DGGE法与常规培养法对稻田蓝细菌多态性分析结果比较 被引量：4

1

作者 宋铁英 林智敏 +2 位作者 郑伟文 LOTTA Martensson ULLA Rusmussen 《中国生态农业学报》 CAS CSCD 2005年第3期140-143,共4页

研究运用蓝细菌和硅藻16SrDNA特异引物,将晚季水稻生长后期稻田土壤中提取的总DNA进行PCR扩增后,以DGGE技术对PCR产物进行分析结果表明,14条DGGE带经克隆测序,经NCBI基因库比对得晚季水稻生长后期存在10种蓝细菌,包括4种Leptolyngbya、1... 研究运用蓝细菌和硅藻16SrDNA特异引物,将晚季水稻生长后期稻田土壤中提取的总DNA进行PCR扩增后,以DGGE技术对PCR产物进行分析结果表明,14条DGGE带经克隆测序,经NCBI基因库比对得晚季水稻生长后期存在10种蓝细菌,包括4种Leptolyngbya、1种Chamaesiphon、1种Nostoc、1种Oscillatoria、2种Syne-chococcus和1种Chroococcidiopsis。同层不同位置土壤中蓝细菌种群亦有所不同,但每个取样点都有一些特有的蓝细菌种类。用常规方法对同一稻田土壤样品进行分离培养,根据蓝细菌鉴定图谱观察到类似Lyngbya、Oscillatori-a、Chroococcidiopsis及Nostoc的蓝细菌,但显微镜下无法准确分类。比较结果表明采用DGGE法比常规培养法能更准确进行蓝细菌多态性鉴定。 展开更多

关键词 dgge法 常规培养法 稻田 蓝细菌 遗传多态性 变性梯度凝胶电泳技术

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松材线虫侵染对马尾松苗不同部位内生细菌菌群结构的影响 被引量：5

2

作者 尹诗恒 张绍勇 +4 位作者 刘骕骦 吴酬飞 王俊伟 李阳 张立钦 《浙江农林大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第4期846-853,共8页

【目的】探究松材线虫Bursaphelenchus xylophilus侵染下松干、松针与根系部位内生细菌菌群的结构变化,可充分挖掘马尾松Pinus massoniana内生细菌资源。【方法】采用变性梯度凝胶电泳(DGGE)及高通量测序技术,对松材线虫侵染下3年生马... 【目的】探究松材线虫Bursaphelenchus xylophilus侵染下松干、松针与根系部位内生细菌菌群的结构变化,可充分挖掘马尾松Pinus massoniana内生细菌资源。【方法】采用变性梯度凝胶电泳(DGGE)及高通量测序技术,对松材线虫侵染下3年生马尾松不同部位内生细菌的结构多样性进行分析。【结果】(1)马尾松不同部位内生细菌菌群结构存在较大差异,菌群多样性从大到小依次为松干、松针、根系。(2)松干部位部分细菌属在侵染15 d时丰度明显增加,但苗木表面并不表现任何症状。(3)马尾松体内共检测到内生细菌442属,分属35门49纲110目210科。其中松干与松针部位的甲基杆菌属Methylobacterium、假平胞菌属Sphingomonas、薄层菌属Hymenobacter、泛菌属Pantoea、假单胞菌属Sphingomonas与短小杆菌属Curtobacterium在侵染过程中相对丰度变化较大。【结论】松材线虫侵染下,马尾松根部基本不受影响,但松干部位内生细菌菌群结构变化极显著,其次是松针。部分内生细菌可能对松材线虫病具有潜在生防效果,有助于后期生防菌株的挖掘。在侵染高峰期实时监测干部内生细菌菌群结构变化,有助于松材线虫病的早期诊断。图5表1参25。 展开更多

