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耻垢分枝杆菌ClpC和ClpX敲低表达菌株的构建及表型分析 被引量:2
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作者 白嘉诚 迟明哲 +2 位作者 胡亚文 郝梦 张雪莲 《中国生物工程杂志》 CAS CSCD 北大核心 2021年第6期13-22,共10页
蛋白质平衡稳定对细菌的生长繁殖以及应对宿主免疫压力十分重要。Clp蛋白酶复合体在结核分枝杆菌的蛋白质降解和平衡稳定中发挥重要作用。Clp蛋白酶中负责识别底物蛋白并将其解折叠的蛋白质有两种:ClpC和ClpX。为初步探究分枝杆菌中ClpC... 蛋白质平衡稳定对细菌的生长繁殖以及应对宿主免疫压力十分重要。Clp蛋白酶复合体在结核分枝杆菌的蛋白质降解和平衡稳定中发挥重要作用。Clp蛋白酶中负责识别底物蛋白并将其解折叠的蛋白质有两种:ClpC和ClpX。为初步探究分枝杆菌中ClpC和ClpX各自的功能特点,运用CRISPRi的方法成功构建了耻垢分枝杆菌的ClpC和ClpX诱导型敲低表达菌株,并对其生长相关表型进行分析。结果显示:与野生菌株相比,ClpC和ClpX的低表达均能严重影响耻垢分枝杆菌的生长。ClpC低表达可导致菌株丧失生物膜的形成能力,而ClpX低表达则导致菌株无法维持正常细胞形态,电镜显示细胞壁不完整且细胞呈丝状化,提示ClpC和ClpX可能在分枝杆菌中具有不同的生理功能。可为后期深入开展ClpC和ClpX对分枝杆菌生理调控功能研究及新型抗结核药物筛选提供基础。 展开更多
关键词 耻垢分枝杆菌 clpc ClpX
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Identification of auxin responsive genes in Arabidopsis by cDNA array 被引量:2
2
作者 Bao Fang Hu Yuxin Li Jiayang 《Chinese Science Bulletin》 SCIE EI CAS 2002年第7期548-552,共5页
The plant hormone auxin influences a variety of developmental and physiological processes. But the mechanism of its action is quite unclear. In order to identify and analyze the expression of auxin responsive genes, a... The plant hormone auxin influences a variety of developmental and physiological processes. But the mechanism of its action is quite unclear. In order to identify and analyze the expression of auxin responsive genes, a cDNA array approach was used to screen for genes with altered expression from Arabidopsis suspension culture after IAA treatment and was identified 50 differentially expressed genes from 13824 cDNA clones. These genes were related to signal transduction, stress responses, senescence, photosynthesis, protein biosynthesis and transportation. The results provide the molecular evidence that auxin influences a variety of physiological processes and pave a way for further investigation of the mechanism of auxin action. Furthermore, we found that the expression of a ClpC (regulation subunit of Clp protease) was repressed by exogenous auxin, but increased in dark-induced senescing leaves. This suggests that ClpC may be a senescence-associated gene and can be regulated by auxin. 展开更多
关键词 cDNA array AUXIN RESPONSIVE GENES ARABIDOPSIS THALIANA clpc senescence-associated genes.
