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Recent advances in the study of hepatitis B virus covalently closed circular DNA 被引量:10
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作者 Mengying Ji Kanghong Hu 《Virologica Sinica》 SCIE CAS CSCD 2017年第6期454-464,共11页
Chronic hepatitis B infection is caused by hepatitis B virus(HBV) and a total cure is yet to be achieved. The viral covalently closed circular DNA(ccc DNA) is the key to establish a persistent infection within hepatoc... Chronic hepatitis B infection is caused by hepatitis B virus(HBV) and a total cure is yet to be achieved. The viral covalently closed circular DNA(ccc DNA) is the key to establish a persistent infection within hepatocytes. Current antiviral strategies have no effect on the pre-existing ccc DNA reservoir. Therefore, the study of the molecular mechanism of ccc DNA formation is becoming a major focus of HBV research. This review summarizes the current advances in ccc DNA molecular biology and the latest studies on the elimination or inactivation of ccc DNA, including three major areas:(1) epigenetic regulation of ccc DNA by HBV X protein,(2) immune-mediated degradation,and(3) genome-editing nucleases. All these aspects provide clues on how to finally attain a cure for chronic hepatitis B infection. 展开更多
关键词 hepatitis B virus(HBV) covalently closed circular dna(cccdna) HBX immunemediated genome-editing nucleases
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HBV cccDNA and Its Potential as a Therapeutic Target 被引量:11
2
作者 Anjing Zhu Xinzhong Liao +4 位作者 Shuang Li Hang Zhao Limin Chen Min Xu Xiaoqiong Duan 《Journal of Clinical and Translational Hepatology》 SCIE 2019年第3期258-262,共5页
Chronic hepatitis B virus infection continues to be a major health burden worldwide.It can cause various degrees of liver damage and is strongly associated with the development of liver cirrhosis and hepatocellular ca... Chronic hepatitis B virus infection continues to be a major health burden worldwide.It can cause various degrees of liver damage and is strongly associated with the development of liver cirrhosis and hepatocellular carcinoma.Covalently closed circular DNA in the nucleus of infected cells cannot be disabled by present therapies which may lead to HBV persistence and relapse.In this review,we summarized the current knowledge on hepatitis B virus covalently closed circular DNA and its potential role as a therapeutic target. 展开更多
