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植物具IQ基序的钙调素结合蛋白的研究进展 被引量:19
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作者 田长恩 周玉萍 《植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第4期447-460,共14页
钙调素作为细胞内主要的Ca2+传感蛋白,通过与不同的钙调素结合蛋白的结合传递钙信号,调控细胞生理和生长发育过程。IQ基序(IQxxxRGxxxR,Pfam00612)是少数几个钙调素与钙调素结合蛋白结合的结构域之一。植物具IQ基序的钙调素结合蛋白包括... 钙调素作为细胞内主要的Ca2+传感蛋白,通过与不同的钙调素结合蛋白的结合传递钙信号,调控细胞生理和生长发育过程。IQ基序(IQxxxRGxxxR,Pfam00612)是少数几个钙调素与钙调素结合蛋白结合的结构域之一。植物具IQ基序的钙调素结合蛋白包括IQM、IQD、CAMTA、CNGC和myosin5个家族及少数其它蛋白。该文综述了植物具IQ基序的钙调素结合蛋白的类型、结构特点和功能等方面的研究进展,并对今后的研究进行了展望。 展开更多
关键词 IQ基序 钙调素结合蛋白 钙调素 植物 IQM IQD CAMTA cngc MYOSIN
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Calcium at the Cell Wall-Cytoplast Interface 被引量:17
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作者 Peter K.Hepler Lawrence J.Winship 《Journal of Integrative Plant Biology》 SCIE CAS CSCD 2010年第2期147-160,共14页
Attention is given to the role of Ca^2+ at the interface between the cell wall and the cytoplast, especially as seen in pollen tubes. While the cytoplasm directs the synthesis and deposition of the wall, it is less w... Attention is given to the role of Ca^2+ at the interface between the cell wall and the cytoplast, especially as seen in pollen tubes. While the cytoplasm directs the synthesis and deposition of the wall, it is less well appreciated that the wall exerts considerable self control and influences activities of the cytoplasm. Ca^2+ participates as a crucial factor in this two way communication. In the cytoplasm, a [Ca^2+] above 0.1 μM, regulates myriad processes, including secretion of cell wall components. In the cell wall Ca^2+ , at 10μM to 10 mM, binds negative charges on pectins and imparts structural rigidity to the wall. The plasma membrane occupies a pivotal position between these two compartments, where selective channels regulate influx of Ca^2+ , and specific carriers pump the ion back into the wall. In addition we draw attention to different factors, which either respond to the wall or are present in the wall, and usually generate elevated[Ca^2+ ] in the cytoplasm. These factors include: (i) stretch activated channels; (ii) calmodulin; (iii) annexins; (iv) wall associated kinases; (v) oligogalacturonides; and (vi) extracellular adenosine 5'-triphosphate. Together they provide evidence for a rich and multifaceted system of communication between the cytoplast and cell wall, with Ca^2+ as a carrier of information. 展开更多
关键词 Calcium at the Cell Wall-Cytoplast Interface cngc
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The Role of Cyclic Nucleotide-Gated Ion Channels in Plant Immunity 被引量:14
3
作者 Wolfgang Moeder William Urquhart +1 位作者 Huoi Ung Keiko Yoshioka 《Molecular Plant》 SCIE CAS CSCD 2011年第3期442-452,共11页
Since the first plant cyclic nucleotide-gated ion channel (CNGC), HvCBT1, was identified as a calmodulin bind- ing protein, more than a decade has passed and a substantial amount of work has been done to understand ... Since the first plant cyclic nucleotide-gated ion channel (CNGC), HvCBT1, was identified as a calmodulin bind- ing protein, more than a decade has passed and a substantial amount of work has been done to understand the molecular nature and function of these channel proteins. Based on electrophysiological and heterologous expression analyses, plant CNGCs function as non-selective cation channels and, so far, their biological roles have been reported in defense responses, development, and ion homeostasis. Forward genetic approaches identified four AtCNGCs (AtCNGC2, 4, 11, and 12) to be involved in plant immunity, as null mutants for AtCNGC2, 4, 11, and 12 as well as a gain-of- function mutant for AtCNGC11 and 12 exhibited alterations in defense responses. Since ion flux changes have been reported as one of the early events upon pathogen recognition and also are an essential component for the activation of defense responses, the involvement of CNGCs in these ion flux changes has been suggested. However, the recent detailed characterization of null mutants suggested a more complex involvement of this channel family. In this review, we focus on the discoveries and character- ization of these CNGC mutants and discuss possible roles of CNGCs as components in plant immunity. 展开更多
关键词 cngc cyclic nucleotide-gated ion channel plant immunity DND1 DND2 HLM1 CPR22 ED51.
