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基因组DNA甲基化及组蛋白甲基化 被引量:58
1
作者 王瑞娴 徐建红 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2014年第3期191-199,共9页
在真核生物中,DNA甲基化是一种非常重要的表观遗传学标记,能影响染色质的结构和基因的表达。随着全基因组甲基化测序的发展,全基因组范围内的DNA甲基化水平得以了解。文章概述了基因组中启动子、基因本体、增强子、沉默子和转座子等不... 在真核生物中,DNA甲基化是一种非常重要的表观遗传学标记,能影响染色质的结构和基因的表达。随着全基因组甲基化测序的发展,全基因组范围内的DNA甲基化水平得以了解。文章概述了基因组中启动子、基因本体、增强子、沉默子和转座子等不同元件的DNA甲基化的研究进展,以及DNA甲基化与基因表达调控间的关系。启动子的DNA甲基化对基因的表达有抑制作用,而基因本体的DNA甲基化与基因的表达关系因物种或细胞类型不同而异。增强子的DNA甲基化状态与基因活性呈反比关系,沉默子则相反呈正相关。转座子的DNA高度甲基化抑制其转座活性,从而维持基因组的稳定性。文章还探讨了DNA甲基化与组蛋白甲基化间的相互作用及其对基因表达、可变剪切、转录的调控作用,以及本领域的未来研究方向。 展开更多
关键词 甲基化 cpg 基因本体 组蛋白
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DNA甲基化的生物信息学研究进展 被引量:35
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作者 凡时财 张学工 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2009年第2期143-150,共8页
作为重要的表观遗传学现象之一,DNA甲基化对基因的表达发挥重要的调控功能.随着高通量检测技术的不断发展,对DNA甲基化的生物信息学研究也成为DNA甲基化研究中的一个非常活跃的热点.对生物信息学在DNA甲基化状态的预测、CpG岛不易被甲... 作为重要的表观遗传学现象之一,DNA甲基化对基因的表达发挥重要的调控功能.随着高通量检测技术的不断发展,对DNA甲基化的生物信息学研究也成为DNA甲基化研究中的一个非常活跃的热点.对生物信息学在DNA甲基化状态的预测、CpG岛不易被甲基化的机制研究、探索DNA甲基化同其他表观遗传学现象之间的关系以及DNA异常甲基化同癌症的发生和发展之间的关系等方面的研究进展进行综述. 展开更多
关键词 DNA甲基化 生物信息学研究 cpg 预测 机制 表观遗传学
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肿瘤相关基因过甲基化的研究进展 被引量:18
3
作者 元云飞 李锦清 +1 位作者 杨祖立 汪建平 《癌症》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2002年第11期1267-1277,共11页
最近的研究资料提示DNA序列的改变和Epigenetics(表遗传学或拟遗传学)的机制都参与肿瘤的发生。表遗传学研究基因表达的变化,这种变化可通过减数分裂遗传,但不涉及有关基因DNA序列的改变。DNA甲基化是表遗传学上研究最深入的一种机制,... 最近的研究资料提示DNA序列的改变和Epigenetics(表遗传学或拟遗传学)的机制都参与肿瘤的发生。表遗传学研究基因表达的变化,这种变化可通过减数分裂遗传,但不涉及有关基因DNA序列的改变。DNA甲基化是表遗传学上研究最深入的一种机制,是一种酶介导的化学修饰过程,在DNA的某些碱基上增加一个甲基。在人类和大多数哺乳动物,DNA甲基化仅影响DNA链上鸟嘌呤前的胞嘧啶(CpG)。在启动子区域的DNA甲基化是抑制基因活性的一种重要机制。既往认为抑癌基因失活有两条途径:基因内突变和染色体物质丢失(杂合性丢失LOH或等位基因丢失)。现已确切证明DNA甲基化是肿瘤抑制基因失活的第三种机制,而且在某些情况下是抑癌基因失活的唯一的机制。各种类型肿瘤具有特征性的DNA甲基化模式;同一肿瘤类型,不同病人的肿瘤其甲基化模式也可不一样;DNA甲基化可在细胞恶变之前;因此,检测基因启动子甲基化可用于鉴别肿瘤类型和亚型,有助于早期发现有癌变倾向的细胞;还可作为分子指标预测对化疗的反应和判断预后等。5-氮-2'-脱氧胞苷等去甲基化药物作为抗肿瘤药物的效应,归因于两种机制:细胞毒性和诱导低甲基化。一些临床试验用去甲基化药物治疗实体肿瘤和恶性血液疾病,总体来说有效率不高。许多实验可评估基因的甲基化状态。 展开更多