关键词 Hepatitis B virus(HBV) Covalently closed circular dna(cccdna) Therapeutic target
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Detection of the covalently closed circular DNA of duck hepatitis B virus by Taq-Man fluorescent quantitative PCR assay
3
作者 MEI LI FU QING LIN +3 位作者 XIAO PENG LIU SHUI LAN SHI DONG LIANG LI ZI RONG CHEN 《Journal of Microbiology and Immunology》 2007年第1期35-39,共5页
To develop a fluorescent quantitative PCR assay based on Taq-Man chemistry to detect the covalenfly closed circular DNA (eccDNA) of duck hepatitis B virus (DHBV), a pair of primers was designed from both sides of ... To develop a fluorescent quantitative PCR assay based on Taq-Man chemistry to detect the covalenfly closed circular DNA (eccDNA) of duck hepatitis B virus (DHBV), a pair of primers was designed from both sides of the nick in the minus strand of DHBV and a Taq-Man probes between the primers, modified with 6-Fam at 5' end and Tamra at its 3' end was designed to detect the PCR products during PCR cycles. The DHBV DNA fragment was cloned into vector PUCm-T, and the recombinant plasmid was purified and subsequently qualified as the HBV DNA standard. The experimental conditions and reagents used in PCR assay for amplification were sophisticatedly optimized in order to yield a perfect amplification efficacy and reduce the possibility to produce non-specific amplification. It was demonstrated that the detect limit of assay was 10^3 copies/ml, and a linear standard curve was obtained between 10^5 -10^9 copies/ml [ C1 =-2.8361 ln(x) + 41.45, r =-0.9985]. The coefficient of variation was 0.2%-3.14% and 2.22%-4.43% for intra- and inter-assay respectively. After a dynamic survey on the contents of DHBV DNA in serum of ducks, it was found that its peak value appeared at the second week of birth in ducks. It is evident that this method of Taq-Man fluorescent quantitative PCR assay appears to be simple, sensitive and specific. 展开更多
关键词 DUCK Hepatitis B virus Covalently closed circular dnacccdna Fluorescence quantitative PCR
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肝组织中HBV cccDNA荧光定量聚合酶链反应检测法的建立 被引量:11
4
作者 王美容 邱宁 +5 位作者 卢实春 修典荣 于建国 李彤 刘学恩 庄辉 《中华流行病学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2011年第5期504-509,共6页
