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轮叶党参EST-SSR标记的开发及在党参属中的应用
被引量:
8
1
作者
刘新星
石有太
+3 位作者
罗俊杰
欧巧明
陈子萱
李忠旺
《中草药》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第13期3110-3115,3121,共7页
目的开发EST-SSR标记,分析其在党参属及近缘属种间的通用性。方法利用MISA软件对轮叶党参在NCBI公布的EST序列进行SSR位点查找,Primer 3.0软件设计引物,经PCR扩增和琼脂糖凝胶电泳对引物进行初步筛选,聚丙烯酰胺凝胶电泳对所筛选的引物...
目的开发EST-SSR标记,分析其在党参属及近缘属种间的通用性。方法利用MISA软件对轮叶党参在NCBI公布的EST序列进行SSR位点查找,Primer 3.0软件设计引物,经PCR扩增和琼脂糖凝胶电泳对引物进行初步筛选,聚丙烯酰胺凝胶电泳对所筛选的引物进行多态性检测。结果共查找到204个EST-SSR位点,总长5 263 bp,平均长度25.80 bp,出现频率为22.97%,其中单核苷酸、二核苷酸和六核苷酸重复占比最多,分别为36.8%、24.8%和15.3%。单核苷酸、二核苷酸、六核苷酸中的主要重复基元类型是A、TG和CAGCTC/GTGGCA。共设计引物112对,以党参为模板,能够扩增出清晰稳定条带的引物有67对,有效引物比率59.82%,其中27对能扩增出多态性条带,多态引物比率24.11%。随机选取5对引物对党参属及桔梗共12份材料进行PCR扩增,聚类结果将党参属和桔梗属分为2大类。结论研究筛选出的EST-SSR标记能够在党参属及近缘属内进行区分鉴别,研究结果为党参种质鉴别、遗传多样性分析及资源的评价利用等提供了重要技术手段。
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关键词
轮叶党参
EST-SSR
党参属
分子标记
鉴别
原文传递
轮叶党参的组织培养及植株再生研究
被引量:
12
2
作者
彭金环
于元杰
张美珍
《西北植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2010年第1期184-189,共6页
以轮叶党参为材料,研究了不同外植体、激素组合、培养基及光照条件对愈伤组织诱导及植株再生的影响。结果表明,叶片是轮叶党参组织培养较为合适的外植体。外植体在添加0.5 mg.L-12,4-D+1.0 mg.L-16-BA+0.5 mg.L-1KT的MS培养基上愈伤组...
以轮叶党参为材料,研究了不同外植体、激素组合、培养基及光照条件对愈伤组织诱导及植株再生的影响。结果表明,叶片是轮叶党参组织培养较为合适的外植体。外植体在添加0.5 mg.L-12,4-D+1.0 mg.L-16-BA+0.5 mg.L-1KT的MS培养基上愈伤组织诱导率最高可达100%;愈伤组织转移到附加0.75 mg.L-16-BA+0.5 mg.L-1NAA的MS培养基进行继代培养,增殖后的愈伤组织转移到附加0.5 mg.L-16-BA+0.2 mg.L-1NAA的1/2 MS分化培养基进行分化,其分化率达89.4%;将分化出的芽转接到附加0.2 mg.L-1IAA+0.2 mg.L-1NAA的1/2 MS培养基,生根率达92.5%。暗培养诱导出愈伤组织后转到16 h.d-1光照条件下,愈伤组织增殖倍数和分化率显著提高,再生苗健壮,长势强。
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关键词
轮叶党参
组织培养
愈伤组织
光照
分化
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职称材料
基于MaxEnt和ArcGIS模型的山海螺生长适宜区预测分析
被引量:
4
3
作者
庄怡雪
李敏
+4 位作者
陆一南
徐水宇
陈懿冲
陈艳柠
杨成梓
《中药材》
CAS
北大核心
2022年第10期2335-2339,共5页
目的:利用山海螺中国分布点的205条地理分布信息及55个环境因子,采用最大熵(MaxEnt)模型结合地理信息系统(ArcGIS)对山海螺的全国适宜性分布区进行预测。方法:采用刀切法(Jackknife)与贡献率筛选主导环境因子,选用受试者工作特征曲线(RO...
目的:利用山海螺中国分布点的205条地理分布信息及55个环境因子,采用最大熵(MaxEnt)模型结合地理信息系统(ArcGIS)对山海螺的全国适宜性分布区进行预测。方法:采用刀切法(Jackknife)与贡献率筛选主导环境因子,选用受试者工作特征曲线(ROC曲线)验证模型的精确度,最后采用ArcGIS软件运算预测山海螺的全国适宜性分布区。结果:MaxEnt模型预测精度较高(AUC>0.9),符合预测要求。综合分析得出影响山海螺生长的主导因子共5个,均为降水量相关因子;山海螺的全国适宜性分布区域与中国植物志的记载稍有不同,最适宜生长地区主要为分布于东北地区的辽宁省,华东地区的福建省、江西省、浙江省、安徽省以及中南地区的湖南省、广东省和广西壮族自治区。中国植物志未记载的西南地区亦可有分布,为低适宜生长区。结论:该结果对山海螺扩大种植面积和提高栽培技术等实践工作具有指导意义。
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关键词
山海螺
最大熵模型
ARCGIS
适宜性分布区
生态因子
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职称材料
题名
轮叶党参EST-SSR标记的开发及在党参属中的应用
被引量:
8
1
作者
刘新星
石有太
罗俊杰
欧巧明
陈子萱
李忠旺
机构
甘肃省农业科学院生物技术研究所
出处
《中草药》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第13期3110-3115,3121,共7页
基金
甘肃省农业科学院中青年基金项目(2016GAAS52)
甘肃省农业科学院科技支撑计划(2016GAAS59)
甘肃省农业科学院科技创新工程学科团队项目(2015GAAS02)
文摘
目的开发EST-SSR标记,分析其在党参属及近缘属种间的通用性。方法利用MISA软件对轮叶党参在NCBI公布的EST序列进行SSR位点查找,Primer 3.0软件设计引物,经PCR扩增和琼脂糖凝胶电泳对引物进行初步筛选,聚丙烯酰胺凝胶电泳对所筛选的引物进行多态性检测。结果共查找到204个EST-SSR位点,总长5 263 bp,平均长度25.80 bp,出现频率为22.97%,其中单核苷酸、二核苷酸和六核苷酸重复占比最多,分别为36.8%、24.8%和15.3%。单核苷酸、二核苷酸、六核苷酸中的主要重复基元类型是A、TG和CAGCTC/GTGGCA。共设计引物112对,以党参为模板,能够扩增出清晰稳定条带的引物有67对,有效引物比率59.82%,其中27对能扩增出多态性条带,多态引物比率24.11%。随机选取5对引物对党参属及桔梗共12份材料进行PCR扩增,聚类结果将党参属和桔梗属分为2大类。结论研究筛选出的EST-SSR标记能够在党参属及近缘属内进行区分鉴别,研究结果为党参种质鉴别、遗传多样性分析及资源的评价利用等提供了重要技术手段。
关键词
轮叶党参
EST-SSR
党参属
分子标记
鉴别
Keywords
codonopsis
lanceolata
(
sieb
.