关键词 研究进展 肿瘤 基因 cpg 甲基化
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胃癌TIMP3基因启动子甲基化及其蛋白表达的研究 被引量:15
4
作者 关志宇 戴冬秋 《世界华人消化杂志》 CAS 北大核心 2006年第2期138-143,共6页
目的:探讨组织金属蛋白酶抑制因子-3(tissue inhibitor of metalloproteinase 3,TIMP3)基因启动子甲基化与其蛋白表达的相关性,并分析 TIMP3基因CpG岛异常甲基化与胃腺癌及其临床病理特征的关联性.方法:应用甲基化特异性PCR(MSP)技术... 目的:探讨组织金属蛋白酶抑制因子-3(tissue inhibitor of metalloproteinase 3,TIMP3)基因启动子甲基化与其蛋白表达的相关性,并分析 TIMP3基因CpG岛异常甲基化与胃腺癌及其临床病理特征的关联性.方法:应用甲基化特异性PCR(MSP)技术和免疫组织化学方法分别检测78例患者的胃正常黏膜组织、胃癌组织及转移淋巴结中,TIMP3 基因启动子甲基化和蛋白表达情况.结果:胃正常黏膜组织、早期、进展期胃癌组织和转移淋巴结中TIMP3基因启动子均有甲基化修饰,其阳性率分别为35.9%(28/78); 85.0%(17/20),89.7%(52/58);转移淋巴结 100%(78/78).胃癌组TIMP3基因启动子甲基化率明显高于胃正常黏膜组(尸<0.05).胃正常黏膜组织TIMP3蛋白表达全部为阳性(100%), 20例早期胃癌中,6例阳性(30%),58例进展期胃癌中,2例阳性(3.4%),在转移淋巴结中全部不表达(0%).胃癌70例蛋白表达阴性的标本中,64例TIMP3基因启动子甲基化阳性 (91.4%),TIMP3蛋白表达与启动子甲基化呈明显负相关(P<0.01).结论:启动子区CpG岛高甲基化是胃癌组织中TIMP3基因表达失活的主要机制,可能成为胃癌分子诊断与病期评估的标志之一. 展开更多
关键词 胃癌 TIMP3 CoG岛 甲基化
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ABO基因启动子CpG岛甲基化与白血病的相关性 被引量:20
5
作者 徐华 鲍国强 +6 位作者 王宝燕 邢荷香 叶世辉 张建耕 郁成雨 檀英霞 章扬培 《中国实验血液学杂志》 CAS CSCD 2008年第2期240-246,共7页
近年来研究发现ABO血型与许多疾病的发生发展相关,某些肿瘤导致A、B血型物质减少的现象已日益引起关注。本研究探讨ABO基因启动子CpG岛甲基化与白血病的相关性。采用流式细胞仪和激光共聚焦显微镜检测了不同血型的健康人群和各种血液病... 近年来研究发现ABO血型与许多疾病的发生发展相关,某些肿瘤导致A、B血型物质减少的现象已日益引起关注。本研究探讨ABO基因启动子CpG岛甲基化与白血病的相关性。采用流式细胞仪和激光共聚焦显微镜检测了不同血型的健康人群和各种血液病患者外周血红细胞表面ABH抗原的相对含量,用PCR和MSP-PCR分别检测血液病患者和健康人ABO基因启动子DNA序列和CpG岛甲基化,以及ABO基因启动子-102位点的甲基化。结果发现,白血病患者均出现不同程度的A、B抗原减少;通过对比检测健康人和患者的ABO基因启动子序列,未发现有序列的不同,说明启动子序列高度保守;利用重亚硫酸盐对DNA样本进行修饰后,通过对健康人和患者的ABO基因启动子序列进行扩增和测序,发现健康人和再生障碍性贫血患者在ABO基因启动子的CpG岛区没有甲基化的位点,而急性髓性白血病(AML)、急性淋巴细胞白血病(ALL)、慢性粒细胞白血病(CML)和部分骨髓增生异常综合征(MDS)患者在位置为-102、-101、-100、-99和-97位置的C碱基均有甲基化的现象。结论:甲基化是造成白血病患者AB抗原下降的原因;-102、-101、-100、-99和-97这几个甲基化位点有可能是白血病的特异性表现;针对-102位点检测结果提示-102位点是否甲基化有可能作为白血病鉴别诊断中一个有意义的分子标识物。 展开更多
