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CCNB1在卵巢癌中的表达及意义 被引量:11
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作者 李莉 熊国平 +1 位作者 颜琳 张庆华 《现代妇产科进展》 CSCD 北大核心 2016年第11期818-820,824,共4页
目的:探讨CCNB1在卵巢癌诊断和预后判断的作用。方法:通过Oncomine数据库分析并提取组织RNA,Real-time PCR法检测CCNB1在卵巢癌组织中的表达。通过在线数据库及分析工具"the Kaplan Meier plotter"(KM plotter)数据库的应用发... 目的:探讨CCNB1在卵巢癌诊断和预后判断的作用。方法:通过Oncomine数据库分析并提取组织RNA,Real-time PCR法检测CCNB1在卵巢癌组织中的表达。通过在线数据库及分析工具"the Kaplan Meier plotter"(KM plotter)数据库的应用发掘CCNB1的预后价值。结果:Oncomine数据库中共有18个研究结果涉及正常卵巢组织和卵巢癌组织中的CCNB1的表达情况,全部显示CCNB1在卵巢癌中表达增高。本研究对9对配对的卵巢癌及其癌旁组织进行Real-time PCR,得到相同结果。在KM plotter数据库中的分析显示:无论是无进展生存期(PFS)或总生存期(OS),CCNB1 mRNA水平越高,卵巢癌患者的预后越差(HR>1,P<0.05)。且CCNB1 mRNA高水平在早于2期(包括2期)卵巢癌患者中提示预后较差,在晚于3期(包括3期)患者中CCNB1 mRNA水平与预后无明显相关性。结论:CCNB1在卵巢癌组织中表达升高,可作为提示预后差的卵巢癌的分子标记物。 展开更多
关键词 卵巢癌 预后 ccnb1 KM plotter
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白花蛇舌草对人胃癌MKN-45细胞周期的影响 被引量:8
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作者 代飞 邵淑丽 +5 位作者 焦凯贺 冯元 张伟伟 张珍珠 崔婷婷 李铁 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2020年第6期2866-2872,共7页
为了寻找能抑制肿瘤细胞增殖的药物,本研究探讨了不同浓度白花蛇舌草(Hedyotis diffusa)对人胃癌MKN-45细胞的影响,使用不同浓度的白花蛇舌草处理人胃癌MKN-45细胞24 h、48 h、72 h,共聚焦显微镜下观察细胞形态,流式细胞术检测细胞周期,... 为了寻找能抑制肿瘤细胞增殖的药物,本研究探讨了不同浓度白花蛇舌草(Hedyotis diffusa)对人胃癌MKN-45细胞的影响,使用不同浓度的白花蛇舌草处理人胃癌MKN-45细胞24 h、48 h、72 h,共聚焦显微镜下观察细胞形态,流式细胞术检测细胞周期,qRT-PCR和Western blotting检测CCNB1和CCND1的表达水平。结果表明,在一定浓度范围内,白花蛇舌草可抑制人胃癌MKN-45细胞增殖且呈剂量时间依赖性;白花蛇舌草处理人胃癌MKN-45细胞24 h、48 h、72 h后的IC50值分别为111.759μg/mL、26.878μg/mL、16.179μg/mL;随着白花蛇舌草的浓度增加,显微镜视野下细胞数量减少;G1期细胞减少,S期细胞增多;CCNB1和CCND1基因表达水平显著降低。白花蛇舌草能能抑制人胃癌MKN-45细胞增殖,阻滞细胞于S期,降低CCNB1和CCND1基因的表达。 展开更多
关键词 白花蛇舌草 MKN-45细胞 流式细胞术 ccnb1 CCND1
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基于加权基因共表达网络分析肺癌相关生物标志物及其潜在的分子机制
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作者 胡世陈 李婉雯 何彬 《四川医学》 CAS 2024年第9期1008-1018,共11页
