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用EST-SSR分子标记技术构建大白菜核心种质及其指纹图谱库 被引量:47
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作者 李丽 何伟明 +4 位作者 马连平 刘庞源 徐海明 徐家柄 郑晓鹰 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2009年第1期76-88,共13页
利用EST-SSR分子标记对大白菜种质资源基因库中686份样品所代表的1900份大白菜种质资源进行分析研究。构建大白菜种质资源的核心种质并且形成核心种质的EST-SSR指纹图谱库。结果表明利用4组鉴定白菜品种的EST-SSR的特异性标记组合,获得... 利用EST-SSR分子标记对大白菜种质资源基因库中686份样品所代表的1900份大白菜种质资源进行分析研究。构建大白菜种质资源的核心种质并且形成核心种质的EST-SSR指纹图谱库。结果表明利用4组鉴定白菜品种的EST-SSR的特异性标记组合,获得近158个EST-SSR多态的标记,对大白菜种质资源基因库中686份样品所代表的1900份大白菜种质资源进行核心种质的构建提供了分析数据。形成的核心种质包括168份样品,占库存资源的8.8%,它的多态位点百分率保持了原群体的100%。所构建的核心种质涵盖了原资源的绝大部分区域来源的品种,包含了早、中、晚熟品种中所有典型的大白菜类型和其相关的特征特性。并进一步进行了核心种质资源遗传多样性分析。核心种质的EST-SSR指纹图谱库中,每一份样品的指纹都是唯一的,为登记、评价、整理、分发、繁殖等种质资源库的管理和育种者对其材料的利用提供了重要的有价值的信息。EST-SSR标记组合是构建中国大白菜核心种质及其指纹图谱的经济、高效的方法。 展开更多
关键词 大白菜 EST—SSR 核心种质 指纹图谱
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28个大白菜品种对根肿菌不同菌株的抗性反应及抗病基因位点检测 被引量:8
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作者 曾令益 任莉 +4 位作者 刘凡 陈旺 陈坤荣 徐理 方小平 《中国油料作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第4期532-539,共8页
为了解白菜品种抗性特征和抗病基因类型之间的关系,以我国油菜主产区存在的2、4和13号小种,以及来自湖北恩施、四川德阳、河北唐山、河南南阳4个地点的未知小种为病原,采用温室人工接种方法,鉴定了28个大白菜品种对8个不同根肿菌菌株抗... 为了解白菜品种抗性特征和抗病基因类型之间的关系,以我国油菜主产区存在的2、4和13号小种,以及来自湖北恩施、四川德阳、河北唐山、河南南阳4个地点的未知小种为病原,采用温室人工接种方法,鉴定了28个大白菜品种对8个不同根肿菌菌株抗病性,同时利用已知的7个抗根肿病基因(Crr1、Crr2、Crr3、CRa、CRb、CRc、CRk)分子标记检测不同品种所含的抗病基因位点。研究结果表明:供试的28个大白菜品种,27个品种对不同菌株表现出一定的抗病性,品种根王F1对所有菌株表现感病。CR春福等10个品种对所有菌株表现抗性;CR-凉春等12个品种只对一个菌株感病,其中9个品种只对恩施菌株感病。分子标记检测结果显示,感病品种根王F1中未检测到抗病基因位点,其余27个大白菜品种共检测到Crr2、Crr3、CRa、CRb、CRk五个抗病位点,CRk在抗病品种中普遍存在,但Crr3仅在CR春福中检测到杂合抗病位点。总体而言,抗病位点较多的品种对不同地方菌株抗性强,少数品种存在例外,包括含有多个位点仍表现感病(含有4个抗病位点的CR-黄心F1对4号、2号、13号生理小种表现感病)和仅含有1个位点但表现抗病(德高CR117和荣耀只检测到CRk抗病位点但对所有菌株都表现出抗性)两类情形。说明大白菜对根肿病抗性及植物病原互作的复杂性,有待深入研究。 展开更多
关键词 大白菜(brassica rapa l.) 芸薹根肿菌 根肿病 抗病基因 生理小种
