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题名马尾松胚乳DNA高效提取及SSR-PCR体系优化
被引量：7
- 1
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作者
何卫龙
杨立恒
王晓锋
林能庆
季孔庶
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机构
南京林业大学林木遗传与生物技术省部共建教育部重点实验室
福建省上杭白砂国有林场
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出处
《林业科技开发》
北大核心
2013年第1期15-18,共4页
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基金
林业公益性行业科研专项经费资助(编号:201104010)
国家"十一五"科技支撑项目(编号:2006BAD01A1403)
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文摘
以马尾松胚乳为试验材料,用CTAB-SDS法提取单粒胚乳DNA,对其浓度和纯度进行检测。结果表明:运用CTAB-SDS法提取的马尾松胚乳DNA浓度高、纯度好,琼脂糖凝胶电泳条带清晰,点样孔干净。此外,还对影响PCR结果的Mg2+、dNTP、模板DNA、引物浓度、TaqDNA聚合酶5个因素进行了正交设计试验,建立了适合马尾松SSR-PCR的反应体系:即在10μL反应体系中,Mg2+浓度为2.80 mmol/L,dNTP浓度为0.35 mmol/L,引物浓度为0.075μmol/L,模板DNA浓度为20 ng/10μL,TaqDNA聚合酶浓度为0.50 U/10μL。
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关键词
马尾松
胚乳DNA
ctab-sds法
SSR-PCR
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Keywords
Pinus massoniana
endosperm DNA
ctab-sds
SSR-PCR
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分类号
S661.2
[农业科学—果树学]
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题名第三代测序细菌基因组DNA提取方法的比较
被引量：6
- 2
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作者
穰杰
李莉
唐琼
杨琦
何恋
丁学知
夏立秋
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机构
湖南师范大学生命科学学院微生物分子生物学国家重点实验室培育基地
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出处
《湖南师范大学自然科学学报》
CAS
北大核心
2015年第6期14-20,共7页
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基金
国家自然科学基金资助项目(31370116)
国家"973"基础研究计划资助项目(2012CB722301)
+4 种基金
国家"863"高技术研究发展计划资助项目(2011AA10A203)
湖南省教育厅重点资助项目(13CY002
10CY013
12K033)
湖南省2011协同创新中心资助项目(20134486)
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文摘
为筛选有效提取细菌菌株总DNA的方法,分别采用SDS法、CTAB-SDS法、试剂盒法和改良试剂盒法对苏云金芽胞杆菌、粘细菌和放线菌进行总DNA的提取、电泳检测、NanoDrop 2000测定、PCR扩增.对放线菌和苏云金芽胞杆菌,用改良试剂盒法所提取的总DNA纯度较高,电泳条带清晰,DNA主带位于23 kb,单位体积菌液所提取到的总DNA较SDS法和CTAB-SDS法高,能满足下游的PCR扩增等分子操作.对待测样品所做的质检报告也证实样品合格,可用于后续建库、测序.而粘细菌提取到的总DNA由于它们的OD260/230在2.0以下,没有达到第三代测序样品的要求.改良试剂盒法所提取到的总DNA大多数可以满足第三代测序技术样品制备的要求.
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关键词
第三代测序技术
DNA提取方法
ctab-sds法
改良溶液型试剂盒法
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Keywords
The third sequencing technology
DNA extraction method
ctab-sds method
improved solution genomic DNA kit extraction method
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分类号
Q939.9
[生物学—微生物学]
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题名2种提取野生蕈菌DNA方法的比较及其应用
被引量：2
- 3
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作者
何山文
雷琼
马立安
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机构
长江大学生命科学学院
湖北省荆州市文物保护中心
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出处
《长江大学学报（自然科学版）》
CAS
2018年第6期43-47,共5页
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文摘
采用CTAB法和SDS-CTAB法分别提取真菌DNA,通过分析比较DNA产量和PCR扩增效果,以筛选优势提取方法应用于野生蕈菌分子鉴定。结果表明,2种方法都能提取获得目的 DNA,并可直接用于PCR扩增分析,但SDS-CTAB法提取的总DNA产量高、质量好,操作方法简便,故作为优势DNA提取方法分析鉴定了16个供试野生蕈菌,其序列提交NCBI获得了基因登录号,进行了分子系统鉴定。
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关键词
DNA提取
ctab法
ctab-sds法
野生蕈菌
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分类号
Q523
[生物学—生物化学]
Q949.32
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题名几种海水经济贝类DNA提取方法探讨
被引量：7
- 4
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作者
李联泰
安贤惠
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机构
淮海工学院海洋学院
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出处
《淮海工学院学报（自然科学版）》
CAS
2005年第4期66-69,共4页
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文摘
以缢蛏、美人蛏、文蛤、扇贝和鲍鱼等几种经济贝类为研究对象,分别用苯酚／氯仿／异戊醇法,CTAB法,SDS法等不同方法提取其基因组DNA,寻找适宜于研究对象基因组DNA提取的方法,结果表明,3种方法均可以从目标材料中提取到DNA,但苯酚／氯仿／异戊醇法无论从数量和质量上都不理想,而SDS和CTAB可根据具体情况选择使用。即对纯度要求不高时均可选用SDS 法,但为了分子生物学研究的应用,需要较高纯度,则缢蛏、美人蛏、文蛤和扇贝等瓣腮纲贝类推荐用SDS法,而鲍鱼等腹足纲贝类推荐用CTAB法。
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关键词
DNA提取
ctab法sds法
苯酚/氯仿/异戊醇法
贝类
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Keywords
DNA extraction
ctab
sds
phenol-ehloroform-isopentanol
shellfish
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分类号
S763.35
[农业科学—森林保护学]
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题名两种不同甘蔗基因组DNA提取方法的比较
被引量：6
- 5
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作者
应雄美
蔡青
毕艳
刘新龙
马丽
毛钧
陆鑫
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机构
云南省农科院甘蔗研究所
云南省农业科学院生物技术与种质资源研究所
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出处
《中国糖料》
2009年第4期22-23,共2页
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基金
国家科技部基础条件平台工作重点项目(2005DKA21002-11)
农业部农作物物种资源保护项目(NB07-2130135-17)
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文摘
采用改良CTAB法和SDS法提取甘蔗嫩叶与正一叶基因组DNA,通过琼脂糖凝胶电泳与紫外光吸收检测,证明SDS法能获得高质量的DNA,适合分子生物学操作的要求,为后续甘蔗遗传多样性分析、遗传图谱构建等研究奠定基础。
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关键词
甘蔗
DNA提取
ctab法:sds法
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Keywords
Sugarcane
DNA extraction
ctab
sds
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分类号
S566.1
[农业科学—作物学]
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