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MSCs心肌样细胞分化过程中GCN5募集促分化相关蛋白的筛选 被引量:5
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作者 周娜 朱静 +4 位作者 田杰 李娅莎 邓兵 张亚兰 智深深 《中国细胞生物学学报》 CAS CSCD 2010年第1期61-68,共8页
筛选并分析间充质干细胞(mesenchymal stem cells,MSCs)诱导分化为心肌样细胞过程中GCN5招募促分化相关蛋白集合体的组成。免疫荧光细胞化学、实时荧光定量PCR鉴定MSCs经5-氮杂胞苷(5-azacytidine,5-azaC)诱导分化为心肌样细胞;免疫共... 筛选并分析间充质干细胞(mesenchymal stem cells,MSCs)诱导分化为心肌样细胞过程中GCN5招募促分化相关蛋白集合体的组成。免疫荧光细胞化学、实时荧光定量PCR鉴定MSCs经5-氮杂胞苷(5-azacytidine,5-azaC)诱导分化为心肌样细胞;免疫共沉淀技术分离、串联质谱鉴定GCN5募集蛋白集合体组成,并从心肌细胞分化角度筛选、验证分化相关蛋白因子。MSCs经5-azaC诱导分化的心肌样细胞表达心肌特异性基因GATA4、MEF2C和心肌细胞结构、功能蛋白cTnt、MHC和Cx43;筛选、验证出心肌细胞分化相关GCN5招募蛋白归类为:(1)DNA结合蛋白Sp1/KLF;(2)转录辅激活子PGC-1α和Rb1;(3)转录延伸复合体组成成分以及信号通路蛋白Akt。通过筛选获得MSCs经诱导向心肌样细胞分化过程中心肌分化相关蛋白因子,为进一步研究干细胞分化信号传导途径、特异性生物靶点干预以及提高干细胞分化效率打下了基础。 展开更多
关键词 间充质干细胞 分化 组蛋白乙酰转移酶GCN5 coip MS/MS
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植物中验证蛋白相互作用的Pull-down和Co-IP技术 被引量:4
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作者 徐重益 《植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第1期62-68,共7页
蛋白互作在细胞生命活动中发挥关键作用,在不同时空层面上参与多种细胞学过程,因此研究蛋白互作对理解分子调控网络至关重要。通常情况下,利用酵母双杂交系统筛选植物蛋白互作必须通过体外和体内系统进行验证。Pull-down和Co-IP是验证... 蛋白互作在细胞生命活动中发挥关键作用,在不同时空层面上参与多种细胞学过程,因此研究蛋白互作对理解分子调控网络至关重要。通常情况下,利用酵母双杂交系统筛选植物蛋白互作必须通过体外和体内系统进行验证。Pull-down和Co-IP是验证植物蛋白互作的常用技术。Pull-down被广泛用于体外验证蛋白间的直接互作;而在植物活体内,利用本氏烟草(Nicotiana benthamiana)叶片瞬时表达蛋白,继而通过Co-IP进行鉴定是目前验证蛋白互作最简单且最有效的方法之一。该文对GST Pull-down和烟草瞬时表达系统中Co-IP技术原理及实验方案进行详细描述,以期为验证植物蛋白互作提供参考。 展开更多
关键词 植物 蛋白互作 Pull-down co-ip
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HAX1 deletion impairs BCR internalization and leads to delayed BCR-mediated apoptosis 被引量:2
3
作者 Susanne Wolkerstorfer Elisabeth Schwaiger +4 位作者 Mark Rinnerthaler Iris Karina Gratz Thomas Zoegg Hans Brandstetter Gertrude Achatz-Straussberger 《Cellular & Molecular Immunology》 SCIE CAS CSCD 2016年第4期451-461,共11页
Deletion of HAX1 in mice causes a severe reduction in the numbers of lymphocytes in the bone marrow and in the spleen. Additionally, B220+ B progenitor cells in the bone marrow are reduced, suggesting an important fu... Deletion of HAX1 in mice causes a severe reduction in the numbers of lymphocytes in the bone marrow and in the spleen. Additionally, B220+ B progenitor cells in the bone marrow are reduced, suggesting an important function of HAX1 in B cell development. HAX1 is thought to play a protective role in apoptotic processes; therefore, we investigated the role of HAX1 in bone marrow B progenitor cells and splenic B cells. We did not observe an effect