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DNA芯片技术研究进展 被引量：61
1
作者 李凌 马文丽 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 2000年第2期151-155,共5页
DNA芯片技术是近年来发展迅速的生物高技术 .其基本过程是采用寡核苷酸原位合成或显微打印手段 ,将大量探针片段有序地固化于支持物如硅芯片的表面 ,然后与扩增、标记的生物样品杂交 ,通过对杂交信号的检测分析 ,即可得出样品的遗传信... DNA芯片技术是近年来发展迅速的生物高技术 .其基本过程是采用寡核苷酸原位合成或显微打印手段 ,将大量探针片段有序地固化于支持物如硅芯片的表面 ,然后与扩增、标记的生物样品杂交 ,通过对杂交信号的检测分析 ,即可得出样品的遗传信息 .该技术不仅可以对遗传信息进行定性、定量分析 ,而且扩展到基因组研究和基因诊断等方面的应用 .尽管目前在硬件和软件上还面临一些困难 ,但其发展和应用的前景广阔 . 展开更多
关键词 dna芯片 基因诊断 基因组研究 技术原理 制备
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人参皂苷Rg_3对肿瘤血管生长调控因子蛋白表达抑制作用的研究 被引量：67
2
作者 陈明伟 倪磊 +1 位作者 赵小革 牛小英 《中国中药杂志》 CAS CSCD 北大核心 2005年第5期357-360,共4页
目的探讨中药单体人参皂苷20(R)Rg3对肿瘤血管生长调控因子(VEGF,bFGF,MMP2)蛋白表达的抑制作用。方法进行人肺腺癌细胞株A549、人脐静脉血管内皮细胞HUVEC304细胞株培养、10-6mol·L-1浓度Rg3药物干预72h,采用免疫组化、基因芯片技... 目的探讨中药单体人参皂苷20(R)Rg3对肿瘤血管生长调控因子(VEGF,bFGF,MMP2)蛋白表达的抑制作用。方法进行人肺腺癌细胞株A549、人脐静脉血管内皮细胞HUVEC304细胞株培养、10-6mol·L-1浓度Rg3药物干预72h,采用免疫组化、基因芯片技术,检测上述因子蛋白表达阳性率和灰度变化以及A549细胞基因的差异表达情况。结果Rg3干预后,A549细胞VEGF蛋白阳性表达率显著降低(P=0.03),VEGF,Flt,KDT以及MMP2蛋白阳性表达的强度较对照组均有显著下降(P<0.05),内皮细胞VEGF,Flt和KDT蛋白阳性表达的灰度较对照组均有显著下降(P<0.05)。基因芯片差异性表达显示其中14个基因下调,10个基因上调。结论Rg3可显著抑制肿瘤细胞和血管内皮细胞的血管生长调控因子蛋白表达,通过不同靶点作用于肿瘤细胞影响肿瘤新生血管的生成。 展开更多
关键词 人参皂苷RG3 蛋白表达 肿瘤血管 VEGF 阳性表达 对照组 抑制作用 生长调控 浓度 因子
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基因芯片技术在非综合征性耳聋快速基因诊断中的应用研究 被引量：78
3
作者 王国建 戴朴 +5 位作者 韩东一 李彩霞 张地 韩冰 康东洋 张昕 《中华耳科学杂志》 CSCD 2008年第1期61-66,共6页
目的应用耳聋基因芯片对非综合征性感音神经性耳聋患者进行分子病因学研究,评估其在快速耳聋基因诊断中的可行性。方法采集158名来自北京第三聋哑学校的非综合征性耳聋学生的外周血,提取基因组DNA,用耳聋基因芯片检测四个国人中常见的... 目的应用耳聋基因芯片对非综合征性感音神经性耳聋患者进行分子病因学研究,评估其在快速耳聋基因诊断中的可行性。方法采集158名来自北京第三聋哑学校的非综合征性耳聋学生的外周血,提取基因组DNA,用耳聋基因芯片检测四个国人中常见的耳聋相关基因中的9个热点突变,包括GJB2(35delG,176del16bp,235delC及299_300delAT),GJB3(538C>T及547G>A),SLC26A4(IVS7-2A>G、2168A>G)和线粒体DNA 12S rRNA(A1555G)。