关键词 马尾松 松材线虫 内生细菌菌群 dgge技术 高通量测序技术

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苯菌灵胁迫对蜜蜂肠道微生物菌群结构的影响 被引量：4

3

作者 代君君 舒蕊 +5 位作者 刘健 章玉萍 张丽丽 陈明 赵萍 刘震 《中国农学通报》 2020年第26期136-140,共5页

旨在探明蜜蜂主要肠道菌群在药物胁迫下的变化规律,为进一步开展蜜蜂肠道共生菌群的生理功能及蜜蜂的健康养殖等研究提供理论参考。以意大利蜜蜂为材料,用PCR-DGGE分析方法对添食苯菌灵前后蜜蜂肠道微生物菌群结构进行研究。基于微生物... 旨在探明蜜蜂主要肠道菌群在药物胁迫下的变化规律,为进一步开展蜜蜂肠道共生菌群的生理功能及蜜蜂的健康养殖等研究提供理论参考。以意大利蜜蜂为材料,用PCR-DGGE分析方法对添食苯菌灵前后蜜蜂肠道微生物菌群结构进行研究。基于微生物的rDNA不同可变区经PCR后呈现出一条明亮的条带,表明蜜蜂肠道中有细菌和真菌的驻留。其中细菌的16S rDNA的V3可变区的PCR-DGGE显示有5条带,2条主带和3条副带;真菌18S rDNA V1+V2可变区的PCR-DGGE显示有3条带,1条主带和2条副带,表明蜜蜂肠道微生物较为丰富。在苯菌灵药物胁迫下,条带b、e、f、g逐渐变弱甚至消失,预示着蜜蜂肠道中的真菌种类和数目都有所减少,说明添食苯菌灵对肠道微生物具有抑制作用。苯菌灵药物胁迫会造成蜜蜂肠道微生态平衡失调,从而破坏机体正常的生理功能,严重影响到蜜蜂的健康。 展开更多

关键词 蜜蜂 肠道微生物 菌群结构 苯菌灵胁迫 dgge技术

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基于PCR-DGGE和16S rDNA克隆技术研究土壤细菌多样性的实验技术 被引量：1

4

作者 刘秉儒 《农业科学研究》 2014年第3期34-38,共5页

PCR-DGGE是测定土壤微生物多样性常用的技术手段之一,但是提供的微生物多样性信息不够完整,如果与16S rDNA克隆技术相结合,微生物多样性信息更加丰富.PCR-DGGE和16S rDNA克隆实验技术复杂,许多新手没有成熟可靠的经验可借鉴.以土壤细菌... PCR-DGGE是测定土壤微生物多样性常用的技术手段之一,但是提供的微生物多样性信息不够完整,如果与16S rDNA克隆技术相结合,微生物多样性信息更加丰富.PCR-DGGE和16S rDNA克隆实验技术复杂,许多新手没有成熟可靠的经验可借鉴.以土壤细菌多样性研究方法为例,分别从DNA提取与纯化、PCR扩增、DGGE、胶片染色技巧以及16S rDNA克隆技术等环节进行技术体系构建,可供利用该技术的研究人员参考. 展开更多

关键词 PCR-dgge 16S RDNA 克隆技术 土壤细菌多样性 实验技术

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利用PCR-DGGE技术指导高温油藏中功能微生物的分离 被引量：29

5

作者 王君 马挺 +4 位作者 刘静 刘清坤 赵玲侠 梁凤来 刘如林 《环境科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2008年第2期462-468,共7页

采用PCR-DGGE技术对高温油藏的微生物群落进行了多样性分析,并将得到的信息用于指导油藏微生物的分离.本研究通过PCR-DGGE技术对油藏水样中DNA的16S rDNA V3、V8、V9 3个高可变区的扩增产物进行了比较,确定采用可得到更多微生物多样性... 采用PCR-DGGE技术对高温油藏的微生物群落进行了多样性分析,并将得到的信息用于指导油藏微生物的分离.本研究通过PCR-DGGE技术对油藏水样中DNA的16S rDNA V3、V8、V9 3个高可变区的扩增产物进行了比较,确定采用可得到更多微生物多样性信息的V9区引物进行PCR扩增,优势条带序列分析表明,在高温油藏中存在的微生物与GenBank数据库中α,β,γ-变形杆菌和芽孢杆菌的序列相似性最高.利用多元细菌培养技术,以序列信息为指导,采用富集培养、直接培养和特殊培养的方法,从水样中分离出5株高温菌(而传统分离方法只能获得3株),其中3株高温解烃菌分别属于Bacillus属、Geobacillus属和Petrobacter属,它们能够在55℃以上兼性厌氧条件良好生长,对原油的降解率分别为56.5%7、0.01%和31.87%,对原油的降粘率分别为40%、54.55%和29.09%,使原油的凝固点分别降低3.7、5.2和3.1℃.因此,序列指导和改变培养条件是分离更多有效采油微生物的改进方法,这3株高温菌的对原油的作用效果证明其具备提高石油采收率的潜力. 展开更多

