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敲除PaLoc毒力岛的无毒性艰难梭菌菌株的构建
被引量:
3
1
作者
饶凤琴
程玉梅
+4 位作者
吴昌学
王义
崔古贞
齐晓岚
洪伟
《贵州医科大学学报》
CAS
2019年第10期1128-1133,共6页
目的:使用CRISPR-Cfp1系统敲除艰难梭菌毒性(PaLoc)毒力基因岛,构建无毒性艰难梭菌菌株。方法:使用分子克隆方法,构建针对PaLoc毒力岛的基因打靶质粒pWH53;将pWH53质粒转化艰难梭菌630菌株后,诱导Cpf1蛋白表达,PCR筛选发生双交换的PaLo...
目的:使用CRISPR-Cfp1系统敲除艰难梭菌毒性(PaLoc)毒力基因岛,构建无毒性艰难梭菌菌株。方法:使用分子克隆方法,构建针对PaLoc毒力岛的基因打靶质粒pWH53;将pWH53质粒转化艰难梭菌630菌株后,诱导Cpf1蛋白表达,PCR筛选发生双交换的PaLoc敲除突变株,测序验证设计位点是否发生等位双交换。结果:PCR结果显示,获得的16株转化子中有8株为敲除PaLoc突变株,阳性率为50%;测序结果显示,获得的8株敲除PaLoc突变株均在设计位点发生了等位双交换。结论:成功构建艰难梭菌毒性毒力岛敲除PaLoc突变株。
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关键词
艰难梭菌
crispr
-
cpf
1
系统
PaLoc毒力岛
基因敲除
活菌疫苗
毒性基因
梭菌感染
载体
质粒
下载PDF
职称材料
利用RGR核酶结构拓展家蚕CRISPR基因组编辑系统的应用研究
2
作者
张启超
宋红生
+5 位作者
曾保胜
陈树清
许军
李芝倩
张忠杰
陈旭
《蚕业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第2期226-232,共7页
针对目前家蚕基因组编辑平台在基因组特定位点的靶点选择、多靶点同时编辑等方面的技术瓶颈,利用家蚕卵巢培养细胞系(Bm N)验证含有双核酶结构的RGR(Ribozyme-gRNA-Ribozyme)在CRISPR/Cas9基因组编辑系统中的应用效果,用以拓展现有C...
针对目前家蚕基因组编辑平台在基因组特定位点的靶点选择、多靶点同时编辑等方面的技术瓶颈,利用家蚕卵巢培养细胞系(Bm N)验证含有双核酶结构的RGR(Ribozyme-gRNA-Ribozyme)在CRISPR/Cas9基因组编辑系统中的应用效果,用以拓展现有CRISPR/Cas9系统的靶点范围。研究结果显示,采用Cas9系统和Cpf1系统,RGR结构在Bm N细胞中具有良好的定点编辑效果,可成功实现对内源、外源靶基因序列的剪切,且对内外源基因具有高效编辑作用,表明RGR结构可应用于家蚕CRISPR/Cas9和CRISPR/Cpf1基因组编辑系统。利用RGR结构的自剪切功能不仅可以拓展家蚕基因组靶基因的范围,还为进一步实现多靶点编辑打下了基础。
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关键词
crispr
/Cas9
系统
crispr
/
cpf
1
系统
RGR核酶结构
家蚕基因组编辑
家蚕卵巢培养细胞
下载PDF
职称材料
基于CRISPR/Cpf1系统下的诱导型多基因激活体系的建立
3
作者
黄秋月
李中瀚
殷旖珂
《四川大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第1期160-164,共5页
为开发高效率的内源多基因激活工具,利用CRISPR/Cpf1系统能够促使pre-crRNA中多个crRNA自我剪切和释放的特性,将As/Fn/LbCpf1的核酸酶区域定点突变形成dCpf1,并在C端和N端分别引入了VPR三元转录激活域和不稳定结构域(DD-domain)、四环...
为开发高效率的内源多基因激活工具,利用CRISPR/Cpf1系统能够促使pre-crRNA中多个crRNA自我剪切和释放的特性,将As/Fn/LbCpf1的核酸酶区域定点突变形成dCpf1,并在C端和N端分别引入了VPR三元转录激活域和不稳定结构域(DD-domain)、四环素控制的操纵子,构建了TRE3G-DD-dCpf1-VPR激活系统.结果显示,Oct4基因的转录水平提升高达104倍,且Myod1、Oct4基因的转录水平分别在Dox和TMP单药的控制下,能够实现不同程度的转录水平的提升,在加双药的条件下Myod1、Oct4基因可分别提高80、120多倍.证明该系统能够通过靶向DNA快捷、高效的进行诱导内源性多基因激活.
