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CardioVISTA:进化保守转录元件的可视化在线程序
1
作者
甄一松
《中国分子心脏病学杂志》
CAS
2014年第5期1078-1079,共2页
目的心脏发育研究领域中的转录调控一直是热点研究问题,它影响了发育过程的各个环节。为了进一步利用多物种的基因组,定位进化保守的转录因子调控位点,我们利用Cardio Signal数据库的数据分析VISTA数据库多重比对后的基因组序列。方法...
目的心脏发育研究领域中的转录调控一直是热点研究问题,它影响了发育过程的各个环节。为了进一步利用多物种的基因组,定位进化保守的转录因子调控位点,我们利用Cardio Signal数据库的数据分析VISTA数据库多重比对后的基因组序列。方法在本文中,我们采用Perl语言和后台Maria DB数据库,可视化的展示基因组序列中的保守调控元件。结果我们的程序能够分析VISTA格式的多重比对数据,能够动态展示基因组保守元件在整个DNA序列的位置。结论我们的Cardio VISTA程序是今后转录调控研究中的利器。
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关键词
CardioVISTA
生物信息学
Perl语音
cardiosignal
数据库
原文传递
题名
CardioVISTA:进化保守转录元件的可视化在线程序
1
作者
甄一松
机构
中国医学科学院北京协和医学院国家心血管病中心阜外心血管病医院心血管疾病国家重点实验室
出处
《中国分子心脏病学杂志》
CAS
2014年第5期1078-1079,共2页
基金
国家自然科学基金青年科学基金项目(31000644)
文摘
目的心脏发育研究领域中的转录调控一直是热点研究问题,它影响了发育过程的各个环节。为了进一步利用多物种的基因组,定位进化保守的转录因子调控位点,我们利用Cardio Signal数据库的数据分析VISTA数据库多重比对后的基因组序列。方法在本文中,我们采用Perl语言和后台Maria DB数据库,可视化的展示基因组序列中的保守调控元件。结果我们的程序能够分析VISTA格式的多重比对数据,能够动态展示基因组保守元件在整个DNA序列的位置。结论我们的Cardio VISTA程序是今后转录调控研究中的利器。
关键词
CardioVISTA
生物信息学
Perl语音
cardiosignal
数据库
Keywords
CardioVlSTA
Bioinfonnatics Analysis
Perk
cardiosignal
Database
分类号
R54 [医药卫生—心血管疾病]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
CardioVISTA:进化保守转录元件的可视化在线程序
甄一松
《中国分子心脏病学杂志》
CAS
2014
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