同时,应用酶切法或直接测序法分别对线粒体12SrRNA A1555G突变,以及GJB2、SLC26A4基因编码区序列进行检测,以验证基因芯片结果的准确性。结果在158名耳聋患者中,基因芯片方法共检出67例携带致聋突变(42.41%)。其中,线粒体DNA 12S rRNA A1555G突变5例(3.16%);GJB2基因突变39例(24.68%),包括235delC纯合突变24例,235delC和299_300delAT复合杂合突变7例,235delC单杂合突变5例,299_300delAT单杂合突变2例,35delG单杂合突变1例;SLC26A4基因突变22例(13.92%),包括IVS7-2A>G纯合突变5例,IVS7-2A>G和2168A>G复合杂合突变5例,IVS7-2A>G单杂合突变11例,2168A>G单杂合1例;另外还有1例患者检出299_300delAT和IVS7-2A>G双杂合突变。未检出GJB3基因突变。除两例纯合235delC被判读为杂合外,基因芯片的结果同酶切及测序方法结果一致,后者的阳性患者检出率为70例(44.3%),与芯片检测结果相比无统计学差异(P=0.250)。经探针优化后,上述两例误判的235delC样品的芯片检测结果均与测序方法一致,同时经测序证实的其他22例235delC纯合突变样品验证,基因芯片的结果均与测序结果一致。结论针对国人常见耳聋相关基因热点突变设计的耳聋基因芯片对非综合征性重度和极重度耳聋患者的突变检出率高(42.41%)。与传统方法相比,它具有快速、高通量、高准确性、低成本等特点,能够满足临床耳聋基因检测的要求;且其操作简单,易于标准化,适于推广,显示出广阔的临床 展开更多
关键词 耳聋 GJB2基因 SLC26A4基因 GJB3基因 线粒体dna 突变 基因芯片
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鼠疫耶尔森菌基因组进化与生态位适应研究 被引量：77
4
作者 周冬生 韩延平 +18 位作者 宋亚军 童宗中 裴德翠 戴二黑 张玲 包静月 李敏 崔百忠 张秀清 王津 郭兆彪 祁芝珍 金丽霞 翟俊辉 杜宗敏 王效义 汪建 黄培堂 杨瑞馥 《解放军医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2004年第3期204-210,共7页
目的　探索鼠疫耶尔森菌基因组进化的基本规律及其与该菌在自然界适应性演化之间的内在联系。方法　对 36株鼠疫耶尔森菌和 7株假结核耶尔森菌进行芯片比较基因组分析 ,鉴定差异区段 (DFR) ,并对 2 6 0株鼠疫耶尔森菌进行PCR验证 ,分析... 目的　探索鼠疫耶尔森菌基因组进化的基本规律及其与该菌在自然界适应性演化之间的内在联系。方法　对 36株鼠疫耶尔森菌和 7株假结核耶尔森菌进行芯片比较基因组分析 ,鉴定差异区段 (DFR) ,并对 2 6 0株鼠疫耶尔森菌进行PCR验证 ,分析各DFR在这些鼠疫耶尔森菌中的分布 ,同时进行基因组岛分析。结果　在鼠疫耶尔森菌基因组中鉴定出 2 2个DFR ,基于DFR图谱 ,将鼠疫耶尔森菌中国分离株分成 14个基因组型。鼠疫耶尔森菌共有 2 1个基因组岛 ,其中 18个已存在于假结核杆菌中 ,余下 3个为鼠疫耶尔森菌独有。结论　探明了各基因组岛在鼠疫耶尔森菌和假结核耶尔森菌间的差异分布 ,探究了鼠疫耶尔森菌的起源进化 ;建立了鼠疫耶尔森菌基因组分型系统 ;建立了各基因组型别间的系统发育关系 ,初步揭示了鼠疫耶尔森菌基因组的进化规律及其与鼠疫耶尔森菌生态位适应和鼠疫疫源地扩展之间的关系 。 展开更多
关键词 耶尔森氏菌 鼠疫 dna芯片 基因组进化 生态位适应
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基因芯片技术及应用研究进展 被引量：53