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关键词
crispr
/
cpf
1
系统
诱导性
多基因激活
下载PDF
职称材料
题名
敲除PaLoc毒力岛的无毒性艰难梭菌菌株的构建
被引量:
3
1
作者
饶凤琴
程玉梅
吴昌学
王义
崔古贞
齐晓岚
洪伟
机构
贵州医科大学地方病与少数民族疾病教育部重点实验室&贵州省分子生物学重点实验室
贵州医科大学附院综合ICU
美国奥本大学系统生物学系
贵州医科大学基础医学院
出处
《贵州医科大学学报》
CAS
2019年第10期1128-1133,共6页
基金
国家自然科学基金(31560318
31601012
+1 种基金
31760318)
贵州省科技计划项目[黔科合平台人才(2017)5652]
文摘
目的:使用CRISPR-Cfp1系统敲除艰难梭菌毒性(PaLoc)毒力基因岛,构建无毒性艰难梭菌菌株。方法:使用分子克隆方法,构建针对PaLoc毒力岛的基因打靶质粒pWH53;将pWH53质粒转化艰难梭菌630菌株后,诱导Cpf1蛋白表达,PCR筛选发生双交换的PaLoc敲除突变株,测序验证设计位点是否发生等位双交换。结果:PCR结果显示,获得的16株转化子中有8株为敲除PaLoc突变株,阳性率为50%;测序结果显示,获得的8株敲除PaLoc突变株均在设计位点发生了等位双交换。结论:成功构建艰难梭菌毒性毒力岛敲除PaLoc突变株。
关键词
艰难梭菌
crispr
-
cpf
1
系统
PaLoc毒力岛
基因敲除
活菌疫苗
毒性基因
梭菌感染
载体
质粒
Keywords
Clostridioides difficile
crispr
-
cpf
1 system
PaLoc loci
gene knockout
live vaccine
toxic gene
Clostridium difficile infection
vector
plasmid
分类号
R378.8 [医药卫生—病原生物学]
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职称材料
题名
利用RGR核酶结构拓展家蚕CRISPR基因组编辑系统的应用研究
2
作者
张启超
宋红生
曾保胜
陈树清
许军
李芝倩
张忠杰
陈旭
机构
上海大学生命科学学院
中国科学院上海生命科学研究院植物生理生态研究所
出处
《蚕业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第2期226-232,共7页
基金
国家自然科学基金国际合作项目(No.31420103918)
国家自然科学基金重点项目(No.31530072)
文摘
针对目前家蚕基因组编辑平台在基因组特定位点的靶点选择、多靶点同时编辑等方面的技术瓶颈,利用家蚕卵巢培养细胞系(Bm N)验证含有双核酶结构的RGR(Ribozyme-gRNA-Ribozyme)在CRISPR/Cas9基因组编辑系统中的应用效果,用以拓展现有CRISPR/Cas9系统的靶点范围。研究结果显示,采用Cas9系统和Cpf1系统,RGR结构在Bm N细胞中具有良好的定点编辑效果,可成功实现对内源、外源靶基因序列的剪切,且对内外源基因具有高效编辑作用,表明RGR结构可应用于家蚕CRISPR/Cas9和CRISPR/Cpf1基因组编辑系统。利用RGR结构的自剪切功能不仅可以拓展家蚕基因组靶基因的范围,还为进一步实现多靶点编辑打下了基础。
关键词
crispr
/Cas9
系统
crispr
/
cpf
1
系统
RGR核酶结构
家蚕基因组编辑
家蚕卵巢培养细胞
Keywords
crispr
/Cas9 system
crispr
/
cpf
l system
RGR (Ribozyme-gRNA-Ribozyme) structure
Bombyx mori genome editing
BmN cell line
分类号
S881.26 [农业科学—特种经济动物饲养]
Q789 [农业科学—畜牧兽医]
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职称材料
题名
基于CRISPR/Cpf1系统下的诱导型多基因激活体系的建立
3
作者
黄秋月
李中瀚
殷旖珂
机构
四川大学生命科学学院
出处
《四川大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第1期160-164,共5页
基金
四川大学专职博士后项目(2018SCU12053)。
文摘
为开发高效率的内源多基因激活工具,利用CRISPR/Cpf1系统能够促使pre-crRNA中多个crRNA自我剪切和释放的特性,将As/Fn/LbCpf1的核酸酶区域定点突变形成dCpf1,并在C端和N端分别引入了VPR三元转录激活域和不稳定结构域(DD-domain)、四环素控制的操纵子,构建了TRE3G-DD-dCpf1-VPR激活系统.结果显示,Oct4基因的转录水平提升高达104倍,且Myod1、Oct4基因的转录水平分别在Dox和TMP单药的控制下,能够实现不同程度的转录水平的提升,在加双药的条件下Myod1、Oct4基因可分别提高80、120多倍.证明该系统能够通过靶向DNA快捷、高效的进行诱导内源性多基因激活.
关键词
crispr
/
cpf
1
系统
诱导性
多基因激活
Keywords
crispr
/
cpf
1 system
Inducible
Multi-activation
分类号
Q291 [生物学—细胞生物学]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
敲除PaLoc毒力岛的无毒性艰难梭菌菌株的构建
饶凤琴
程玉梅
吴昌学
王义
崔古贞
齐晓岚
洪伟
《贵州医科大学学报》
CAS
2019
3
下载PDF
职称材料
2
利用RGR核酶结构拓展家蚕CRISPR基因组编辑系统的应用研究
张启超
宋红生
曾保胜
陈树清
许军
李芝倩
张忠杰
陈旭
《蚕业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2018
0
下载PDF
职称材料
3
基于CRISPR/Cpf1系统下的诱导型多基因激活体系的建立
黄秋月
李中瀚
殷旖珂
《四川大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2021
0
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职称材料
已选择
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