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clpC 基因对变异链球菌感受态形成的影响
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作者 徐巧丽 饶慧华 +4 位作者 马晓波 黄朝阳 郑港森 张加勤 宋秀宇 《中华微生物学和免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2015年第4期247-252,共6页
目的:构建变异链球菌clpC缺陷突变株,检测该基因对变异链球菌感受态形成的影响。方法分别以变异链球菌UA159基因组和pIB107质粒为模板,PCR扩增clpC基因片段和卡那霉素基因盒(lox71-KMR-lox66);将clpC基因片段插入pMD-19T simple... 目的:构建变异链球菌clpC缺陷突变株,检测该基因对变异链球菌感受态形成的影响。方法分别以变异链球菌UA159基因组和pIB107质粒为模板,PCR扩增clpC基因片段和卡那霉素基因盒(lox71-KMR-lox66);将clpC基因片段插入pMD-19T simple载体,经ClaⅠ/EcoRⅠ酶切、补平后连入卡那霉素基因盒,构建clpC缺陷突变同源重组载体pCKX2;SalⅠ线性化pCKX2并转化变异链球菌,卡那霉素筛选阳性菌落;质粒pCrePA转化阳性菌株,30℃培养剔除卡那霉素基因盒;37℃培养去除pCrePA,获得clpC缺陷突变株,PCR和测序鉴定;提取细菌总RNA并逆转录成cDNA,用RT-PCR法扩增clpC缺失序列的核苷酸片段并进行产物的电泳分析;pDL276分别转化变异链球菌和clpC缺陷突变株,观察感受态细胞形成变化。结果 PCR和测序结果证实成功构建同源重组载体pCKX2及变异链球菌clpC缺陷突变株;RT-PCR结果显示,△clpC缺失的核苷酸片段PCR产物电泳结果并无相应的条带出现;clpC缺陷突变株的感受态形成期延迟并延长维持期。结论 clpC基因具有负调控变异链球菌晚期感受态细胞形成的作用。 展开更多
关键词 变异链球菌 感受态细胞 clpc Cre/loxP
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开放式现场总线CC-Link推广体系——CLPA与CLPC
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作者 覃强 《国内外机电一体化技术》 2001年第5期39-40,共2页
CC-Link是三菱电机于1996年推出的开放式现场总线。它具有性能卓越、用途广泛、使用简单、节省成本等突出的特点。作为开放式现场总线,CC-Link是唯一起源于亚洲地区的总线系统。CC-Link的技术特点尤其适合亚洲人的思维习惯。 CC-Link在... CC-Link是三菱电机于1996年推出的开放式现场总线。它具有性能卓越、用途广泛、使用简单、节省成本等突出的特点。作为开放式现场总线,CC-Link是唯一起源于亚洲地区的总线系统。CC-Link的技术特点尤其适合亚洲人的思维习惯。 CC-Link在中国大陆地区知名度还不及其他的现场总线,主要的原因是先前CC-Link的推广工作是由三菱电机FA系统进行,显然对于开放式系统的普及是有局限性的。 展开更多
关键词 开放式现场总线 CC-LINK CLPA clpc
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结核分枝杆菌ClpC2基因序列分析及功能预测 被引量:2
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作者 李岱容 穆柳青 +1 位作者 张春燕 杨春 《遵义医学院学报》 2014年第1期57-61,共5页
目的对结核分枝杆菌的基因clpC2(Rv2667)的同源基因进行序列分析和相似性比较,并对其编码蛋白进行理化性质及功能的预测,为ClpC2蛋白的结构与功能研究提供基础技术资料。方法根据GeneBank中分枝杆菌clpC2同源基因的核苷酸序列,进行多重... 目的对结核分枝杆菌的基因clpC2(Rv2667)的同源基因进行序列分析和相似性比较,并对其编码蛋白进行理化性质及功能的预测,为ClpC2蛋白的结构与功能研究提供基础技术资料。方法根据GeneBank中分枝杆菌clpC2同源基因的核苷酸序列,进行多重序列比对和进化树构建;应用ExPA Sy在线序列分析工具,对结核分枝杆菌ClpC2蛋白质理化性质及保守结构域进行预测;应用Gene ontology(GO)在线软件对ClpC2蛋白酶的功能进行分析。结果 clpC2系统进化树分析,与16 s rRNA基因相比,进化距离明显变大,而在结核分枝杆菌复合群中高度保守。ClpC2蛋白为亲水性非跨膜蛋白,在细胞质表达,具有水解和催化功能,是一个依赖于ATP的Clp亚单位。结论 clpC2基因在结核分枝杆菌复合群中高度保守,其编码的蛋白ClpC2是一个依赖于ATP的水解蛋白酶。 展开更多
关键词 结核分枝杆菌 clpc2 序列分析 功能预测
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A Deep Reinforcement Learning-Based Power Control Scheme for the 5G Wireless Systems
6
作者 Renjie Liang Haiyang Lyu Jiancun Fan 《China Communications》 SCIE CSCD 2023年第10期109-119,共11页
