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华东地区新生隐球菌药物敏感性分析 被引量：4
1
作者 朱均昊 韩德忞 +1 位作者 李莉 章强强 《检验医学》 CAS 2016年第9期761-764,共4页
目的探索近年来华东地区分离的新生隐球菌临床株对常用抗真菌药物的体外敏感性。方法采用美国临床实验室标准化协会（CLSI）推荐的M27-A3肉汤微量稀释法检测氟康唑、氟胞嘧啶、两性霉素B、伊曲康唑和伏立康唑对新生隐球菌临床分离株的... 目的探索近年来华东地区分离的新生隐球菌临床株对常用抗真菌药物的体外敏感性。方法采用美国临床实验室标准化协会（CLSI）推荐的M27-A3肉汤微量稀释法检测氟康唑、氟胞嘧啶、两性霉素B、伊曲康唑和伏立康唑对新生隐球菌临床分离株的最低抑菌浓度（MIC）范围,并通过内转录间隔区（ITS）测序法对检测出的耐药和剂量依赖性敏感（SDD）菌株进行进一步鉴定。结果抗真菌药物对96株新生隐球菌的MIC90（MIC范围）为：氟康唑4（0.5~16）μg/m L,氟胞嘧啶4（0.25~64）μg/m L,两性霉素B 0.5（0.03~1）μg/m L,伊曲康唑0.5（0.03~1）μg/m L,伏立康唑0.25（0.03~0.5）μg/m L,所有耐药菌株及SDD菌株的分子鉴定均为新生隐球菌格鲁比变种。结论除伊曲康唑外,华东地区新生隐球菌临床株对抗真菌药物的敏感性高,耐药菌株少,不敏感株以新生隐球菌格鲁比变种为主。 展开更多
关键词 新生隐球菌 药物敏感性 内转录间隔区测序 格鲁比变种
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新生隐球菌格鲁比变种国内菌株的多位点微卫星灶分型 被引量：3
2
作者 朱键 刘莹 +1 位作者 大楠悦子 三上襄 《基础医学与临床》 CSCD 北大核心 2009年第10期1054-1058,共5页
目的应用多位点微卫星灶分型(MLMT)对国内6个城市分离出的新生隐球菌格鲁比变种(Cryptococcus neo-formans var.grubii)进行基因分型,了解该变种的国内基因型分布特征。方法提取已鉴定的43株新生隐球菌格鲁比变种DNA,用PCR对3个微卫星位... 目的应用多位点微卫星灶分型(MLMT)对国内6个城市分离出的新生隐球菌格鲁比变种(Cryptococcus neo-formans var.grubii)进行基因分型,了解该变种的国内基因型分布特征。方法提取已鉴定的43株新生隐球菌格鲁比变种DNA,用PCR对3个微卫星位点(CNG1,CNG2,CNG3)的基因片段进行扩增后测序。再计算每一菌株位点基序重复数(CNG1对应TA重复,CNG2对应GA重复,CNG3对应CAT重复);据基序重复数判定各菌株的基因型。结果所有43株菌中,MLMT-17型占83.72%,该型在临床和环境的菌株中分别占86.67%和70%。MLMT-39、-40是新发现的基因型。结论在我国,MLMT-17是最常见的新生隐球菌格鲁比变种基因型,普遍存在于临床和环境菌株中,表明国内临床新生隐球菌病的感染菌株主要源于本土环境菌株。 展开更多
关键词 新生隐球菌变种格鲁比 多位点微卫星灶分型(MLMT)
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云南省部分地区鸽粪中新型隐球菌格鲁比变种微卫星分型分析 被引量：2
3
作者 陶星辰 程攀 苏鸿雁 《中国病原生物学杂志》 CSCD 北大核心 2016年第2期107-109,共3页