关键词 油藏 梯度凝胶变性电泳(dgge) 16SrDNA 高温解烃菌 培养技术

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PCR-DGGE技术在微生物生态学中的应用 被引量：16

6

作者 梁英娟 罗湘南 付红霞 《生物学杂志》 CAS CSCD 2007年第6期58-60,共3页

PCR-DGGE技术是随着现代分子生物学发展起来的一种很重要的分析手段,与传统的种群鉴定方法相比,PCR-DGGE技术具有快速和操作简便等优点,对于不可培养的微生物也能达到分离的效果,因而在微生物生态学中受到普遍关注与重视。介绍了该技术... PCR-DGGE技术是随着现代分子生物学发展起来的一种很重要的分析手段,与传统的种群鉴定方法相比,PCR-DGGE技术具有快速和操作简便等优点,对于不可培养的微生物也能达到分离的效果,因而在微生物生态学中受到普遍关注与重视。介绍了该技术的基本原理、主要影响因素等研究动态以及在微生物生态学中的应用现状,并对其应用前景作了综述。 展开更多

关键词 PCR—dgge 微生物生态学 现代分子生物学技术

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PCR-DGGE技术及其在微生物生态学中的应用 被引量：16

7

作者 张宝涛 王立群 +1 位作者 伍宁丰 石鹏君 《生物信息学》 2006年第3期132-134,142,共4页

现代分子生物学技术PCR-DGGE是一种分析微生物群落的有效工具,可以用于研究生态系统中微生物多样性和群落动态性。本文简要介绍了PCR-DGGE技术原理及其在微生物生态学领域的应用,并对该技术的局限性进行了评价。

关键词 PCR-dgge 微生物生态学 现代分子生物学技术 微生物多样性 微生物群落动态性

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高通量测序技术在传统发酵食品微生物群落中的应用研究 被引量：21

8

作者 夏梦雷 杨帆 +3 位作者 陆锴 王頔 郑宇 王敏 《中国酿造》 CAS 北大核心 2021年第5期1-7,共7页

传统发酵食品风味独特,营养丰富,历史悠久,生产方式多采用自然接种,部分食品的生产工艺已有数千年的历史,其最终质量与发酵过程中存在的多种微生物密切相关。研究表明,运用现代分子生物学技术,可从基因水平上揭示微生物的多样性和群落... 传统发酵食品风味独特,营养丰富,历史悠久,生产方式多采用自然接种,部分食品的生产工艺已有数千年的历史,其最终质量与发酵过程中存在的多种微生物密切相关。研究表明,运用现代分子生物学技术,可从基因水平上揭示微生物的多样性和群落结构的动态变化,系统阐明其发酵机理。该文综述高通量测序技术在传统发酵食品微生物群落中的应用研究,对聚合酶链式反应-变性梯度凝胶电泳(PCR-DGGE)、实时荧光定量聚合酶链式反应(RT-FQPCR)、宏基因组、宏转录组测序等研究方法的原理、操作方法及其研究成果进行了总结,并对各分析技术优缺点进行了比较,旨在为传统发酵食品的微生物群落研究提供参考。 展开更多

关键词 高通量测序技术 传统发酵食品 微生物群落 聚合酶链式反应-变性梯度凝胶电泳 实时荧光定量聚合酶链式反应 宏基因组测序技术 宏转录组测序技术

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生物絮团在罗氏沼虾育苗中的应用 被引量：21

9

作者 刘杜娟 潘晓艺 +6 位作者 尹文林 张宇飞 王军毅 郝贵杰 徐洋 蔺凌云 沈锦玉 《上海海洋大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第1期47-53,共7页