目的建立和优化一种灵敏、特异的检测肝组织中乙型肝炎(乙肝)病毒(HBV)共价闭合环状DNA(cccDNA)荧光定量聚合酶链反应(荧光定量PCR)。方法设计检测HBVDNA(tDNA)和cccDNA特异性引物及探针,用3.44×10^0~3.44×10^9... 目的建立和优化一种灵敏、特异的检测肝组织中乙型肝炎(乙肝)病毒(HBV)共价闭合环状DNA(cccDNA)荧光定量聚合酶链反应(荧光定量PCR)。方法设计检测HBVDNA(tDNA)和cccDNA特异性引物及探针,用3.44×10^0~3.44×10^9copies/pl含HBV全基因组序列(C基因型)质粒作为标准品,建立荧光定量PCR检测标准曲线。取33例乙肝肝癌患者肝组织标本、13例慢性乙肝患者肝活检组织标本和10例非乙肝患者肝组织标本,验证该法灵敏度和特异度。提取肝组织中DNA,取一部分进行质粒安全ATP依赖的DNA酶(PSAD)酶切;另一部分不酶切作为tDNA和β—globin检测样本,分别进行HBV cccDNA、tDNA和β—globin定量检测,以β-globin为参比,对每个细胞的HBV cccDNA和tDNA含量进行标准化。结果检测肝组织中HBV cccDNA和tDNA定量的线型范围均为3.44×10^0~3.44×10^9copies/μl。检测HBV cccDNA和HBVDNA下限均为3.44×10^0copies/μl。33例乙肝肝癌患者和13例慢性乙肝患者的肝组织中HBV cccDNA最低含量分别为0.003copies/cell和0.031 copies/cell;检测10份非乙肝肝癌患者的肝组织标本均为阴性。应用PSAD消化肝组织中提取的DNA可减少假阳性,提高cccDNA检测法特异度达7.24×10^2倍。对2例乙肝肝癌患者的肝组织标本重复检测5次,Ct值的变异系数为0.224%-0.609%。结论该方法灵敏度和特异度高,重复性好,可用于检测肝组织中HBV cccDNA。 展开更多
关键词 乙型肝炎病毒 共价闭合环状dna(cccdna) 实时荧光定量聚合酶链反应
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原发性肝细胞癌患者乙型肝炎病毒表面抗原与肝组织HBV cccDNA水平的相关性 被引量:7
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作者 李莹 韩涛 +4 位作者 马晓艳 裴彦祯 杜智 高英堂 王毅军 《中国病毒病杂志》 CAS 2011年第1期32-34,共3页
目的检测乙型肝炎相关性原发性肝细胞癌患者(hepatocellular carcinoma,HCC)HBV tDNA、HBVcccDNA,并探讨其与乙型肝炎病毒表面抗原(HBsAg)定量的相互关系。方法应用实时荧光PCR方法对37例HCC患者癌组织和癌旁组织HBV tDNA、HBV cccDNA... 目的检测乙型肝炎相关性原发性肝细胞癌患者(hepatocellular carcinoma,HCC)HBV tDNA、HBVcccDNA,并探讨其与乙型肝炎病毒表面抗原(HBsAg)定量的相互关系。方法应用实时荧光PCR方法对37例HCC患者癌组织和癌旁组织HBV tDNA、HBV cccDNA及血清HBV tDNA进行定量检测;采用雅培化学发光法进行HBsAg定量检测。结果癌组织HBV tDNA、HBV cccDNA与HBsAg定量无相关性(r=0.146,P=0.388;r=0.151,P=0.371);癌旁组织HBV tDNA、HBV cccDNA与HBsAg定量无相关性(r=0.323,P=0.051;r=0.186,P=0.271)。癌组织HBV tDNA、HBV cccDNA及HBV cccDNA占HBV tDNA比例与癌旁组织比较差异均无统计学意义(6.61 lg拷贝/μgvs6.26 lg拷贝/μg,P=0.067;0.96 lg拷贝/μgvs1.33lg拷贝/μg,P=0.438;14.23%vs19.65%,P=0.501);HBV复制指标间相关性弱,仅癌组织HBV cccDNA与外周血HBV tDNA存在相关性(r=0.382,P=0.020),癌旁组织HBV tDNA与HBV cccDNA存在相关性(r=0.327,P=0.048),癌与癌旁组织HBV tDNA存在相关性(r=0.665,P<0.001)。结论 HCC患者病毒复制水平减低,癌与癌旁组织病毒复制水平无明显差异,且与血清HBsAg水平亦无明显相关性。 展开更多
关键词 乙型肝炎表面抗原 定量 肝细胞 共价闭合环状dna
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无锡地区HBsAg-/HBV DNA+献血人群HBcrAg检出特点分析
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作者 王嫣 金建怀 +2 位作者 许友山 郝庆钦 夏卫 《中国输血杂志》 2024年第1期32-36,共5页
