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河南省首例输入性基孔肯雅热病例的发现和病原特征分析 被引量:6
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作者 李幸乐 李懿 +5 位作者 王若琳 张白帆 苏佳 郭大城 许汴利 黄学勇 《中华预防医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2019年第4期415-418,共4页
针对河南省2017年首例基孔肯雅热病例开展流行病学调查和病原特征分析。采用荧光定量RT-PCR方法诊断病例,采用金黄地鼠肾细胞BHK-21分离基孔肯雅热病毒,测定病毒全基因序列、开展进化分析。分离株CHIKV/Henan001/2017属于ECSA基因型,与2... 针对河南省2017年首例基孔肯雅热病例开展流行病学调查和病原特征分析。采用荧光定量RT-PCR方法诊断病例,采用金黄地鼠肾细胞BHK-21分离基孔肯雅热病毒,测定病毒全基因序列、开展进化分析。分离株CHIKV/Henan001/2017属于ECSA基因型,与2016年中国香港输入株hk02在E1基因区段核苷酸同源性最为接近(99.8%)。流行病学调查和分子进化分析同时证实河南省2017年首例基孔肯雅热病例为输入性病例,病例未在河南境内引起继发流行。 展开更多
关键词 切昆贡亚病毒 虫媒病毒 基孔肯雅热 全基因测序
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猪圆环病毒2型三株贵州流行株全基因序列分析 被引量:4
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作者 李涛 王开功 +3 位作者 程振涛 周碧君 文明 崔亚兰 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第3期165-170,共6页
为掌握贵州省猪圆环病毒2型(PCV2)流行株的分子生物学资料,对已分离的3株PCV2贵州流行株(GZ-LZ1株、GZ-KY1株和GZ-PX1株)进行全基因克隆与测序,应用生物信息学软件将贵州PCV2流行株与参考株进行核苷酸同源性与系统进化树分析。结果显示,... 为掌握贵州省猪圆环病毒2型(PCV2)流行株的分子生物学资料,对已分离的3株PCV2贵州流行株(GZ-LZ1株、GZ-KY1株和GZ-PX1株)进行全基因克隆与测序,应用生物信息学软件将贵州PCV2流行株与参考株进行核苷酸同源性与系统进化树分析。结果显示,3株PCV2贵州流行株贵州全基因组大小均为1 767 bp,同源性为97.0%-98.3%,与国内外24株参考株同源性为77.5%-99.9%,与国产疫苗株同源性为95.5%-98.2%;系统进化树结果显示,3株PCV2贵州流行株归属PCV2d分支,其中GZ-LZ1株和GZ-PX1株与国内PCV2疫苗YM-SH株的进化关系较远,而GZ-KY1与四川SC-10株、浙江ZJ-38株和黑龙江HLJ-10株的进化关系较近。 展开更多
关键词 猪圆环病毒 2 全基因序列 分离株的遗传分析
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完全型雄激素不敏感综合征雄激素受体基因突变的鉴定与分析 被引量:4
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作者 谢建红 瞿京辉 +1 位作者 肖奇志 周玉球 《中华医学遗传学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2013年第1期99-101,共3页
目的对1例完全型雄激素不敏感综合征(completeandrogeninsensitivitysyndrome,CAIS)患者的雄激素受体(androgenreceptor,AR)基因进行分析,寻找潜在的突变位点,并进一步分析其发病原因。方法提取患者外周血全基因组DNA,扩增位于... 目的对1例完全型雄激素不敏感综合征(completeandrogeninsensitivitysyndrome,CAIS)患者的雄激素受体(androgenreceptor,AR)基因进行分析,寻找潜在的突变位点,并进一步分析其发病原因。方法提取患者外周血全基因组DNA,扩增位于X染色体AR基因8个外显子及邻近外显子与内含子剪切位点DNA序列,对扩增产物直接进行DNA序列测定,与GenBank中的基因序列进行比对。结果该患者AR基因在第6外显子核苷酸序列3507位点缺失一个碱基C而引起移码突变,致使在第808位密码子出现终止密码子(TGA)使得翻译提前终止形成截短的雄激素受体蛋白。该突变可能诱导雄激素受体结合能力发生功能七的变异,导致CAIS的发生。结论AR基因第6外显子核苷酸序列3507位点缺失碱基C引起的移码突变是一种导致CAIS新的基因突变方式,该研究丰富了AR基因突变谱,为了解CAIs的发病机制提供了新的依据。 展开更多
关键词 完全型雄激素不敏感综合征 雄激素受体 基因突变 DNA测序
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A novel mutation in the SRY gene of a Chinese 46,XY female patient with unilateral mixed germ cell tumor
4
作者 Yan-ling DONG Yu-ting YI +6 位作者 Hua-mei HU Rong ZHANG Tao LIU Li-ying ZHOU Li-jie SONG Xin YI Hong YAO 《Journal of Reproduction and Contraception》 CSCD 2016年第2期82-88,共7页
Objective To determine the nosogenetic factors of a 46,XY female with primary amenorrhea and unilateral mixed germ cell tumor.Methods Eight genes associated with 46,XY gonadal dysgenesis were detected in the patient a... Objective To determine the nosogenetic factors of a 46,XY female with primary amenorrhea and unilateral mixed germ cell tumor.Methods Eight genes associated with 46,XY gonadal dysgenesis were detected in the patient and her parents by target region captured-next generation sequencing.Results An insertion of a single nucleotide(adenine) at the coding site 