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睾丸酮丛毛单胞菌QYY降解喹啉的转录组分析
1
作者
许馨
赵雪莹
+3 位作者
霍洪亮
于杨
彭举威
霍明昕
《东北师大学报(自然科学版)》
CAS
北大核心
2020年第4期123-130,共8页
以分离出的一株喹啉降解菌睾丸酮丛毛单胞菌QYY为实验对象,利用转录组测序技术,对喹啉质量浓度为0(C组)、100 mg/L降解6h(Q-100组)及400 mg/L降解7h(Q-400组)条件下的菌株进行了测序分析,研究了睾丸酮丛毛单胞菌对喹啉的降解途径和相关...
以分离出的一株喹啉降解菌睾丸酮丛毛单胞菌QYY为实验对象,利用转录组测序技术,对喹啉质量浓度为0(C组)、100 mg/L降解6h(Q-100组)及400 mg/L降解7h(Q-400组)条件下的菌株进行了测序分析,研究了睾丸酮丛毛单胞菌对喹啉的降解途径和相关基因.结果表明:与对照C组相比,Q-100和Q-400组中分别有上调基因606和915个、下调基因510和685个.其中,参与喹啉降解的bphB基因在两组实验组中均显著上调,ligABC基因在Q-100组中显著上调.此外差异基因主要富集在KEGG数据库中ABC转运系统与能量代谢中,这与底物的识别转运、信号转导、基因表达调控及能量提供有关.
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关键词
喹啉
睾丸酮丛毛单胞菌
qyy
转录组测序
差异表达基因
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职称材料
题名
睾丸酮丛毛单胞菌QYY降解喹啉的转录组分析
1
作者
许馨
赵雪莹
霍洪亮
于杨
彭举威
霍明昕
机构
东北师范大学环境学院
吉林建筑大学市政与环境工程学院
东北师范大学环境学院
出处
《东北师大学报(自然科学版)》
CAS
北大核心
2020年第4期123-130,共8页
基金
国家自然科学基金资助项目(51678273,51978132)
吉林自然科学基金资助项目(20180101083JC).
文摘
以分离出的一株喹啉降解菌睾丸酮丛毛单胞菌QYY为实验对象,利用转录组测序技术,对喹啉质量浓度为0(C组)、100 mg/L降解6h(Q-100组)及400 mg/L降解7h(Q-400组)条件下的菌株进行了测序分析,研究了睾丸酮丛毛单胞菌对喹啉的降解途径和相关基因.结果表明:与对照C组相比,Q-100和Q-400组中分别有上调基因606和915个、下调基因510和685个.其中,参与喹啉降解的bphB基因在两组实验组中均显著上调,ligABC基因在Q-100组中显著上调.此外差异基因主要富集在KEGG数据库中ABC转运系统与能量代谢中,这与底物的识别转运、信号转导、基因表达调控及能量提供有关.
关键词
喹啉
睾丸酮丛毛单胞菌
qyy
转录组测序
差异表达基因
Keywords
quinoline
comamonas
testosterone
qyy
transcriptome
sequencing
differentially
expressed
genes
分类号
X172 [环境科学与工程—环境科学]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
睾丸酮丛毛单胞菌QYY降解喹啉的转录组分析
许馨
赵雪莹
霍洪亮
于杨
彭举威
霍明昕
《东北师大学报(自然科学版)》
CAS
北大核心
2020
0
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