-
题名胡葱黄条病毒吉林毛葱分离物全基因组序列测定与分析
被引量：4
- 1
-
-
作者
马俊丰
张宸
张春雨
李小宇
王永志
-
机构
吉林省农业科学院植物保护研究所
-
出处
《中国蔬菜》
北大核心
2020年第6期44-48,共5页
-
基金
国家重点研发计划项目(2017YFD0201604),农业部东北作物有害生物综合治理重点实验室开放课题(DB2018-08)。
-
文摘
使用RT-PCR方法从吉林省疑似感染胡葱黄条病毒(Shallot yellow stripe virus,SYSV)的分蘖洋葱(毛葱)叶片中获得了SYSV吉林毛葱分离物SYSV-JL(MN607702)的全基因组序列。SYSV-JL的全长序列为10427 nt,与GenBank已登录的3条SYSV全长或近全长序列在多个基因上保持着较高的序列一致性,但在P1基因上核苷酸和氨基酸序列一致性较低,分别为69.5%~84.2%和60.9%~76.9%,进一步通过变异分析发现,P1基因包含369个变异位点,表现出较为明显的高变异特征。系统发育分析显示,不同SYSV分离物具有较为明显的地区差异,SYSV-JL分离物与多个中国分离物系统发育关系较近。
-
关键词
胡葱黄条病毒
分蘖洋葱(毛葱)
全基因组
变异分析
-
Keywords
Shallot yellow stripe virus(SYSV)
Tillering onion
complete genome:variation analysis
-
分类号
S436.33
[农业科学—农业昆虫与害虫防治]
-