目的通过生物信息学分析、鉴定枢纽基因(hub gene),寻找可以作为肺癌的生物标志物或预后标志物并探讨潜在的分子机制。方法基于癌症基因组图谱(TCGA)的数据,鉴定肺癌肿瘤样本与正常样本之间差异表达的基因;利用R软件包中的“Limma”识... 目的通过生物信息学分析、鉴定枢纽基因(hub gene),寻找可以作为肺癌的生物标志物或预后标志物并探讨潜在的分子机制。方法基于癌症基因组图谱(TCGA)的数据,鉴定肺癌肿瘤样本与正常样本之间差异表达的基因;利用R软件包中的“Limma”识别差异表达基因(DEGs),通过GO富集分析、加权基因共表达网络分析(WGCNA)确定相关基因模块及其功能,最终确定hub基因;基于基因表达谱交互分析数据库(GEPIA)和CBioPortal数据库,探讨hub基因表达与肺癌患者总生存期之间的关系,通过检索相关文献分析其潜在的分子机制,并进行其表达量和蛋白表达的验证。结果根据TCGA共鉴定出5259个差异表达基因(2178个上调,3081个下调),利用WGCNA确定8个与肺癌患者临床特征相关基因模块(包括与癌症发病相关模块),从中筛选出5个hub基因:CCNB1、CKAP2L、HMMR、ANLN、CDCA5,通过生存分析发现其表达水平与预后相关,并确定其与肺癌病理生理学关联。另发现CCNB1与P53有相关调控机制,CCNB1的沉默可激活P53的表达。结论5个hub基因在肺癌发生发展至关重要,可为肺癌预测、诊断、治疗和预后的生物标志物提供依据,其中CCNB1在肺癌中高表达,CCNB1沉默激活肺癌中P53信号通路抑制细胞增殖,促进细胞衰老。 展开更多
关键词 肺癌 加权基因共表达网络 枢纽基因 ccnb1 P53
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CDCA5促进子宫内膜癌细胞增殖和迁移的作用及机制 被引量:3
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作者 杨家湟 罗艳露 +2 位作者 钟春燕 梁栩芝 范江涛 《现代妇产科进展》 北大核心 2023年第6期401-407,共7页
目的:探讨CDCA5在促进子宫内膜癌细胞增殖和迁移上的作用及相关机制。方法:生物信息学预测和分析CDCA5与CCNB1在子宫内膜癌中可能存在的相关性。慢病毒敲低CDCA5表达后检测CCNB1表达水平的变化情况,以及检测子宫内膜癌细胞增殖、迁移能... 目的:探讨CDCA5在促进子宫内膜癌细胞增殖和迁移上的作用及相关机制。方法:生物信息学预测和分析CDCA5与CCNB1在子宫内膜癌中可能存在的相关性。慢病毒敲低CDCA5表达后检测CCNB1表达水平的变化情况,以及检测子宫内膜癌细胞增殖、迁移能力。使用特异性ERK抑制剂后检测磷酸化ERK1/2及CDCA5表达水平,以及验证ERK抑制剂对子宫内膜癌细胞增殖、迁移能力的影响。过表达CDCA5后检测子宫内膜癌细胞功能及相关蛋白表达的变化。结果:生物信息学分析结果显示,CDCA5和CCNB1在子宫内膜癌中高表达且两者之间存在相关性。敲降CDCA5表达显著降低子宫内膜癌中CCNB1表达,抑制细胞增殖和迁移。特异性MAPK通路抑制剂能有效抑制子宫内膜癌细胞中CDCA5和磷酸化ERK1/2蛋白表达并抑制细胞增殖和迁移能力。过表达CDCA5能促进ERK1/2蛋白磷酸化并增强子宫内膜癌细胞的增殖和迁移能力。结论:CDCA5可能成为子宫内膜癌的潜在治疗靶点,其可能通过上调CCNB1表达,激活ERK信号通路促进子宫内膜癌的发生发展,抑制和干扰CDCA5或其通路关键因子,可能为子宫内膜癌的临床诊断和治疗提供更多思路。 展开更多
关键词 子宫内膜癌 细胞分裂周期相关蛋白5 细胞周期蛋白B1 丝裂原活化蛋白激酶 细胞增殖 细胞迁移
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miR-144CCNB1信号调节通路在肝癌增殖、迁移和侵袭作用及相关机制的研究 被引量:5
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作者 户平安 雷霆 赵龙栓 《肝胆外科杂志》 2017年第6期471-474,共4页