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植物环核苷酸门控离子通道的研究进展 被引量:10
4
作者 王文颖 柴薇薇 +1 位作者 马清 王锁民 《植物生理学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第11期1799-1808,共10页
环核苷酸门控离子通道(cyclic nucleotide-gated channels,CNGCs)广泛存在于动植物体中,是一类非选择性阳离子通道,由环核苷酸的绑定直接门控。植物中的CNGCs在调节花粉正常发育、维持体内的离子稳态、抵御生物胁迫和非生物胁迫等生长... 环核苷酸门控离子通道(cyclic nucleotide-gated channels,CNGCs)广泛存在于动植物体中,是一类非选择性阳离子通道,由环核苷酸的绑定直接门控。植物中的CNGCs在调节花粉正常发育、维持体内的离子稳态、抵御生物胁迫和非生物胁迫等生长发育过程中均发挥重要作用。本文综述了植物CNGCs的分子特性、结构、调节方式及功能方面的研究进展,并对今后有关该通道的主要研究方向做了展望。 展开更多
关键词 cngcs 功能 结构 调节
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Three CNGC Family Members, CNGC5, CNGC6, and CNGC9, Are Required for Constitutive Growth of Arabidopsis Root Hairs as Ca2+-Permeable Channels 被引量:4
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作者 Yan-Qiu Tan Yang Yang +7 位作者 An Zhang Cui-Fang Fei Li-Li Gu Shu-Jing Sun Wei Xu Lingling Wang Hongtao Liu Yong-Fei Wang 《Plant Communications》 2020年第1期164-178,共15页
The genetic identities of Ca2+ channels in root hair (RH) tips essential for constitutive RH growth have remained elusive for decades. Here, we report the identification and characterization of three cyclicnucleotide-... The genetic identities of Ca2+ channels in root hair (RH) tips essential for constitutive RH growth have remained elusive for decades. Here, we report the identification and characterization of three cyclicnucleotide-gated channel (CNGC) family members, CNGC5, CNGC6, and CNGC9, as Ca2+ channels essential for constitutive RH growth in Arabidopsis. We found that the cngc5-1cngc6-2cngc9-1 triple mutant(designated shrh1) showed significantly shorter and branching RH phenotypes as compared with thewild type. The defective RH growth phenotype of shrh1 could be rescued by either the expression ofCNGC5, CNGC6, or CNGC9 single gene or by the supply of high external Ca2+, but could not be rescuedby external K+ supply. Cytosolic Ca2+ imaging and patch-clamp data in HEK293T cells showed that thesethree CNGCs all function as Ca2+-permeable