5
作者 王升启 《生物工程进展》 CSCD 1999年第4期45-51,共7页
采用高速打印或光刻合成技术可在硅片、玻璃或尼龙膜上制造ＤＮＡ微阵列。样品ＤＮＡ／ＲＮＡ通过ＰＣＲ扩增、体外转录等技术掺入荧光标记分子，与微阵列杂交后通过荧光扫描仪器扫描及计算机分析即可获得样品中大量基因序列及表达的信... 采用高速打印或光刻合成技术可在硅片、玻璃或尼龙膜上制造ＤＮＡ微阵列。样品ＤＮＡ／ＲＮＡ通过ＰＣＲ扩增、体外转录等技术掺入荧光标记分子，与微阵列杂交后通过荧光扫描仪器扫描及计算机分析即可获得样品中大量基因序列及表达的信息。该技术可应用于高通量基因表达平行分析、大规模基因发现及序列分析。 展开更多
关键词 基因芯片 表达谱 基因组计划
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用基因表达谱芯片研究人正常肝和肝细胞癌中差异表达的基因 被引量：32
6
作者 李瑶 裘敏燕 +7 位作者 吴超群 曹跃琼 唐榕 陈沁 石学银 胡志前 谢毅 毛裕民 《Acta Genetica Sinica》 SCIE CAS CSCD 2000年第12期1042-1048,共7页
以基因表达谱芯片对人正常肝及肝癌组织基因表达的差异性进行了研究比较。将4096条人cDNA用点样仪点在特制玻片上制备成表达谱芯片；利用肝和肝癌组织的mRNA通过逆转录方法，将Cy3和Cy5 2种荧光分别标记到两种组织的cDNA上，制备成cDNA... 以基因表达谱芯片对人正常肝及肝癌组织基因表达的差异性进行了研究比较。将4096条人cDNA用点样仪点在特制玻片上制备成表达谱芯片；利用肝和肝癌组织的mRNA通过逆转录方法，将Cy3和Cy5 2种荧光分别标记到两种组织的cDNA上，制备成cDNA探针，并与表达谱芯片进行杂交及扫描，重复4次实验，通过计算机数据处理判定基因是否在上述2种组织中有表达差异，筛选出差异表达的基因共903条。基因芯片技术可同时定量研究数以千计的基因表达水平，从而鉴定参与肿瘤发生的基因。 展开更多
关键词 基因 基因芯片 表达谱 肝细胞癌
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DNA微集阵列技术的研究进展 被引量：25
7
作者 马文丽 郑文岭 《中国科学基金》 CSCD 1999年第5期270-273,共4页
DNA微集阵列(DNA Microarray)技术采用寡聚核苷酸原位合成或显微打印方式,将大量DNA探针片段显微固化于支持物的表面,以实现遗传信息的快速、敏感和高效检测,该技术在基因组研究、新基因发现及基因诊断等方面有着重要的理论意义和应用... DNA微集阵列(DNA Microarray)技术采用寡聚核苷酸原位合成或显微打印方式,将大量DNA探针片段显微固化于支持物的表面,以实现遗传信息的快速、敏感和高效检测,该技术在基因组研究、新基因发现及基因诊断等方面有着重要的理论意义和应用前景。 展开更多
关键词 dna 微集阵列 基因组 基因诊断 研究进展
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慢性浅表性胃炎脾虚证患者与健康人物质能量代谢基因差异表达研究 被引量：43
8
作者 杨泽民 陈蔚文 王颖芳 《中国中西医结合杂志》 CAS CSCD 北大核心 2013年第2期159-163,共5页