et
zucc
.)
EST-SSR
codonopsis
Wall.
ex
Roxb
molecular
markers
identify
分类号
R282.12 [医药卫生—中药学]
原文传递
题名
轮叶党参的组织培养及植株再生研究
被引量:
12
2
作者
彭金环
于元杰
张美珍
机构
山东农业大学农学院
山东省章丘市农业局
出处
《西北植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2010年第1期184-189,共6页
文摘
以轮叶党参为材料,研究了不同外植体、激素组合、培养基及光照条件对愈伤组织诱导及植株再生的影响。结果表明,叶片是轮叶党参组织培养较为合适的外植体。外植体在添加0.5 mg.L-12,4-D+1.0 mg.L-16-BA+0.5 mg.L-1KT的MS培养基上愈伤组织诱导率最高可达100%;愈伤组织转移到附加0.75 mg.L-16-BA+0.5 mg.L-1NAA的MS培养基进行继代培养,增殖后的愈伤组织转移到附加0.5 mg.L-16-BA+0.2 mg.L-1NAA的1/2 MS分化培养基进行分化,其分化率达89.4%;将分化出的芽转接到附加0.2 mg.L-1IAA+0.2 mg.L-1NAA的1/2 MS培养基,生根率达92.5%。暗培养诱导出愈伤组织后转到16 h.d-1光照条件下,愈伤组织增殖倍数和分化率显著提高,再生苗健壮,长势强。
关键词
轮叶党参
组织培养
愈伤组织
光照
分化
Keywords
codonopsis
lanceolata
(
sieb
.
et
zucc
.)
Trautv.
tissue
culture
callus
illumination
differentiation
分类号
Q813.12 [生物学—生物工程]
下载PDF
职称材料
题名
基于MaxEnt和ArcGIS模型的山海螺生长适宜区预测分析
被引量:
4
3
作者
庄怡雪
李敏
陆一南
徐水宇
陈懿冲
陈艳柠
杨成梓
机构
福建中医药大学药学院
福建省级中药原料质量监测技术服务中心
出处
《中药材》
CAS
北大核心
2022年第10期2335-2339,共5页
基金
2019年中医药公共卫生服务补助专项“全国中药资源普查项目”(财社[2019]39号)
文摘
目的:利用山海螺中国分布点的205条地理分布信息及55个环境因子,采用最大熵(MaxEnt)模型结合地理信息系统(ArcGIS)对山海螺的全国适宜性分布区进行预测。方法:采用刀切法(Jackknife)与贡献率筛选主导环境因子,选用受试者工作特征曲线(ROC曲线)验证模型的精确度,最后采用ArcGIS软件运算预测山海螺的全国适宜性分布区。结果:MaxEnt模型预测精度较高(AUC>0.9),符合预测要求。综合分析得出影响山海螺生长的主导因子共5个,均为降水量相关因子;山海螺的全国适宜性分布区域与中国植物志的记载稍有不同,最适宜生长地区主要为分布于东北地区的辽宁省,华东地区的福建省、江西省、浙江省、安徽省以及中南地区的湖南省、广东省和广西壮族自治区。中国植物志未记载的西南地区亦可有分布,为低适宜生长区。结论:该结果对山海螺扩大种植面积和提高栽培技术等实践工作具有指导意义。
关键词
山海螺
最大熵模型
ARCGIS
适宜性分布区
生态因子
Keywords
codonopsis
lanceolata
(
sieb
.
et
zucc
.)Trautv.
MaxEnt
ArcGIS
Suitability
distribution
area
Ecological
factor
分类号
R282.71 [医药卫生—中药学]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
轮叶党参EST-SSR标记的开发及在党参属中的应用
刘新星
石有太
罗俊杰
欧巧明
陈子萱
李忠旺
《中草药》
CAS
CSCD
北大核心
2018
8
原文传递
2
轮叶党参的组织培养及植株再生研究
彭金环
于元杰
张美珍
《西北植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2010
12
下载PDF
职称材料
3
基于MaxEnt和ArcGIS模型的山海螺生长适宜区预测分析
庄怡雪
李敏
陆一南
徐水宇
陈懿冲
陈艳柠
杨成梓
《中药材》
CAS
北大核心
2022
4
下载PDF
职称材料
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