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白菜S-腺苷甲硫氨酸脱羧酶BrSAMDC基因的克隆、表达及生物信息学分析 被引量:2
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作者 唐文武 吴秀兰 《分子植物育种》 CAS CSCD 北大核心 2020年第11期3485-3492,共8页
S-腺苷甲硫氨酸脱羧酶(S-adenosylmethionine decarboxylase,SAMDC)是生物体内亚精胺合成过程中的限速酶,在植物生长发育及抗逆境胁迫方面起到重要的调节作用。本研究通过RT-PCR技术从大白菜栽培种Chiifu-401中克隆得到一个BrSAMDC基因... S-腺苷甲硫氨酸脱羧酶(S-adenosylmethionine decarboxylase,SAMDC)是生物体内亚精胺合成过程中的限速酶,在植物生长发育及抗逆境胁迫方面起到重要的调节作用。本研究通过RT-PCR技术从大白菜栽培种Chiifu-401中克隆得到一个BrSAMDC基因,并对其进行表达特性及其蛋白的结构与功能进行生物信息学分析。结果表明,BrSAMDC的cDNA扩增序列为1566 bp,CDS区为1107 bp,编码368个氨基酸。定量PCR结果显示,BrSAMDC基因在白菜的各个组织均有较高表达,其中角果中的表达量最高,其次为花、茎和根,而在叶片中的表达量最低。BrSAMDC蛋白分子量为40.52 kD,属于亲水、稳定蛋白;预测其分布于细胞核内,不存在信号肽和跨膜结构域;二级结构中以无规则卷曲和α-螺旋为主,三级结构同源建模成功。14种植物SAMDC蛋白的序列对比分析显示,均含有LSESSLF结构域和PEST结构域,且十分保守;十字花科的SAMDC蛋白同源性较高,且其氨基酸的进化与植物分化具有一致性。本研究为白菜SAMDC基因的功能研究及应用提供数据基础。 展开更多
关键词 白菜(brassica rapa l.) BrSAMDC 基因克隆 基因表达 生物信息学
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“十二五”我国大白菜遗传育种研究进展 被引量:32
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作者 张凤兰 于拴仓 +4 位作者 余阳俊 张德双 赵岫云 苏同兵 汪维红 《中国蔬菜》 北大核心 2017年第3期16-22,共7页
"十二五"期间,我国大白菜遗传育种研究取得了长足进步,选育出一批优、特、异育种材料,进一步完善了双单倍体育种技术体系,高通量分子标记辅助育种技术初步应用于育种实践,实现了杂交种全程机械化制种,培育出一批满足生产和消... "十二五"期间,我国大白菜遗传育种研究取得了长足进步,选育出一批优、特、异育种材料,进一步完善了双单倍体育种技术体系,高通量分子标记辅助育种技术初步应用于育种实践,实现了杂交种全程机械化制种,培育出一批满足生产和消费需求的大白菜新品种并在生产上推广应用,应用基础研究取得突破性进展。本文系统总结了过去5年大白菜应用基础和育种技术研究、种质创新和新品种选育等方面取得的重要进展,讨论分析了存在问题和今后发展方向。 展开更多
关键词 大白菜 遗传育种 细胞育种 分子育种 新品种 综述
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大白菜软腐病新病原菌Pectobacterium aroidearum的鉴定及其生物学特性 被引量:15
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作者 李晓颖 田宇 +2 位作者 张瑾 陈昌龙 谢华 《植物病理学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第4期455-465,共11页