目的对云南部分地区鸽粪分离株新型隐球菌进行多位点微卫星位点(multilocus microsatellite typing,MLMT)分型,了解其种群分布特征。方法对分离自云南省部分地区鸽粪中的152株新型隐球菌提取DNA,分别以CNG1、CNG2、CNG3为引物进行PCR扩... 目的对云南部分地区鸽粪分离株新型隐球菌进行多位点微卫星位点(multilocus microsatellite typing,MLMT)分型,了解其种群分布特征。方法对分离自云南省部分地区鸽粪中的152株新型隐球菌提取DNA,分别以CNG1、CNG2、CNG3为引物进行PCR扩增并测序,计算每一菌株CNG1中TA、CNG2中GA以及CNG3中CAT的重复数,结合不同基序重复数进行MLMT分型。结果采用MLMT法将大理、昭通、曲靖和临沧地区鸽粪分离株新型隐球菌格鲁比变种分为6个基因型,其中MLMT-17型占91.45%,为主要基因型;MLMT-26、29、34、39、40型分别占0.66%、1.97%、0.66%、0.66%和4.60%。结论 MLMT-17是云南省部分地区鸽粪新型隐球菌格鲁比变种中最常见的基因型。 展开更多
关键词 新型隐球菌格鲁比变种 鸽粪 多位点微卫星灶分型
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播散性隐球菌病1例及其实验研究 被引量：1
4
作者 冉梦龙 鲁巧云 +5 位作者 涂平 万喆 杨淑霞 吴艳 李若瑜 王爱平 《中国真菌学杂志》 2011年第4期207-211,共5页
目的播散性隐球菌病1例临床及实验研究。方法患者男,72岁,红皮病1年2个月,口服醋酸泼尼松治疗,双下肢出现结节、溃烂6个月。皮损组织病理、皮损组织真菌培养、尿素酶试验、PCR扩增测序比对明确诊断,同时做胸部及脑部CT。结果皮损组织病... 目的播散性隐球菌病1例临床及实验研究。方法患者男,72岁,红皮病1年2个月,口服醋酸泼尼松治疗,双下肢出现结节、溃烂6个月。皮损组织病理、皮损组织真菌培养、尿素酶试验、PCR扩增测序比对明确诊断,同时做胸部及脑部CT。结果皮损组织病理显示为感染肉芽肿改变,可见大量圆形和椭圆形酵母细胞。皮损组织真菌培养可见酵母样菌落生长,菌株尿素酶试验阳性,ITS区测序比对鉴定为新生隐球菌grubii变种。血清隐球菌荚膜多糖抗原乳胶凝集试验阳性(++++)。胸部CT显示左下肺后基底段空洞性病灶。依据临床及实验室检查确诊为由新生隐球菌grubii变种引起的播散性隐球菌病。给予患者静滴氟康唑400 mg/d治疗2周,之后改口服300 mg/d治疗,3个月后结节性皮损全部消退,胸片显示左肺陈旧性病变,血清隐球菌荚膜多糖抗原乳胶凝集试验阳性(++)。治疗15个月后,血清隐球菌荚膜多糖抗原乳胶凝集试验仍阳性(++)。结论对该病例的临床和实验室研究为临床明确诊断和治疗提供了依据,确定菌种需要进行分子生物学研究。 展开更多
关键词 播散性隐球菌病 新生隐球菌grubii变种 氟康唑 红皮病
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新生隐球菌毒力差异基因型菌株间部分毒力相关基因分析 被引量：1
5
作者 陈玉如 赵亮 +3 位作者 金方 李小玲 曹煜 康颖倩 《中华微生物学和免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2014年第8期577-582,共6页
目的：了解新生隐球菌格鲁比变种（ Cryptococcus neoformans var． grubii）两组毒力差异明显的多位点微卫星型（ multilocus microsatellite typing ， MLMT ）菌株间的差异基因，探讨导致新生隐球菌格鲁比变种间毒力差异的相关基因... 目的：了解新生隐球菌格鲁比变种（ Cryptococcus neoformans var． grubii）两组毒力差异明显的多位点微卫星型（ multilocus microsatellite typing ， MLMT ）菌株间的差异基因，探讨导致新生隐球菌格鲁比变种间毒力差异的相关基因及这些基因的功能。