关键词 白血病 ABO基因 cpg 基因甲基化 分子标识物
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DNA甲基化与肿瘤 被引量:15
6
作者 王震凯 汪芳裕 《医学研究生学报》 CAS 2011年第6期641-645,共5页
DNA甲基化是最早发现的基因修饰途径之一,可引起染色质结构、DNA构象、DNA稳定性及DNA与蛋白质相互作用方式的改变,控制基因表达。肿瘤中普遍存在DNA甲基化状态的改变,DNA甲基化在肿瘤的发生发展中的作用是当前的研究热点。
关键词 甲基化 cpg 肿瘤
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DNA甲基化与食管癌的关系 被引量:12
7
作者 宋长山 杨光 谭家驹 《中华肿瘤防治杂志》 CAS 2007年第1期71-74,共4页
肿瘤细胞普遍存在DNA甲基化模式的改变,DNA甲基化异常包括原癌基因低甲基化和抑癌基因高甲基化。近年来研究结果表明,在食管癌发生过程中同样存在相关抑癌基因启动子区甲基化导致的基因表达的紊乱。其中由DNA甲基转移酶(DNA methyltrans... 肿瘤细胞普遍存在DNA甲基化模式的改变,DNA甲基化异常包括原癌基因低甲基化和抑癌基因高甲基化。近年来研究结果表明,在食管癌发生过程中同样存在相关抑癌基因启动子区甲基化导致的基因表达的紊乱。其中由DNA甲基转移酶(DNA methyltrans-ferase,DNMT)和去甲基化酶的活性改变导致的抑癌基因CpG岛超甲基化的研究,已成为食管癌发病机制研究中的热点之一。综述DNA甲基化的特点及其抑制基因转录和表达的分子生物学机制;DNA异常甲基化与食管癌发生发展的关系;食管癌相关肿瘤抑制基因的甲基化谱构成了食管癌独特的表遗传学标志;目前常用的甲基化检测手段及各方法的优缺点;DNA甲基化和去甲基化研究的展望及所需要解决的的问题等。 展开更多
关键词 食管肿瘤/遗传学DNA甲基化 cpg
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胃癌患者外周血与胃癌组织中ERCC1基因甲基化的关系及其意义 被引量:12
8
作者 王红兵 陈卫昌 《中国癌症杂志》 CAS CSCD 北大核心 2013年第11期900-903,共4页
背景与目的:胃癌的发生基于基因和表观遗传学机制,表观遗传学的改变在胃癌的发展中起到重要作用。DNA甲基化是目前研究最多、最为深入的一种表观遗传学表达机制。DNA甲基化是一个可逆性过程。核苷酸切除修复交叉互补基因1(excision repa... 背景与目的:胃癌的发生基于基因和表观遗传学机制,表观遗传学的改变在胃癌的发展中起到重要作用。DNA甲基化是目前研究最多、最为深入的一种表观遗传学表达机制。DNA甲基化是一个可逆性过程。核苷酸切除修复交叉互补基因1(excision repair cross-complementing gene 1,ERCC1)是一种DNA损伤修复基因。本研究检测胃癌患者外周血与胃癌组织中ERCC1基因启动子CpG岛甲基化状态,探讨两者的关系及其意义。方法:采用甲基化特异性PCR技术,检测30例胃癌患者外周血、胃癌组织中ERCC1基因启动子CpG岛甲基化状态。结果:胃癌组织中ERCC1基因启动子CpG岛甲基化率为76.7%(23/30),外周血中ERCC1基因启动子CpG岛甲基化率为63.3%(19/30),差异无统计学意义。结论:胃癌患者外周血中的ERCC1基因启动子CpG岛甲基化率与胃癌组织中相似,检测胃癌患者外周血中的ERCC1基因启动子CpG岛甲基化状态为治疗胃癌提供一个简便、快捷、可靠的途径,同时也为以ERCC1基因启动子CpG岛甲基化作为靶点治疗胃癌提供了可靠的理论依据。 展开更多
关键词 胃癌 核苷酸切除修复交叉互补基因1 cpg 甲基化 甲基化特异性PCR
