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高效柴油降解菌Acinetobacter sp.W3分离鉴定及降解酶基因扩增分析 被引量：8
1
作者 孙敏 沈先荣 +3 位作者 侯登勇 施展 罗群 何颖 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第6期159-165,共7页
从柴油污染的海水样品中分离高效柴油降解细菌,分析菌株对柴油的降解能力及降解酶基因,为海洋柴油污染的生物修复奠定基础。选取浙江定海港柴油污染的海水样品,进行降解菌的富集培养;采用常规方法分离筛选高效柴油降解菌。利用革兰氏染... 从柴油污染的海水样品中分离高效柴油降解细菌,分析菌株对柴油的降解能力及降解酶基因,为海洋柴油污染的生物修复奠定基础。选取浙江定海港柴油污染的海水样品,进行降解菌的富集培养;采用常规方法分离筛选高效柴油降解菌。利用革兰氏染色、形态学观察、生理生化鉴定及16S rDNA分析等方法对降解菌株进行种属鉴定。采用紫外吸收法测定菌株对柴油的降解率。采用PCR方法、核酸序列测定和比对,对其降解酶基因进行扩增分析。筛选出一株高效降解菌,形态学观察及生理生化鉴定初步确定为不动杆菌。16S rDNA序列分析及比对结果表明,其16S rDNA序列与威尼斯不动杆菌(Acinetobacter venetianus)属的序列同源性达到99.7%,命名为不动杆菌W3(Acinetobactersp.W3),该菌对柴油的7 d降解率达到84.7%。PCR方法从Acinetobactersp.W3菌株中的基因组DNA和质粒DNA上扩增到了大小为540 bp的烷烃羟化酶基因alkB和864 bp的CYP153A部分DNA片段,分别与Acinetobacter venetianus1-D-2的alkB和Acinetobactersp.OC4、Acinetobactersp.EB104的CYP153具有99%和98%的同源性。从定海港口柴油污染海水分离得到一株高效柴油降解菌Acinetobactersp.W3,该菌属于不动杆菌属,含有烷烃降解酶基因,能高效降解柴油污染物,有望应用于海水柴油污染的生物修复。 展开更多
关键词 柴油降解菌 ALKB cyp153A 柴油污染 生物修复
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Dietzia菌中铁氧还蛋白及其还原酶在正十六烷降解中的关键作用 被引量：1
2
作者 范裕昭 秦晓宇 +2 位作者 聂勇 吴晓磊 许子牧 《应用与环境生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第1期1-6,共6页
微生物降解烷烃作为一种经济高效的方式,在环境修复和石油开采等方面起到了重要作用.在烃降解过程中主要通过红素氧还蛋白(Rd)和红素氧还蛋白还原酶(RdR)的电子传递链为中长链烷烃羟化酶AlkB提供能量;然而许多依赖于AlkB的烷烃降解菌,如... 微生物降解烷烃作为一种经济高效的方式,在环境修复和石油开采等方面起到了重要作用.在烃降解过程中主要通过红素氧还蛋白(Rd)和红素氧还蛋白还原酶(RdR)的电子传递链为中长链烷烃羟化酶AlkB提供能量;然而许多依赖于AlkB的烷烃降解菌,如Dietzia菌,其基因组中未发现已知的RdR的蛋白编码基因,因而其如何发挥AlkB的功能依然未知.以Dietzia sp.DQ12-45-1b作为模式菌株,前期研究发现铁氧还蛋白(Fd)与铁氧还蛋白还原酶(FdR)编码基因的缺失会导致菌株对正十六烷代谢的缺陷.通过构建Fd、FdR及其所在的细胞色素P450类烷烃羟化酶CYP153基因簇的敲除与回补突变株,对比野生型菌株生长表型,发现在Fd或FdR的编码基因缺失的情况下会导致菌株丧失对正十六烷的代谢能力,确定了该基因簇中Fd及FdR基因是Dietzia sp.DQ12-45-1b正十六烷降解的必需基因.此外还发现烷烃羟化酶CYP153基因的缺失并不影响菌株对正十六烷的降解利用.上述结果暗示FdR在降解过程中可能存在与其他烷烃羟化酶如AlkW等的电子传递关系,有助于进一步探索Dietzia菌的烃代谢降解过程机制.(图6表2参20) 展开更多
关键词 Dietzia菌属 烷烃降解 电子传递 铁氧还蛋白还原酶 cyp153羟化酶
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细胞色素P450 153C1蛋白的表达、纯化及初步晶体学研究
3
作者 周卫红 杨文 +3 位作者 Stephen G.Bell Mark Bartlam Luet-Lok Wong 饶子和 《生物物理学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第S1期378-379,共2页
细胞色素P450,又称CYP,是最大的酶类超家族之一,属于血红素蛋白的一个大家族[1]。它们在生物界分布极其广泛,从细菌到高等的动植物中都有分布。
关键词 细胞色素 P450 单加氧酶 cyp153C1 纯化 结晶
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