为了进一步了解和认识CuZnSOD基因的结构和功能,揭示CuZnSOD对猪抗氧化机能的影响,寻找与肉质性状相关联的分子标记,文章采用RACE(Rapid amplification of cDNA end)方法,对莱芜猪CuZnSOD基因cDNA进行克隆测序,分析其结构和功能,并用Rea...为了进一步了解和认识CuZnSOD基因的结构和功能,揭示CuZnSOD对猪抗氧化机能的影响,寻找与肉质性状相关联的分子标记,文章采用RACE(Rapid amplification of cDNA end)方法,对莱芜猪CuZnSOD基因cDNA进行克隆测序,分析其结构和功能,并用Real-time PCR检测CuZnSOD基因的表达。结果表明,CuZnSOD基因cDNA序列全长658bp(GenBank登录号:GU944822),包含76bp的5′UTR和120bp的3′UTR序列。全部CDS序列462bp,编码153个氨基酸,分子量为15.9kDa,等电点为6.03。CuZnSOD基因编码的氨基酸序列中,第3氨基酸残基处存在1个O-糖基化位点,第86氨基酸残基处存在1个N-糖基化位点。二级结构中α螺旋仅占1.31%。在进化过程中高度保守,与人、牛、小鼠和褐鼠的编码区同源性分别为87.74%、87.66%、83.44%和83.23%;氨基酸序列同源性分别为90.26%、94.12%、92.21%和91.50%。CuZnSOD存在典型的金属结合配体结构域(GFHVHQFGDNT)。基于蛋白序列所构建的分子进化树表明猪与牛的亲缘关系最近。在mRNA水平上,CuZnSOD是一个广谱表达基因,在大脑、心脏、脾脏、肝脏、肾脏、肺、大肠、小肠、脊髓、肌肉、背膘和胃中都能检测到,其在肾脏、小肠和肺中表达量较高,在心脏和肌肉组织中表达量较低。展开更多
为探索环境胁迫影响昆虫适合度的内在机制,通过cDNA末端快速扩增(rapid amplification of c DNA end,RACE)技术克隆得到荻草谷网蚜Sitobion miscanthi体内超氧化物歧化酶(superoxide dismutase,SOD)基因MnSOD和CuZnSOD的cDNA序列全长,...为探索环境胁迫影响昆虫适合度的内在机制,通过cDNA末端快速扩增(rapid amplification of c DNA end,RACE)技术克隆得到荻草谷网蚜Sitobion miscanthi体内超氧化物歧化酶(superoxide dismutase,SOD)基因MnSOD和CuZnSOD的cDNA序列全长,对该序列进行分析,检测紫外线、高压静电和大麦黄矮病毒(barley yellow dwarf virus,BYDV)胁迫下荻草谷网蚜体内MnSOD和CuZnSOD基因表达量的变化。结果显示,荻草谷网蚜体内MnSOD和CuZnSOD基因的cDNA序列全长分别为1517 bp和954 bp(GenBank登录号分别为MT533627和MT533626),开放阅读框分别为669 bp和459 bp,分别编码222个和152个氨基酸,预测蛋白质相对分子量分别为24.99 kD和15.84 kD。荻草谷网蚜体内MnSOD和CuZnSOD蛋白均与半翅目蚜科昆虫同源蛋白氨基酸序列相似性高,亲缘关系最近。0.50 m W/cm^(2)(低强度)和0.70 m W/cm^(2)(高强度)紫外线胁迫下荻草谷网蚜体内MnSOD基因相对表达量显著上调,分别为对照的2.55倍和1.40倍,高压静电和BYDV胁迫下荻草谷网蚜体内MnSOD基因相对表达量显著下调,分别为对照的32%和14%;但低强度和高强度紫外线胁迫下荻草谷网蚜体内CuZnSOD基因相对表达量均较对照无显著变化,高压静电和BYDV胁迫下荻草谷网蚜体内CuZnSOD基因相对表达量均显著下调,分别为对照的51%和20%。表明SOD基因在荻草谷网蚜适应紫外线、高压静电和BYDV三种环境胁迫中发挥着重要作用。展开更多
文摘为探索环境胁迫影响昆虫适合度的内在机制,通过cDNA末端快速扩增(rapid amplification of c DNA end,RACE)技术克隆得到荻草谷网蚜Sitobion miscanthi体内超氧化物歧化酶(superoxide dismutase,SOD)基因MnSOD和CuZnSOD的cDNA序列全长,对该序列进行分析,检测紫外线、高压静电和大麦黄矮病毒(barley yellow dwarf virus,BYDV)胁迫下荻草谷网蚜体内MnSOD和CuZnSOD基因表达量的变化。结果显示,荻草谷网蚜体内MnSOD和CuZnSOD基因的cDNA序列全长分别为1517 bp和954 bp(GenBank登录号分别为MT533627和MT533626),开放阅读框分别为669 bp和459 bp,分别编码222个和152个氨基酸,预测蛋白质相对分子量分别为24.99 kD和15.84 kD。荻草谷网蚜体内MnSOD和CuZnSOD蛋白均与半翅目蚜科昆虫同源蛋白氨基酸序列相似性高,亲缘关系最近。0.50 m W/cm^(2)(低强度)和0.70 m W/cm^(2)(高强度)紫外线胁迫下荻草谷网蚜体内MnSOD基因相对表达量显著上调,分别为对照的2.55倍和1.40倍,高压静电和BYDV胁迫下荻草谷网蚜体内MnSOD基因相对表达量显著下调,分别为对照的32%和14%;但低强度和高强度紫外线胁迫下荻草谷网蚜体内CuZnSOD基因相对表达量均较对照无显著变化,高压静电和BYDV胁迫下荻草谷网蚜体内CuZnSOD基因相对表达量均显著下调,分别为对照的51%和20%。表明SOD基因在荻草谷网蚜适应紫外线、高压静电和BYDV三种环境胁迫中发挥着重要作用。
