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人退变椎间盘组织细胞凋亡相关基因表达的初步研究 被引量：9
1
作者 胡明 马远征 +4 位作者 张传森 陈道运 陈兴 才晓军 白一冰 《中国康复理论与实践》 CSCD 2006年第6期484-486,F0003,共4页
目的探讨细胞凋亡与腰椎间盘退变的发生机制。方法一步法抽提6例退变及6例正常椎间盘组织的总RNA,分别用cy3,cy5荧光标记,获得两组椎间盘cDNA的探针,与cDNA表达谱芯片杂交,扫描芯片荧光信号图像,对所获得的凋亡相关基因进行生物信息学... 目的探讨细胞凋亡与腰椎间盘退变的发生机制。方法一步法抽提6例退变及6例正常椎间盘组织的总RNA,分别用cy3,cy5荧光标记,获得两组椎间盘cDNA的探针,与cDNA表达谱芯片杂交,扫描芯片荧光信号图像,对所获得的凋亡相关基因进行生物信息学分析。采用原位末端标记法(TUNEL)和免疫组化方法,检测12例人退变椎间盘及10例正常椎间盘组织的细胞凋亡状态及凋亡相关基因Bcl-2、Bax蛋白的表达。结果在4096条基因中,与细胞凋亡相关类蛋白为10条,其中Bax蛋白相关基因表达增高,Bcl-2蛋白相关基因表达降低。正常组TUNEL检测凋亡指数(AI)为(24.897±3.620),Bcl-2阳性细胞百分率为(31.440±4.150)%,Bax阳性细胞百分率为(29.372±2.588)%,阳性颗粒平均光密度值分别为(0.183±0.010)、(0.203±0.012)和(0.169±0.005);退变组AI为(49.232±3.440),Bcl-2阳性细胞百分率为(18.239±2.470)%,Bax阳性细胞百分率为(52.349±3.764)%,阳性颗粒平均光密度值分别为(0.152±0.003)、(0.310±0.008)和(0.262±0.014),两组间的AI均值、Bcl-2、Bax蛋白表达均有显著性差异(P<0.05)。结论细胞凋亡在椎间盘退变的进程中发挥重要作用,凋亡相关基因Bcl-2和Bax参与了髓核细胞凋亡的发生和发展过程。 展开更多
关键词 基因芯片 基因表达谱 椎间盘退变 细胞凋亡 Bcl-2 BAX 上皮细胞膜蛋白
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用基因芯片研究不同皮肤组织创面愈合过程中同源异形框基因的差异表达 被引量：11
2
作者 宋慧锋 柴家科 +1 位作者 陈敏亮 林子豪 《中华整形外科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2005年第5期372-374,共3页
目的探讨人胎儿及成人皮肤创面愈合过程中同源异形框基因的差异表达。方法采用包含有14000个靶基因cDNA克隆的基因芯片技术,对正常成人和胎儿及其创面愈合过程中同源异形框基因族的表达进行对比观察。结果正常成人和胎儿及其创面愈合过... 目的探讨人胎儿及成人皮肤创面愈合过程中同源异形框基因的差异表达。方法采用包含有14000个靶基因cDNA克隆的基因芯片技术,对正常成人和胎儿及其创面愈合过程中同源异形框基因族的表达进行对比观察。结果正常成人和胎儿及其创面愈合过程中同源异形框基因族呈现差异表达,其中以PRX2、HOXB13、HOXB6和HOXB7的差异表达为显著。结论同源异形框基因的差异表达表明正常成人和胎儿皮肤的发育生物学状态存在差异,可能是胎儿和成人皮肤不同创面愈合方式的根本原因。 展开更多
关键词 同源异形框基因 胎儿 皮肤 创面愈合 基因芯片 同源异形框基因 皮肤组织创面 基因芯片技术 差异表达 愈合过程 cdna克隆 发育生物学 人胎儿 皮肤创面
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摄食低钠盐对三高病人局部基因网络模式的共同影响 被引量：1
3
作者 张治洲 韩潇 +1 位作者 王志伟 王芸 《现代食品科技》 EI CAS 2009年第1期1-5,14,共6页
应用局部基因网络模式(Local gene network pattern)研究摄食低钠盐在高血压、高脂血及高血糖三种疾病人群血液基因表达谱引起的若干共同差异。测试人群包含19个样本(8正常,11三高疾病),经过检测食用低钠盐前后的基因表达芯片,在监测的... 应用局部基因网络模式(Local gene network pattern)研究摄食低钠盐在高血压、高脂血及高血糖三种疾病人群血液基因表达谱引起的若干共同差异。测试人群包含19个样本(8正常,11三高疾病),经过检测食用低钠盐前后的基因表达芯片,在监测的150个高血压候选基因中,有17个有明显表达,其中的14个发现可以通过明确的信号通路相互连通成包含约60个基因的局部基因网络。该局部基因网络相对于正常组在三高疾病组中的共同变化表现在4个基因上。结果表明,局部基因网络可在分子水平上研究营养因子对不同人群的营养效应。上述三高病人响应低钠盐的共同局部基因网络可以从方法学上作为进一步研发功能食品的基础,也为低钠盐作为针对三高人群的非药物保健因子在基因表达上提供了进一步研究所需的素材。 展开更多
关键词 局部基因网络(LGN) 高血压基因 基因芯片 低钠盐 高血糖和高脂血
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幽门螺杆菌基因组DNA芯片的研制
4
作者 韩跃华 刘文忠 +3 位作者 史耀舟 卢莉琼 萧树东 赵国屏 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第3期244-247,共4页
目的研制幽门螺杆菌(H.pylori)基因组DNA芯片。方法以H.pylori26695和J99作为模板,利用多聚酶链反应(PCR)扩增得到所需要的开放阅读框(open reading frame,ORF)片段。使用Genemachine点样仪进行点样,采用Cy3-dCTP或Cy5-dCTP以及Klenow... 目的研制幽门螺杆菌(H.pylori)基因组DNA芯片。方法以H.pylori26695和J99作为模板,利用多聚酶链反应(PCR)扩增得到所需要的开放阅读框(open reading frame,ORF)片段。使用Genemachine点样仪进行点样,采用Cy3-dCTP或Cy5-dCTP以及Klenow片段标记H.pylori基因组DNA,并完成芯片杂交和数据读取。数据判断标准是标化后Cy3/Cy5比值(ratio)<0.5则认为不存在这一基因(记作0),若ratio值≥0.5则认为存在这一基因(记作1)。使用芯片重复性、信噪比以及假阳性率和假阴性率评估芯片质量。结果研制的H.pylori基因组DNA芯片共包括1 882个基因片段,相对应于1 636个ORF,其中H.pylori26695为1 549个,H.pyloriJ99为87个。信噪比(S/N)<2的基因点数约为10%。芯片的假阳性率分别为3.4%(H.pylori26695)和7.21%(H.pyloriJ99),假阴性率分别为0.27%(H.pylori26695)和0.24%(H.pyloriJ99)。芯片内点间重复率为98%,芯片间重复率为97%。结论成功制备了H.pylori基因组DNA芯片,所制备的芯片具有较高点一致性、信噪比和统计学重复性,为在全基因组范围内进行H.pylori的基础和应用研究提供了一工具。 展开更多
关键词 幽门螺杆菌 基因组dna芯片 研制
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