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贵州省安顺烟区烟草主要病毒种类及复合侵染类型分析
1
作者 潘首慧 薛原 +6 位作者 张海 何海永 龚双军 杨馥韩 赵玳琳 李继业 谭清群 《烟草科技》 CAS CSCD 北大核心 2024年第8期67-74,共8页
为明确贵州省安顺烟区烟草主要病毒毒源种类和侵染类型,2023年从安顺烟区采集表现为花叶、叶脉扭曲坏死、畸形、闪电斑和斑点黄化等症状的烟草样品306份,并利用烟草花叶病毒(TMV)、黄瓜花叶病毒(CMV)、马铃薯Y病毒(PVY)、烟草脉带花叶病... 为明确贵州省安顺烟区烟草主要病毒毒源种类和侵染类型,2023年从安顺烟区采集表现为花叶、叶脉扭曲坏死、畸形、闪电斑和斑点黄化等症状的烟草样品306份,并利用烟草花叶病毒(TMV)、黄瓜花叶病毒(CMV)、马铃薯Y病毒(PVY)、烟草脉带花叶病毒(TVBMV)和辣椒脉斑驳病毒(ChiVMV)5种主要病毒病特异性引物进行RT-PCR扩增检测,统计病毒的检出率并分析复合侵染类型。结果显示:总病毒检出率为89.87%。其中,TMV占比最高,为81.70%;ChiVMV次之,为67.97%;CMV占比最低,为16.34%。复合侵染是主要的侵染类型,检出率为68.30%。其中,ChiVMV+TMV类型占比最高,为22.88%,其次是ChiVMV+TMV+TVBMV、ChiVMV+TMV+PVY和ChiVMV+TMV+CMV 3种类型,分别占11.11%、10.46%和9.15%。贵州省安顺烟区烟草病毒病的优势毒源为TMV和ChiVMV,复合侵染普遍发生,以ChiVMV+TMV复合侵染类型为主。 展开更多
关键词 贵州安顺烟区 烟草 病毒病 烟草花叶病毒(TMV) 黄瓜花叶病毒(CMV) 马铃薯Y病毒(PVY) 烟草脉带花叶病毒(TVBMV) 辣椒脉斑驳病毒(chivmv) 侵染类型
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辣椒脉斑驳病毒文昌分离物基因组测序及分析 被引量：5
2
作者 龚殿 王健华 +4 位作者 吴育鹏 张雨良 王洪星 孙玉娟 刘志昕 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2011年第5期583-589,共7页
辣椒脉斑驳病毒(Chilli veinal mottle virus,ChiVMV)近年来严重危害海南黄灯笼辣椒的产量,开展针对该病毒的研究以求达到对其有效防控迫在眉睫。本研究分7段克隆了ChiVMV文昌分离物(ChiVMV Wenchang isolate,ChiVMV-WC)的基因组。分段... 辣椒脉斑驳病毒(Chilli veinal mottle virus,ChiVMV)近年来严重危害海南黄灯笼辣椒的产量,开展针对该病毒的研究以求达到对其有效防控迫在眉睫。本研究分7段克隆了ChiVMV文昌分离物(ChiVMV Wenchang isolate,ChiVMV-WC)的基因组。分段克隆的测序结果通过拼接,共获得ChiVMV-WC基因组9717个核苷酸(nt)序列(GenBank登录号:GQ981316)。在核苷酸序列的第164位～第9270位存在一个大的开放阅读框(ORF),编码一个多聚蛋白(分子量为350.44kD)。近年来被证实的马铃薯Y病毒科的一个新的ORF(pretty interesting potyviridae ORF,PIPO)存在于ChiVMV-WC基因组核苷酸序列的第2892位～第3110位,编码一个由72个氨基酸聚合而成的多肽(分子量为8.26kD)。ChiVMV-WC与ChiVMV其它分离物的基因组核苷酸序列比较发现该病毒存在着较高的变异率。本研究通过与同属内病毒的同源性分析以及系统进化树分析,确定了ChiVMV-WC在生物进化史上的地位。 展开更多
关键词 辣椒脉斑驳病毒 马铃薯Y病毒属 基因组 系统进化树 黄灯笼
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侵染贵州烟草的辣椒脉斑驳病毒鉴定及其基因组分子特征分析
3
作者 冷东蔚 韦学锋 +5 位作者 张洪保 马志锋 蒋卫 吴慧子 田维强 蔡璘 《西南农业学报》 CSCD 北大核心 2023年第12期2695-2702,共8页
