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基于COX I基因的太平洋西岸文昌鱼地理种群分析 被引量：5
1
作者 李伟业 钟婧 王义权 《Zoological Research》 CAS CSCD 北大核心 2010年第4期375-380,共6页
文昌鱼是进化发育研究的重要模式动物,目前实验材料均采自野外。因此,对其进行正确的物种鉴定和地理种群的遗传分化分析十分必要。该研究扩增并测定了COXⅠ基因部分序列,结合NCBI数据库中的COXΙ序列信息,对太平洋西岸文昌鱼的种类和地... 文昌鱼是进化发育研究的重要模式动物,目前实验材料均采自野外。因此,对其进行正确的物种鉴定和地理种群的遗传分化分析十分必要。该研究扩增并测定了COXⅠ基因部分序列,结合NCBI数据库中的COXΙ序列信息,对太平洋西岸文昌鱼的种类和地理种群分化情况进行了分析。结果表明,马来文昌鱼(Branchiostoma malayanum)、白氏文昌鱼(B.belcheri)和日本文昌鱼(B.japonicum)这3个种之间的遗传差异很大,再次证实3个物种的有效性,同时提出应当审慎对待NCBI数据库中文昌鱼的种名标注;太平洋西岸文昌鱼属Branchiostoma的3种文昌鱼群体遗传多样性均处于较高水平,同一物种的不同地理种群间没有出现明显的遗传分化,反映了海洋动物的基因交流较容易,不同海域隔离较弱。 展开更多
关键词 文昌鱼 coxⅰ基因 地理种群 物种
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捻转血矛线虫线粒体COXⅠ基因序列测定及进化分析 被引量：4
2
作者 白鹏霞 郝宝成 +1 位作者 陈长江 项海涛 《中兽医医药杂志》 2016年第5期13-16,共4页
为了对捻转血矛线虫进行分子鉴定,并且探寻其与毛圆科内不同属线虫存在差异的分子水平关联性,对采自牦牛体内的捻转血矛线虫线粒体COXⅠ基因部分序列进行扩增与进化分析,扩增出的序列登录到GenBank,登录号：KU314701。进化分析结果显示... 为了对捻转血矛线虫进行分子鉴定,并且探寻其与毛圆科内不同属线虫存在差异的分子水平关联性,对采自牦牛体内的捻转血矛线虫线粒体COXⅠ基因部分序列进行扩增与进化分析,扩增出的序列登录到GenBank,登录号：KU314701。进化分析结果显示,捻转血矛线虫H-yak线粒体COXⅠ基因与毛圆科不同属线虫的线粒体COXⅠ基因同源性在85.5%～97.4%之间,其中与KJ724363.1的同源性最高,达到97.4%;其编码的蛋白氨基酸序列与血矛属线虫的线粒体细胞色素C氧化酶亚基Ⅰ蛋白的氨基酸序列完全相同,同源性为100%,且与长刺属线虫的同源性极高,同为100%,但与古柏属和奥斯特属的线虫蛋白同源性均为98.7%。该研究在基因和蛋白两个层面间接印证了毛圆科内不同属线虫在形态和生活史方面有较多相似和不同之处。 展开更多
关键词 捻转血矛线虫 线粒体 coxⅰ基因 序列测定 进化分析
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香螺线粒体COXⅠ和CYTB基因遗传多样性研究 被引量：3
3
作者 张旦旦 王煜 +6 位作者 李卓 田莹 王荦 毛俊霞 王许波 常亚青 郝振林 《大连海洋大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第4期612-619,共8页
为探明香螺Neptunea cumingii遗传多样性水平及其种质资源背景,采用分子生物学技术对中国黄、渤海海域6个不同地理群体香螺COXⅠ和CYTB基因的遗传多样性进行比较分析。结果表明:COXⅠ基因序列长度为1536 bp,多态性位点141个,共定义COX... 为探明香螺Neptunea cumingii遗传多样性水平及其种质资源背景,采用分子生物学技术对中国黄、渤海海域6个不同地理群体香螺COXⅠ和CYTB基因的遗传多样性进行比较分析。结果表明:COXⅠ基因序列长度为1536 bp,多态性位点141个,共定义COXⅠ单倍型11个,大连市大连湾群体(DL)的单倍型COXⅠ-10变异位点数最多(115个),群体内遗传多样性分析显示,大连湾群体的平均核苷酸差异数(K)和遗传多样性指数(P i)最高,分别为31.133和0.02121,群体间比较结果显示,烟台市八角港群体(YT)与蓬莱市长岛群体(PL)间的K值最低(2.094),大连湾群体与大连市旅顺盐场群体(LS)间的K值最高(24.971);CYTB基因序列全长为1140 bp,多态性位点34个,共定义单倍型14种,群体内遗传多样性分析显示,大连市獐子岛群体(ZZ)和大连市旅顺盐场群体的K和P i值最高,分别为13.444和0.01236,群体间比较结果显示,烟台市八角港群体与蓬莱市长岛群体间K值最低(1.395),大连湾群体与旅顺盐场群体间的K值最高(11.497);聚类分析结果显示,6个不同群体香螺的线粒体COXⅠ和CYTB基因有显著性差异,分子方差分析(AMOVA)显示,群体内变异远大于群体间差异。研究表明,不同海域香螺未出现明显的群体间差异,且群体内变异远大于群体间差异,不同海域间香螺未达到亚种分化。 展开更多
关键词 香螺 coxⅰ基因 CYTB基因 遗传多样性
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基于COXⅠ及ITS基因粪类圆线虫PCR鉴定方法的建立 被引量：1
4
作者 芦亚君 邢维媚 夏乾峰 《实验与检验医学》 CAS 2021年第2期267-270,共4页
目的探讨以COXⅠ及ITS基因作为分子标记的PCR技术在粪类圆线虫病诊断中的应用。方法收集粪类圆线虫病患者的粪便作为检验物,离心沉淀法处理粪便,弃去粪渣,浓集、纯化粪便中的粪类圆线虫虫体,光学显微镜下观察虫体做形态学初判。PCR扩增... 目的探讨以COXⅠ及ITS基因作为分子标记的PCR技术在粪类圆线虫病诊断中的应用。方法收集粪类圆线虫病患者的粪便作为检验物,离心沉淀法处理粪便,弃去粪渣,浓集、纯化粪便中的粪类圆线虫虫体,光学显微镜下观察虫体做形态学初判。PCR扩增COXⅠ及ITS基因,1%琼脂糖凝胶电泳鉴定目的片段。结果琼脂糖凝胶电泳紫外成像显示,COXⅠ和ITS基因目的条带单一、清晰,大小分别约为1500bp和900bp。COXⅠ基因的退火温度为48℃、ITS退火温度为50℃时有清晰的特异性条带。COX I基因条带与Genebank中其他线虫COX I基因片段大小一致,可作为粪类圆线虫虫种鉴定的分子标记。而在Genebank中检索到不同线虫的ITS基因,分别含有18S、5.8S和28S的部分或完全序列,因此碱基长度变化较大,若以ITS鉴别虫种需进一步做Blast分析。结论基于COXⅠ及ITS基因的粪类圆线虫分子检验方法应用于临床上,可有效提高粪类圆线虫病诊断的特异性和敏感性。 展开更多
关键词 粪类圆线虫 coxⅰ基因 ITS基因
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