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TSLC1基因甲基化与宫颈癌HeLa细胞凋亡相关性的研究 被引量:9
9
作者 王艳华 黄利鸣 《中国现代医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2007年第21期2575-2578,共4页
目的研究天花粉蛋白诱导宫颈癌HeLa细胞凋亡过程中肿瘤抑制基因TSLC1的甲基化的变化情况,并探讨其在宫颈癌的发生发展中的作用及细胞凋亡和抑癌基因甲基化的相关性,寻找新型的去甲基化药物。方法应用MTT法检测对HeLa细胞增殖抑制的影响... 目的研究天花粉蛋白诱导宫颈癌HeLa细胞凋亡过程中肿瘤抑制基因TSLC1的甲基化的变化情况,并探讨其在宫颈癌的发生发展中的作用及细胞凋亡和抑癌基因甲基化的相关性,寻找新型的去甲基化药物。方法应用MTT法检测对HeLa细胞增殖抑制的影响;流式细胞仪分析天花粉蛋白对宫颈癌HeLa细胞诱导凋亡作用;甲基化特异性PCR技术(MSP)检测天花粉蛋白处理前、后宫颈癌HeLa细胞中TSLC1基因启动子区CpG岛的甲基化的变化情况。结果宫颈癌HeLa细胞中TSLC1基因启动子区CpG岛是呈高度的甲基化状态,经天花粉蛋白处理后,HeLa细胞生长明显受抑,流式细胞仪分析出有特征性的亚二倍体凋亡峰,TSLC1基因启动子区CpG岛无异常甲基化表现。结论天花粉蛋白诱导宫颈癌HeLa细胞凋亡过程中对TSLC1基因有明显的去甲基化作用,可能是新型的甲基化抑制剂,肿瘤细胞凋亡与抑癌基因的甲基化失活之间可能存在某些相关性。并且TSLC1基因甲基化的检测有可能成为宫颈癌的早期诊断和指导临床治疗的又一指标。 展开更多
关键词 TSLC1基因 天花粉蛋白 宫颈癌 cpg 甲基化
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Promoter methylation of tumor suppressor genes in esophageal squamous cell carcinoma 被引量:13
10
作者 Ji-Sheng Li Jian-Ming Ying +3 位作者 Xiu-Wen Wang Zhao-Hui Wang Qian Tao Li-Li Li 《Chinese Journal of Cancer》 SCIE CAS CSCD 2013年第1期3-11,共9页
Esophageal squamous cell carcinoma(ESCC) is a prevalent and fatal cancer in China and other Asian countries.Epigenetic silencing of key tumor suppressor genes(TSGs) is critical to ESCC initiation and progression.Recen... Esophageal squamous cell carcinoma(ESCC) is a prevalent and fatal cancer in China and other Asian countries.Epigenetic silencing of key tumor suppressor genes(TSGs) is critical to ESCC initiation and progression.Recently,many novel TSGs silenced by promoter methylation have been identified in ESCC,and these genes further serve as potential tumor markers for high-risk group stratification,early detection,and prognosis prediction.This review summarizes recent discoveries on aberrant promoter methylation of TSGs in ESCC,providing better understanding of the role of disrupted epigenetic regulation in tumorigenesis and insight into diagnostic and prognostic biomarkers for this malignancy. 展开更多
