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薏苡转录组中密码子使用偏好性分析
被引量：
2
1
作者
张重菊
赵懿琛
赵德刚
《种子》
北大核心
2022年第4期13-19,共7页
密码子是生物的重要组成部分,生物体在进化过程中面对复杂多变的环境会偏好使用一部分密码子来提高适应环境的能力,对物种密码子使用模式进行分析,有利于该物种基因的异源表达。本研究使用Codon W软件对薏苡转录组中54275个基因密码子...
密码子是生物的重要组成部分,生物体在进化过程中面对复杂多变的环境会偏好使用一部分密码子来提高适应环境的能力,对物种密码子使用模式进行分析,有利于该物种基因的异源表达。本研究使用Codon W软件对薏苡转录组中54275个基因密码子进行分析,统计密码子的相对使用频率(Relative Synonymous Codon Usage,RSCU),确定了薏苡的26个偏好密码子。这些偏好密码子大多以C和U结尾,通过GC 12-GC_(3)和ENC-GC_(3)关联分析及PR 2-plot偏倚分析,发现薏苡密码子除了受到碱基突变的影响外,还受到了自然选择和其他因素的影响。通过分析将薏苡和其他生物的密码子使用频率,发现薏苡密码子使用频率与其他生物存在一定的差异,但与高粱和拟南芥的差异较小,所以拟南芥或许是异源表达的最佳转化供体。
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关键词
薏苡
转录组
偏好密码子
碱基突变
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职称材料
正交设计优选薏苡茎多糖的酶提取工艺
被引量：
4
2
作者
郭立强
黄礼德
+4 位作者
张照平
潘廷啟
文全泰
颜祖弟
黄锁义
《安徽农业科学》
CAS
2012年第21期10876-10877,共2页
[目的]确定薏苡茎多糖的最佳酶提取工艺。[方法]利用纤维素酶从薏苡茎中提取多糖,采用正交试验方法进行条件优选,并用分光光度法对提取物进行多糖的含量测定。[结果]检测波长为490 nm;葡萄糖含量在0.010～0.100 mg/ml范围内与吸光度呈...
[目的]确定薏苡茎多糖的最佳酶提取工艺。[方法]利用纤维素酶从薏苡茎中提取多糖,采用正交试验方法进行条件优选,并用分光光度法对提取物进行多糖的含量测定。[结果]检测波长为490 nm;葡萄糖含量在0.010～0.100 mg/ml范围内与吸光度呈良好的线性关系(R=0.999 8);最佳酶提取工艺为:pH值为5,酶用量为6.0 ml,反应温度为40℃,酶解时间为150 min;在此条件下,薏苡茎多糖的平均提取率为19.62%,RSD为0.21%。[结论]优选出的酶提取工艺合理,经济,可行。
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关键词
薏苡茎
多糖
纤维素酶
正交设计
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职称材料
题名
薏苡转录组中密码子使用偏好性分析
被引量：
2
1
作者
张重菊
赵懿琛
赵德刚
机构
贵州大学山地植物资源保护与种质创新省部共建教育部重点实验室/生命科学学院/茶学院
贵州省农业科学院
出处
《种子》
北大核心
2022年第4期13-19,共7页
基金
贵州省农委《薏苡分子育种研究与示范》
贵州省高层次创新人才培养项目(黔科合人才[2016]4003号)。
文摘
密码子是生物的重要组成部分,生物体在进化过程中面对复杂多变的环境会偏好使用一部分密码子来提高适应环境的能力,对物种密码子使用模式进行分析,有利于该物种基因的异源表达。本研究使用Codon W软件对薏苡转录组中54275个基因密码子进行分析,统计密码子的相对使用频率(Relative Synonymous Codon Usage,RSCU),确定了薏苡的26个偏好密码子。这些偏好密码子大多以C和U结尾,通过GC 12-GC_(3)和ENC-GC_(3)关联分析及PR 2-plot偏倚分析,发现薏苡密码子除了受到碱基突变的影响外,还受到了自然选择和其他因素的影响。通过分析将薏苡和其他生物的密码子使用频率,发现薏苡密码子使用频率与其他生物存在一定的差异,但与高粱和拟南芥的差异较小,所以拟南芥或许是异源表达的最佳转化供体。
关键词
薏苡
转录组
偏好密码子
碱基突变
Keywords
coix
lachrymal
-
jobi
l
.
transcriptome
preferred
codon
base
mutation
分类号
S519 [农业科学—作物学]
下载PDF
职称材料
题名
正交设计优选薏苡茎多糖的酶提取工艺
被引量：
4
2
作者
郭立强
黄礼德
张照平
潘廷啟
文全泰
颜祖弟
黄锁义
机构
右江民族医学院
出处
《安徽农业科学》
CAS
2012年第21期10876-10877,共2页
基金
广西自然科学基金资助课题(2011GXNSFA018046)
广西中医药科技专项资助课题(GZKZ 10-128)
+3 种基金
广西教育厅课题(201106LX425)
广西中医药管理局课题(gzzc1047)
广西医学科学实验中心开放基金专项资助项目(KFJJ2011-04)
右江民族医学院民族医药协会资助项目(20110715)
文摘
[目的]确定薏苡茎多糖的最佳酶提取工艺。[方法]利用纤维素酶从薏苡茎中提取多糖,采用正交试验方法进行条件优选,并用分光光度法对提取物进行多糖的含量测定。[结果]检测波长为490 nm;葡萄糖含量在0.010～0.100 mg/ml范围内与吸光度呈良好的线性关系(R=0.999 8);最佳酶提取工艺为:pH值为5,酶用量为6.0 ml,反应温度为40℃,酶解时间为150 min;在此条件下,薏苡茎多糖的平均提取率为19.62%,RSD为0.21%。[结论]优选出的酶提取工艺合理,经济,可行。
关键词
薏苡茎
多糖
纤维素酶
正交设计
Keywords
coix
lachrymal
-
jobi
l
.stems
Po
l
ysaccharides
Ce
l
l
u
l
ase
Orthogona
l
design
分类号
S567 [农业科学—中草药栽培]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
薏苡转录组中密码子使用偏好性分析
张重菊
赵懿琛
赵德刚
《种子》
北大核心
2022
2
下载PDF
职称材料
2
正交设计优选薏苡茎多糖的酶提取工艺
郭立强
黄礼德
张照平
潘廷啟
文全泰
颜祖弟
黄锁义
《安徽农业科学》
CAS
2012
4
下载PDF
职称材料
已选择
0
条
导出题录
引用分析
参考文献
引证文献
统计分析
检索结果
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