目的分析新型血清标志物乙型肝炎核心相关抗原(HBcrAg)在无锡地区HBsAg-/HBV DNA+献血人群中的检出特点。方法通过电话追踪随访了37名既往HBsAg-/HBV DNA+献血者并获得其血清,采用电化学发光法和实时荧光定量PCR核酸筛检出22例HBsAg-/HB... 目的分析新型血清标志物乙型肝炎核心相关抗原(HBcrAg)在无锡地区HBsAg-/HBV DNA+献血人群中的检出特点。方法通过电话追踪随访了37名既往HBsAg-/HBV DNA+献血者并获得其血清,采用电化学发光法和实时荧光定量PCR核酸筛检出22例HBsAg-/HBV DNA+献血者血清作为OBI组进行HBcrAg酶联免疫吸附法检测。挑选出20名经2遍酶免和1遍核酸筛检的健康献血者的血清作为健康对照组,20例经无锡第五人民医院临床诊断为慢性乙型肝炎患者血清作为实验的CHB组,分别进行HBcrAg酶联免疫吸附法检测;并对OBI组进行HBcrAg与HBeAb、HBcAb、ALT、HBV DNA的相关性分析。结果37份献血者标本经化学发光法检测HBsAg和核酸筛查,检出22份HBsAg-/HBV DNA+标本即OBI组,检出率59.46%。OBI组与健康对照组、CHB组血清的HBcrAg表达含量分别是(0.92±0.13)ng/mL、(0.47±0.09)ng/mL、(1.14±0.23)ng/mL(P<0.05),OBI组与CHB组的HBcrAg表达均高于健康对照组(P<0.05)。OBI组的HBcrAg与HBeAb、HBcAb、ALT、HBV DNA指标均无相关性(P>0.05)。结论OBI组与CHB组的HBcrAg表达均高于健康对照组,其血清HBcrAg在一定程度上与HBeAb、HBcAb、ALT、HBV DNA无相关性,HBcrAg在筛查HBsAg-/HBV DNA+献血者中具有较好的应用前景。 展开更多
关键词 乙型肝炎核心相关抗原 HBsAg-/HBV dna+ 献血者 共价闭合环状dna
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套式聚合酶链反应法检测外周血单个核细胞中HBcVccDNA 被引量:4
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作者 郑守虎 董庆鸣 《中国卫生检验杂志》 CAS 2008年第11期2317-2318,共2页
目的:建立套式聚合酶链反应法(nPCR)检测慢性乙型肝炎患者外周血单个核细胞(PBMC)中乙型肝炎病毒共价闭合环状DNA(HBV cccDNA)。方法:根据HBV基因组DNA正负链上下游缺口序列,设计两套相对保守的引物,建立HBV cccDNA套式PCR,并用该法检测... 目的:建立套式聚合酶链反应法(nPCR)检测慢性乙型肝炎患者外周血单个核细胞(PBMC)中乙型肝炎病毒共价闭合环状DNA(HBV cccDNA)。方法:根据HBV基因组DNA正负链上下游缺口序列,设计两套相对保守的引物,建立HBV cccDNA套式PCR,并用该法检测200例慢性乙型肝炎患者PBMC中HBV cccDNA。结果:该法检测200例慢性乙型肝炎患者,HBV cccDNA阳性率为60%。结论:套式PCR法简便、灵敏,可用于测定PBMC中HBV cccDNA。 展开更多
关键词 乙型肝炎病毒 套式聚合酶链反应法 共价闭合环状dna(cccdna) 慢性乙型肝炎
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慢性乙型肝炎新型诊断标志物的研发概况
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作者 马亦林 《中华临床感染病杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期93-98,共6页
乙型肝炎已成为严重威胁人类健康的世界性疾病,也是我国当前流行广泛、危害性严重的传染病之一。据《中国卫生健康统计年鉴(2022)》数据显示,2021年,我国乙型肝炎发病率为69.25人/10万人。为了使感染科临床工作者获得乙型肝炎研究的前... 乙型肝炎已成为严重威胁人类健康的世界性疾病,也是我国当前流行广泛、危害性严重的传染病之一。据《中国卫生健康统计年鉴(2022)》数据显示,2021年,我国乙型肝炎发病率为69.25人/10万人。为了使感染科临床工作者获得乙型肝炎研究的前沿信息,本文对乙型肝炎的靶点和新型诊断标志物与病毒复制的相关性、临床意义及检测技术改进等作了重点介绍,建议有条件单位逐步扩大检测,这将对临床诊断率及抗病毒药物评估有帮助,并有助于实现世界卫生组织提出“到2030年乙型肝炎诊断率要提升至90%”的目标。 展开更多
关键词 慢性乙型肝炎 新型诊断标志物 共价闭合环状dna HBV核糖核酸 HBV核心相关抗原 乙型肝炎核心抗体
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乙型肝炎病毒共价闭合环状DNA清除的研究进展
9
作者 李成 莫雪 +2 位作者 牛文霞 李明明 付丽娟 《系统医学》 2023年第7期194-198,共5页
乙型肝炎是感染乙型肝炎病毒(hepatitis B virus,HBV)引起肝脏慢性炎症性改变为主要特征的一类传染病。长期慢性感染将导致肝纤维化、肝硬化、肝癌等终末期肝病的发生,严重危害人民群众的健康。慢性乙型肝炎病毒感染依然是全球公共卫生... 乙型肝炎是感染乙型肝炎病毒(hepatitis B virus,HBV)引起肝脏慢性炎症性改变为主要特征的一类传染病。长期慢性感染将导致肝纤维化、肝硬化、肝癌等终末期肝病的发生,严重危害人民群众的健康。慢性乙型肝炎病毒感染依然是全球公共卫生健康问题之一。目前临床上使用的抗病毒治疗方案难以实现对乙型肝炎病毒的彻底清除,其根源在于被感染肝细胞核内持续存在具有稳定结构的共价闭合环状DNA(covalently closed circular DNA,cccDNA)。本文对乙型肝炎病毒共价闭合环状DNA清除的研究进展进行综述,旨在寻找清除cccDNA的途径及办法从而达到乙型肝炎病毒的彻底清除。 展开更多