on the survival of Hax1-/- bone marrow cells but detected enhanced survival of splenic Hax1-/- B cells upon in vitro starvation/ growth-factor withdrawal. To explain this apparent inconsistency with previous reports of HAX1 function, we also studied the B cell receptor (BCR)-induced apoptosis of IgM-stimulated splenic naive B cells and found that apoptosis decreased in these cells. We further found impaired internalization of the BCR from Hax1-/- splenic B cells after IgM crosslinking; this impaired internalization may result in decreased BCR signaling and, consequently, decreased BCR-mediated apoptosis. We measured HAX1 binding to the cytoplasmic domains of different Ig subtypes and identified KVKWI(V)F as the putative binding motif for HAX1 within the cytoplasmic domains. Because this motif can be found in almost all Ig subtypes, it is likely that HAX1 plays a general role in BCR-mediated internalization events and BCR-mediated apoptosis. 展开更多
关键词 VIABILITY apoptosis INTERNALIZATION BCR surface plasmon resonance analysis (SPRA) wild type (WT) B cellreceptor (BCR) co-immunoprecipitation co-ip room temperature (RT) annexin V(A) eFluor (eF)
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伪狂犬病病毒UL56蛋白与宿主蛋白Nedd4相互作用的研究 被引量:3
4
作者 王书文 吕闯 蔡雪辉 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第6期553-559,共7页
伪狂犬病病毒(PRV)UL56蛋白(pUL56)属于Ⅱ型膜蛋白。近期研究结果表明PRVpUL56与PRV对啮齿动物的致病性相关。为揭示PRVpUL56与宿主相互作用的分子基础,本研究通过免疫共沉淀(Co-IP)试验确定了pUL56与神经前体细胞表达的发育下调蛋白4(N... 伪狂犬病病毒(PRV)UL56蛋白(pUL56)属于Ⅱ型膜蛋白。近期研究结果表明PRVpUL56与PRV对啮齿动物的致病性相关。为揭示PRVpUL56与宿主相互作用的分子基础,本研究通过免疫共沉淀(Co-IP)试验确定了pUL56与神经前体细胞表达的发育下调蛋白4(Nedd4)存在相互作用。进一步,利用激光共聚焦试验确定过表达pUL56与Nedd4在转染HEK293T细胞的高尔基体存在共定位。通过互作,pUL56可以将细胞质分布的Nedd4重新定位于高尔基体。前期研究表明,含有WW结构域的宿主蛋白可以与含有PPxY(PY)基序的病毒蛋白互作。因此,本研究构建了pUL56PY基序丙氨酸突变体(PPxY/AAxY),利用Co-IP试验对pUL56突变体和Nedd4相互作用进行验证,结果表明随着pUL56PY基序突变的增加,蛋白互作能力逐渐减弱。此外,pUL56通过其PY基序显著下调Nedd4的表达。这些结果证实了PRVpUL56与Nedd4主要通过WW结构域/PY基序模式发挥相互作用,并下调Nedd4的表达。因此,本研究为阐明PRVpUL56与宿主相互作用的分子机制提供了参考依据。 展开更多
关键词 伪狂犬病病毒 pUL56 高尔基体 co-ip 蛋白互作
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组蛋白乙酰化酶调控MSCs经5-azaC诱导后的细胞周期和增殖特性 被引量:3
5
作者 周娜 朱静 +3 位作者 田杰 张亚兰 邓兵 李娅莎 《基础医学与临床》 CSCD 北大核心 2010年第7期689-697,共9页
目的阐述组蛋白乙酰化酶GCN5在间充质干细胞(MSC)经5-氮杂胞苷(5-azaC)诱导过程中的作用及其转录调控机制。方法 MTT法、流式细胞术检测细胞周期和细胞增殖;定量PCR检测P21基因表达;CH IP技术验证GCN5募集蛋白复合体与P21基因的相互作用... 目的阐述组蛋白乙酰化酶GCN5在间充质干细胞(MSC)经5-氮杂胞苷(5-azaC)诱导过程中的作用及其转录调控机制。方法 MTT法、流式细胞术检测细胞周期和细胞增殖;定量PCR检测P21基因表达;CH IP技术验证GCN5募集蛋白复合体与P21基因的相互作用及P21基因启动子区域的乙酰化水平;Co-IP技术分离、串联质谱技术鉴定GCN5募集蛋白复合体组成。结果 MSCs经5-azaC诱导3 d后,G0/G1期细胞比例、P21基因表达量最高,此后逐渐降低,细胞增殖指数及G2/S期细胞比例与上述结果相反;筛选出GCN5募集蛋白复合体为:依赖ATP的染色质重塑复合体成分、转录起始复合体成分、转录因子和锌指结构蛋白;诱导组GCN5与P21基因启动子区域结合能力及P21基因启动子区域组蛋白H3乙酰化水平高于未诱导组。结论 GCN5募集蛋白复合体通过结合于P21基因启动子区域参与调控MSCs经5-azaC诱导体外分化过程中细胞周期G0/G1期和细胞增殖特性的调控。 展开更多