目的探讨microRNA-144细胞周期蛋白B1(miR-144CCNB1)信号调节通路在肝癌增殖、迁移和侵袭作用及其相关机制。方法以2011年1月~2016年1月我院收治的100例肝癌患者的肝癌组织和癌旁组织为研究标本,采用荧光定量PCR(qRT-PCR)法检测肝癌及... 目的探讨microRNA-144细胞周期蛋白B1(miR-144CCNB1)信号调节通路在肝癌增殖、迁移和侵袭作用及其相关机制。方法以2011年1月~2016年1月我院收治的100例肝癌患者的肝癌组织和癌旁组织为研究标本,采用荧光定量PCR(qRT-PCR)法检测肝癌及其癌旁组织的miR-144表达和CCNB1蛋白表达情况,采用RNA干扰技术沉默CCNB1基因,并将靶向CCNB1的siRNA转染至肝癌细胞系HepG2和QGY-7703中,检测其对肝癌细胞生长、迁移和侵袭的生物学行为的影响。结果肝癌组织中miR-144表达较癌旁组织明显下调,CCNB1蛋白在肝癌组织的表达水平较癌旁组织明显上调,miR-144高表达者预后无瘤生存期较其低表达者明显长,而CCNB1蛋白低表达者无瘤生存期明显长于其高表达者,差异有统计学意义(P<0.05);与未处理者和阴性对照模拟物相较,转染CCNB1 siR肝癌细胞CCNB1蛋白表达水平明显下降;与未处理和阴性对照模拟物相较,转染CCBN1 siR HepG2细胞凋亡百分明显升高,转染CCNB1 siR HepG2细胞增殖能力明显下降,转染CCNB1siR HepG2细胞迁移能力明显降低;与阴性对照模拟物和未处理细胞相较,转染CCNB1-siR QGY-7703细胞克隆团数(成瘤能力)明显减少。结论 miR-144CCNB1信号调节通路在肝癌增殖、迁移和侵袭中发挥重要作用,其可能机制为miR-144负向调控CCNB1表达,从而影响肝癌细胞增殖、凋亡、迁移等生物学行为,为肝癌治疗的新靶点提供理论依据。 展开更多
关键词 肝癌 增殖 迁移 侵袭 miR-144 ccnb1 机制
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辐射诱导细胞周期调控和DNA损伤反应相关基因表达变化的实验研究 被引量:3
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作者 金顺子 武宁 +4 位作者 刘丽波 张萱 倪冠英 刘宇光 刘树铮 《辐射防护》 CAS CSCD 北大核心 2010年第2期70-79,共10页
采用实时定量PCR技术检测小鼠胸腺和脾脏基因表达对X射线全身照射的反应,为探索可行的辐射生物标志物打下实验基础。研究中选用细胞周期调控和DNA损伤反应相关基因Cdkn1a、Ccnd1、Ccnb1、Gadd45a、Atm和Fdxr,以Gapdh为参考基因,观察0.5... 采用实时定量PCR技术检测小鼠胸腺和脾脏基因表达对X射线全身照射的反应,为探索可行的辐射生物标志物打下实验基础。研究中选用细胞周期调控和DNA损伤反应相关基因Cdkn1a、Ccnd1、Ccnb1、Gadd45a、Atm和Fdxr,以Gapdh为参考基因,观察0.5、1、2、4、6 Gy X射线全身照射后4和24小时上述基因在胸腺和脾脏的相对表达量的变化。同时计数骨髓细胞涂片嗜多染红细胞(PCE)的微核率进行对比。结果显示,上述6种基因对电离辐射全身作用都出现变化,但以Cdkn1a、Ccnd1和Ccnb1三者对全身照射的剂量效应关系较为明显,其中Cdkn1a和Ccnd1基因的表达随辐射剂量增加而升高,Ccnb1基因的表达随辐射剂量增加而下降。剂量效应曲线可拟合为线性-平方方程,其相关系数r为0.851~0.998,p<0.05~0.01。但与嗜多染红细胞微核率进行对比,Ccnd1和Ccnb1的表达只有部分结果与之具有显著的相关关系。Cdkn1a的表达量则不仅随辐射剂量增加而升高,而且与嗜多染红细胞微核率的剂量-效应曲线明显相关,在两器官和两时间点其相关系数为0.950~0.975,p<0.01。另一方面Cd-kn1a表达量变化的幅度较大,照射后4小时和24小时胸腺的最高表达量分别为11.2和11.3倍,脾脏的最高表达量分别为20.6和9.3倍。鉴于实时定量PCR技术适用于快速、高通量检测,通过进一步在人体观察验证,Cdkn1a基因表达变化有可能成为研制新的辐射生物剂量计的候选者。 展开更多