细菌性软腐病是大白菜生产上主要发生病害之一,其病原菌通常为胡萝卜软腐果胶杆菌Pectobacterium carotovorum subsp.carotovorum(Pcc)。从北京房山区大白菜软腐病样中分离获得一株菌株KC20,其在LB固体培养基上的菌落呈圆形、乳白色、... 细菌性软腐病是大白菜生产上主要发生病害之一,其病原菌通常为胡萝卜软腐果胶杆菌Pectobacterium carotovorum subsp.carotovorum(Pcc)。从北京房山区大白菜软腐病样中分离获得一株菌株KC20,其在LB固体培养基上的菌落呈圆形、乳白色、半透明、表面光滑且边缘整齐,在半选择性培养基CVP上产生典型的杯状凹陷。致病性测定结果表明,该菌株侵染引发的大白菜软腐症状与田间大白菜软腐自然发病症状相同。利用果胶杆菌属特异引物Y1/Y2可扩增出预期大小为434 bp的目的片段;ITS-PCR和ITS-PCR-RFLP结果发现,KC20与P.carotovorum菌株带型均不相同。KC20的16S rDNA基因完整序列与已报道的标准菌株P.aroidearum SCRI 109T(JN600323)的相应序列相似性高达99%以上;该序列系统发育关系分析表明,KC20与已报道的P.aroidearum菌株聚集,并形成了明显的P.aroidearum类群,基于pmrA基因序列和基于果胶杆菌8个看家基因(acnA、icd、gapA、mdh、mtlD、pgi、proA和rpoS)的MLSA-多位点序列分析进一步支持了这一结果。以上结果表明,引发北京地区大白菜软腐病的病原菌株KC20为果胶杆菌P.aroidearum。人工接种条件下,KC20还可侵染马蹄莲、虎眼万年青、马铃薯、鳄梨、西葫芦、胡萝卜、生菜和芹菜等植物;该菌株具备在37℃以及含有7%NaCl培养基中生长的能力,能液化明胶;可利用棉籽糖、纤维素二糖、蜜二糖,不能利用异麦芽酮糖、D-麦芽糖、D-阿拉伯糖、D-山梨醇、菊糖等。大白菜软腐病新病原菌Pectobacterium aroidearum的发现加深了我们对该病害的了解,为该病害的有效防治提供了参考。 展开更多
关键词 大白菜 细菌性软腐病 PECTOBACTERIUM aroidearum 病原鉴定 生物学特性
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利用EST-SSR标记鉴定大白菜杂交种纯度的研究 被引量:14
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作者 张庶 周新成 +5 位作者 李利斌 刘立锋 李化银 宋梅芳 高建伟 高玲 《天津农业科学》 CAS 2010年第6期1-4,共4页
利用EST-SSR分子标记技术,选用自主开发的3对EST-SSR引物,对13个大白菜品种的总DNA进行了PCR扩增。结果表明:EST-SSR标记可以体现品种内的一致性、亲本间以及品种间的多态性,具有共显性、稳定性和可重复性的特点;EST-SSR标记可以快速、... 利用EST-SSR分子标记技术,选用自主开发的3对EST-SSR引物,对13个大白菜品种的总DNA进行了PCR扩增。结果表明:EST-SSR标记可以体现品种内的一致性、亲本间以及品种间的多态性,具有共显性、稳定性和可重复性的特点;EST-SSR标记可以快速、准确地鉴别大白菜品种的真实性和杂交种纯度,为大白菜种子质量的高效检测提供科学依据。 展开更多
关键词 大白菜 种子纯度 鉴定 EST—SSR标记
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白菜抽薹性状相关基因的cDNA-AFLP分析 被引量:9
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作者 邹艳敏 于拴仓 +3 位作者 张凤兰 余阳俊 赵岫云 张德双 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2009年第7期755-762,共8页
先期抽薹严重制约着我国春大白菜及高原或高海拔地区的春夏白菜栽培,给生产造成重大损失,因而研究白菜作物低温春化途径抽薹和开花的相关基因对白菜育种具有重要意义。文章选取极早抽薹株系DH-54和极晚抽薹株系DH-43为材料,利用256对引... 先期抽薹严重制约着我国春大白菜及高原或高海拔地区的春夏白菜栽培,给生产造成重大损失,因而研究白菜作物低温春化途径抽薹和开花的相关基因对白菜育种具有重要意义。文章选取极早抽薹株系DH-54和极晚抽薹株系DH-43为材料,利用256对引物组合进行cDNA-AFLP分析,筛选到与抽薹开花相关的差异表达的转录衍生片段(Transcript-derived fragment,TDF)191条,对其中82个TDF进行克隆测序。结果表明:52个TDF与NCBI或TIGR已有序列同源,功能涉及代谢、胁迫及逆境应答、信号转导、转录调控等等;22个TDF在NCBI或TIGR找到同源序列,但功能未知;有8个TDF在NCBI或TIGR找不到同源序列,可能是一些新基因。 展开更多