channels. Cytosolic Ca2+ imaging in growing RHs furthershowed that the Ca2+ gradients and their oscillation in RH tips were dramatically attenuated in shrh1compared with those in the wild type. Phenotypic analysis revealed that these three CNGCs are Ca2+ channels essential for constitutive RH growth, with different roles in RHs from the conditional player CNGC14.Moreover, we found that these three CNGCs are involved in auxin signaling in RHs. Taken together, ourstudy identified CNGC5, CNGC6, and CNGC9 as three key Ca2+ channels essential for constitutive RHgrowth and auxin signaling in Arabidopsis. 展开更多
关键词 Ca2+channels cngc root hair polar growth ARABIDOPSIS
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陆地棉CNGC全基因组鉴定及表达分析 被引量:1
6
作者 刘文豪 田琴 +4 位作者 余渝 王旭文 马麒 司爱君 孔宪辉 《江苏农业科学》 北大核心 2021年第24期49-56,共8页
环状核苷酸门控通道(CNGC)基因家族是非选择性阳离子通道基因家族之一,在与植物发育和环境胁迫等有关的生理生化过程中起着至关重要的作用,但是目前尚无陆地棉CNGC基因家族的全基因组鉴定和分析。基于已知的拟南芥CNGC基因家族成员序列... 环状核苷酸门控通道(CNGC)基因家族是非选择性阳离子通道基因家族之一,在与植物发育和环境胁迫等有关的生理生化过程中起着至关重要的作用,但是目前尚无陆地棉CNGC基因家族的全基因组鉴定和分析。基于已知的拟南芥CNGC基因家族成员序列信息,以生物信息学方法分析陆地棉基因组中CNGC家族成员的理化性质、系统发育、染色体定位和差异表达情况。结果表明,共鉴定出33个GhCNGC基因,它们不均匀地分布在A、D染色体亚组上,其中15个基因分布在A染色体亚组上,18个基因分布在D染色体亚组上。系统发育分析结果表明,GhCNGC基因家族被分为4个主要组,由于在进化过程中不均等地扩增,Ⅳ组又分为Ⅳa和Ⅳb组。同组陆地棉、拟南芥的CNGC基因显示出相似的保守基序和基因结构,尤其是同源性越近,相似度越高。GhCNGC基因的表达谱以组织特异性模式表达,多数基因在根、叶中的表达量较高。研究结果使人们增加了对陆地棉和其他植物中CNGC基因家族的了解。 展开更多
关键词 cngc 基因家族 全基因组 陆地棉 染色体定位 差异表达
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紫花苜蓿CNGC基因家族成员鉴定及分析
7
作者 李小红 王晓彤 +4 位作者 麻旭霞 蔡文祺 冯学丽 马梦凡 李淑霞 《草地学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期588-598,共11页
环核苷酸门控通道(CNGC)基因家族作为非选择性阳离子通道基因家族之一,在植物信号转导、生长发育和环境胁迫等生理过程中发挥着重要作用。本研究利用生物信息学手段和转录组数据对紫花苜蓿CNGC家族成员的进化关系、基因结构、保守基序... 环核苷酸门控通道(CNGC)基因家族作为非选择性阳离子通道基因家族之一,在植物信号转导、生长发育和环境胁迫等生理过程中发挥着重要作用。本研究利用生物信息学手段和转录组数据对紫花苜蓿CNGC家族成员的进化关系、基因结构、保守基序、顺式作用元件、染色体定位、共线性关系以及基因表达进行分析。结果表明,紫花苜蓿MsCNGC基因家族成员有16个,在染色体上不均匀分布,存在片段重复,大多数蛋白定位于细胞质膜。系统发育树将MsCNGCs为4个亚家族。基因结构和保守基序分析表明,都含有cNMP/CNBD和ITP功能域。顺式作用元件分析表明,MsCNGCs基因含有许多与非生物或生物胁迫和激素响应元件。MsCNGC4和MsCNGC7.2蛋白之间存在互作。MsCNGC基因具有组织表达特异性。MsCNGC基因对干旱、盐和激素等非生物胁迫均有显著的响应,为进一步研究MsCNGC基因在调控非生物胁迫过程中的潜在功能提供了理论依据。 展开更多