对罗氏沼虾育苗水体连续添加不同浓度的葡萄糖和定量的枯草芽孢杆菌培育生物絮团,自1日龄幼体培育至仔虾,连续监测水体的氨氮、亚硝酸氮、溶解氧、COD、葡萄糖和生物絮团等浓度;通过变性梯度凝胶电泳(DGGE)分析生物絮团中微生物组成,测... 对罗氏沼虾育苗水体连续添加不同浓度的葡萄糖和定量的枯草芽孢杆菌培育生物絮团,自1日龄幼体培育至仔虾,连续监测水体的氨氮、亚硝酸氮、溶解氧、COD、葡萄糖和生物絮团等浓度;通过变性梯度凝胶电泳(DGGE)分析生物絮团中微生物组成,测定出苗率及育成仔虾个体大小。通过27 d室内罗氏沼虾育苗试验发现:各组生物絮团含量无显著差异,应用生物絮团后,葡萄糖终浓度为20 mg/L组的氨态氮和亚硝酸氮明显低于对照组(P<0.05),溶解氧和COD浓度在试验组与对照组之间不存在显著差异。DGGE分析结果和序列测定结果显示,添加葡萄糖和枯草芽孢杆菌制剂产生的生物絮团,条件致病菌气单胞菌属细菌(Aeromonas sp.)显著少于自然产生的生物絮团,并促进水产有益菌芽孢杆菌属细菌(Bacillus sp.)的生长。出苗率及生长测定表明,对照组出苗率为32.60%,20 mg/L试验组为60.60%,比对照组高85.90%。对照组仔虾体长平均值为8.193 mm,20 mg/L试验组体长平均值为10.488 mm,比对照组高28.00%。添加一定浓度葡萄糖和枯草芽孢杆菌产生的生物絮团能有效地控制水质和减少有害细菌的生长。 展开更多

关键词 生物絮团 dgge 罗氏沼虾 育苗 水质控制

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夏季湖泊表层沉积物的理化性质与微生物多样性 被引量：18

10

作者 高慧琴 刘凌 方泽建 《河海大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2011年第4期361-366,共6页

为揭示夏季湖泊表层沉积物理化性质和微生物多样性及二者之间的关系,运用化学方法和PCR-DGGE技术测定里下河地区湖群夏季表层沉积物理化性质(pH值,Eh以及TOC,TP,TN,NH3-N,NO3-N的质量分数(w))和微生物多样性,并用Statistica和Canoco软... 为揭示夏季湖泊表层沉积物理化性质和微生物多样性及二者之间的关系,运用化学方法和PCR-DGGE技术测定里下河地区湖群夏季表层沉积物理化性质(pH值,Eh以及TOC,TP,TN,NH3-N,NO3-N的质量分数(w))和微生物多样性,并用Statistica和Canoco软件分析它们之间的关系.结果表明:表层沉积物pH值呈中性偏弱酸性或弱碱性;除少数采样点外,Eh均处于轻度还原状态;w(TOC),w(TP),w(TN),w(NH3-N)和w(NO3-N)的分布呈现一定的空间差异性;各湖泊微生物多样性也有差异,形成了自己特定生态位的群落结构.Spearman相关分析表明,w(TOC)和w(TN)显著正相关,但微生物群落多样性指标与各理化指标之间均不存在显著相关性;CCA分析结果显示,TOC和TP是影响微生物群落结构的主要环境因子. 展开更多

关键词 湖泊 表层沉积物 微生物多样性 PCR-dgge技术 理化性质

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人工湿地生态系统中的微生物作用及PCR-DGGE技术的应用 被引量：11