关键词 大白菜(brassica rapa l.ssp.pekinensis) 春化 cDNA—AFlP 抽薹
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与大白菜霜霉病抗性主效QTL连锁的分子标记开发 被引量:4
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作者 李慧 于拴仓 +4 位作者 张凤兰 余阳俊 赵岫云 张德双 赵湘 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2011年第11期1271-1278,共8页
霜霉病是危害大白菜的三大病害之一,该病的发生会严重影响大白菜的产量及品质,因而研究与霜霉病抗性QTL紧密连锁的分子标记对大白菜抗病新品种培育具有重要意义。该研究在前期工作的基础上,选用高感霜霉病株系91-112、高抗霜霉病株系T12... 霜霉病是危害大白菜的三大病害之一,该病的发生会严重影响大白菜的产量及品质,因而研究与霜霉病抗性QTL紧密连锁的分子标记对大白菜抗病新品种培育具有重要意义。该研究在前期工作的基础上,选用高感霜霉病株系91-112、高抗霜霉病株系T12-19以及由二者为双亲构建的DH群体为实验材料,针对大白菜霜霉病抗性主效QTL——BrDW所在的标记区间,利用已有的大白菜基因组信息发展与抗性QTL紧密连锁的分子标记,通过Blast和IMap分析,将与BrDW连锁的RAPD标记K14-1030定位于大白菜KBrB058M10上(位于Contig214上),根据KBrB058M10附近的BAC及BAC-end序列设计引物,结合限制性内切酶酶切及HRM分析方法,筛选得到5个与BrDW连锁的分子标记,包括1个Indel标记Brb062-Indel230,3个CAPS标记Brb094-DraⅠ787、Brb094-AatⅡ666和Brb043-BglⅡ715,1个SNP标记Brh019-SNP137;同时,通过筛选与目标区域具有同源性的Unigene序列得到了1个与BrDW紧密连锁的SSR标记bru1209。标记Brb062-Indel230、Brb094-DraⅠ787、Brb094-AatⅡ666、Brb043-BglⅡ715、Brh019-SNP137和bru1209与RAPD标记K14-1030之间的遗传距离分别为4.3 cM、1.7 cM、5.9 cM、5.9 cM、4.6 cM和0.8 cM,在对DH群体中的抗性株系选择上准确率分别为69.7%、70.9%、72.4%、72.4%、58.3%和74.2%,可应用于分子标记辅助选择,为霜霉病抗性分子育种奠定了良好基础。 展开更多
关键词 大白菜(brassicarapa l.ssp.pekinensis) 霜霉病 BAC序列 分子标记
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抑制差减杂交法研究复等位基因遗传的大白菜核雄性不育分子机制 被引量:3
9
作者 冀瑞琴 宋倩 +2 位作者 辛喜凤 周雪 冯辉 《中国农学通报》 CSCD 北大核心 2011年第22期167-171,共5页
AB01是本课题组培育的复等位基因遗传的核雄性不育大白菜甲型"两用系",目前已建立了一套该材料的应用技术体系,但其不育分子机制尚不明确。本研究以AB01的不育株和可育株为材料,利用抑制差减杂交技术构建了正反抑制差减cDNA文... AB01是本课题组培育的复等位基因遗传的核雄性不育大白菜甲型"两用系",目前已建立了一套该材料的应用技术体系,但其不育分子机制尚不明确。本研究以AB01的不育株和可育株为材料,利用抑制差减杂交技术构建了正反抑制差减cDNA文库,并通过测序及生物信息学手段寻找育性相关基因,以此来推断该材料的不育分子机制。研究共找到27个差异表达基因,其中25个基因在NCBI数据库中均有同源序列,这些基因中7个与花发育相关,5个与脂类代谢相关,3个与活性氧及能量代谢相关,3个与光合作用及叶绿体合成相关,其余7个为功能未知基因。由此推测复等位基因遗传的核雄性不育大白菜不育的发生与脂类、能量代谢及光合作用有关。 展开更多