目的分析慢性浅表性胃炎脾虚证患者体内脂类、蛋白质、糖类和核酸代谢情况,从物质能量代谢的角度探讨脾虚证的病理发生机制。方法选择4例2004年6月—2005年3月就诊于广州中医药大学一附院和广东省中医院的慢性浅表性胃炎脾虚证患者,选... 目的分析慢性浅表性胃炎脾虚证患者体内脂类、蛋白质、糖类和核酸代谢情况,从物质能量代谢的角度探讨脾虚证的病理发生机制。方法选择4例2004年6月—2005年3月就诊于广州中医药大学一附院和广东省中医院的慢性浅表性胃炎脾虚证患者,选择广州中医药大学健康人4名,钳取患者及健康人胃黏膜进行DNA芯片实验,利用BRB ArrayTools和IPA软件对DNA芯片双通道数据进行数据挖掘和生物信息学分析。结果获得15个与物质能量代谢相关差异基因,占总差异表达基因(20个)的75%,其中上调基因1个,下调基因14个,11个基因为酶基因。其中脂类代谢相关差异基因有ACAA2和CYP20A1,表现为脂肪酸分解和胆固醇转化降低;蛋白质代谢相关差异基因有ALDH9A1、ASL、ASS1、PCYOX1L、RPS28、UBE2D2、UBXN1、B3GNT1、GCNT1和PPP1R3C,表现为影响自主神经、尿素循环等生物学过程的氨基酸代谢降低,蛋白质合成降低,错误折叠蛋白泛素化降解增加,翻译后糖基化和磷酸化修饰降低;糖类代谢相关差异基因有PPP1R3C、B3GNT1和GCNT1,表现为糖原和聚糖合成降低;核酸代谢相关差异基因有RMI1、SMARCD3和PARP1,表现为DNA复制和转录降低,DNA损伤修复增加。结论慢性浅表性胃炎脾虚证患者体内脂类、蛋白质、糖类和核酸代谢水平明显降低,并且主要表现为酶基因表达下调,推测此可能是导致脾虚证营养代谢障碍的重要机制之一。 展开更多
关键词 脾虚证 dna芯片 物质代谢 慢性浅表性胃炎
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表达谱基因芯片筛选烧伤后增生性瘢痕相关基因的研究 被引量：30
9
作者 马兵 吴军 +4 位作者 易绍萱 罗高兴 贺伟峰 王珍祥 陈烯伟 《中华创伤杂志》 CAS CSCD 北大核心 2001年第6期334-337,共4页
目的　应用基因芯片技术从基因水平初步了解烧伤后增生性瘢痕形成的机制。　方法　按一步法抽提 3例烧伤患者的增生性瘢痕及其自身正常皮肤组织的总RNA ,纯化mRNA ;将40 96种人类基因PCR产物用CartesianPixsys 75 0 0点样仪微矩阵列点... 目的　应用基因芯片技术从基因水平初步了解烧伤后增生性瘢痕形成的机制。　方法　按一步法抽提 3例烧伤患者的增生性瘢痕及其自身正常皮肤组织的总RNA ,纯化mRNA ;将40 96种人类基因PCR产物用CartesianPixsys 75 0 0点样仪微矩阵列点样于化学涂层的载玻片上 ,制成基因芯片 ;将等量的增生性瘢痕和患者自身正常皮肤组织mRNA分别逆转录合成荧光标记的cDNA混合物探针 ,与上述基因芯片杂交。经严格洗片后 ,用SanArray 30 0 0扫描仪扫描芯片荧光信号图像 ,计算机分析后比较两种组织中差异表达的基因。　结果　在 40 96种基因中 ,患者的增生性瘢痕及其自身正常皮肤组织间存在差异表达基因。在所检测的 3例临床标本中 ,共有差异表达基因 12 8条。　结论　包括细胞凋亡基因、免疫相关基因、细胞骨架和运动基因、原癌基因和抑癌基因。 展开更多
关键词 烧伤 增生性瘢痕 基因芯片 基因表达
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基因芯片技术检测3种食源性致病微生物方法的建立 被引量：37
10
作者 陈昱 潘迎捷 +4 位作者 赵勇 金维荣 秦红友 徐晓晶 唐明未 《微生物学通报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第2期285-291,共7页
建立一种运用多重PCR和基因芯片技术检测和鉴定志贺氏菌、沙门氏菌、大肠杆菌O157的方法,为3种食源性致病菌的快速检测和鉴定提供了准确、快速、灵敏的方法。分别选取编码志贺氏菌侵袭性质粒抗原H基因(ipaH)、沙门氏菌肠毒素(stn)基因... 建立一种运用多重PCR和基因芯片技术检测和鉴定志贺氏菌、沙门氏菌、大肠杆菌O157的方法,为3种食源性致病菌的快速检测和鉴定提供了准确、快速、灵敏的方法。分别选取编码志贺氏菌侵袭性质粒抗原H基因(ipaH)、沙门氏菌肠毒素(stn)基因和致泻性大肠杆菌O157志贺样毒素(slt)基因设计引物和探针,进行三重PCR扩增,产物与含特异性探针的芯片杂交。对7种细菌共26株菌进行芯片检测,仅3种菌得到阳性扩增结果,证明此方法具有很高的特异性。3种致病菌基因组DNA和细菌纯培养物的检测灵敏度约为8pg。对模拟食品样品进行直接检测,结果与常规细菌学培养结果一致,检测限为50CFU/mL。结果表明:所建立的基因芯片检测方法特异性好,灵敏度高,为食源性致病菌的检测提供了理想手段,有良好的应用前景。 展开更多