关键词 间充质干细胞 细胞周期 组蛋白乙酰化酶GCN5 co-ip CHip
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肝癌细胞中VIPR1互作蛋白质谱分析及肝癌预后模型的构建
6
作者 王小燕 张豪 +1 位作者 郭泽皓 莫之婧 《现代肿瘤医学》 CAS 北大核心 2023年第17期3176-3182,共7页
目的:寻找与血管活性肠肽受体1(vasoactive intestinal peptide receptor 1,VIPR1)相互作用的蛋白并构建肝细胞肝癌(hepatocellular carcinoma,HCC)预后模型。方法:采用免疫共沉淀技术(Co-immunoprecipitation,Co-IP)筛选Flag标签抗体... 目的:寻找与血管活性肠肽受体1(vasoactive intestinal peptide receptor 1,VIPR1)相互作用的蛋白并构建肝细胞肝癌(hepatocellular carcinoma,HCC)预后模型。方法:采用免疫共沉淀技术(Co-immunoprecipitation,Co-IP)筛选Flag标签抗体结合的蛋白复合体,采用SDS-PAGE银染实验和Western blot进行验证,采用质谱分析(liquid chromatograph-mass spectrometer,LC-MS)获得VIPR1的互作蛋白,采用生物信息学软件和癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas project,TCGA)数据库筛选hub互作蛋白、富集分析、构建HCC预后模型并采用国际癌症基因组联盟(International Cancer Genome Consortium,ICGC)中LIHC数据和GSE14520数据集作为外部数据对其预测准确性进行验证。结果:得到196个VIPR1的互作蛋白,筛选出8个关键模块共104个hub互作蛋白,主要与细胞骨架、核糖体的功能和细胞免疫密切相关,获得7个关键蛋白并构建了HCC预后Lasso回归模型,随后在两个外部数据集中验证了该模型在预测HCC预后方面具有可接受的准确性及临床适用性。结论:VIPR1的互作蛋白可促进HCC发生发展,其中关键蛋白构建的HCC预后模型有良好的准确性。 展开更多
关键词 VipR1 HCC 免疫共沉淀 质谱 预后
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流感病毒NP蛋白与宿主蛋白SNRPA的相互作用研究 被引量:4
7
作者 张杰 罗维玉 +7 位作者 周圆 王广文 赵玉辉 周陈陈 黄山雨 李呈军 陈化兰 姜丽 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第3期167-171,共5页
流感病毒核蛋白(NP)是由病毒RNA节段5编码的主要结构蛋白,与病毒基因组RNA及聚合酶(PB1、PB2、PA)构成核糖核蛋白(vRNP)复合体,是病毒基因组的转录和复制的基本功能单位。本实验室采用酵母双杂交技术从人细胞系cDNA文库中筛选与流感病... 流感病毒核蛋白(NP)是由病毒RNA节段5编码的主要结构蛋白,与病毒基因组RNA及聚合酶(PB1、PB2、PA)构成核糖核蛋白(vRNP)复合体,是病毒基因组的转录和复制的基本功能单位。本实验室采用酵母双杂交技术从人细胞系cDNA文库中筛选与流感病毒NP蛋白相互作用的宿主蛋白U1 small nuclear ribonucleoprotein A(SNRPA)。本研究通过酵母回交验证、免疫共沉淀(Co-IP)和GST pull down试验进一步证实NP与SNRPA之间存在直接相互作用。利用siRNA干扰基因的表达后,流感病毒的复制滴度在24 h和48 h分别下降2.7倍和1.75倍,表明SNRPA蛋白表达对流感病毒的复制发挥正调控作用。本研究丰富了流感病毒蛋白与宿主蛋白之间的蛋白质调控网络,为进一步研究流感病毒复制调控的机制奠定了基础。 展开更多
关键词 酵母双杂交 co-ip NP蛋白 SNRPA蛋白 相互作用
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LUBAC介导RabGEF1的线性泛素化修饰
8
作者 黄彬 张令强 张学利 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2023年第4期749-759,共11页
目的验证RabGEF1(Rab guanine nucleotide exchange factor 1)为线性泛素化修饰的新底物。方法在pEF6/MycHis C载体中克隆人RabGEF1基因。通过免疫共沉淀(Co-IP)实验验证RabGEF1和HOIP的相互作用。利用GST-pulldown实验探索RabGEFl与HOI... 目的验证RabGEF1(Rab guanine nucleotide exchange factor 1)为线性泛素化修饰的新底物。方法在pEF6/MycHis C载体中克隆人RabGEF1基因。通过免疫共沉淀(Co-IP)实验验证RabGEF1和HOIP的相互作用。利用GST-pulldown实验探索RabGEFl与HOIP相互作用结构域。通过免疫荧光实验验证RabGEF1和HOIP的相互作用与亚细胞定位。应用体内泛素化实验检测RabGEF1的线性泛素化修饰。通过NTA-His泛素化实验进一步明确RabGEF1能够发生线性泛素化修饰。将RabGEF1的泛素化蛋白质样品进行质谱分析,根据质谱结果提示的RabGEF1泛素化位点构建赖氨酸位点突变质粒,进一步在体内泛素化实验中验证RabGEF1的线性泛素化修饰位点。结果RabGEF1与HOIP存在相互作用,且HOIP通过ZF-NEF结构域与RabGEF1发生直接相互作用。RabGEF1与HOIP共同定位于细胞质。LUBAC介导RabGEF1发生线性泛素化修饰依赖于LUBAC酶活性,RabGEF1泛素化修饰位点为K158。结论RabGEFl为线性泛素化修饰的新底物,且K158是其发生线性泛素化修饰的位点。 展开更多
