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题名基于高通量测序的银木内生细菌多样性分析
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作者
余劲夫
康凯丽
涂继红
王朴
江杰
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机构
武汉市园林科学研究院
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出处
《河北农业科学》
2024年第1期74-80,共7页
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基金
上海市科学技术委员会科研计划项目(17DZ1202801)
武汉市园林和林业局科研项目“武汉城市智慧园林土壤监测管理信息系统及应用”(WHGF2020A01下达文号武园林发(2020)22号)。
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文摘
近年来城市绿地盐碱化问题持续加重,南方常见绿化树种樟树多出现长势衰弱和叶片黄化现象。武汉市园林科学研究院通过长期研究发现,樟科植物银木(Cinnamomum septentrionale Hand. Mazz)相对于樟科其他植物具有长势良好、耐盐碱、树形挺拔等诸多优势,是优秀的园林行道绿化树种。为了进一步对这一优良绿化树种展开研究,探究其茎和叶片内生细菌的种类、功能以及群落结构,采用高通量测序技术,对栽种于武汉市园林科学研究院的1 a生盆栽银木进行了生物多样性分析以及微生物群落鉴定。结果表明:银木茎、叶片中内生菌有效序列分别为89 434和95 218条,有效序列平均长度均为406 bp,银木茎内生细菌的Chao1指数、Simpson指数和Shannon指数均高于叶片。银木茎和叶片内生菌在门水平上的优势菌群为厚壁菌门(Firmicutes)、变形菌门(Proteobacteria)、蓝藻门(Cyanobacteria)、拟杆菌门(Bacteroidetes)和放线菌门(Actinobacteria)。银木叶片与茎内生菌属水平群落结构差异不大。尽管不同植物内生菌菌落结构存在显著差异,但内生菌的功能基因数量存在一定程度的相似性。对银木内生菌功能基因的表达状况进行分析,发现银木茎与叶片内生菌在功能基因的表达上具有显著差异,猜测这与银木茎木质化程度较叶片高,内生细菌定植环境存在较大差异有关。
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关键词
银木
内生菌
优势菌群
群落结构
功能预测
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Keywords
cinnamommum septentrionale
Endophytes
Dominant bacteria
Community structure
Functional prediction
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分类号
S792.23
[农业科学—林木遗传育种]
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