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中国荷斯坦牛和鲁西黄牛mtDNA D-loop序列多态性分析
被引量:
9
1
作者
郝荣超
王国华
+2 位作者
常玉霞
杨国忠
昝林森
《基因组学与应用生物学》
CAS
CSCD
北大核心
2011年第5期544-549,共6页
为了从母系遗传角度深入阐明中国荷斯坦牛和鲁西黄牛的群体遗传多样性以及起源进化,本研究采用PCR测序法测定了9头中国荷斯坦牛和11头鲁西黄牛的线粒体DNAD-loop区的部分序列,并经剪切后进行生物信息学软件分析。结果表明,20个个体D-loo...
为了从母系遗传角度深入阐明中国荷斯坦牛和鲁西黄牛的群体遗传多样性以及起源进化,本研究采用PCR测序法测定了9头中国荷斯坦牛和11头鲁西黄牛的线粒体DNAD-loop区的部分序列,并经剪切后进行生物信息学软件分析。结果表明,20个个体D-loop区共711bp,共检测到19种单倍型和50个多态位点。核苷酸多样性(Pi)为0.02133±0.00454,单倍型多样性(Hd)为0.994±0.019,平均核苷酸差异数(k)为15.14620。构建的NJ网络进化树共分为两大支系,其中部分鲁西黄牛与瘤牛聚为一支,而中国荷斯坦牛和部分鲁西黄牛与普通黄牛聚为一支。说明中国荷斯坦牛和鲁西黄牛群体遗传多样性均较高;鲁西黄牛同时含有瘤牛和普通黄牛的血统,而中国荷斯坦牛只含有普通黄牛的血统。
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关键词
中国荷斯坦牛
鲁西黄牛
线粒体DNA
D-LOOP
多态性
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职称材料
题名
中国荷斯坦牛和鲁西黄牛mtDNA D-loop序列多态性分析
被引量:
9
1
作者
郝荣超
王国华
常玉霞
杨国忠
昝林森
机构
河北北方学院
张家口市农业行政综合执法支队
西北农林科技大学
出处
《基因组学与应用生物学》
CAS
CSCD
北大核心
2011年第5期544-549,共6页
基金
国家转基因育种重大专项(No.2008ZX08007-002)
教育部长江学者与创新团队发展计划(No.IRT0940)
国家863计划(No.2008AA101010)共同资助
文摘
为了从母系遗传角度深入阐明中国荷斯坦牛和鲁西黄牛的群体遗传多样性以及起源进化,本研究采用PCR测序法测定了9头中国荷斯坦牛和11头鲁西黄牛的线粒体DNAD-loop区的部分序列,并经剪切后进行生物信息学软件分析。结果表明,20个个体D-loop区共711bp,共检测到19种单倍型和50个多态位点。核苷酸多样性(Pi)为0.02133±0.00454,单倍型多样性(Hd)为0.994±0.019,平均核苷酸差异数(k)为15.14620。构建的NJ网络进化树共分为两大支系,其中部分鲁西黄牛与瘤牛聚为一支,而中国荷斯坦牛和部分鲁西黄牛与普通黄牛聚为一支。说明中国荷斯坦牛和鲁西黄牛群体遗传多样性均较高;鲁西黄牛同时含有瘤牛和普通黄牛的血统,而中国荷斯坦牛只含有普通黄牛的血统。
关键词
中国荷斯坦牛
鲁西黄牛
线粒体DNA
D-LOOP
多态性
Keywords
chinese
holsein
cattle
Luxi
cattle
mtDNA(mitochondrial
DNA)
D-loop
region
Polymorphism
分类号
S823 [农业科学—畜牧学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
中国荷斯坦牛和鲁西黄牛mtDNA D-loop序列多态性分析
郝荣超
王国华
常玉霞
杨国忠
昝林森
《基因组学与应用生物学》
CAS
CSCD
北大核心
2011
9
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