关键词 RabGEF1 线性泛素化修饰 LUBAC 免疫共沉淀
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Screening and identifkation of proteins interacting with nudeostemin 被引量:3
9
作者 Hai-Xia Yang Geng-Lin Jin +3 位作者 Ling Meng Jian-Zhi Zhang Wen-Bin Liu Cheng-Chao Shou 《World Journal of Gastroenterology》 SCIE CAS CSCD 2005年第31期4812-4814,共3页
AIM: To identify the proteins interacting with nucleostemin (NS), thereby gaining an insight into the function of NS. METHODS: Yeast two-hybrid assay was performed to screen a human placenta cDNA library with the ... AIM: To identify the proteins interacting with nucleostemin (NS), thereby gaining an insight into the function of NS. METHODS: Yeast two-hybrid assay was performed to screen a human placenta cDNA library with the full length of NS as a bait. X-Gal assay and β-galactosidase filter assay were subsequently conducted to check the positive clones and the gene was identified by DNA sequencing. To further confirm the interaction of two proteins, the DNA fragment coding NS and the DNA fragment isolated from the positive clone were inserted into the mammalian expression vector pcDNA3 and pcDNA3-myc, respectively. Then, two plasmids were cotransfected into the COS-7 cells by DEAE-dextron. The total protein from the cotransfected cells was extracted and coimmunoprecipitation and Western blot were performed with suitable antibodies sequentially. RESULTS: Two positive clones that interacted with NS were obtained from human placenta cDNA library. One was an alpha isoform of human protein phosphatase 2 regulatory subunit B (B56) (PPP2RSA) and the other was a novel gene being highly homologous to the gene associated with spondylo paralysis. The co-immunoprecipitation also showed that NS specifically interacted with PPP2R5A. CONCLUSION: NS and PPP2R5A interact in yeast and mammalian cells, respectively, which is helpful for addressing the function of NS in cancer development and progression. 展开更多
关键词 NUCLEOSTEMIN Yeast two-hybrid co-ip
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全反式视黄酸通过RARγ蛋白直接调控PPARγ2蛋白抑制骨髓间充质干细胞成脂分化 被引量:3
10
作者 刘祖银 李清 +2 位作者 陈丽君 陈洁 刘友学 《上海交通大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2015年第5期682-687,共6页