【目的】明确辣椒脉斑驳病毒(Chilli veinal mottle virus,ChiVMV)在贵州烟草上的发生情况及其与我国其他省份不同ChiVMV株系之间的遗传进化关系,为制定科学合理的防控措施提供依据。【方法】从贵州省贵阳、遵义、安顺和铜仁的烟田采集... 【目的】明确辣椒脉斑驳病毒(Chilli veinal mottle virus,ChiVMV)在贵州烟草上的发生情况及其与我国其他省份不同ChiVMV株系之间的遗传进化关系,为制定科学合理的防控措施提供依据。【方法】从贵州省贵阳、遵义、安顺和铜仁的烟田采集表现叶片斑驳、皱缩、坏死和花叶等症状的疑似病毒侵染的烟叶样品80份。采用RT-PCR法,设计多种病毒引物对所采集的样品进行检测,对检测出的ChiVMV进一步进行PCR分段扩增以获得贵州烟草ChiVMV的全基因组序列,基于NCBI已公布的所有ChiVMV基因组序列进行序列一致性分析并构建系统发育进化树,以研究贵州ChiVMV烟草分离株的遗传进化关系。【结果】RT-PCR检测结果显示,ChiVMV在贵州烟区检出率为37.50%,烟草普通花叶病毒(Tobacco mosaic virus,TMV)检出率为48.75%,马铃薯Y病毒(Potato virus Y,PVY)的检出率为35.00%,黄瓜花叶病毒(Cucumber mosaic virus,CMV)检出率仅8.75%;检测出4种复合侵染类型TMV+PVY、PVY+ChiVMV、PVY+CMV和ChiVMV+PVY+TMV,检出率分别为26.25%、6.25%、10.00%和3.75%。PCR分段扩增获得贵州省烟草分离株ChiVMV-GZ(GenBank:OP589298),其与来自四川的番茄分离株(KC711055)和四川烟草分离株(MK405594)具有较高的序列一致性(98.70%和98.50%);构建系统发育进化树发现其与来自四川和云南的ChiVMV株系聚为一支。【结论】辣椒脉斑驳病毒在贵州烟草上的为害已日趋严重,应当引起足够重视,本研究在贵州烟草上分离获得分离株ChiVMV-GZ并扩增获得该病毒全基因组;基于遗传进化分析发现,ChiVMV-GZ与来自四川和云南的ChiVMV株系间的亲缘关系最近。 展开更多
关键词 烟草 辣椒脉斑驳病毒 病毒检测 基因组分析 贵州
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辣椒脉斑驳病毒的多基因联合检测与鉴定 被引量：4
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作者 杨宏凯 杨晶文 +2 位作者 沈建国 蔡伟 高芳銮 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2020年第16期3412-3420,共9页
【目的】辣椒脉斑驳病毒(Chilli veinal mottle virus,ChiVMV)是辣椒生产上危害严重的病毒,也是口岸检疫的重要病毒之一。本文旨在建立一种快速检测ChiVMV的多基因联合检测方法,实现ChiVMV的快速、准确鉴定。【方法】利用DAS-ELISA、RT-... 【目的】辣椒脉斑驳病毒(Chilli veinal mottle virus,ChiVMV)是辣椒生产上危害严重的病毒,也是口岸检疫的重要病毒之一。本文旨在建立一种快速检测ChiVMV的多基因联合检测方法,实现ChiVMV的快速、准确鉴定。【方法】利用DAS-ELISA、RT-PCR方法对印度进境辣椒进行检测以确定是否携带有ChiVMV。根据ChiVMV外壳蛋白(coat protein,CP)和圆柱状内含体蛋白(cytoplasmic inclusion protein,CI)保守区域分别设计引物,筛选两个基因(CP和CI)的特异性引物组合,通过设定不同的引物用量组合以及对退火温度等条件进行优化,探索最佳的反应条件,建立多基因联合检测方法。利用建立的多基因联合检测体系对包含ChiVMV在内的辣椒病毒进行检测,以验证该体系特异性。同时对ChiVMV阳性样品的不同浓度cDNA进行扩增,测定其检测灵敏度。此外,对田间辣椒样本进行检测,以验证体系的实际应用效果。【结果】通过对印度进境辣椒的DAS-ELISA检测,发现样品提取液与ChiVMV呈阳性反应;利用CP861-F/CP861-R特异性引物对进行RT-PCR,扩增出与预期大小相一致的特异性片段,确认该批辣椒样品携带有ChiVMV。多基因联合检测体系中,应用引物对CP337-F/CP337-R、CI655-F/CI655-R分别扩增出长度为337、655 bp的特异性目的片段。经优化后的反应体系和程序为cDNA 2μL、CP337-F/CP337-R各0.625μL(10μmol·L-1)、CI655-F/CI655-R各1.375μL(10μmol·L-1)、2×PCR Master Mix12.5μL、ddH2O 6.5μL,退火温度50℃,共35个循环。建立的多基因联合检测方法具有良好的特异性和灵敏度,两个基因检测灵敏度均为10-4数量级。实际应用检测结果表明,该方法可从感染ChiVMV的样品中同时扩增出CP和CI的特异性目的片段。【结论】建立的多基因联合检测方法具有特异性强、灵敏度高、重复性好的特点,可为辣椒脉斑驳病毒的快速检测提供可靠的技术支持。 展开更多
关键词 辣椒脉斑驳病毒 外壳蛋白基因 圆柱状内含体蛋白基因 多基因联合检测
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