In the fifth generation(5G)wireless system,a closed-loop power control(CLPC)scheme based on deep Q learning network(DQN)is introduced to intelligently adjust the transmit power of the base station(BS),which can improv... In the fifth generation(5G)wireless system,a closed-loop power control(CLPC)scheme based on deep Q learning network(DQN)is introduced to intelligently adjust the transmit power of the base station(BS),which can improve the user equipment(UE)received signal to interference plus noise ratio(SINR)to a target threshold range.However,the selected power control(PC)action in DQN is not accurately matched the fluctuations of the wireless environment.Since the experience replay characteristic of the conventional DQN scheme leads to a possibility of insufficient training in the target deep neural network(DNN).As a result,the Q-value of the sub-optimal PC action exceed the optimal one.To solve this problem,we propose the improved DQN scheme.In the proposed scheme,we add an additional DNN to the conventional DQN,and set a shorter training interval to speed up the training of the DNN in order to fully train it.Finally,the proposed scheme can ensure that the Q value of the optimal action remains maximum.After multiple episodes of training,the proposed scheme can generate more accurate PC actions to match the fluctuations of the wireless environment.As a result,the UE received SINR can achieve the target threshold range faster and keep more stable.The simulation results prove that the proposed scheme outperforms the conventional schemes. 展开更多
关键词 reinforcement learning closed-loop power control(clpc) signal-to-interference-plusnoise ratio(SINR)
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系统发育分析指示细菌向Apicoplast的水平基因转移(英文) 被引量:2
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作者 朱新宇 《Acta Genetica Sinica》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2004年第11期1316-1320,共5页
顶复合器门的原生动物 (Apicomplexanprotozoa)含有一个高度退化的质体样 (plastid like)细胞器 ,定名为apicoplast。来自apicoplast的clpC基因和它在其他质体和细菌中的同源物用来重建apicoplast的系统发育史。使用邻接法 (Neighbor Jo... 顶复合器门的原生动物 (Apicomplexanprotozoa)含有一个高度退化的质体样 (plastid like)细胞器 ,定名为apicoplast。来自apicoplast的clpC基因和它在其他质体和细菌中的同源物用来重建apicoplast的系统发育史。使用邻接法 (Neighbor Joining)、最小进化法 (MinimumEvolution)、最大简约法 (MaximumParsimony)和最大似然法(MaximumLikelihood)建立进化树。此外为了避免由于序列之间相似的碱基组成而引起的虚假聚类 ,建立了基于LogDet距离的核苷酸NJ树 ;以及为了避免由于在核苷酸和氨基酸水平上的突变饱和而引起的长分枝吸引 (LongBranchAttraction ,LBA) ,建立了基于非饱和位点的核苷酸和氨基酸序列的系统发育树。重建结果强有力地支持apicoplast和细菌B .buigdorferi之间的单系 (monophyly)起源关系 ,也强化了apicoplasst属于混合基因组的假设 。 展开更多
关键词 质体 混合基因组 水平基因转移 系统发育分析指示细菌 突变
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拿什么拯救你网客的生活