关键词 紫花苜蓿 cngc基因家族 全基因组 系统进化 基因结构 非生物胁迫
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大白菜BrCNGC全基因组鉴定及其表达分析 被引量:5
8
作者 汪影 张昌伟 +1 位作者 吕善武 侯喜林 《南京农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第6期994-1002,共9页
[目的]本文旨在研究大白菜环核苷酸门控离子通道基因(BrCNGC)的进化关系、结构特征、染色体定位及其表达模式。[方法]通过生物信息技术对大白菜BrCNGC进行分子进化分析、功能结构分析、染色体定位分析、保守结构域分析,并且通过荧光定量... [目的]本文旨在研究大白菜环核苷酸门控离子通道基因(BrCNGC)的进化关系、结构特征、染色体定位及其表达模式。[方法]通过生物信息技术对大白菜BrCNGC进行分子进化分析、功能结构分析、染色体定位分析、保守结构域分析,并且通过荧光定量PCR分析该基因家族在脱落酸(ABA)+芜菁花叶病毒(TuMV)、水杨酸(SA)+TuMV、茉莉酸甲酯(MeJA)+TuMV和抗坏血酸(AsA)+TuMV处理下的表达差异。[结果]大白菜BrCNGC家族有26个成员,可分为4个组(Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ),其中第Ⅳ组又可以分为2个亚组(Ⅳa和Ⅳb)。它们分布在9条染色体上,1号染色体上BrCNGC数量最多(有5个),5号染色体上只有1个BrCNGC基因,而8号染色体上没有BrCNGC基因分布。基因结构分析表明:该家族基因中共鉴定出10种motif,其中有14个BrCNGC蛋白都包含这10种motif,同组成员之间的motif组成相似。荧光定量PCR结果表明:在植物生长调节剂与TuMV相互作用下,大部分BrCNGC的表达量上调,少数BrCNGC的表达量下调。[结论]大白菜BrCNGC结构高度保守,其在大白菜抵御TuMV侵染过程中发挥一定的作用,该发现为以后进一步研究BrCNGC的功能奠定了基础。 展开更多
关键词 大白菜 环核苷酸门控离子通道基因(cngc) 全基因组分析 芜菁花叶病毒(TuMV) 荧光定量PCR
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霸王环核苷酸门控通道基因ZxCNGC5的克隆及表达模式分析 被引量:3
9
作者 刘亚琪 王文颖 +3 位作者 崔彦农 郭欢 李孟湛 王锁民 《植物生理学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第1期157-164,共8页
钙离子(Ca^(2+))作为生命活动过程中重要的第二信使,对植物的生长发育至关重要。环核苷酸门控离子通道(cyclic nucleotide-gated channels,CNGCs)是一类Ca^(2+)通道,在植物的花粉发育、免疫反应以及响应逆境胁迫等生理过程中发挥着重要... 钙离子(Ca^(2+))作为生命活动过程中重要的第二信使,对植物的生长发育至关重要。环核苷酸门控离子通道(cyclic nucleotide-gated channels,CNGCs)是一类Ca^(2+)通道,在植物的花粉发育、免疫反应以及响应逆境胁迫等生理过程中发挥着重要作用。本研究通过RACE和RT-PCR技术克隆了荒漠旱生植物霸王(Zygophyllum xanthoxylum)CNGCs家族的一个编码基因,命名为ZxCNGC5。生物信息学分析显示其编码728个氨基酸,包含CNGCs家族所特有的6个跨膜域、1个P环以及环核苷酸结合域(cyclic nucleotide-binding domain,CNBD)和钙调蛋白结合域(calmodulin-binding domain,CaMBD);系统进化树将CNGCs家族分为5个亚族(Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ、ⅣA和ⅣB),Zx CNGC5属于第Ⅱ亚族;组织特异性分析显示该基因主要在根中表达;在0.01和10 mmol·L^(-1) CaCl_2处理下,ZxCNGC5在根中的表达量短期内均显著升高,并分别在3和12 h达到最高,随后逐渐降低,表明ZxCNGC5在根中的表达受外界CaCl_2的短期诱导。 展开更多
关键词 霸王 CA2+ cngc5 基因克隆 表达模式