关键词 基因芯片 多重PCR 微生物 检测
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基因芯片的制备研究 被引量：20
11
作者 李瑶 陈菊祥 +7 位作者 裘敏燕 应康 陈沁 符薇 王品 沈娴 谢毅 毛裕民 《第二军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2000年第9期812-814,I002,共4页
目的 :建立基因芯片的制备技术。 方法 :基因样本准备 ,将带荧光标记的 PCR产物用点样仪点于玻片介质上 ,并经过点样后处理制备成基因芯片 ,用扫描仪测定处理前后芯片上荧光强度的变化 ,计算 DNA固定率。分别设计了 5种玻片 3种固定条件... 目的 :建立基因芯片的制备技术。 方法 :基因样本准备 ,将带荧光标记的 PCR产物用点样仪点于玻片介质上 ,并经过点样后处理制备成基因芯片 ,用扫描仪测定处理前后芯片上荧光强度的变化 ,计算 DNA固定率。分别设计了 5种玻片 3种固定条件和 6种点样后处理方法的固定率测定。结果 :对芯片制备的各种条件和方法优化实验表明 ,c DNA的氨基修饰 ,点样后的 UV交联和芯片室温干燥处理能有效提高 DNA的固定率。结论 :本研究建立的基因芯片制备技术有较高的效率和可靠的实用性能。 展开更多
关键词 微矩阵基因芯片 基因表达谱 dna固定率 制备
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PRRS-CSF-PCV2诊断DNA芯片构建研究 被引量：22
12
作者 肖驰 曹三杰 +3 位作者 文心田 张焕容 肖国生 黄小波 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第8期799-803,共5页
本研究旨在研制CSF-PRRS-PCV2诊断DNA芯片。根据各病毒序列选取靶标,制备相应探针,并构建DNA芯片。结果表明:该芯片能同时检测PRRS、CSF和PCV2感染,并能区分PRRSV欧洲型和美洲型毒株,芯片检测阳性判读标准为SNR≥1.5(信号总强度模式量化... 本研究旨在研制CSF-PRRS-PCV2诊断DNA芯片。根据各病毒序列选取靶标,制备相应探针,并构建DNA芯片。结果表明:该芯片能同时检测PRRS、CSF和PCV2感染,并能区分PRRSV欧洲型和美洲型毒株,芯片检测阳性判读标准为SNR≥1.5(信号总强度模式量化)或信号强度≥1 000(信号中位值模式量化)。该芯片具有特异性高、灵敏度高和可重复利用的优点。应用PRRS-CSF-PCV2诊断DNA芯片检测20份临床病料发现PRRSV、CSFV和PCV2单独感染分别为0、15%和5%,PRRSV与CSFV、PRRSV与PCV2、PRRSV、PCV2和CS-FV混合感染分别为15%、35%和15%。 展开更多
关键词 猪繁殖与呼吸综合征病毒 猪瘟病毒 猪圆环病毒2型 dna芯片 诊断
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基因表达数据的聚类分析研究进展 被引量：25
13
作者 岳峰 孙亮 +2 位作者 王宽全 王永吉 左旺孟 《自动化学报》 EI CSCD 北大核心 2008年第2期113-120,共8页