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作者 砖客 《软件与光盘》 2009年第2期22-25,共4页
电脑是什么? 有一个著名的流言:比尔盖茨宣称个人用户只需要640k内存。尽管比尔先生多次公开辟谣但效果不明显,每年四月一日还是有不少嘴客要把这事拿出来重说一边。其实这话不无道理,直到现在我们都该想想,普通用户要大内存有什... 电脑是什么? 有一个著名的流言:比尔盖茨宣称个人用户只需要640k内存。尽管比尔先生多次公开辟谣但效果不明显,每年四月一日还是有不少嘴客要把这事拿出来重说一边。其实这话不无道理,直到现在我们都该想想,普通用户要大内存有什么用?我们的前辈们在二战中用计算尺造出了雷达,并且用1K内存的电子管计算机造出了原子弹还登上了月球,现在给你640K,造个阿童术都绰绰有余,怎么可能不够? 展开更多
关键词 IT行业 网客 clpc计划 发展历史
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结核分枝杆菌ATP依赖的丝氨酸蛋白酶调节亚基C2基因原核表达质粒的构建及表达
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作者 穆柳青 李岱容 +3 位作者 张春燕 杨静 冯鑫 杨春 《中国生物制品学杂志》 CAS CSCD 2013年第10期1392-1394,1399,共4页
目的构建结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis,MTB)ATP依赖的丝氨酸蛋白酶调节亚基C2(ATP-dependent Clp regulatory subunit C2,ClpC2)基因的原核表达质粒,并在大肠埃希菌中表达重组蛋白。方法以MTB H37Rv基因组DNA为模板,PCR扩增... 目的构建结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis,MTB)ATP依赖的丝氨酸蛋白酶调节亚基C2(ATP-dependent Clp regulatory subunit C2,ClpC2)基因的原核表达质粒,并在大肠埃希菌中表达重组蛋白。方法以MTB H37Rv基因组DNA为模板,PCR扩增ClpC2基因,插入表达载体pET32a(+)中,构建重组原核表达质粒pET32a(+)-ClpC2,经双酶切及测序鉴定正确后,转化大肠埃希菌BL21(DE3),IPTG诱导表达。表达产物经SDS-PAGE和Western blot进行鉴定。结果重组表达质粒经双酶切和测序鉴定,证明构建正确;表达的重组融合蛋白相对分子质量约46 000,可与鼠抗组氨酸单克隆抗体特异性结合。结论已成功构建了重组表达质粒pET32a(+)-ClpC2,并在大肠埃希菌中表达了重组蛋白,为进一步研究ClpC2蛋白的生物学功能奠定了基础。 展开更多
关键词 结核分枝杆菌 clpc2基因 原核细胞 基因表达
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分枝杆菌表达质粒的快速构建及ClpC2基因功能初步研究
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作者 康月茜 卢楠 +2 位作者 孙菱 李岱容 杨春 《免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2016年第2期158-163,共6页
目的通过一种不受到序列限制、酶切连接反应一步进行的分子克隆方法,构建分枝杆菌Clp C2重组表达质粒,检测其在耻垢分枝杆菌中的蛋白表达并对其功能进行初步探讨。方法利用识别甲基化位点的内切酶Fsp EⅠ进行一步法酶切、连接反应,构建... 目的通过一种不受到序列限制、酶切连接反应一步进行的分子克隆方法,构建分枝杆菌Clp C2重组表达质粒,检测其在耻垢分枝杆菌中的蛋白表达并对其功能进行初步探讨。方法利用识别甲基化位点的内切酶Fsp EⅠ进行一步法酶切、连接反应,构建重组质粒PMV261(+)-Clp C2。将重组质粒转入耻垢分枝杆菌,利用SDS-PAGE和Western blot检测Clp C2基因在耻垢分枝杆菌中的表达以及氧化应激、酸应激对其功能进行初步探讨。结果利用Fsp EⅠ快速构建了分枝杆菌表达质粒Clp C2,将其成功电转至耻垢分枝杆菌中,SDS-PAGEA和Western blot检测其蛋白的表达,His单抗和兔多抗均能检测到目的条带,Mr大小27 570。氧化应激及酸应激实验表明Clp C2重组耻垢分枝杆菌与空载耻垢分枝杆菌在对抗应激方面无明显差异。结论成功构建了一种不受序列限制的分子克隆方法以及分枝杆菌Clp C2重组表达质粒,Western blot表明其具有一定的免疫原性,氧化应激及酸应激表明Clp C2重组耻垢分枝杆菌对抗应激方面无明显改变,为进一步深入研究Clp C2基因的功能奠定了基础。 展开更多
关键词 FspEⅠ内切酶 耻垢分枝杆菌 CLP C2基因 免疫原性
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一种新的CLPC联合功率控制方法
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作者 张海波 李方伟 刘开健 《计算机工程与应用》 CSCD 北大核心 2010年第7期80-82,共3页
提出了一种新的自适应变步长的联合闭环功率控制方法,分别根据信噪比(SIR)的差值产生粗调因子和功率控制命令(TPC)的历史记录产生微调因子来跟踪信道的快慢衰落。仿真结果表明,该算法提高了收敛速度和收敛精度,具有较好的适用价值。
关键词 闭环功率控制 信噪比 功率控制命令
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