关键词 乙型肝炎病毒 共价闭合环状dna(cccdna) 基因
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过氧化物酶体增殖物激活受体α(PPARα)调控HBV微染色体重塑与病毒复制 被引量:3
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作者 谢冰珏 郭进军 +1 位作者 张燕 李青岭 《重庆医科大学学报》 CSCD 北大核心 2017年第7期795-802,共8页
目的:研究过氧化物酶体增殖物激活受体α(peroxisome proliferator-activated receptor alpha,PPARα)是否参与调控乙型肝炎病毒(hepatitis B virus,HBV)微染色体重塑与病毒复制。方法:HepG2细胞单独转染、共转染线性HBV单体与PPARα表... 目的:研究过氧化物酶体增殖物激活受体α(peroxisome proliferator-activated receptor alpha,PPARα)是否参与调控乙型肝炎病毒(hepatitis B virus,HBV)微染色体重塑与病毒复制。方法:HepG2细胞单独转染、共转染线性HBV单体与PPARα表达或PPARα沉默载体;Southern blot检测转染细胞质内HBV核心颗粒DNA;实时定量PCR定量检测细胞质HBV核心颗粒DNA及细胞核内HBV共价闭合环状DNA(covalently closed circular DNA,cccDNA)水平;酶联免疫吸附试验(enzyme-linked immunosorbent assay,ELISA)检测转染细胞上清中乙型肝炎表面抗原(hepatitis B surface antigen,HBsAg)和e抗原(hepatitis B e antigen,HBeAg);染色质免疫共沉淀技术(chromatin immunoprecipitation,ChIP)检测与cccDNA结合的PPARα、组蛋白和染色质修饰酶。结果:与单独转染线性HBV单体相比,共转染PPARα增加了PPARα与HBV cccDNA的结合,增加了HBV开环DNA(open circular DNA,OC DNA)及HBsAg和HBeAg水平,同时也增加了cccDNA微染色质中组蛋白H3和H4的乙酰化水平及乙酰转移酶p300的水平;共转染PPARα沉默载体则有相反的结果。结论:PPARα能直接与cccDNA结合并有助于乙酰转移酶p300募集到cccDNA上,从而调控HBV微染色质的表观遗传学和HBV复制。这一发现对HBV与宿主转录因子间相互作用的相关分子机制提供了新的机制。 展开更多
关键词 乙型肝炎病毒(HBv) 共价闭合环状dna(cccdna) 过氧化物酶体增殖物激活受体α(PPARα) 病毒微染色体重塑
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增殖细胞核抗原通过其DNA结合结构域促进乙肝病毒rcDNA向cccDNA的转化 被引量:1
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作者 袁颖 冯巾晏 +7 位作者 赵丽娜 杨光 赵曼 袁红凤 贠昊林 刘姿娴 李悦国 张晓东 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第9期1197-1204,共8页
慢性乙型肝炎病毒(HBV)感染是造成肝癌的主要原因,消除病毒基因组中稳定的共价闭合环状DNA(cccDNA)是乙肝治疗的主要难点。HBV cccDNA的形成需要填充单链区域和闭合松弛环状DNA(rcDNA)。我们之前已报道,增殖细胞核抗原(PCNA)参与了HBV c... 慢性乙型肝炎病毒(HBV)感染是造成肝癌的主要原因,消除病毒基因组中稳定的共价闭合环状DNA(cccDNA)是乙肝治疗的主要难点。HBV cccDNA的形成需要填充单链区域和闭合松弛环状DNA(rcDNA)。我们之前已报道,增殖细胞核抗原(PCNA)参与了HBV cccDNA的形成。然而,HBV rcDNA向cccDNA转化的分子机制尚不清楚。本研究旨在探讨PCNA参与从HBV rcDNA到HBV cccDNA的转化过程的分子机制。结果显示,CRISPR/Cas9系统敲除PCNA能显著阻止HBV rcDNA向cccDNA的转化,而过表达PCNA能够有效地拯救这一现象(P<0.001)。敲除PCNA可显著减缓HBV rcDNA向cccDNA转化的动力学(P<0.01)。在HBV rcDNA向cccDNA转化的过程中,PCNA的DNA结合域是必需的(P<0.01)。由此获得结论,PCNA通过其DNA结合结构域促进乙肝病毒从rcDNA向cccDNA的转化。在临床上,PCNA可能成为抗病毒治疗的新靶点。 展开更多
关键词 乙型肝炎病毒 闭合松弛环状dna 共价闭合环状dna 增殖细胞核抗原 dna结合域
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肝移植术后乙型肝炎病毒再激活的分子机制研究进展 被引量:2
