发,荧光显微镜下呈现红黄二色的点形成的矩阵.在固定的探针浓度为2 m m ol/L时,用10pm ol/μL荧光标记Oligo 进行杂交,出现阳性结果为100% ;固定的寡核苷酸浓度下限至15.6 μm ol/L,通过ScannerArray 展开更多
关键词 dna矩阵 寡核苷酸固定 荧光检测
原文传递
单核苷酸多态性DNA微矩阵分析有利于评估激素治疗的利弊
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作者 Tempfer C.B. Riener E.-K. +1 位作者 Hefler L.A. 闫坤 《世界核心医学期刊文摘(妇产科学分册)》 2005年第1期30-31,共2页
Objective To determine what percentage of women can be given individu alized co unseling based on genetic information, as single nucleotide polymorphisms (SNPs) are associated with risks and benefits of estrogen thera... Objective To determine what percentage of women can be given individu alized co unseling based on genetic information, as single nucleotide polymorphisms (SNPs) are associated with risks and benefits of estrogen therapy and hormone therapy such as thrombosis, myocardial infarction, breast cancer, and bone protection. D esign Cross-sectional study. Setting Academic research institution. Patient(s) A consecutive series of 2,507 perimenopausal and postmenopausal women. Intervent ion(s) Peripheral venous puncture and multiplex polymerase chain reaction on a m icroarray system. Main outcome measure(s) Analysis of 22 SNPs of 17 genes: AGTMe t235Thr, APOECys112Arg, APOEArg158-Cys, COMTVal158Met, CYP17-34T >C, CYP191558 C >T, CYP19Arg264Cys, CYP1A16235T >C, CYP1A1Ile462Val, CYP1B1Leu432Val, CYP1B1A -sn453Ser, HSD17B1-27A >C, ER-αIVS-401T >C, prothrombin20210G >A, factor V Leiden, eNOS-786T >C, eNOSGlu298Asp, MRSer810L eu, MTHFR677C >T, PAI 15G >4G, SRD5A2Val89Leu, and VDRb >B. Result(s) Among the women in the study, 66%had at least two homozygous mutant SNPs of interest. A t hrombophilic disposition was found in 9.9%of women, and 23%of women had at lea st two SNPs associated with an increased risk of breast cancer (COMT, CYP17, CYP 19, CYP1A1, and CYP1B1). The SNPs predisposing women to cardiovascular pathologi es (e.g., APOE, AGT, eNOS, and PAI 1) were found in 12.3%of women. Carriage of SNPs predisposing to early postmenopausal bone loss and osteoporosis (ER-αand VDR) were found in 26.7%of women. Conclusion( s) These data suggest that the as sessment of SNPs associated with risks and benefits of estrogen/hormone therapy may be a new means to individualize counseling about and prescription of estroge n/hormone therapy in up to 66%of women. 展开更多
关键词 激素替代治疗 dna矩阵 单核苷酸多态性 矩阵分析 围绝经期 患病风险 PROTHROMBIN 外周静脉穿刺 骨质疏松 突变纯合子
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DNA微矩阵芯片检测沙利度胺对HepG2细胞基因表达谱的影响 被引量:1
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作者 陈小朋 袁守军 +3 位作者 丁林茂 傅学琦 徐兰平 田增月 《中国药理学与毒理学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2003年第1期44-50,共7页
目的 从整个细胞基因组表达变化的角度 ,研究沙利度胺 (Tha)对基因表达谱的影响 ,揭示发育毒性药物的致畸机制。方法 用载有 8192条基因的DNA微矩阵芯片 ,检测在 11.6μmol·L- 1的Tha作用4 2h后 ,HepG2细胞基因表达谱的变化。结... 目的 从整个细胞基因组表达变化的角度 ,研究沙利度胺 (Tha)对基因表达谱的影响 ,揭示发育毒性药物的致畸机制。方法 用载有 8192条基因的DNA微矩阵芯片 ,检测在 11.6μmol·L- 1的Tha作用4 2h后 ,HepG2细胞基因表达谱的变化。结果有 19条基因的表达有明显变化 ,其中 17条基因表达下调 ,2条基因表达上调。下调基因中有多条为转录调控和胚胎发育相关基因 ,上调的基因中有DNA修复相关基因和线粒体功能相关的基因。结论 Tha能影响若干基因转录和胚胎发育基因的表达 ,可能与其发育毒性机制相关 。 展开更多
关键词 沙利度胺 dna矩阵芯片 细胞系 HEPG2 发育毒性
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