关键词 大白菜 雄性不育 抑制差减杂交 分子机制
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分子标记辅助选择创制抗根肿病橙色大白菜新种质 被引量:1
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作者 卢倩倩 孟艳 +5 位作者 张妮南 王亚秀 和禹廷 张学芬 刘小愿 张鲁刚 《分子植物育种》 CAS 北大核心 2022年第11期3698-3705,共8页
为了获得优质抗病大白菜种质资源,以抗根肿病普通大白菜与橙色大白菜杂交的F_(2)分离群体为试材,对202个分离单株进行橙色叶球和抗根肿病分子标记鉴定。结果表明,51个单株含有纯合橙色叶球基因,37个单株含有纯合抗根肿病基因。最终筛选... 为了获得优质抗病大白菜种质资源,以抗根肿病普通大白菜与橙色大白菜杂交的F_(2)分离群体为试材,对202个分离单株进行橙色叶球和抗根肿病分子标记鉴定。结果表明,51个单株含有纯合橙色叶球基因,37个单株含有纯合抗根肿病基因。最终筛选得到8个纯合抗根肿病橙色叶球单株,单株编号分别为8、17、24、50、107、134、155和168。本研究明确了大白菜F_(2)分离群体中橙色叶球基因和抗根肿基因聚合情况,获得了纯合抗根肿橙色叶球大白菜单株,为大白菜育种提供了科学指导和重要资源。 展开更多
关键词 大白菜(brassica rapa l.ssp.pekinensis) 根肿病 抗病基因 橙色叶球 分子标记
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高效液相色谱-荧光检测法测定大白菜中维生素K1含量
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作者 于翰宗 田蒙 +2 位作者 姜山 程斐 孙朝晖 《湖北农业科学》 2022年第20期149-152,共4页
为准确测定样品中维生素K的含量,建立了基于高效液相色谱-荧光检测的大白菜(Brassica rapa L.ssp.pekinensis)维生素K高灵敏检测技术。采用经优化的流动相,正己烷涡旋提取待测样品,通过中性氧化铝柱净化后使用C反相色谱柱对试样进行定... 为准确测定样品中维生素K的含量,建立了基于高效液相色谱-荧光检测的大白菜(Brassica rapa L.ssp.pekinensis)维生素K高灵敏检测技术。采用经优化的流动相,正己烷涡旋提取待测样品,通过中性氧化铝柱净化后使用C反相色谱柱对试样进行定量分析。结果表明,在浓度为0.229~6.197μg/mL时维生素K线性关系良好,相关系数(R~2)为0.9969。此方法检出限为0.29μg/100 g,定量限为0.95μg/100 g,回收率为97.5%~101.8%。该方法出峰时间早、能有效分离杂峰、检出限高,是对大白菜中维生素K进行检测的优选方法。 展开更多
关键词 维生素K1 大白菜(brassica rapa l.ssp.pekinensis) 固相萃取 液相色谱
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分蘖洋葱复种大白菜栽培模式初探
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作者 汪宗仁 张清友 +3 位作者 蒋欣梅 于锡宏 齐月 陈典 《湖北农业科学》 北大核心 2013年第11期2569-2570,2587,共3页