关键词 基因启动子 抑癌基因 鳞状细胞癌 食管癌 甲基化 肿瘤抑制基因 肿瘤标志物 表观遗传
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前列腺癌中E-钙粘素、p16及雌激素受体基因甲基化的检测及其临床意义 被引量:8
11
作者 姚青 何晓松 +1 位作者 张建民 何杰 《中华男科学杂志》 CAS CSCD 2006年第1期28-31,共4页
目的:研究前列腺病变中E-钙粘素、p16和雌激素受体(ER)基因启动子CpG岛甲基化状况及其与临床资料的关系,探讨基因过甲基化在前列腺癌(PCa)发生发展中的作用及其临床意义。方法:收集石蜡包埋前列腺全切术标本:良性前列腺增生(BPH)13例,... 目的:研究前列腺病变中E-钙粘素、p16和雌激素受体(ER)基因启动子CpG岛甲基化状况及其与临床资料的关系,探讨基因过甲基化在前列腺癌(PCa)发生发展中的作用及其临床意义。方法:收集石蜡包埋前列腺全切术标本:良性前列腺增生(BPH)13例,高级别前列腺上皮内瘤(HGPIN)10例,有随访记录的PCa 20例。采用甲基化特异性PCR(MSP)技术对E-钙粘素、p16和ER基因CpG岛甲基化进行检测。结果:E-钙粘素、p16和ER基因过甲基化在PCa中的发生率分别为30%、25%和65%。非恶性病变(BPH和HGPIN)很少发生DNA过甲基化。结论:PCa的发生及进展与E-钙粘素、p16和ER基因过甲基化密切相关,检测甲基化状况对HGPIN与PCa的鉴别诊断可能有辅助作用。E-钙粘素和ER基因过甲基化可能提示预后差。 展开更多
关键词 前列腺癌 前列腺上皮内瘤 E-钙粘素 P16 雌激素受体 抑癌基因 甲基化 cpg 甲基化特异性PCR
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先天性小耳畸形全基因组甲基化谱的研究 被引量:7
12
作者 宋宇鹏 林琳 +4 位作者 潘博 杨庆华 韩娟 蒋海越 庄洪兴 《中华整形外科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2012年第3期193-198,共6页
目的筛查先天性小耳畸形患者整个基因组存在甲基化水平异常的CpG岛和CpG位点及其相关差异基因,进而探讨基因甲基化水平的异常与先天性小耳畸形发病之间的关系。方法收集2009年7月至2010年12月先天性小耳畸形患者术中废弃的残耳软骨组... 目的筛查先天性小耳畸形患者整个基因组存在甲基化水平异常的CpG岛和CpG位点及其相关差异基因,进而探讨基因甲基化水平的异常与先天性小耳畸形发病之间的关系。方法收集2009年7月至2010年12月先天性小耳畸形患者术中废弃的残耳软骨组织为研究对象共50例(实验组),非耳畸形(耳外伤)患者的正常耳软骨组织34例作为对照。应用NimblegenCpG启动子芯片,对实验组3例及对照组3例样本的基因组DNA进行全基因组28226个CpG岛扫描,筛选存在CpG岛甲基化水平差异的基因;应用SpectroCHIP芯片对实验组47例,对照组31例的差异基因的CpG岛进行各个CpG位点的检测,筛选出存在甲基化水平差异的CpG位点。结果实验组与对照组在全基因组范围内存在36个具有甲基化水平差异的CpG岛,其中有29个与已命名的29个基因相关。经t检验分析,在COL18A1、MYH14、RBMY1A1、ZIC3这4个差异基因的6个CpG位点,2组甲基化水平差异具有统计学意义(P〈0.05),实验组和对照组甲基化水平分别为:COL18A1—2-CpG-170.9783±0.0235、0.9526±0.0589;MYH14-CpG-170.9600±0.0414、0.9284±0.0655;RBMY1A1—1-CpG-3.40.9966±0.0055、0.9914±0.0069;RBMY1A1—1-CpG-130.9648±0.0118、0.9757±0.0127;ZIC3_3-CpG-150.0867±0.0212、0.0543±0.0399;ZIC3—2-CpG-270.3775±0.1816、0.4723±0.0439。结论初步建立了先天性小耳畸形甲基化谱,COL18A1、MYH14、RBMY1A1、ZIC3基因甲基化水平差异可能与小耳畸形的发病相关。 展开更多