11

作者 朱砺之 黄娟 +2 位作者 傅大放 李稹 沈恬宇 《安全与环境工程》 CAS 北大核心 2012年第2期26-30,共5页

人工湿地作为一种经济高效的污水生态处理工艺,可通过植物、微生物、基质三者的协同作用实现污染物的去除。而微生物作为湿地生态系统的重要组成部分,又是污染物去除的积极分解者,发挥了不可忽视的关键作用,其数量、丰度、多样性及群落... 人工湿地作为一种经济高效的污水生态处理工艺,可通过植物、微生物、基质三者的协同作用实现污染物的去除。而微生物作为湿地生态系统的重要组成部分,又是污染物去除的积极分解者,发挥了不可忽视的关键作用,其数量、丰度、多样性及群落结构等均直接影响污水净化效果。本文介绍了湿地生态系统在微生物种群结构、污染物降解机制等方面的国内外研究进展,并针对PCR-DGGE新型分子技术在湿地微生物领域的应用成果进行了探讨,以为湿地生态系统的微生物作用及新型分子技术在其中的应用提供理论支撑和技术支持。 展开更多

关键词 人工湿地 植物 微生物 PCR-dgge技术

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PCR-DGGE研究微生物种群中多条带产生原因分析 被引量：9

12

作者 陈章宝 向少能 +1 位作者 江震献 周泽扬 《微生物学通报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第1期147-154,共8页

鸡肠道微生物菌群经PCR-DGGE分析,回收PCR-DGGE分析胶上的一条DNA片段,回收的DNA片段再重复进行2次PCR-DGGE分析,以及分别用PCR反复循环扩增和PCR高保真酶扩增后再进行DGGE分析等方法研究PCR-DGGE分析中多条带产生原因。结果显示PCR-DGG... 鸡肠道微生物菌群经PCR-DGGE分析,回收PCR-DGGE分析胶上的一条DNA片段,回收的DNA片段再重复进行2次PCR-DGGE分析,以及分别用PCR反复循环扩增和PCR高保真酶扩增后再进行DGGE分析等方法研究PCR-DGGE分析中多条带产生原因。结果显示PCR-DGGE分析中多条带产生原因可能是作PCR扩增模板的DNA混杂有少量其他DNA片段,多条带现象不易被消除。DGGE分析胶上的DNA片段测序时,将该DNA片段回收、PCR扩增后克隆,提取多个阳性克隆菌的质粒DNA片段,分别与其原目的DNA片段进行DGGE分析,在DGGE分析胶上选取与原目的DNA片段处于同一电泳位置的质粒DNA测序,提高测序的准确性。 展开更多

关键词 PCR—dgge技术 多条带 原因分析 微生物种群

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南亚热带不同树种人工林对土壤细菌群落多样性的影响 被引量：9

13

作者 覃鑫浩 梁艳 +1 位作者 陈超凡 覃林 《林业科学研究》 CSCD 北大核心 2021年第4期120-127,共8页

[目的]探讨我国南亚热带地区不同树种人工林对土壤细菌群落多样性的影响,为该地区实施人工林生态系统适应性经营策略的树种选择提供土壤微生物生态学方面的科学依据。[方法]采用PCR-DGGE技术,比较分析位于广西凭祥市中国林业科学研究院... [目的]探讨我国南亚热带地区不同树种人工林对土壤细菌群落多样性的影响,为该地区实施人工林生态系统适应性经营策略的树种选择提供土壤微生物生态学方面的科学依据。[方法]采用PCR-DGGE技术,比较分析位于广西凭祥市中国林业科学研究院热带林业实验中心的4个乡土树种(马尾松、红锥、米老排和火力楠)人工林和外来树种尾巨桉人工林土壤(0~20 cm)细菌群落的丰富度、多样性和均匀度,并探讨了土壤细菌群落多样性与土壤理化性质因子之间的相互关系。[结果]5种不同树种人工林土壤细菌群落多样性之间无显著差异(p>0.05),其土壤细菌群落多样性与土壤全氮和全磷呈显著正相关(p<0.05)。[结论]从土壤细菌群落多样性看,在该地区营建乡土树种人工林与外来桉树人工林的效果无明显差异。 展开更多

关键词 土壤细菌群落 PCR-dgge技术 人工林 南亚热带

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食醋中污染菌的分离与鉴定 被引量：9

14

作者 翟磊 苏姣姣 +3 位作者 刘洋 曹艳花 姚粟 程池 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第3期198-202,共5页