基因表达数据的爆炸性增长迫切需求自动、有效的数据分析工具.目前聚类分析己成为分析基因表达数据获取生物学信息的有力工具.为了更好地挖掘基因表达数据,近年来提出了许多改进的传统聚类算法和新聚类算法.本文首先简单介绍了基因表达... 基因表达数据的爆炸性增长迫切需求自动、有效的数据分析工具.目前聚类分析己成为分析基因表达数据获取生物学信息的有力工具.为了更好地挖掘基因表达数据,近年来提出了许多改进的传统聚类算法和新聚类算法.本文首先简单介绍了基因表达数据的获取和表示,之后系统地介绍了近年来应用在基因表达数据分析中的聚类算法.根据聚类目标的不同将算法分为基于基因的聚类、基于样本的聚类和两路聚类,并对每类算法介绍了其生物学的含义及其难点,详细讨论了各种算法的基本原理及优缺点.最后总结了当前的基因表达数据的聚类分析方法,并对发展趋势作了进一步的展望. 展开更多
关键词 dna微阵列 基因表达数据 聚类分析
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遗传性耳聋基因芯片检测的临床应用研究 被引量：27
14
作者 江凌晓 凌月仙 +1 位作者 蔡桂君 王瑞莲 《分子诊断与治疗杂志》 2011年第3期170-172,共3页
目的应用遗传性耳聋基因芯片对散发性耳聋患者进行耳聋基因筛查,评价其在临床上快速检测常见遗传性耳聋基因的可行性。方法研究对象为76例耳聋患儿,取外周血5mL,分离提取全血淋巴细胞基因组DNA,用遗传性耳聋基因芯片检测中国人中常见的... 目的应用遗传性耳聋基因芯片对散发性耳聋患者进行耳聋基因筛查,评价其在临床上快速检测常见遗传性耳聋基因的可行性。方法研究对象为76例耳聋患儿,取外周血5mL,分离提取全血淋巴细胞基因组DNA,用遗传性耳聋基因芯片检测中国人中常见的4个耳聋相关基因上的9个热点突变,包括GJB2(35delG、176del16、235delC及299delAT)、GJB3(C538T)、SLC26A4(IVS7-2A>G、A2168G)以及线粒体12S rRNA(A1555G、C1494T)。结果在76例样本中,共检出9例突变,其中5例为SLC26A4IVS7-2A>G杂合突变型;1例线粒体12S rRNA1555A>G均质突变型;1例GJB2235delC/GJB2299delAT复合杂合突变型;1例GJB2235delC纯合突变型;1例SLC26A4IVS7-2A>G纯合突变型。结论遗传性耳聋基因芯片对中国人中常见耳聋相关基因突变位点检出率高,可满足临床耳聋基因检测的要求,具有广阔的临床应用前景。 展开更多
关键词 耳聋基因 基因芯片
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DNA微阵列(或芯片)技术原理及应用 被引量：20
15
作者 何志巍 姚开泰 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 1999年第5期507-510,共4页
ＤＮＡ微阵列或芯片（ＤＮＡｍｉｃｒｏａｒｒａｙ ｏｒｃｈｉｐ） 技术是近年发展起来的又一新的分子生物学研究工具． 它是利用光导化学合成、照相平板印刷以及固相表面化学合成等技术， 在固相表面合成成千上万个寡核苷酸探针，或将... ＤＮＡ微阵列或芯片（ＤＮＡｍｉｃｒｏａｒｒａｙ ｏｒｃｈｉｐ） 技术是近年发展起来的又一新的分子生物学研究工具． 它是利用光导化学合成、照相平板印刷以及固相表面化学合成等技术， 在固相表面合成成千上万个寡核苷酸探针，或将液相合成的探针由微阵列器或机器人点样于尼龙膜或硅片上， 再与放射性同位素或荧光物标记的ＤＮＡ 或ｃＤＮＡ杂交， 用于分析ＤＮＡ突变及多态性、ＤＮＡ测序、监测同一组织细胞在不同状态下或同一状态下多种组织细胞基因表达水平的差异。 展开更多
关键词 dna微阵列(或芯片) 原理 应用
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检测乙、丙型肝炎病毒基因芯片的制备 被引量：20
16
