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用于DNA合成测序的可断裂连接单元研究现状
1
作者
姜玉
谭连江
+3 位作者
殷燕
沈玉梅
龚兵
邵志峰
《化学进展》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2016年第1期58-66,共9页
DNA测序技术是遗传基因组相关疾病研究的基础。合成测序是DNA二代测序技术中非常重要的一种。合成测序技术能够有效地实现大规模平行测序,大大提高测序通量的同时也降低成本,目前已得到广泛的应用。在合成测序中,首先需要合成荧光素标...
DNA测序技术是遗传基因组相关疾病研究的基础。合成测序是DNA二代测序技术中非常重要的一种。合成测序技术能够有效地实现大规模平行测序,大大提高测序通量的同时也降低成本,目前已得到广泛的应用。在合成测序中,首先需要合成荧光素标记的核苷酸,作为能够参与DNA链延伸的循环可逆终端。已有文献报道的可逆终端结构主要包括单位点修饰(MRT)和双位点修饰(DRT)两种类型。DRT类型可逆终端的最大优势是DNA聚合酶容易识别且合成路线简单,能够较好地应用于DNA合成测序。在此过程中可断裂连接单元将核苷酸和荧光素连接起来,它的性质直接决定了测序的效率、读长等关键指标。本文主要对目前用于DNA合成测序的可断裂连接单元研究现状进行介绍,并对其发展前景进行了展望。
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关键词
dna
合成
测序
循环可逆终端
可断裂连接单元
原文传递
四色荧光标记二硫键可逆终端的合成及在DNA合成测序中的应用
2
作者
汤道年
江敏
+6 位作者
李小卫
康亚妮
伍新燕
龚兵
邵志峰
赵小东
沈玉梅
《高等学校化学学报》
SCIE
EI
CAS
CSCD
北大核心
2014年第11期2346-2352,共7页
分别以5-碘-2'-脱氧尿苷、5-碘-2'-脱氧胞苷、7-去氮-7-碘-2'-脱氧腺苷及7-去氮-7-碘-2'-脱氧鸟苷为原料,以二硫键为可裂解连接单元,通过多步反应合成了四色荧光标记不同碱基的脱氧核糖核苷酸;研究了该类荧光标记核苷...
分别以5-碘-2'-脱氧尿苷、5-碘-2'-脱氧胞苷、7-去氮-7-碘-2'-脱氧腺苷及7-去氮-7-碘-2'-脱氧鸟苷为原料,以二硫键为可裂解连接单元,通过多步反应合成了四色荧光标记不同碱基的脱氧核糖核苷酸;研究了该类荧光标记核苷酸作为可逆终端在DNA合成测序中的应用.所得产物结构经1H NMR,31P NMR及HRMS表征,并对其进行了DNA高通量测序的测试.结果表明,该类荧光标记核苷酸作为DNA合成测序的可逆终端能够满足高通量测序的生化反应要求,具有较好的应用前景.
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关键词
dna
合成
测序
可逆终端
可裂解连接单元
四色荧光标记
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职称材料
题名
用于DNA合成测序的可断裂连接单元研究现状
1
作者
姜玉
谭连江
殷燕
沈玉梅
龚兵
邵志峰
机构
上海应用技术学院化学与环境工程学院
上海交通大学系统生物医学研究院
上海交通大学生物医学工程学院Bio-ID中心
布法罗纽约州立大学化学系
出处
《化学进展》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2016年第1期58-66,共9页
基金
国家自然科学基金项目(No.11374207,31370750,81071250,91227109)资助~~
文摘
DNA测序技术是遗传基因组相关疾病研究的基础。合成测序是DNA二代测序技术中非常重要的一种。合成测序技术能够有效地实现大规模平行测序,大大提高测序通量的同时也降低成本,目前已得到广泛的应用。在合成测序中,首先需要合成荧光素标记的核苷酸,作为能够参与DNA链延伸的循环可逆终端。已有文献报道的可逆终端结构主要包括单位点修饰(MRT)和双位点修饰(DRT)两种类型。DRT类型可逆终端的最大优势是DNA聚合酶容易识别且合成路线简单,能够较好地应用于DNA合成测序。在此过程中可断裂连接单元将核苷酸和荧光素连接起来,它的性质直接决定了测序的效率、读长等关键指标。本文主要对目前用于DNA合成测序的可断裂连接单元研究现状进行介绍,并对其发展前景进行了展望。
关键词
dna
合成
测序
循环可逆终端
可断裂连接单元
Keywords
dna
sequencing by synthesis
cyclic reversible terminator
cleavable linkers
分类号
O629.7 [理学—有机化学]
Q523 [理学—化学]
原文传递
题名
四色荧光标记二硫键可逆终端的合成及在DNA合成测序中的应用
2
作者
汤道年
江敏
李小卫
康亚妮
伍新燕
龚兵
邵志峰
赵小东
沈玉梅
机构
上海交通大学系统生物医学研究院
华东理工大学化学与分子工程学院
上海交通大学生物医学工程学院
北京师范大学化学学院
布法罗纽约州立大学化学系
出处
《高等学校化学学报》
SCIE
EI
CAS
CSCD
北大核心
2014年第11期2346-2352,共7页
基金
国家自然科学基金(批准号:81071250
91227109)
科技重大专项'重大新药创制'项目(批准号:2011ZX09501-00105)资助~~
文摘
分别以5-碘-2'-脱氧尿苷、5-碘-2'-脱氧胞苷、7-去氮-7-碘-2'-脱氧腺苷及7-去氮-7-碘-2'-脱氧鸟苷为原料,以二硫键为可裂解连接单元,通过多步反应合成了四色荧光标记不同碱基的脱氧核糖核苷酸;研究了该类荧光标记核苷酸作为可逆终端在DNA合成测序中的应用.所得产物结构经1H NMR,31P NMR及HRMS表征,并对其进行了DNA高通量测序的测试.结果表明,该类荧光标记核苷酸作为DNA合成测序的可逆终端能够满足高通量测序的生化反应要求,具有较好的应用前景.
关键词
dna
合成
测序
可逆终端
可裂解连接单元
四色荧光标记
Keywords
dna
sequencing by synthesis
Reversible terminator
Cleavable linker
Four fluorescence labelled nucleotide
分类号
O629.11 [理学—有机化学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
用于DNA合成测序的可断裂连接单元研究现状
姜玉
谭连江
殷燕
沈玉梅
龚兵
邵志峰
《化学进展》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2016
0
原文传递
2
四色荧光标记二硫键可逆终端的合成及在DNA合成测序中的应用
汤道年
江敏
李小卫
康亚妮
伍新燕
龚兵
邵志峰
赵小东
沈玉梅
《高等学校化学学报》
SCIE
EI
CAS
CSCD
北大核心
2014
0
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职称材料
已选择
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