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植物中钙信号介导的硝酸盐信号途径的研究进展 被引量:1
10
作者 刘利 韩真 +1 位作者 杨阳 李勃 《植物科学学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第1期115-123,共9页
硝酸盐不仅是植物的主要氮源,而且是植物极为重要的信号分子,参与众多生理生化反应、代谢过程,调控植物的生长和发育。研究发现钙信号参与初级硝酸盐响应过程,然而关于钙信号如何参与硝酸盐信号的感知和硝酸盐信号的传递过程尚未清楚。... 硝酸盐不仅是植物的主要氮源,而且是植物极为重要的信号分子,参与众多生理生化反应、代谢过程,调控植物的生长和发育。研究发现钙信号参与初级硝酸盐响应过程,然而关于钙信号如何参与硝酸盐信号的感知和硝酸盐信号的传递过程尚未清楚。本文综述了具有钙离子通道活性的环核苷酸门控通道与硝酸盐转运体复合体(Cyclic nucleotide-gated channel 15-nitrate transceptor 1.1,CNGC15-NRT1.1)、钙调磷酸酶B类蛋白(Calcineurin B-like protein,CBL)、CBL互作蛋白激酶(CBL-interacting protein kinases,CIPKs)、钙依赖蛋白激酶(Calcium-dependent protein kinases,CPKs)和磷脂酶C(Phospholipase C,PLC)如何从细胞膜到细胞核参与植物的硝酸盐信号过程,从而形成相对完整的硝酸盐信号网络。并对未来钙信号如何连接上游硝酸盐传感器复合体与下游硝酸盐信号通路的多个传感器,从而完成营养生长调控网络的研究方向进行了展望。 展开更多
关键词 钙信号 硝酸盐信号 cngc15-NRT1.1 CPK 初级硝酸盐响应
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植物环核苷酸门控通道(CNGC)基因家族的结构与功能 被引量:5
11
作者 王月 侯和胜 《植物生理学通讯》 CAS CSCD 北大核心 2007年第1期1-8,共8页
环核苷酸门控通道(CNGC)是近年来被确认的在动植物细胞中普遍存在的离子通道基因家族。文章就近年来植物中CNGC基因的种类、分子结构、作用机制及其在植物生长发育中的功能的研究进展作了概述。
关键词 环核苷酸门控通道(cngc) 离子吸收 信号转导 基因结构 基因功能
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缺Ca/Fe及盐分胁迫下番茄Pb吸收转运与关键基因的表达关系 被引量:1
12
作者 叶汉杰 王立立 +6 位作者 余丹萍 李取生 徐智敏 周初 林欣 吕耀 周婷 《农业环境科学学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第1期37-43,共7页
选取台湾黄圣女番茄为供试材料,通过水培试验研究缺Ca/Fe及盐分胁迫三种处理对Pb在番茄中富集的影响,并测定不同处理下根部CNGC1(环核苷酸门控非选择性阳离子通道)和HMA3(P1B-ATPase酶)基因的相对表达量,进而探究CNGC1和HMA3基因的表达... 选取台湾黄圣女番茄为供试材料,通过水培试验研究缺Ca/Fe及盐分胁迫三种处理对Pb在番茄中富集的影响,并测定不同处理下根部CNGC1(环核苷酸门控非选择性阳离子通道)和HMA3(P1B-ATPase酶)基因的相对表达量,进而探究CNGC1和HMA3基因的表达对番茄吸收累积Pb的影响。结果表明:与对照相比,缺钙处理显著增强了根对Pb的吸收能力并抑制了Pb往地上部转运过程,缺Fe处理对根吸收能力无显著影响而增加了往地上部转运量,盐分处理同时增强了根部吸收及往地上部转运能力;不同处理下番茄根部单位质量Pb净吸收量与CNGC1离子通道的活性水平呈现出极显著正相关(P<0.01),说明番茄根部CNGC1离子通道在不同处理下Pb的吸收可能起着重要作用;番茄Pb转运系数与HMA3的表达量呈现极显著负相关(P<0.01),说明番茄HMA3的高表达抑制了番茄对Pb的地上转运能力。因此,缺Ca/Fe及盐分胁迫处理对Pb在番茄中富集有不同影响,CNGC1离子通道和HMA3的表达量在一定程度上决定了Pb在番茄中的分布。 展开更多
关键词 番茄 铅吸收 胁迫 cngc1 钙离子通道 HMA3
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甘蓝型油菜BnCNGC基因家族鉴定及其在核盘菌侵染和PEG处理下的表达特性分析