关键词 小耳畸形 DNA甲基化 cpg cpg位点
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人原发性肝癌中p16,p15基因CpG岛甲基化研究 被引量:5
13
作者 刘建余 覃扬 +1 位作者 孙芝琳 孙泽芳 《四川大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2002年第S1期127-132,共6页
目的 检测人原发性肝癌中 p16和 p15基因 5’启动子区CpG岛的异常甲基化 ,并分析其与人原发性肝癌发生发展的关系 ,探索其在临床早期基因诊断和治疗中的意义 .方法 用敏感的甲基化特异性PCR检测 2 0例人原发性肝癌患者癌组织、癌旁组... 目的 检测人原发性肝癌中 p16和 p15基因 5’启动子区CpG岛的异常甲基化 ,并分析其与人原发性肝癌发生发展的关系 ,探索其在临床早期基因诊断和治疗中的意义 .方法 用敏感的甲基化特异性PCR检测 2 0例人原发性肝癌患者癌组织、癌旁组织和远癌正常组织中p16 ,p15基因5’CpG岛的甲基化状况 ,统计分析这两个基因 5’CpG岛甲基化与肝癌病理特征的相关性 .结果 2 0例原发性肝癌肝癌组织中 p16和 p15基因 5’CpG岛分别有 6 5 %(13/2 0 )和 5 0 %(10 /2 0 )异常甲基化 ;癌旁组织中 p16和 p15基因 5’CpG岛分别有 6 0 %(12例 )和 4 0 %(8例 )异常甲基化 ;远癌正常组织中p16和 p15基因 5’CpG岛分别有 35 %(7例 )和 2 5 %(5例 )异常甲基化 .p16 ,p15基因 5’CpG岛甲基化在癌组织和癌组织旁、癌组织和远癌组织中均有相关性 .两个基因 5’CpG岛异常甲基化与临床病理特征无显著相关性 .结论 p16和 p15基因 5’CpG岛异常甲基化在人原发性肝癌中频率很高 ,可能在肝癌发生发展中扮演了重要角色 ;而且这可能是一个早期事件 ,其临床早期诊断和基因治疗意义均值得进一步深入研究 . 展开更多
关键词 肝癌 P16基因 P15基因 cpg DNA甲基化
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DNA甲基化与衰老研究进展 被引量:9
14
作者 胡宗福 赵静雯 杨景峰 《生命科学》 CSCD 2014年第10期1026-1031,共6页
DNA甲基化与衰老的研究是近年来生命科学领域研究的热点之一。综述了DNA甲基化理论研究进展和探讨影响甲基化与衰老的主要因素,以揭示两者之间可能存在的联系。
关键词 DNA甲基化 衰老 cpg 甲基化衰老理论 老年性疾病
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非小细胞肺癌11个肿瘤相关基因启动子CpG岛甲基化的研究 被引量:8
15
作者 杨振华 蔡映云 +2 位作者 孙丽华 于坚 朱景德 《临床内科杂志》 CAS 2005年第10期708-710,共3页
目的观测11个基因在非小细胞肺癌中的甲基化谱,探讨肺癌基因诊断的新途径。方法应用甲基化特异性的PCR(m ethyl-spec ific PCR,MSP)。方法检测甲基化率,回收产物测序。结果11个基因中有6个基因在癌组织中的甲基化率均>40%并且高于癌... 目的观测11个基因在非小细胞肺癌中的甲基化谱,探讨肺癌基因诊断的新途径。方法应用甲基化特异性的PCR(m ethyl-spec ific PCR,MSP)。方法检测甲基化率,回收产物测序。结果11个基因中有6个基因在癌组织中的甲基化率均>40%并且高于癌旁组织,6个基因的甲基化率分别是APC 61%,RASSF1 a 55%,p73 45%,p16 INK4 a 43%,CDH13 43%及RAR-β41%,>65岁组RASSF1 a、p16 INK4 a和RAR-β甲基化率高于≤65岁组;吸烟史组APC、RASSF1 a、p16 INK4 a和CDH13的甲基化率高于无吸烟史组;腺癌组APC、CDH13和RAR-β甲基化率高于鳞癌组,而鳞癌组p16 INK4 a甲基化率高于腺癌组;RASSF1 a和p16 INK4 a甲基率随TNM临床分期而逐渐增加。结论6个基因甲基化率的发生具有肿瘤特异性,并且相关基因的甲基化与NSCLC患者的病理生理密切相关,我们的研究为早期诊断NSCLC提供帮助。 展开更多