作者 吴海 顾少华 +5 位作者 胡志前 许一斌 徐东 应康 谢毅 毛裕民 《第二军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2001年第6期527-529,T003,共4页
目的 :探讨研制检测乙型和丙型肝炎病毒的基因芯片。方法 :以 HBV、HCV高度保守的基因片段为探针 ,同时用没有同源性的植物基因片段为内参照基因 ,制备成“乙、丙型肝炎病毒双检基因芯片”。检测时抽提患者血清中的病毒核酸 ,进行RT- PC... 目的 :探讨研制检测乙型和丙型肝炎病毒的基因芯片。方法 :以 HBV、HCV高度保守的基因片段为探针 ,同时用没有同源性的植物基因片段为内参照基因 ,制备成“乙、丙型肝炎病毒双检基因芯片”。检测时抽提患者血清中的病毒核酸 ,进行RT- PCR扩增及荧光标记 ,然后与双检基因芯片杂交 ,杂交结果用 Scan Array 30 0 0扫描仪扫描。 结果 :双检基因芯片的内参照结果能做到绝对阳性和绝对阴性 ,同时对不同血清 (正常人血清 ,乙肝 E抗原阳性血清 ,丙肝 RNA阳性血清 ,乙肝、丙肝阳性混合血清 )能有效检测区分。 结论 :本研究成功地制作了乙、丙型肝炎病毒双检基因芯片 。 展开更多
关键词 基因芯片 基因诊断 乙型肝炎病毒 丙型肝炎病毒
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应用基因芯片研究雄黄对NB4细胞的作用 被引量：20
17
作者 王怀宇 刘陕西 《中国中药杂志》 CAS CSCD 北大核心 2002年第8期600-604,共5页
目的 :研究雄黄在诱导急性早幼粒细胞白血病细胞株NB4分化及凋亡过程中基因表达谱的改变。方法 :应用包含 10 0 3条人类基因的cDNA表达谱芯片 ,检测雄黄作用于NB4细胞前后基因表达的调控。结果 :NB4细胞在雄黄作用后 12h ,9条基因上调 ... 目的 :研究雄黄在诱导急性早幼粒细胞白血病细胞株NB4分化及凋亡过程中基因表达谱的改变。方法 :应用包含 10 0 3条人类基因的cDNA表达谱芯片 ,检测雄黄作用于NB4细胞前后基因表达的调控。结果 :NB4细胞在雄黄作用后 12h ,9条基因上调 ,37条基因下调 ;2条参与蛋白酶体降解途径的基因显著上调 ,多条与细胞信号传导、RNA加工及蛋白质合成相关的基因下调。结论 :PSMC2 ,PSMD1及ITGB1基因的表达改变可能与NB4细胞的分化和凋亡有密切关系。 展开更多
关键词 NB4细胞 雄黄 基因芯片 急性早幼粒细胞白血病 细胞凋亡 基因表达谱
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用酿酒酵母全基因组DNA芯片研究盐酸小檗碱的药理作用机制 被引量：13
18
作者 张岩 张亮 +4 位作者 周一鸣 赵艳君 果德安 周玉祥 程京 《中国中西医结合杂志》 CAS CSCD 北大核心 2003年第1期48-53,共6页
目的 :利用自己构建的酿酒酵母全基因组DNA芯片 ,分析盐酸小檗碱处理酵母细胞后对其整个基因表达谱的影响 ,在基因水平上分析盐酸小檗碱的药理机制。方法 :用盐酸小檗碱 (10 0 μg/ml)处理酵母细胞 90min后 ,抽提细胞的RNA进行反转录荧... 目的 :利用自己构建的酿酒酵母全基因组DNA芯片 ,分析盐酸小檗碱处理酵母细胞后对其整个基因表达谱的影响 ,在基因水平上分析盐酸小檗碱的药理机制。方法 :用盐酸小檗碱 (10 0 μg/ml)处理酵母细胞 90min后 ,抽提细胞的RNA进行反转录荧光标记cDNA ,与DNA芯片进行杂交。用激光扫描仪检测杂交信号。结果 :共有 5 45个基因〔占全部基因 (6 183个 )的 9%〕受到诱导 ,38个基因 (占全部基因的 0 6 % )受到抑制。被诱导的基因包括与细胞生长、蛋白质合成及应激反应相关的基因。受抑制的基因包括与氧化磷酸化过程相关的基因和好氧基因。与金属离子平衡 ,特别是与铁离子和铜离子平衡有关的基因表达有较大变化。结论 :处理 90min后 ,酵母细胞在转录水平上表现出对盐酸小檗碱处理的适应性。盐酸小檗碱的药理作用可能和引起细胞内的氧浓度变化及氧化还原反应产生的自由基有关。细胞容易对盐酸小檗碱产生抗药性的原因是由于与细胞抗药性相关的基因受到了明显的诱导。 展开更多