13
作者 陈松余 丁一娟 +5 位作者 孙峻溟 黄登文 杨楠 代雨涵 万华方 钱伟 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第6期1357-1371,共15页
CNGC是植物中普遍存在的环核苷酸门控通道,对植物的逆境响应有重要作用。系统分析甘蓝型油菜BnCNGC基因家族成员全基因组分布、结构、进化及其响应不同逆境胁迫的表达特性,对于阐明其生物学功能具有重要意义。本研究利用拟南芥和甘蓝CNG... CNGC是植物中普遍存在的环核苷酸门控通道,对植物的逆境响应有重要作用。系统分析甘蓝型油菜BnCNGC基因家族成员全基因组分布、结构、进化及其响应不同逆境胁迫的表达特性,对于阐明其生物学功能具有重要意义。本研究利用拟南芥和甘蓝CNGC蛋白保守结构域及特异基序氨基酸序列在全基因组水平鉴定了甘蓝型油菜BnCNGC家族成员,分析其基因结构、染色体定位、蛋白理化性质、蛋白保守结构域、系统进化及启动子顺式作用元件等。利用转录组数据,筛选甘蓝型油菜逆境响应候选BnCNGC成员,并采用实时荧光定量PCR分析其在核盘菌、PEG模拟干旱胁迫下的表达模式。结果显示,共鉴定到49个甘蓝型油菜BnCNGC成员,分布于除A08、C06的17对染色体上,含有5~10个内含子,其上游1500 bp包含大量逆境胁迫响应元件。BnCNGC家族成员编码的蛋白质含413~801个氨基酸,相对分子量(MW)范围47.62~110.58kD,等电点(pI)范围6.10~9.88。系统进化分析表明,BnCNGC分为Group Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ和Ⅳ四类。转录组数据分析表明, BnCNGC9、BnCNGC27和BnCNGC48均参与逆境胁迫响应。实时荧光定量PCR分析表明,甘蓝型油菜叶片中BnCNGC9、BnCNGC27和BnCNGC48均在核盘菌胁迫下表达下调,下调量分别为48.2%~99.1%、79.4%~87.1%和39.7%~92.6%。PEG模拟干旱胁迫时,甘蓝油菜叶片中BnCNGC9在处理24 h后上调3.34倍, BnCNGC48在处理48 h后上调6.27倍, BnCNGC27对干旱胁迫不敏感。 展开更多
关键词 甘蓝型油菜 cngc基因家族 核盘菌 PEG模拟干旱 表达分析
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蓖麻CNGC基因家族鉴定与冷胁迫下的表达模式分析 被引量:1
14
作者 王晓宇 张洪雨 +5 位作者 刘栩铭 孟迪 苑伟鹏 霍红雁 于丽丽 张继星 《分子植物育种》 CAS 北大核心 2021年第22期7373-7382,共10页
环核苷酸门控通道蛋白(cyclic nucleotide-gated channel proteins,CNGCs)是介导低价阳离子转运的重要蛋白,在植物信号传递、生长发育与非生物胁迫响应等方面发挥重要作用。本研究利用序列比对法在蓖麻基因组水平进行CNGC家族成员鉴定;... 环核苷酸门控通道蛋白(cyclic nucleotide-gated channel proteins,CNGCs)是介导低价阳离子转运的重要蛋白,在植物信号传递、生长发育与非生物胁迫响应等方面发挥重要作用。本研究利用序列比对法在蓖麻基因组水平进行CNGC家族成员鉴定;利用生物信息学手段对蓖麻CNGC家族成员的基因结构、保守基序、特征结构域、聚类方式、顺式作用元件及染色体定位信息进行分析。研究成功鉴定到17个蓖麻CNGC基因家族成员,定位于16个未完整拼接的染色体片段上;除RcCNGC13外,其他蛋白序列均包含高度保守的环核苷酸结合结构域CNBD,但RcCNGC4RcCNGC6RcCNGC13RcCNGC14均存在明显的基序缺失;部分RcCNGCs启动子区均含有MYB、MYC与ABRE、ARE元件,推测其响应逆境胁迫。聚类分析将蓖麻CNGC成员分为Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ组,推测不同类型CNGC蛋白存在功能差异。转录组数据分析发现仅有RcCNGC14受冷胁迫显著上调表达,暗示该基因参与调控蓖麻的冷适应性。本研究首次在蓖麻全基因组水平对CNGC基因家族进行鉴定,并分析其冷胁迫下的表达模式,为进一步创制蓖麻抗冷新种质提供重要的候选基因。 展开更多
关键词 蓖麻 cngc基因家族 冷胁迫 表达模式
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毛果杨CNGC家族全基因组鉴定及胁迫响应分析
15