目的研究高浓度全反式视黄酸(atRA)抑制大鼠骨髓间充质干细胞(r BMSCs)成脂分化过程中,视黄酸核受体γ(RARγ)对过氧化物酶体增殖激活受体γ2(PPARγ2)与CCAAT增强子结合蛋白α(C/EBPα)调控的机制。方法体外分离、培养、诱导r BMSCs。... 目的研究高浓度全反式视黄酸(atRA)抑制大鼠骨髓间充质干细胞(r BMSCs)成脂分化过程中,视黄酸核受体γ(RARγ)对过氧化物酶体增殖激活受体γ2(PPARγ2)与CCAAT增强子结合蛋白α(C/EBPα)调控的机制。方法体外分离、培养、诱导r BMSCs。成脂分化诱导液中,加入0.5、1.0μmol/L atRA持续作用15 d后,real-time PCR和Western blotting分别检测RARγ、C/EBPα、PPARγ2的mRNA和蛋白表达水平。重组腺病毒过表达RARγ(over-RARγ)、沉默RARγ(si-RARγ)分别感染BMSCs,采用real-time PCR及Western blotting检测RARγ、C/EBPα、PPARγ2的mRNA及蛋白表达水平。Co-IP检测1.0μmol/L atRA持续成脂诱导15 d后,明确RARγ与PPARγ2两者之间是否有相互作用。结果诱导15 d结束时,与对照组相比,加入0.5、1.0μmol/L atRA后,RARγ表达明显增加(P<0.01,P<0.001),而PPARγ2、C/EBPα表达明显降低(P<0.001)。over-RARγ组:RARγmRNA和蛋白表达均较对照组明显增加(P<0.01),而PPARγ2、C/EBPαmRNA和蛋白表达均较对照组明显降低(P<0.05,P<0.01)。si-RARγ组:RARγ蛋白表达较对照组明显减低,但PPARγ2、C/EBPα却无明显变化。Co-IP结果提示:RARγ与PPARγ2蛋白之间有直接作用,形成复合物,未发现其与视黄酸反应元件(RARE)相结合证据。结论高浓度atRA抑制r BMSCs成脂分化,是通过激活视黄酸信号通路RARγ而实现的。RARγ下调成脂分化通路PPARγ2、C/EBPα表达是通过直接作用于下游的PPARγ2蛋白而实现的。 展开更多
关键词 全反式视黄酸 RARγ PPARΓ2 骨髓间充质干细胞 co-ip
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小麦翻译控制肿瘤蛋白TCTP与蔗糖非酵解型蛋白激酶SnRK1的相互作用 被引量:3
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作者 麻楠 乔金柱 +6 位作者 汤文倩 孙天杰 刘娜 陈琰 路兴通 韩胜芳 王冬梅 《生物工程学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第9期1686-1697,共12页
翻译控制肿瘤蛋白(Translationally controlled tumor protein, TCTP)广泛存在于真核细胞中,参与调节细胞分裂、植物生长发育,并介导植物抵御病原物侵染。蔗糖非酵解型蛋白激酶(SNF1-related protein kinase, SnRK1)在酵母、动物和植物... 翻译控制肿瘤蛋白(Translationally controlled tumor protein, TCTP)广泛存在于真核细胞中,参与调节细胞分裂、植物生长发育,并介导植物抵御病原物侵染。蔗糖非酵解型蛋白激酶(SNF1-related protein kinase, SnRK1)在酵母、动物和植物中非常保守,并参与包括糖代谢和抵抗非生物和生物胁迫在内的一系列生理过程。本实验室前期工作证明TaTCTP响应叶锈菌侵染并参与诱发寄主产生防卫反应。为了深入探讨TaTCTP在叶锈菌侵染小麦诱发的防卫反应中发挥的作用,采用串联亲和纯化(TAP)与质谱(MS)联用技术,鉴定出SnRK1可能为TaTCTP潜在互作蛋白。文中对TCTP和SnRK1的相互作用进行了研究。酵母双杂交结果表明,同时携带TCTP和SnRK1的酵母可以在SD/-Leu/-Trp/-His/-Ade(SD/-LWHA,四缺)培养基上生长,说明TCTP与SnRK1在酵母双杂交系统中可以发生相互作用;通过双分子荧光互补实验,发现TCTP与SnRK1发生相互作用的荧光信号分布在细胞质中;进一步用Co-IP实验证明TCTP和SnRK1可以发生相互作用。本研究为深入研究TaTCTP在小麦与叶锈菌互作过程中的作用机制奠定了重要基础,对进一步完善小麦抵御叶锈菌侵染的分子机理具有重要意义。 展开更多
关键词 翻译控制肿瘤蛋白 蔗糖非酵解型蛋白激酶 酵母双杂交 双分子荧光互补 免疫共沉淀
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与猪流行性腹泻病毒M蛋白互作的宿主蛋白的鉴定 被引量:3
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作者 王瑞阳 于瑞嵩 +5 位作者 陈冰清 李凤平 谢春芳 司伏生 董世娟 李震 《微生物学通报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第6期1434-1442,共9页