关键词 酿酒酵母 dna芯片 盐酸小檗碱 基因差异表达 中药
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黄芩苷和木犀草苷在体外对流感病毒H1N1感染A549细胞中NF-κB信号通路的调控作用 被引量：20
19
作者 刘晓婷 顾立刚 +4 位作者 邓东沅 于卓男 王玥琦 吴珺 邱泽计 《中华中医药杂志》 CAS CSCD 北大核心 2016年第5期1937-1941,共5页
目的:探讨流感病毒H1N1体外感染诱导细胞NF-κB信号通路相关因子表达及黄芩苷和木犀草素-7-O-葡萄糖苷的调控作用。方法:正常生长细胞接种100TCID50的病毒液;吸附2h后分别加入黄芩苷(3.96、0.99mg/L)、木犀草苷(25.0、12.5mg/L),并以奥... 目的:探讨流感病毒H1N1体外感染诱导细胞NF-κB信号通路相关因子表达及黄芩苷和木犀草素-7-O-葡萄糖苷的调控作用。方法:正常生长细胞接种100TCID50的病毒液;吸附2h后分别加入黄芩苷(3.96、0.99mg/L)、木犀草苷(25.0、12.5mg/L),并以奥司他韦(0.75mg/L)做阳性对照。采用基因芯片技术分析各组细胞差异表达炎性因子。以RT-PCR和Western blot法检测细胞NF-κB信号通路相关因子m RNA和蛋白的表达变化。结果:与正常细胞对照组比较,H1N1感染组差异表达基因IRAK1、RIPK1、TAB2、NFKB、IL1B、IL8、TNFA和COX-2明显上调;与H1N1感染组比较,奥司他韦对照组基因NFKB、IL1B和TNFA明显下调,NFKBIA明显上调;黄芩苷高、低剂量组基因IRAK1、RIPK1、TAB2、NFKB、IL1B、IL8和TNFA明显下调,NFKBIA和TNFAIP3上调;木犀草苷高、低剂量组对差异表达基因RIPK1、IRAK1、TAB2、NFKB、IL1B、TNFA和COX-2明显下调,对NFKBIA上调作用。结论:流感病毒感染后活化NF-κB信号通路,引起炎性因子过度表达;黄芩苷和木犀草苷可以对活化通路的正负反馈进行调节,减轻病毒对宿主细胞的炎性损伤作用,发挥抗病毒作用。 展开更多
关键词 黄芩苷 木犀草素-7-O-葡萄糖苷 流感病毒H1N1 人肺腺癌A549细胞 NF-ΚB信号通路 基因芯片
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用于寡核苷酸芯片制备载体的醛基载玻片的制备方法优化及性质研究 被引量：12
20
作者 邹宗亮 王升启 王志清 《生物工程学报》 CAS CSCD 北大核心 2001年第5期498-502,共5页
优化了醛基载玻片的制备方法 ,探讨了醛基修饰载玻片固定寡核苷酸探针的性质。研究发现氨基硅烷试剂的浓度是影响载玻片荧光背景的主要因素 ;2 %氨基化试剂处理 16min、戊二醛处理 30min可以得到荧光背景较低、固定效果较好的醛基载玻... 优化了醛基载玻片的制备方法 ,探讨了醛基修饰载玻片固定寡核苷酸探针的性质。研究发现氨基硅烷试剂的浓度是影响载玻片荧光背景的主要因素 ;2 %氨基化试剂处理 16min、戊二醛处理 30min可以得到荧光背景较低、固定效果较好的醛基载玻片。寡核苷酸固定过程中 ,末端氨基修饰没有明显的特异性 ,但是可以提高被固定探针的杂交容量。在较低的浓度 (小于 10 μmol L)时 ,探针的浓度与杂交信号趋近线性关系 ,浓度为 2 0 μmol 展开更多
关键词 寡核苷酸芯片 共价交联 玻璃 醛基修饰 载体 载玻片 制备 优化
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