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作者 杨健 谢炎 +3 位作者 田大治 张骊 张洋铭 蒋文涛 《器官移植》 CAS CSCD 北大核心 2020年第2期298-303,共6页
肝移植是治疗乙型病毒性肝炎(乙肝)相关性肝衰竭、肝硬化和肝细胞癌(肝癌)的最有效方法。然而,肝移植术后乙型肝炎病毒(HBV)再激活不利于移植肝功能恢复且导致预后不良,其防治问题是当前内、外科医师研究的焦点。目前的病毒抑制策略不... 肝移植是治疗乙型病毒性肝炎(乙肝)相关性肝衰竭、肝硬化和肝细胞癌(肝癌)的最有效方法。然而,肝移植术后乙型肝炎病毒(HBV)再激活不利于移植肝功能恢复且导致预后不良,其防治问题是当前内、外科医师研究的焦点。目前的病毒抑制策略不能完全根除HBV,也不能完全预防HBV在未来复发感染。本文旨在探讨肝移植术后HBV再激活的分子机制,以期更有效预防肝移植术后乙肝复发。 展开更多
关键词 肝移植 乙型肝炎病毒 超螺旋共价闭环dna(cccdna) 基因整合 肝外复制 乙型病毒性肝炎复发 丁型肝炎病毒 基因型
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乙型肝炎病毒感染新型生物学标志物的临床意义解析——2017年版欧洲肝病学会《慢性乙型肝炎病毒感染管理临床实践指南》解读 被引量:2
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作者 万谟彬 《中国病毒病杂志》 CAS 2017年第5期328-329,共2页
本文介绍了2017年版欧洲肝病学会《慢性乙型肝炎病毒感染管理临床实践指南》中关于慢性乙型肝炎病毒感染的新型生物学标志物及其临床意义。
关键词 肝炎 乙型 乙型肝炎病毒 生物学标志物 新型 病毒共价闭合环状dna(cccdna) HBV核心相关抗原(HBcrAg) HBV RNA
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环介导等温扩增(LAMP)试剂盒检测石蜡包埋肝组织中乙型肝炎病毒(HBV)共价闭合环状DNA(cccDNA) 被引量:1
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作者 周冬青 刘成永 +7 位作者 王骥 王春颖 张克球 刘加彬 黄海滨 候远沛 成松 王鑫 《复旦学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2015年第2期245-249,共5页
目的建立一种检测石蜡包埋的肝组织中乙型肝炎病毒(hepatitis B virus,HBV)共价闭合环状DNA(covalently closed circular DNA,cccDNA)的新方法,并探讨其应用价值和临床意义。方法提取30例慢性HBV感染患者的石蜡包埋肝组织中的DNA,采用... 目的建立一种检测石蜡包埋的肝组织中乙型肝炎病毒(hepatitis B virus,HBV)共价闭合环状DNA(covalently closed circular DNA,cccDNA)的新方法,并探讨其应用价值和临床意义。方法提取30例慢性HBV感染患者的石蜡包埋肝组织中的DNA,采用质粒安全ATP依赖性DNA酶(plasmid-safe ATP-dependent DNase,PSAD)消化,去除非cccDNA后,加入引物及Bst DNA酶进行环介导等温扩增(loop-mediated isothermal amplification,LAMP),将检测结果与临床实验室资料结合并进行分析,以判断其临床应用价值。结果 30例HBV感染患者中,有17例HBV cccDNA阳性,阳性检测率56.67%。其中肝癌5例、肝硬化4例、重型乙型肝炎5例、慢性乙型肝炎(轻-中度)3例。提示肝组织HBV cccDNA阳性可能与疾病进展密切相关,与血清HBV cccDNA阳性有一定的相关性,与乙型肝炎病毒血清免疫标志物以及肝功能状况无明显相关。结论 LAMP法能检测到石蜡包埋肝组织中的HBV cccDNA,结合临床实验室资料,对判断抗病毒药物疗效及研究乙型肝炎致病机制具有一定的意义。 展开更多
关键词 环介导等温扩增(LAMP) 乙型肝炎病毒(HBV) 共价闭合环状dna(cccdna)
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HBV共价闭合环状DNA Real-time PCR检测方法比较 被引量:2
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作者 曹经琳 窦剑 +1 位作者 周文亭 任贵军 《中华实验和临床病毒学杂志》 CAS CSCD 2017年第1期71-74,共4页