230(c.230231insA) located in the high mobility group(HMG) domain of SRY was revealed,which led to a truncated protein(p.Lys77 fsX 27). This mutation was at position 2655414 of the Y chromosome, supported with 127 unique mapped reads, however, this mutation was not found in the in-house dataset of 1 092 controls. Additionally, none of the candidate gene was detected in the patient’s parents, which indicated that it is a de novo mutation.Conclusion A novel SRY sporadic mutation due to a single nucleotide insertion at position 230(c.230231insA) was identified as the cause of the disease in this patient.Target region captured-next generation sequencing was found to be an effective method for the molecular genetic testing of 46,XY complete gonadal dysgenesis(46,XY CGD). 展开更多
关键词 46 XY complete gonadal dysgenesis(46 XY CGD) SRY gene novel mutation next generation sequencing(NGS)
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用长链RT-PCR技术分析一个完全型雄激素不敏感综合征家系AR基因的突变 被引量:1
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作者 张晓 曾健 +1 位作者 林炎鸿 涂向东 《中华医学遗传学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2017年第1期78-80,共3页
目的分析一例完全型雄激素不敏感综合征(complete androgen insensitivity syndrome,CAIS)患者及其家系成员雄激素受体(androgen receptor,AR)基因的潜在突变。方法提取患者及其家系成员的外周血基因组DNA和总RNA,应用PCR技术扩... 目的分析一例完全型雄激素不敏感综合征(complete androgen insensitivity syndrome,CAIS)患者及其家系成员雄激素受体(androgen receptor,AR)基因的潜在突变。方法提取患者及其家系成员的外周血基因组DNA和总RNA,应用PCR技术扩增X染色体上AR基因的7个外显子,对产物直接进行DNA测序,寻找突变位点;应用PCR-限制性片段长度多态性方法分析相应的基因组片段,进一步确证AR基因的突变位点;用逆转录PCR扩增AR基因,再次验证其突变位点。结果发现患者及其舅舅AR基因第7外显子的第2880个核苷酸G被A替换,引起错义突变,导致第840位密码子CGT突变为CAT,即精氨酸被组氨酸替代。该突变可能引起雄激素受体结合能力的变化,导致CAIS。患者母亲一条AR等位基因的第840位密码子亦存在CGT→CAT改变,另一条等位基因则未发现突变。结论AR基因第7外显子核苷酸序列2880位点碱基G引起的错义突变很可能是引起CAIS的原因。应用长链RT-PCR技术扩增AR基因可为CAIS的分子诊断提供新的方法。 展开更多
关键词 完全型雄激素不敏感综合征 雄激素受体 基因突变 DNA测序
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9例46,XY完全性性腺发育不全患者分子遗传学分析
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作者 王海城 刘宇 +6 位作者 叶荟 倪琳 曹英 孙云龙 肖冰 马彩霞 唐利芳 《上海交通大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2022年第1期63-69,共7页
目的·分析9例46,XY完全性性腺发育不全(complete gonadal dysgenesis,CGD)患者的遗传学病因。方法·应用SRY基因测序、二代测序(next generation sequencing,NGS)和染色体微阵列(chromosome microarray,CMA)等分子诊断技术综... 目的·分析9例46,XY完全性性腺发育不全(complete gonadal dysgenesis,CGD)患者的遗传学病因。方法·应用SRY基因测序、二代测序(next generation sequencing,NGS)和染色体微阵列(chromosome microarray,CMA)等分子诊断技术综合分析9例46,XY CGD患者的基因变异情况。结果·9例46,XY CGD先证者中检出4例携带SRY基因突变,其中2例携带未见报道的SRY基因致病/疑似致病突变,分别为SRY缺失突变和c.208T>C (p.Trp70Arg)错义突变;2例携带已报道的SRY基因致病突变,即c.169C>T (p.Gln57X)和c.264dup (p.Glu89fs*15)。NGS检测出1例MAP3K1基因杂合突变c.1016G>A (p.Arg339Gln),该突变为疑似致病突变。有2例散发病例经NGS检测、CMA分析未发现致病性拷贝数变异(copy number variations,CNVs)。有2例为家族病例,通过对父母为近亲结婚的两姐妹中的妹妹进行全外显子组测序,在筛选纯合区域的纯合变异后未发现明确的致病突变或可能与性发育相关的变异;CNVs分析发现两姐妹DMRT1基因内含子2中有约14 kb纯合缺失(Chr9:866,388-880,086,hg19),扩增覆盖断点的PCR测序显示健康双亲为杂合缺失携带者;而后采用PhastCons软件对内含子的缺失序列进行保守片段分析,发现2个保守的非编码元件(conserved non-coding elements,CNEs)。结论·SRY基因突变是46,XY CGD较常见的遗传学病因;发现2个新的SRY基因致病/疑似致病突变。DMRT1内含子2中14 kb纯合缺失可能是该研究中两姐妹的候选致病突变。采用不同序贯的遗传学方法逐步分析46,XY CGD患者的遗传病因,有助于全面了解46,XY CGD患者的分子病因。 展开更多
关键词 46 XY完全性性腺发育不全 性发育不全 SRY基因 MAP3K1基因 二代测序
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