方法根据已有基因组数据，针对可能为新生隐球菌毒力相关的基因设计特异性引物，扩增并测序，通过序列对比分析每个基因在两组微卫星基因型菌株间存在的单核苷酸多态性（single nucleotide polymorphisms ，SNPs）位点，并对引起差异的蛋白质进行分析和预测。结果在成功测序的11个基因中，除2个基因序列完全相同外，其余9个基因在两组毒力差异明显的基因型菌株间分别存在1～4个规律性SNPs，其中，有2个基因中存在非同义SNPs（ non-synonymous SNPs ，nsSNPs ），这2个基因的编码产物分别为沉默信息调节因子2家族成员HST302和UV切除修复蛋白RAD23。另外，在对RAD23蛋白的系统发育分析发现，与真菌界的其他门类相比，在担子菌纲的多数RAD23蛋白与人类的同源基因亲缘关系更近。结论本研究发现了新生隐球菌两种毒力差异明显的微卫星基因型菌株间具有重要功能的两个差异基因（ Rad23和Hst302），且经预测nsSNPs对蛋白结构和功能均有一定影响，而蛋白的具体功能有待通过各项试验进一步深入研究。 展开更多
关键词 新生隐球菌格鲁比变种 微卫星基因分型 毒力 蛋白
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新生隐球菌毒力差异菌株的全基因组测序及毒力相关基因的筛选 被引量：1
6
作者 刘涛华 王颜颜 +4 位作者 陈玉如 赵亮 吕倩 牟丽丽 康颖倩 《中华微生物学和免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2016年第2期103-109,共7页
目的了解及分析新生隐球菌格鲁比变种（Cryptococcus neoformans var grubii）两组毒力差异明显的多位点微卫星型（multilocus microsatellite typing，MLMT）菌株的全基因组序列，筛选出引起其毒力差异的相关基因。方法选取毒力差异最... 目的了解及分析新生隐球菌格鲁比变种（Cryptococcus neoformans var grubii）两组毒力差异明显的多位点微卫星型（multilocus microsatellite typing，MLMT）菌株的全基因组序列，筛选出引起其毒力差异的相关基因。方法选取毒力差异最为明显的不同基因型菌株各1株进行全基因组重测序，运用比较基因组学方法全面分析测序结果，使用非同义SNPs（non-synonymous SNPs，nsSNPs）、无义突变SNPs、产生移码突变InDels的策略广泛筛选差异基因。对筛选出的基因在所有实验菌株中进行DNA测序验证，并提取总RNA，采用快速扩增5’和3’cDNA末端（rapidamplificationof5’and3’cDNAends，RACE）技术，克隆后测序获得对应基因的完整cDNA全长序列信息。结果通过全基因组重测序，环境株IFM56731和临床株IFM56800均分别获得127倍和111倍覆盖率的有效数据。分别对SNPs和InDels数据进行统计分析，应用无义突变SNPs和产生移码突变的InDel分别筛选出3个差异基因。对筛选出的6个基因在所有实验菌株中进行扩增测序，并对其中3个基因进行cDNA的测序分析，最终确定基因CNAG_01032的转录序列位置和结构，并验证了预测的无义突变位点存在于实际的mRNA中。结论本研究通过全基因重测序数据分析证明，应用无义突变SNPs和产生移码突变的InDels进行差异基因筛选的策略具有较好针对性，并筛选出6个潜在与毒力相关的基因，通过对所有实验菌株的测序和对全长cDNA的测序验证，最终筛选出基因CNAG一01032为可能引起菌株毒力差异的基因。 展开更多
关键词 新生隐球菌格鲁比变种 微卫星基因分型 全基因序列分析 毒力
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