目的 比较HBV共价闭合环状DNA (Covalently closed circular DNA,cccDNA) Real-time PCR检测方法.方法 选择文献中常用的普通Taq-Man探针及Taq-Man MGB探针两种检测方法,合成引物及探针,制备质粒标准品,提取乙肝患者血清及肝组织标本H... 目的 比较HBV共价闭合环状DNA (Covalently closed circular DNA,cccDNA) Real-time PCR检测方法.方法 选择文献中常用的普通Taq-Man探针及Taq-Man MGB探针两种检测方法,合成引物及探针,制备质粒标准品,提取乙肝患者血清及肝组织标本HBV DNA,分别用质粒安全ATP依赖的DNA酶(Plasmid-safe ATP-dependent DNase,PSAD)酶切,进行敏感性、特异性及重复性检测验证.结果 两种检测方法扩增质粒标准品均有良好线性关系(R20.989和0.976),重复性良好(CV<4%);检测PSAD酶切前后质粒、血清及肝组织HBV cccDNA均有良好特异性;检测相同浓度样品时普通Taq-Man探针Ct值较Taq-Man MGB探针略低.结论 两种方法均可用于HBV cccDNA检测,本实验所用的普通Taq-Man探针较Taq-Man MGB探针敏感性略高;MGB探针本底更低.实际工作中可根据需求选择适宜的探针. 展开更多
关键词 肝炎病毒 乙型 共价闭合环状dna(cccdna) REAL-TIME PCR
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鸭肝组织中DHBV cccDNA的实时荧光定量PCR方法的建立 被引量:1
16
作者 王亚文 惠凌云 +6 位作者 张琳 冯艾 王威 马列婷 王全颖 杨广笑 刘正稳 《现代检验医学杂志》 CAS 2014年第4期1-4,172,共5页
目的 建立基于DHBV病毒正、负链缺口区设计引物、沉淀蛋白结合的DNA、酶切消化残留线性DNA的DHBVcccDNA荧光定量PCR方法.方法 根据DHBV cccDNA和rcDNA结构的不同,将引物设计在DHBV DNA负链缺口的两侧.采用十二烷基硫酸钾蛋白质沉淀法分... 目的 建立基于DHBV病毒正、负链缺口区设计引物、沉淀蛋白结合的DNA、酶切消化残留线性DNA的DHBVcccDNA荧光定量PCR方法.方法 根据DHBV cccDNA和rcDNA结构的不同,将引物设计在DHBV DNA负链缺口的两侧.采用十二烷基硫酸钾蛋白质沉淀法分离肝组织中cccDNA和rcDNA.并对提取的DNA进行紫外定量,按照每2UPSAD消化500ng cccDNA,计算PSAD的用量,酶切消化残存的线性DNA.以pBR322/2DHBV Core重组质粒为PCR标准品,通过优化反应体系和扩增条件,建立检测DHBV cccDNA的SYBR Green I实时荧光定量PCR方法,并进行方法学考察和实际应用.结果 优化的PCR扩增产物电泳后可见239 bp的DNA片段,与目标片段长度相同.标准曲线回归方程Y=-4.085 7X+48.805,R2=-0.997 6.方法的灵敏度为103 copies/ml,线性范围可达103~108 copies/ml.方法特异性强,未检出DHV,HBV及E coli DNA.对已感染DHBV的鸭肝组织检测DHBV cccDNA,进行定量,含量从0.36~1733.08 copies/diploid genome.其中分布最广的是10~99 copies/dioploid genome.DHBV cccDNA占总DHBV DNA的比例平均仅为3.86%,范围从0.01%~13.3s%.结论 根据DHBV cccDNA与rcDNA的结构和理化性质的差异,设计能够特异性扩增DHBV cccDNA的荧光定量PCR方法,方法灵敏度高、特异度强,可广泛应用于DHBV和HBV抗病毒治疗策略的相关研究中. 展开更多
关键词 鸭乙肝病毒 cccdna 实时荧光定量PCR
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HBV cccDNA检测临床应用研究进展
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作者 王美容 刘学恩 庄辉 《中国病毒病杂志》 CAS 2011年第5期395-400,共6页
乙型肝炎病毒共价闭合环状DNA(hepatitisBviruscovalentlyclosedcircularDNA,HBVcccDNA)是嗜肝病毒复制过程中产生的一种重要复制中间体,在宿主细胞核内积聚,形成HBVcccDNA池,半衰期长,现有抗病毒药物不能清除,是宿主肝细胞持... 乙型肝炎病毒共价闭合环状DNA(hepatitisBviruscovalentlyclosedcircularDNA,HBVcccDNA)是嗜肝病毒复制过程中产生的一种重要复制中间体,在宿主细胞核内积聚,形成HBVcccDNA池,半衰期长,现有抗病毒药物不能清除,是宿主肝细胞持续感染和抗病毒治疗后产生耐受和停药后复发的关键,受到病毒包膜蛋白及免疫细胞因子等一系列因素的精确调控。随着检测技术灵敏度和特异度的不断提高, 展开更多
关键词 乙型肝炎病毒 HBV dna 共价闭合环状dna(cccdna)
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鸭乙型肝炎病毒cccDNA Taq Man荧光定量PCR的建立 被引量:1
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作者 付美丽 林青 +6 位作者 刘小朋 施水兰 陈少华 郑丽雅 林福海 李东良 陈紫榕 《中华微生物学和免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2007年第7期656-659,共4页