【背景】猪流行性腹泻病毒(Porcine epidemic diarrhea virus,PEDV)膜蛋白(M)在病毒粒子的组装、膜融合和病毒复制等方面具有重要的作用,但M蛋白与宿主细胞的互作机制尚不清楚。【目的】利用免疫沉淀技术和液质联用技术筛选细胞内与PEDV... 【背景】猪流行性腹泻病毒(Porcine epidemic diarrhea virus,PEDV)膜蛋白(M)在病毒粒子的组装、膜融合和病毒复制等方面具有重要的作用,但M蛋白与宿主细胞的互作机制尚不清楚。【目的】利用免疫沉淀技术和液质联用技术筛选细胞内与PEDVM蛋白相互作用的蛋白,为揭示M蛋白在病毒增殖过程中发挥的功能提供研究基础。【方法】将MOI=0.1的PEDV DR13疫苗株接种于长成单层的Vero细胞,感染36 h后,收集细胞并进行裂解。利用抗M的单克隆抗体沉淀与M相互作用蛋白复合物,通过液相色谱串联质谱(LC-MS/MS)进行鉴定并利用细胞功能富集分析(Gene ontology,GO)对感染组鉴定到的细胞蛋白进行分析,确定两个细胞内源性蛋白为候选蛋白,进行免疫共沉淀(Co-IP)验证和共定位分析。【结果】基于鉴定蛋白的肽段数的方法分析显示,感染组与对照组相比,鉴定了218个与M蛋白相互作用的细胞内源性蛋白,分别与蛋白质合成、代谢、细胞信号通路转导等密切相关,选择细胞分裂周期蛋白42 (Cell division cycle 42,CDC42)、真核翻译起始因子3亚基L蛋白(eIF3L)为候选蛋白进行Co-IP(Co-immunoprecipitation)验证和共定位分析,结果证实CDC42、eIF3L蛋白分别与M蛋白在细胞内存在相互作用。【结论】鉴定出PEDV M蛋白能够与宿主细胞CDC42和eIF3L蛋白相互作用,并鉴定出其他可能与M蛋白发生相互作用的宿主蛋白60个,为开展PEDV与宿主细胞蛋白相互作用研究提供了重要理论依据。 展开更多
关键词 免疫共沉淀 猪流行性腹泻病毒 CDC42 eIF3L 膜蛋白 蛋白互作
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暹罗炭疽菌中脂滴包被蛋白Cap20与乙酸激酶CsAck的互作研究
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作者 王娜 王记圆 +4 位作者 李潇 张宇 刘文波 林春花 缪卫国 《热带作物学报》 CSCD 北大核心 2022年第3期582-588,共7页
暹罗炭疽菌(Colletotrichum siamense)是一种重要的病原真菌,是我国橡胶树炭疽病(Colletotrichum leaf disease,CLD)的田间优势病原种,也是热带、亚热带地区许多其他农林作物炭疽病的主要病原种。脂滴是细胞的中性脂,存在于绝大多数真... 暹罗炭疽菌(Colletotrichum siamense)是一种重要的病原真菌,是我国橡胶树炭疽病(Colletotrichum leaf disease,CLD)的田间优势病原种,也是热带、亚热带地区许多其他农林作物炭疽病的主要病原种。脂滴是细胞的中性脂,存在于绝大多数真核细胞中,是细胞内甘油三酯的主要贮存形式。脂滴在细胞内可以参与脂质代谢、膜转运、蛋白降解和信号传导等。包被蛋白(perilipin)是脂滴表面最丰富的脂质相关蛋白,主要存在于动植物体内,对细胞内脂滴代谢起着重要的调控作用。Cap20是暹罗炭疽菌中包被蛋白的同源蛋白,前期证实Cap20是一个致病相关蛋白,它参与了炭疽菌附着胞膨压形成、脂滴数量和致病性。了解其互作蛋白和互作的生物学意义可能为深入了解脂滴包被蛋白参与的致病分子机制具有重要意义。课题组前期通过酵母双杂交技术在暹罗炭疽菌cDNA文库中筛选到一个与Cap20互作的候选蛋白乙酸激酶,本研究克隆了该乙酸激酶的编码基因,并进行了蛋白结构和同源蛋白聚类分析。结果表明,乙酸激酶编码基因的DNA大小为1312 bp,包括一个内含子,cDNA为1248 bp,编码415个氨基酸,含有一个乙酸激酶结构域,命名为CsAck。然后构建含6×his标签的原核表达载体PET32a-CsAck,利用其和含GST标签的pGEX6p-1-Cap20(先前构建)进行蛋白表达和纯化,获得含有6×His标签的融合蛋白CsAck和含有GST标签的Cap20。通过Pull down验证了Cap20和CsAck蛋白之间的体外互作。最后,构建含有潮霉素转移酶基因HPH的表达载体PXY203-CsAck-S和含有氯嘧磺隆抗性基因ILV1的表达载体pCB1532-GFP-Cap20,将它们共同转化暹罗炭疽菌野生型菌株获得转化子。Co-IP(Co-immunoprecipitation)的结果证实Cap20和CsAck在暹罗炭疽菌中可以相互作用。该结果证实了致病性相关蛋白Cap20和乙酸激酶CsAck在体外和体内均可发生蛋白互作,可为进一步研究Cap20在暹罗炭 展开更多
关键词 暹罗炭疽菌 Cap20 CsAck 蛋白互作验证 Pull down co-ip
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肺腺癌细胞中PRDM5抑癌作用的分子机制初探 被引量:1
14
作者 马梦楚 任媛媛 刘欣 《天津医科大学学报》 2022年第4期360-365,共6页
目的:解析肺腺癌中PR结构域锌指蛋白5(PRDM5)发挥抑癌功能的分子机制,寻找与PRDM5相互作用的蛋白因子。方法:免疫共沉淀实验(Co-IP)检测肺腺癌细胞系A549和H1299中PRDM5与核小体重塑和去乙酰化酶复合物(NuRD复合物)各组分之间内源性结... 目的:解析肺腺癌中PR结构域锌指蛋白5(PRDM5)发挥抑癌功能的分子机制,寻找与PRDM5相互作用的蛋白因子。方法:免疫共沉淀实验(Co-IP)检测肺腺癌细胞系A549和H1299中PRDM5与核小体重塑和去乙酰化酶复合物(NuRD复合物)各组分之间内源性结合。构建含有GST标签的原核表达载体pGEX-4T-1-HDAC1、pGEX-4T-1-MTA1、pGEX-4T-1-MTA2以及带有His标签的原核表达载体pET-28a(+)-PRDM5。将上述重组质粒转化入大肠埃希菌(E.coli)BL21中诱导融合蛋白成功表达并纯化相应的蛋白。GST-pull down体外实验检测PRDM5与NuRD复合物直接结合的组分。结果:在肺腺癌细胞系A549和H1299中证实PRDM5与NuRD复合物多个主要组分CHD3、CHD4、MTA1/2、HDAC1/2、RbAp46/48、MBD2/3间存在内源性结合。体外GST-pull down实验证实PRDM5与NuRD复合物中的组蛋白去乙酰化酶1(HDAC1)、转移相关蛋白1(MTA1)和转移相关蛋白2(MTA2)组分存在直接结合。结论:肺腺癌细胞中PRDM5与NuRD复合物存在相互作用。 展开更多