关键词 非小细胞肺癌 肿瘤相关基因 启动子cpg 甲基化
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哺乳动物CpG岛甲基化研究进展 被引量:8
16
作者 许登高 周扬 潘庆杰 《青岛农业大学学报(自然科学版)》 2012年第4期252-260,266,共10页
DNA甲基化修饰是一种重要的表观遗传修饰,对基因表达调控具有重要影响作用。在哺乳动物中,DNA甲基化主要发生在CpG岛,其通过影响染色质结构、DNA构象、稳定性以及与蛋白质相互作用方式等来发挥作用,调控基因的表达。在转基因动物中,外... DNA甲基化修饰是一种重要的表观遗传修饰,对基因表达调控具有重要影响作用。在哺乳动物中,DNA甲基化主要发生在CpG岛,其通过影响染色质结构、DNA构象、稳定性以及与蛋白质相互作用方式等来发挥作用,调控基因的表达。在转基因动物中,外源基因的表达与DNA的甲基化密切相关,CpG岛甲基化介导的基因沉默往往使外源基因不表达或低表达。而在人类基因组中异常的DNA甲基化常常伴随着疾病的发生。本文通过对哺乳动物中CpG岛甲基化研究现状及甲基化调控基因表达可能的分子机制进行了综述,并对其发展趋势及应用前景进行了展望。 展开更多
关键词 哺乳动物 cpg 甲基化
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人类基因组DNA甲基化数据分析的研究现状 被引量:8
17
作者 凡时财 李承哲 裴云飞 《中国科学:生命科学》 CSCD 北大核心 2015年第5期450-459,共10页
作为人类基因组最为典型的表观遗传现象,DNA甲基化在多种关键生理活动中扮演重要角色.系统分析基因组尺度的DNA甲基化概况意义重大.从Cp G岛等基本定义出发,阐述了高通量DNA甲基化的检测技术以及针对芯片技术与下一代测序技术的低水平... 作为人类基因组最为典型的表观遗传现象,DNA甲基化在多种关键生理活动中扮演重要角色.系统分析基因组尺度的DNA甲基化概况意义重大.从Cp G岛等基本定义出发,阐述了高通量DNA甲基化的检测技术以及针对芯片技术与下一代测序技术的低水平数据处理方法;重点对比了基于机器学习理论对Cp G位点及Cp G岛甲基化水平的预测算法,以及所利用的特征对预测效果的影响与发展趋势;并对DNA差异甲基化在组织特异性、癌症等多种疾病中的计算分析进行了全面的综述. 展开更多
关键词 DNA甲基化 检测技术 预测方法 差异甲基化 cpg
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OPCML、DAPK基因甲基化与宫颈癌CasKi细胞凋亡相关性的研究 被引量:7
18
作者 王艳华 黄利鸣 《中国药理学通报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第4期543-546,共4页
目的研究天花粉蛋白(TCS)诱导宫颈癌CasKi细胞凋亡过程中肿瘤抑制基因OPCML、DAPK甲基化的变化情况,并探讨其在宫颈癌的发生发展中的作用及细胞凋亡和抑癌基因甲基化的相关性,寻找新型的去甲基化药物。方法①应用MTT法检测TCS对CasKi细... 目的研究天花粉蛋白(TCS)诱导宫颈癌CasKi细胞凋亡过程中肿瘤抑制基因OPCML、DAPK甲基化的变化情况,并探讨其在宫颈癌的发生发展中的作用及细胞凋亡和抑癌基因甲基化的相关性,寻找新型的去甲基化药物。方法①应用MTT法检测TCS对CasKi细胞增殖抑制的影响;流式细胞仪分析天花粉蛋白对宫颈癌CasKi细胞诱导凋亡作用;②应用甲基化特异性PCR(MSP)技术检测人宫颈癌细胞OPCML和DAPK基因启动子CpG岛甲基化的状况及天花粉蛋白的去甲基化作用。结果TCS对宫颈癌CasKi细胞生长有明显抑制作用,流式细胞仪检测见特征性的亚二倍体凋亡峰;MSP检测表明宫颈癌CasKi细胞OPCML、DAPK基因启动子区CpG岛呈高度的甲基化状态,TCS处理后OPCML、DAPK基因启动子区CpG岛无异常甲基化表现。结论天花粉蛋白具有抑制宫颈癌CasKi细胞生长、诱导Cas-Ki细胞凋亡和对CasKi细胞OPCML、DAPK基因明显的去甲基化作用;其抑制生长和诱导凋亡作用可能与对OPCML、DAPK基因的去甲基化作用有关。TCS有可能是一种新型的甲基化抑制剂。 展开更多