作者 王雪莹 王瑞琪 +3 位作者 张洋 刘聪 夏德安 魏志刚 《植物研究》 CAS CSCD 北大核心 2022年第4期613-625,共13页
植物环核苷酸门控离子通道(cyclic nucleotide-gated channels,CNGC)家族具有多种生物学功能,尤其是在植物的生长发育及逆境胁迫响应中发挥着重要的作用。本研究通过生物信息学方法及qRT-PCR对PtrCNGC家族成员蛋白的基本理化性质与结构... 植物环核苷酸门控离子通道(cyclic nucleotide-gated channels,CNGC)家族具有多种生物学功能,尤其是在植物的生长发育及逆境胁迫响应中发挥着重要的作用。本研究通过生物信息学方法及qRT-PCR对PtrCNGC家族成员蛋白的基本理化性质与结构特征、系统发育、基因结构和保守基序、启动子顺式作用元件,以及基因表达模式进行分析。结果表明:在毛果杨(Populus trichocarpa)全基因组中共鉴定出19个PtrCNGC基因,PtrCNGC家族成员可分为4个亚群(Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ和Ⅳ亚群),其中第Ⅳ亚群分为2个亚组(Ⅳa组和Ⅳb组)。PtrCNGC基因编码的蛋白均为碱性蛋白,此外,该家族仅有1个成员为疏水性蛋白,其余成员全部为亲水性蛋白。19个PtrCNGC不均匀地分布于毛果杨的11条染色体上,剩余8条染色体上没有成员分布。PtrCNGC家族包含7对同源基因且它们之间的Ka/Ks值均远小于1。PtrCNGC家族各亚群成员之间的基因结构、蛋白保守基序分布差异较小。启动子顺式作用元件预测分析发现,PtrCNGC基因序列启动子区域存在响应多种激素以及逆境胁迫相关的作用元件。qRT-PCR结果表明,PtrCNGC家族在不同组织中的表达具有特异性,在茎中的表达量较高,在根和叶中的表达量较低;在盐胁迫和干旱胁迫下,PtrCNGC家族同一分支上的多数成员表现出相似的表达模式。本研究结果为进一步研究毛果杨CNGC家族在非生物胁迫中的功能提供参考。 展开更多
关键词 毛果杨 cngc家族 生物信息学分析 逆境胁迫
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钙调素结合位点调控环核苷酸门控离子通道研究进展
16
作者 余冰清 严汉池 《湖北农业科学》 2021年第20期5-9,42,共6页
环核苷酸门控离子通道(Cyclic nucleotide-gated ion channels,CNGC)是非选择性的阳离子通道,受细胞内信使小分子环核苷酸(cAMP和cGMP)以及Ca^(2+)/CaM调控。哺乳动物CNGC功能的变构调节机制受到CaM结合影响,哺乳动物CNGC在胞质N和/或C... 环核苷酸门控离子通道(Cyclic nucleotide-gated ion channels,CNGC)是非选择性的阳离子通道,受细胞内信使小分子环核苷酸(cAMP和cGMP)以及Ca^(2+)/CaM调控。哺乳动物CNGC功能的变构调节机制受到CaM结合影响,哺乳动物CNGC在胞质N和/或C末端具有CaMBD。在植物方面,研究大多集中于与植物CNGC的环核苷酸结合结构域重叠的C端CaM结合结构域(CaMBD)。然而近期对模式植物拟南芥CNGC12的研究提供了单个植物CNGC同种型具有多个CaMBD的证据。重点总结了动植物钙调蛋白多个结合位点调控环核苷酸门控离子通道的研究进展。 展开更多
关键词 环核苷酸门控离子通道(cngc) 钙调素CaM 环化核苷酸(cNMP)
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发现植物固氮过程中缺失的环节
17
作者 周凌 《基层农技推广》 2016年第12期67-67,共1页
英国约翰英纳斯中心的研究人员发现了植物固氮过程中一个重要的成分,即鉴定出一个可促进植物细胞内钙运动的关键蛋白质。这个钙信号可向附近有固氮菌的植物运动,并且引发其根部的根瘤的发育,为这些细菌提供住处。豆科植物能够从空气中... 英国约翰英纳斯中心的研究人员发现了植物固氮过程中一个重要的成分,即鉴定出一个可促进植物细胞内钙运动的关键蛋白质。这个钙信号可向附近有固氮菌的植物运动,并且引发其根部的根瘤的发育,为这些细菌提供住处。豆科植物能够从空气中获取氮,并将其纳入它的细胞中。由Giles Oldroyd教授领导的一个研究小组,旨在将固氮能力装移到其它类型的植物,如小麦或大麦上。这将促进这些作物的生长与产量。 展开更多
关键词 植物 固氮菌 细菌 固氮细菌 cngc 细胞核 核(细胞学) 固氮 氮代谢
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