关键词 PRDM5 NuRD复合物 免疫共沉淀 肺腺癌
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不同载体微球在p300与RORγt Co-IP实验效率的比较
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作者 王秀男 滕霄 +4 位作者 刘彪 殷浩程 任翠平 刘淼 沈际佳 《安徽医科大学学报》 CAS 北大核心 2019年第11期1722-1725,共4页
目的:在免疫共沉淀(Co-IP)过程中使用Protein A/G-琼脂糖珠捕获蛋白和使用Protein A/G-磁珠捕获蛋白的比较分析。方法先通过共转染Flag-p300和Myc-RORγt质粒入人胚肾细胞系293T(HEK293T)进行过表达,裂解细胞制备蛋白,分别使用Protein A... 目的:在免疫共沉淀(Co-IP)过程中使用Protein A/G-琼脂糖珠捕获蛋白和使用Protein A/G-磁珠捕获蛋白的比较分析。方法先通过共转染Flag-p300和Myc-RORγt质粒入人胚肾细胞系293T(HEK293T)进行过表达,裂解细胞制备蛋白,分别使用Protein A/G-琼脂糖珠捕获蛋白和使用Protein A/G-磁珠捕获蛋白进行Co-IP;再通过分离人脐血单个核细胞诱导分化人辅助性T细胞17(Th17)进行Co-IP比较分析;通过CCK8实验排除转染试剂等对细胞活性毒性。结果过表达的HEK293T细胞和诱导分化的Th17细胞中均显示腺病毒E1A结合蛋白(p300)与维甲酸相关孤儿核受体(RORγt)在Co-IP过程中使用Protein A/G-磁珠捕获大分子的p300蛋白效果好于中分子的RORγt蛋白,使用Protein A/G-琼脂糖珠捕获中分子的RORγt蛋白效果好于大分子的p300蛋白。结论在Co-IP过程中使用Protein A/G-磁珠捕获大分子蛋白效果较好,使用Protein A/G-琼脂糖珠捕获中分子蛋白效果较好。 展开更多
关键词 P300 维甲酸相关孤儿核受体 co-ip PROTEIN A/G-琼脂糖珠 PROTEIN A/G-磁珠
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高脂、禁食条件下CIDEC互作蛋白的分析
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作者 崔涵 靳艺 +3 位作者 杨冉冉 李一星 邹知明 周磊 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2016年第12期3241-3248,共8页
脂肪过度沉积是引起肥胖的最主要原因。脂肪沉积水平受到脂肪代谢的影响。CIDEC是近年研究新发现的一种脂肪滴结合蛋白,是调控脂肪滴发育和脂肪沉积的关键因子。本研究以小鼠为动物模型,采用Co-IP和质谱分析等实验方法,从蛋白功能、亚... 脂肪过度沉积是引起肥胖的最主要原因。脂肪沉积水平受到脂肪代谢的影响。CIDEC是近年研究新发现的一种脂肪滴结合蛋白,是调控脂肪滴发育和脂肪沉积的关键因子。本研究以小鼠为动物模型,采用Co-IP和质谱分析等实验方法,从蛋白功能、亚细胞定位、GO、KEGG功能及其富集度等方面解析CIDEC在高脂和禁食条件下互作蛋白的差异,为理解CIDEC感应机体能量状态的分子机制,及在不同生理条件下的信号传导和功能转换提供实验依据。 展开更多
关键词 肥胖 CIDEC co-ip 互作蛋白 质谱
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RIG-G基因在酵母双杂交后的蛋白互作验证
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作者 程姗 曾庆韬 童建华 《湖北大学学报(自然科学版)》 CAS 2003年第1期73-76,共4页
RIG G基因是利用全反式维甲酸(ATRA)诱导,采用差异显示PCR方法从APL细胞系NB4中克隆到的一个新基因.采用酵母双杂交的方法筛到了与RIG G发生相互作用的JAB1.由于在酵母这种低等真核细胞中缺少诸如高等真核细胞中各种保证蛋白正常生物学... RIG G基因是利用全反式维甲酸(ATRA)诱导,采用差异显示PCR方法从APL细胞系NB4中克隆到的一个新基因.采用酵母双杂交的方法筛到了与RIG G发生相互作用的JAB1.由于在酵母这种低等真核细胞中缺少诸如高等真核细胞中各种保证蛋白正常生物学功能发挥所必需的翻译后修饰,这种方法筛到的阳性克隆并不一定代表了真实的作用,所以在COS7细胞中采用了CO IP(co immunoprecipitation)实验,间接法、直接法均证实了这种相互作用. 展开更多
关键词 RIG-G基因 差异显示 PCR 酶母双杂交 co-ip 高等真核水平 coS7
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泛素特异性蛋白酶18刺激乙型肝炎病毒复制的初步研究 被引量:1
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作者 姚敏 李玉佳 +4 位作者 叶海艳 廖鑫忠 赵航 李世林 陈利民 《中国输血杂志》 CAS 2018年第4期361-365,共5页
