为鉴定影响蛋壳色素含量的基因组拷贝数变异,试验以长顺绿壳蛋鸡为研究对象,依据蛋壳表型设置2个试验组:B2 vs B1和B3 vs B1,通过CGH芯片全基因组检测筛选和Ac⁃cuCopyTM多重基因拷贝数检测验证,在全基因组范围内进行鉴定,选择其中12个...为鉴定影响蛋壳色素含量的基因组拷贝数变异,试验以长顺绿壳蛋鸡为研究对象,依据蛋壳表型设置2个试验组:B2 vs B1和B3 vs B1,通过CGH芯片全基因组检测筛选和Ac⁃cuCopyTM多重基因拷贝数检测验证,在全基因组范围内进行鉴定,选择其中12个注释功能基因开展关联验证。结果显示:两个试验组分别检测到绿壳表型差异关联区域22个和24个;腺苷酸环化酶10(ADCY10)基因拷贝数变异与原卟啉色素含量呈极显著负相关(R=-0.424,P=0.001),与胆绿素色素含量呈显著正相关(R=0.299,P=0.018)。研究提示,ADCY10基因可能是影响蛋壳中不同色素含量的关键基因之一。展开更多
【目的】探究溶质载体家族8成员A1(solute carrier family 8 member A1,SLC8A1)基因多态性对长顺绿壳蛋鸡蛋壳品质的影响,为今后改善蛋壳品质提供参考。【方法】根据GenBank数据库中鸡SLC8A1基因序列(登录号:NC_052534.1),使用Primer Pr...【目的】探究溶质载体家族8成员A1(solute carrier family 8 member A1,SLC8A1)基因多态性对长顺绿壳蛋鸡蛋壳品质的影响,为今后改善蛋壳品质提供参考。【方法】根据GenBank数据库中鸡SLC8A1基因序列(登录号:NC_052534.1),使用Primer Premier 3.0软件设计引物进行PCR扩增,采用直接测序法筛选SLC8A1基因SNP位点,并利用SPSS 22.0软件检测SNP位点不同基因型蛋壳指标的差异。【结果】在SLC8A1基因外显子11上共发现3个新的SNPs:g.16085681 T>C、g.16085766 C>T和g.16085781 T>C,共存在3种单倍型:H1(TCT)、H2(CTC)、H3(TTC),以及6种双倍型:H1H1(TTCCTT)、H1H2(TCTCTC)、H1H3(TTTCTC)、H2H2(CCTTCC)、H2H3(CTTTCC)、H3H3(TTTTCC)。χ~2检验结果显示,3个SNPs位点均处于Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05),均表现为中度多态。关联性分析结果显示,g.16085681 T>C位点TC基因型个体蛋壳强度显著高于TT基因型(P<0.05),g.16085681 T>C位点和单倍型H2(C_(16085681)T_(16085766)C_(16085781))对SLC8A1基因mRNA二级结构产生明显的影响;g.16085766 C>T位点CC基因型个体蛋形指数显著高于TT基因型(P<0.05);双倍型H1H1、H1H3个体蛋形指数显著高于H2H3,H2H3个体蛋壳强度和蛋壳厚度均显著高于H1H3,H1H2、H2H2个体蛋重均显著高于H3H3(P<0.05)。【结论】g.16085681 T>C位点可作为影响蛋壳强度的标记位点,g.16085766 C>T位点可作为影响蛋形指数的标记位点,双倍型H2H3可能是蛋壳强度和蛋壳厚度的有利双倍型。展开更多
文摘为鉴定影响蛋壳色素含量的基因组拷贝数变异,试验以长顺绿壳蛋鸡为研究对象,依据蛋壳表型设置2个试验组:B2 vs B1和B3 vs B1,通过CGH芯片全基因组检测筛选和Ac⁃cuCopyTM多重基因拷贝数检测验证,在全基因组范围内进行鉴定,选择其中12个注释功能基因开展关联验证。结果显示:两个试验组分别检测到绿壳表型差异关联区域22个和24个;腺苷酸环化酶10(ADCY10)基因拷贝数变异与原卟啉色素含量呈极显著负相关(R=-0.424,P=0.001),与胆绿素色素含量呈显著正相关(R=0.299,P=0.018)。研究提示,ADCY10基因可能是影响蛋壳中不同色素含量的关键基因之一。
文摘为更好地对长顺绿壳蛋鸡进行品种保护和利用,并从母系遗传角度深入阐明长顺绿壳蛋鸡的群体遗传背景,利用PCR直接测序法,测定了114只长顺绿壳蛋鸡的线粒体DNA(mt DNA)D-loop第1高变区568 bp片段序列。结果表明:在所分析的长顺绿壳蛋鸡mt DNA D-loop区序列中,A、C、G、T平均比例为27.1%、29.5%、13.4%、30.0%;共检测到核苷酸变异位点37个,核苷酸多样度为0.0111,24种单倍型,单倍型多样度为0.845,表明长顺绿壳蛋鸡遗传多样性较丰富,具有较好的选育潜力。聚类分析结果表明,长顺绿壳蛋鸡与红原鸡亲缘关系较近。