首次关于耐酸乳杆菌是引起食醋变质的报道,旨在为食醋生产企业进行微生物污染控制提供理论依据。采用PCRDGGE技术以及纯培养技术,对正常醋样和污染醋样的微生物群落结构和种类进行了研究,通过对比分析以及回接实验发现了引起食醋变质的... 首次关于耐酸乳杆菌是引起食醋变质的报道,旨在为食醋生产企业进行微生物污染控制提供理论依据。采用PCRDGGE技术以及纯培养技术,对正常醋样和污染醋样的微生物群落结构和种类进行了研究,通过对比分析以及回接实验发现了引起食醋变质的污染菌为耐酸乳杆菌(Lactobacillus acetotolerans)。 展开更多

关键词 PCR-dgge 纯培养技术 耐酸乳杆菌(Lactobacillus acetotolerans)

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运用PCR-DGGE技术分析原料乳中腐败细菌的多样性 被引量：7

15

作者 唐玲 王晓静 +2 位作者 周国君 朱建荣 胡萍 《贵州农业科学》 CAS 北大核心 2013年第5期151-154,共4页

为揭示原料乳中主要的污染细菌种群,从原料乳中提取细菌的总DNA,PCR扩增16SrDNA的V3可变区,再通过DGGE得到指纹图谱。结果表明:原料乳中共检测出12种细菌,说明原料乳中细菌具有较丰富的种群多样性。条带经DNA测序分析表明,猪链球菌(Stre... 为揭示原料乳中主要的污染细菌种群,从原料乳中提取细菌的总DNA,PCR扩增16SrDNA的V3可变区,再通过DGGE得到指纹图谱。结果表明:原料乳中共检测出12种细菌,说明原料乳中细菌具有较丰富的种群多样性。条带经DNA测序分析表明,猪链球菌(Streptococcus suis)、马肠链球菌(Strepto-coccus equinus)和乳酸链球菌(Lactococcus lactis subsp.)是混合原料乳中的优势污染菌,其次为海豚链球菌(Streptococcus iniae)、解没食子酸链球菌(Streptococcus gallolyticus)和1株非培养的细菌(Unculturedbacterium)。 展开更多

关键词 PCR—dgge技术 原料乳 腐败菌 多样性

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循环水系统黏泥细菌群落结构多样性的PCR-DGGE分析 被引量：6

16

作者 马涛 刘芳 +1 位作者 赵朝成 张培 《石油学报（石油加工）》 EI CAS CSCD 北大核心 2011年第3期493-500,共8页

以炼油厂循环冷却水作为接种水,考察了水质条件对生物黏泥中活细菌数量的影响,并利用聚合酶链式反应-变性梯度凝胶电泳(PCR-DGGE)技术分析了不同黏泥中的优势菌种组成、多样性及相似性。结果表明,在中营养水平下(COD=50 mg/L)形成的黏... 以炼油厂循环冷却水作为接种水,考察了水质条件对生物黏泥中活细菌数量的影响,并利用聚合酶链式反应-变性梯度凝胶电泳(PCR-DGGE)技术分析了不同黏泥中的优势菌种组成、多样性及相似性。结果表明,在中营养水平下(COD=50 mg/L)形成的黏泥中含菌量最多,贫营养下的(COD=25 mg/L)最少,但是贫营养下的黏泥中细菌群落多样性最为丰富。3组样品之间,富营养(COD=100 mg/L)与另外2种营养下黏泥中细菌群落结构相似性差别较大。所选19个主要条带与其对应的GenBank中最相近的菌种DNA序列相似度均在97%以上,反映出鉴定结果的准确性。通过16S rDNA序列系统进化树分析发现,有多组菌种在系统发育上具有相近的亲缘关系,但其在不同黏泥中的优势地位由于受到营养水平和生物黏泥空间结构的影响而各不相同。 展开更多

关键词 循环冷却水 生物黏泥 细菌群落多样性 PCR-dgge技术

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PCR-DGGE在废水生物处理技术中的应用 被引量：6

17

作者 熊毅 赵璟 赵鑫 《重庆三峡学院学报》 2010年第3期97-101,共5页

本文围绕分子生物学技术中的PCR-DGGE技术,介绍了PCR-DGGE的技术优缺点,并结合当前的废水处理新技术,尤其是在新型脱氮工艺方面的应用进行综述,并对未来废水生物处理中PCR-DGGE的应用进行了展望.