目的建立鸭乙型肝炎病毒(DHBV)cccDNA TaqMan荧光定量PCR方法。方法用pUCm-T载体和PCR纯化产物连接,转染TOP10菌,筛选阳性菌落,提取质粒,制作外标准品;在DHBV基因组负链两侧设计一对引物,并在引物间设计和荧光标记一段TaqMan探针,严格... 目的建立鸭乙型肝炎病毒(DHBV)cccDNA TaqMan荧光定量PCR方法。方法用pUCm-T载体和PCR纯化产物连接,转染TOP10菌,筛选阳性菌落,提取质粒,制作外标准品;在DHBV基因组负链两侧设计一对引物,并在引物间设计和荧光标记一段TaqMan探针,严格优化反应物的组成和扩增条件,建立了DHBV cccDNA TaqMan荧光定量PCR方法。结果最低可检出10~4拷贝/ml;批内误差为0.2%~3.14%,批间误差为2.22%~4.43%;在10~5~10^(12)拷贝/ml之间与C_t值具有很好的线性[Ct=-2.8361 ln(x)+41.45,r=-0.9985]。结论该法是一种灵敏度高、特异性强、较为简便的DHBV cccDNA定量检测技术。 展开更多
关键词 乙型肝炎病毒 脱氧核糖核酸 共价闭合环状 聚合酶链反应
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乙型肝炎病毒共价闭合环状DNA及其检测的研究进展
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作者 苏怀彬 胡接力 黄爱龙 《中国生物制品学杂志》 CAS CSCD 2011年第11期1373-1376,共4页
共价闭合环状DNA(Covalently closed circular DNA,cccDNA)是乙型肝炎病毒(Hepatitis B Virus,HBV)复制的模板,也是慢性乙肝患者持续感染的主要原因。由于核苷类药物对cccDNA无抑制作用,因此不能从根本上清除病毒,也就不能彻底治疗乙肝... 共价闭合环状DNA(Covalently closed circular DNA,cccDNA)是乙型肝炎病毒(Hepatitis B Virus,HBV)复制的模板,也是慢性乙肝患者持续感染的主要原因。由于核苷类药物对cccDNA无抑制作用,因此不能从根本上清除病毒,也就不能彻底治疗乙肝。本文对HBV cccDNA的最新研究进展及检测作一综述。 展开更多
关键词 肝炎病毒 乙型 共价闭合环状dna
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乙型肝炎病毒感染相关性肝癌中HBV cccDNA水平与突变关系的研究 被引量:14
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作者 罗璇 黄瑶 +2 位作者 陈彦猛 黄爱龙 胡源 《重庆医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第6期552-556,共5页
目的:研究乙型肝炎病毒(hepatitis B virus,HBV)感染相关性肝癌(hepatocellular carcinoma,HCC)中HBV共价闭合环状DNA(covalently closed circular DNA,ccc DNA)水平与突变关系。方法:运用特异性荧光定量PCR定量分析了12例肝癌组织和癌... 目的:研究乙型肝炎病毒(hepatitis B virus,HBV)感染相关性肝癌(hepatocellular carcinoma,HCC)中HBV共价闭合环状DNA(covalently closed circular DNA,ccc DNA)水平与突变关系。方法:运用特异性荧光定量PCR定量分析了12例肝癌组织和癌旁组织中乙肝病毒复制水平的表征因子HBV ccc DNA,HBV total DNA及前基因组RNA(pregenome RNA,pg RNA)的表达水平,再用滚环扩增(rolling circle amplification,RCA)特异性扩增癌组织中HBV ccc DNA,测序分析了病毒基因组4个编码调控区域pre C/C、RT、X、pre S中ccc DNA序列的突变。最后检测了肿瘤组织ccc DNA的AP位点。结果:HBV ccc DNA在癌组织的表达水平明显低于癌旁组织(3.32 copies/cell vs.9.64 copies/cell,P=0.029),但是HBV总DNA和pg RNA的表达没有明显差异(16.94 copies/cell vs.12.18 copies/cell,P=0.325,75.54 copies/cell vs.22.46 copies/cell,P=0.128);在肝癌组织中,HBV ccc DNA pre C/C和X区间,G-A突变是主要的突变类型;其次,pre C/C和X区域发生G-A突变的位置上,均更倾向于GA二联核苷酸组合方式,在肝癌中所占比例为37.1%和40%。最后,肿瘤组织中APE1酶处理后,HBV ccc DNA水平明显下降(1 011 copies/μl vs.501.8 copies/μl,P=0.058)。结论:HBV ccc DNA水平在癌组织中明显低于癌旁组织,可能与癌组织中HBV ccc DNA发生大量GA突变及形成的AP位点有关。 展开更多
关键词 乙型肝炎病毒 肝癌 HBV共价闭合环状dna 序列突变
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