目的了解泛素特异性蛋白酶18(USP18)对乙型肝炎病毒(HBV)复制的影响及其潜在机制。方法 1)USP18和Pol质粒构建:采用常规基因克隆方法,将人USP18编码序列及HBV多聚酶(Pol)编码序列分别构建到pcDNA3.1-3tag真核细胞表达载体内。2... 目的了解泛素特异性蛋白酶18(USP18)对乙型肝炎病毒(HBV)复制的影响及其潜在机制。方法 1)USP18和Pol质粒构建:采用常规基因克隆方法,将人USP18编码序列及HBV多聚酶(Pol)编码序列分别构建到pcDNA3.1-3tag真核细胞表达载体内。2)研究Pol对USP18的影响:高表达转染Pol质粒至Hep AD38细胞内,抽提细胞内总RNA,逆转录成c DNA,用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)检测Pol对USP18的影响。3)研究USP18对HBV的影响:高表达转染USP18质粒至Hep AD38细胞内,抽提细胞内总RNA和总DNA,qRT-PCR检测USP18对HBV复制的影响。4)研究Pol与USP18之间的相互作用:将Pol质粒按一定比例转染到铺有293T细胞的10cm培养皿中,采用免疫共沉淀的方法检测Pol与USP18之间是否存在相互作用。结果成功构建USP18和Pol表达质粒,并在HepAD38细胞中高表达;过表达Pol蛋白促进USP18表达;过表达USP18刺激HBV复制;Pol与USP18存在相互作用。结论初步证明USP18可能通过与Pol相互作用促进HBV复制。 展开更多
关键词 泛素特异性蛋白酶18(USP18) 乙型肝炎病毒 病毒复制 蛋白免疫印迹试验 实时荧光定量PCR 免疫共沉淀
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基于RNA聚合酶靶点的抗流感病毒药物筛选系统的鉴定 被引量:1
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作者 李娟 房师松 +6 位作者 王昕 吕星 吴春利 程小雯 张仁利 程锦泉 郑青 《中国热带医学》 CAS 2013年第5期527-531,539,共6页
目的鉴定基于聚合酶亚基间相互作用的靶点特异性抗流感病毒药物筛选酵母双杂交体系。方法挑取筛选平板SD/-Ade/-His/-Leu/-Trp/X-α-Gal阳性单菌落(共转化质粒PB1-pGBKT7与PA-pGADT7的AH109酵母细胞)接种培养,PCR验证重组质粒共转是否成... 目的鉴定基于聚合酶亚基间相互作用的靶点特异性抗流感病毒药物筛选酵母双杂交体系。方法挑取筛选平板SD/-Ade/-His/-Leu/-Trp/X-α-Gal阳性单菌落(共转化质粒PB1-pGBKT7与PA-pGADT7的AH109酵母细胞)接种培养,PCR验证重组质粒共转是否成功;glass-beads法提取酵母总蛋白,Western-blot验证融合蛋白在酵母细胞中是否表达;将PB1-pGBKT7质粒PB1基因克隆至载体pAcGFP1-C,PA-pGADT7质粒PA基因克隆至载体pProLabel-C,将构建的重组质粒PB1-pAcGFP1、PA-pProLabel共转染人胚肾GP2-293细胞,Co-IP验证在哺乳动物细胞中流感病毒聚合酶亚基PB1、PA具有相互作用。结果 PB1、PA基因PCR结果均为阳性;PB1-Myc融合蛋白Western-blot结果为阴性,PA-HA融合蛋白Western-blot结果为阳性;PB1-pAcGFP1、PA-pProLabel重组质粒PCR验证结果 PB1、PA基因阳性;Western-blot检测PB1-GFP融合蛋白阳性;Co-IP结果表明流感病毒RNA聚合酶亚基PB1与PA在哺乳动物细胞内具有相互作用。结论基于RNA聚合酶亚基间相互作用的抗流感病毒药物筛选系统构建成功,可以用于抗流感病毒靶点特异性的高通量药物的筛选。 展开更多
关键词 流感病毒聚合酶 酵母双杂交 免疫共沉淀 药物筛选
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FlightlessⅠ与核质转运蛋白Importin β及核孔蛋白Nup88的相互作用 被引量:1
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作者 廖声友 王翠华 +7 位作者 汤冬娥 魏金梅 贺玉娇 熊海庭 徐凤梅 高学娟 刘小会 刘朗夏 《生物工程学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第8期1247-1254,共8页
Fightless I(FLII)是一个在肿瘤中高表达的蛋白,前期研究提示FLII可能参与核质转运过程,为鉴定FLII是否与核膜结合蛋白相互作用,构建GST-FLII、GST-LRR融合蛋白重组质粒并转化至大肠杆菌Rosetta进行诱导表达,使用GST琼脂糖珠进行融合蛋... Fightless I(FLII)是一个在肿瘤中高表达的蛋白,前期研究提示FLII可能参与核质转运过程,为鉴定FLII是否与核膜结合蛋白相互作用,构建GST-FLII、GST-LRR融合蛋白重组质粒并转化至大肠杆菌Rosetta进行诱导表达,使用GST琼脂糖珠进行融合蛋白的纯化。通过SDS-PAGE对纯化蛋白进行验证之后,利用GST-pull down及免疫共沉淀技术证明了FLII与Importinβ、Nup88蛋白的相互作用,并鉴定FLII上的LRR结构域为相互作用区域。研究结果提示FLII可能参与了Importinβ的部分生物学作用,为进一步分析FLII与Importinβ、Nup88的生物学功能奠定了基础。 展开更多
关键词 分子生物学 RNA转运 GST-pull down 免疫共沉淀 FLIGHTLESS IMPORTIN β NUP88
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