以分蘖洋葱(Allium cepa L.var.multiplcans Bailey)‘海伦兔耳红’和大白菜(Brassica rapa L.ssp.pekinensis)‘金福’为试材,以常规模式(分蘖洋葱复种大白菜直播栽培模式)为对照,研究分蘖洋葱复种大白菜育苗栽培模式的生产效果。结果... 以分蘖洋葱(Allium cepa L.var.multiplcans Bailey)‘海伦兔耳红’和大白菜(Brassica rapa L.ssp.pekinensis)‘金福’为试材,以常规模式(分蘖洋葱复种大白菜直播栽培模式)为对照,研究分蘖洋葱复种大白菜育苗栽培模式的生产效果。结果表明,采用分蘖洋葱复种大白菜育苗栽培模式可以使大白菜播种期、出苗期、莲座期、结球期分别提前20、20、6、9 d,延长了大白菜的生育期;大白菜的株高、球高和球直径显著提高,根肿病发病率显著降低。 展开更多
关键词 分蘖洋葱(Allium cepa l. var. multiplcans Bailey) 大白菜(brassica rapa l. ssp. pekinensis) 复种 栽培模式
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大白菜玻利玛细胞质雄性不育系92-09A的形态特征及相关基因的克隆与表达模式分析
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作者 王红霞 李洪雷 +8 位作者 郝建梅 丁谦 张一卉 王凤德 邓永林 王均邦 何启伟 李景娟 高建伟 《山东农业科学》 2016年第12期6-15,共10页
玻利玛细胞质雄性不育(Pol CMS)是目前很有利用价值的胞质雄性不育源。在前期的研究中,我们利用柯桂兰提供的大白菜Pol CMS不育源为母本,以大白菜骨干亲本92-09为轮回亲本,培育出大白菜Pol CMS不育系92-09A。本研究对大白菜Pol CMS不育... 玻利玛细胞质雄性不育(Pol CMS)是目前很有利用价值的胞质雄性不育源。在前期的研究中,我们利用柯桂兰提供的大白菜Pol CMS不育源为母本,以大白菜骨干亲本92-09为轮回亲本,培育出大白菜Pol CMS不育系92-09A。本研究对大白菜Pol CMS不育系92-09A及其保持系92-09、恢复系早28的形态特征进行观察,并对相应的不育基因Braraorf224及其恢复基因Brara PPR进行了克隆及生物信息学分析。结果表明,大白菜Pol CMS不育系92-09A的花瓣、萼片和雌雄蕊都比保持系92-09小,不能形成有活力的成熟花粉粒;其保持系和杂种F1(不育系92-09A×恢复系早28)均可以产生有活力的花粉粒。大白菜Pol CMS不育基因Braraorf224及恢复基因Brara PPR与甘蓝型油菜的Pol CMS不育基因及恢复基因同源性很高。qRT-PCR结果显示,Brara PPR在恢复系早28和杂种F1中的表达量均明显高于雄性不育系92-09A。本研究可为进一步揭示大白菜Pol CMS雄性不育机理奠定基础。 展开更多
关键词 大白菜 POl CMS 不育基因 恢复基因
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利用隐性性状及其分子标记快速选择大白菜育种纯系
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作者 张烨 贺立龙 +9 位作者 魏清岗 王红霞 李景娟 王凤德 徐少君 荆世新 孙令强 李洪雷 邓永林 高建伟 《山东农业科学》 2019年第12期7-14,共8页
加快纯系选育速度、缩短育种进程,是大白菜新品种选育的重要目标。本试验利用大白菜桔红色、无表皮毛、亮绿秆三个隐性性状及其分子标记辅助大白菜优良纯系选择,开展加快大白菜育种效率的研究。结果表明:该分子标记属于基因本身外显子... 加快纯系选育速度、缩短育种进程,是大白菜新品种选育的重要目标。本试验利用大白菜桔红色、无表皮毛、亮绿秆三个隐性性状及其分子标记辅助大白菜优良纯系选择,开展加快大白菜育种效率的研究。结果表明:该分子标记属于基因本身外显子区段的InDel或SNP标记,选择效率高(100%),可使大白菜优良纯系培育时间缩短3年,与常规育种相结合形成的育种技术体系,可实现桔红心、无表皮毛、亮绿秆优质大白菜新品种选育的精准分子设计。本研究结果直接来源于大白菜育种实践,具有重要的理论和实践价值。 展开更多
关键词 大白菜 隐性性状 分子标记 分离纯化 育种效率
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