关键词 OPCML基因 DAPK基因 天花粉蛋白 cpg
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DNA甲基化与系统性红斑狼疮 被引量:7
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作者 袁敏 沈南 +1 位作者 唐元家 罗晓兵 《中国病理生理杂志》 CAS CSCD 北大核心 2009年第11期2217-2220,2224,共5页
Systemic lupus erythematosus (SLE) is an archetypical systemic,autoimmune inflammatory disease,of which the mechanism still not unveiled. Studies on epigenetics in SLE have long been the subject of investigation and a... Systemic lupus erythematosus (SLE) is an archetypical systemic,autoimmune inflammatory disease,of which the mechanism still not unveiled. Studies on epigenetics in SLE have long been the subject of investigation and as part of epigenetics. DNA methylation has been confirmed to play a role in the pathogenesis of SLE. The high autoreactivity of CD4+T cell from SLE patients is associated with DNA hypomethylation. DNA hypomethylation is crucial to induce SLE-like autoimmune disease in SLE-non-susceptible mice. The reactivation of inactive X chromosome by hypomethylation may lead to high incidence of SLE in women. Drug-induced SLE is also connected with DNA hypomethylation. To understand the role of DNA methylation in the onset of SLE comprehensively,we review the findings reported in the literatures about DNA methylation and SLE. 展开更多
关键词 红斑狼疮 系统性 DNA甲基化 cpg X染色体
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DNA甲基化与肿瘤 被引量:6
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作者 孔祥东 王军 张思仲 《浙江肿瘤》 CAS 2000年第2期119-121,共3页
DNA甲基化类型改变是人类肿瘤中最常见的基因变化之一 ,癌基因的低甲基化与抑癌基因的高甲基化在肿瘤发生、发展中的基因表达调控。
关键词 甲基化 CpC岛 甲基转移酶 基因表达 肿瘤
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