关键词 PCR-dgge 废水生物处理 新型脱氮工艺

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应用PCR-DGGE技术快速检测病原微生物的研究 被引量：5

18

作者 徐晓东 张孝卫 +3 位作者 杜雪 王兵 李铁军 孔健 《中国卫生检验杂志》 CAS 2011年第5期1058-1060,共3页

目的:建立临床病原微生物的快速检测方法。方法:采用PCR-DGGE技术,PCR扩增标准菌株和检验样品的16S rDNA中的V3可变区序列,通过变性梯度凝胶电泳(DGGE)技术来进行检测,并将电泳检测结果同传统分离培养结果进行对比。结果:PCR-DGGE技术... 目的:建立临床病原微生物的快速检测方法。方法:采用PCR-DGGE技术,PCR扩增标准菌株和检验样品的16S rDNA中的V3可变区序列,通过变性梯度凝胶电泳(DGGE)技术来进行检测,并将电泳检测结果同传统分离培养结果进行对比。结果:PCR-DGGE技术检测样品结果同传统分离培养结果一致。结论:应用PCR-DGGE技术检测病原微生物,快速高效可行。 展开更多

关键词 PCR-dgge技术 病原微生物 快速检测

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DGGE和qPCR联用定量分析环境样品中优势菌群 被引量：4

19

作者 付小花 李艳丽 +1 位作者 乐毅全 王磊 《实验技术与管理》 CAS 北大核心 2012年第9期45-47,50,共4页

精确定量环境样品中特定微生物类群的数量对阐明环境生物治理/修复过程中微生物的功能和效应具有重要意义。该文以土壤样品为例,将PCR-DGGE技术与定量PCR(qPCR)技术联用,定量检测样品中优势微生物类群数量。方法:抽提样品DNA,针对16SrDN... 精确定量环境样品中特定微生物类群的数量对阐明环境生物治理/修复过程中微生物的功能和效应具有重要意义。该文以土壤样品为例,将PCR-DGGE技术与定量PCR(qPCR)技术联用,定量检测样品中优势微生物类群数量。方法:抽提样品DNA,针对16SrDNA进行PCR-DGGE分析,明确样品中的优势菌群;再根据特定优势菌群的基因序列设计适合的定量引物,通过针对特定优势菌群的定量PCR分析,得到样品中优势菌群的数量信息。该方法灵敏度高、重复性好,并且无需培养,最大限度地保持了样品原始群落信息。 展开更多

关键词 优势菌群 定量检测 dgge 定量PCR(qPCR)

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PCR-DGGE技术在城镇供排水系统微生物多样性研究中的应用 被引量：4

20

作者 贾淑宇 张克峰 +4 位作者 逯南南 王明泉 赵清华 孙韶华 贾瑞宝 《安全与环境工程》 CAS 北大核心 2018年第6期60-66,共7页

聚合酶链式反应-变性梯度凝胶电泳(PCR-DGGE)技术已广泛应用于微生物分子生态学领域,成为研究微生物多样性常用的分子检测工具之一。在总结归纳PCR-DGGE技术的原理和特点的基础上,综述了PCR-DGGE技术在城镇供水系统和污水处理系统中微... 聚合酶链式反应-变性梯度凝胶电泳(PCR-DGGE)技术已广泛应用于微生物分子生态学领域,成为研究微生物多样性常用的分子检测工具之一。在总结归纳PCR-DGGE技术的原理和特点的基础上,综述了PCR-DGGE技术在城镇供水系统和污水处理系统中微生物多样性分析等方面的研究进展,并展望了该技术今后的发展方向。 展开更多

关键词 PCR-dgge技术 城镇供水系统 城镇污水处理系统 微生物多样性 微生物群落结构

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