关键词 Cdkn1a CCND1 ccnb1 GADD45A Atm Fdxr 实时定量PCR 基因表达变化 骨髓嗜多染红细胞微核率 辐射生物剂量计
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CCNB1、KIF23作为骨肉瘤的核心生物标志物的探索研究
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作者 刘磊 刘夏丞 高永昌 《临床医学进展》 2024年第5期162-177,共16页
目的:骨肉瘤是一种高度侵袭性的原发性骨肿瘤,危害性不容小觑,然而目前骨肉瘤的发病机制和分子生物学特征还未确定。方法:我们利用生物信息技术,在GEO数据库中下载骨肉瘤及正常组织样本的基因表达矩阵,利用R软件包进行差异分析,获取差... 目的:骨肉瘤是一种高度侵袭性的原发性骨肿瘤,危害性不容小觑,然而目前骨肉瘤的发病机制和分子生物学特征还未确定。方法:我们利用生物信息技术,在GEO数据库中下载骨肉瘤及正常组织样本的基因表达矩阵,利用R软件包进行差异分析,获取差异基因列表,并进行GOKEGG和GSEA富集分析,构建PPI网络获取核心差异基因,并制作核心基因的表达热图。使用CIBERSORT软件包进行免疫浸润分析,获得了全基因表达矩阵的免疫细胞的比例结果和免疫细胞组分间的共表达模式图,用于研究在免疫系统治疗干预下,对于骨肉瘤的疾病进程的影响。还获取了在CTD网站中,我们找到了与核心基因的最相关的疾病。TargetScan用于筛选调节中枢DEG的miRNA。结果:共获得了1342个差异基因,富集结果显示差异表达基因主要富集在细胞激活、分泌颗粒、脂质结合、细胞周期、P53信号通路。构建了PPI网络,获得了核心基因KIF23、CCNB1,绘制了核心基因在基因表达矩阵中的表达差异情况,结果显示KIF23、CCNB1在骨肉瘤和正常组织中具有显著差异。并在CTD网站中查找到了KIF23、CCNB1和骨肉瘤、肿瘤、炎症等疾病有关。结论:CCNB1和KIF23的高表达可能导致细胞周期的异常,促进骨肉瘤细胞的异常增殖和侵袭,在骨肉瘤的发生发展过程中发挥重要的作用,CCNB1和KIF23的表达越高,则骨肉瘤的预后越差。 展开更多
关键词 骨肉瘤 生物信息学 ccnb1 KIF23
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CCNB1在宫颈癌中的生物学功能及其与患者预后关系生物信息学分析
8
作者 纪霞 郭海荣 +3 位作者 王宁 高杰 秦淑丽 杜海燕 《包头医学院学报》 CAS 2023年第7期29-33,共5页
目的:采用数据挖掘方法探讨细胞周期蛋白B1(CCNB1)在宫颈癌中的表达、功能富集和信号通路及其与患者预后关系。方法:采用生物信息数据分析方法探讨相关肿瘤数据库中CCNB1基因在宫颈癌组织及其癌旁组织中的表达;对CCNB1基因进行生物学功... 目的:采用数据挖掘方法探讨细胞周期蛋白B1(CCNB1)在宫颈癌中的表达、功能富集和信号通路及其与患者预后关系。方法:采用生物信息数据分析方法探讨相关肿瘤数据库中CCNB1基因在宫颈癌组织及其癌旁组织中的表达;对CCNB1基因进行生物学功能和信号通路富集,在STRING数据库中(http://string-db.org/cgi/input.pl)构建CCNB1基因表达蛋白相互作用网络。在Kaplan-Meier数据库(http://kmplot.com/analysis/)中分析CCNB1高低表达与宫颈癌患者总生存(OS)和无疾病进展生存(DFS)的关系。结果:在宫颈癌患者,癌组织CCNB1表达水平明显高于癌旁组织(P<0.05);CCNB1生物学过程、细胞组分和分子功能主要富集于细胞分裂和细胞周期、细胞质及细胞周期蛋白依赖性蛋白丝氨酸/苏氨酸激酶活性;KEGG相关信号通路主要包括细胞周期、孕酮介导的卵母细胞成熟和卵母细胞减数分裂;CCNB1及其相互作用蛋白网络,蛋白与蛋白间的相互作用关系为196,平均聚集指数为0.944,蛋白网络相关作用显著(P<0.005);CCNB1高表达宫颈癌患者总生存(HR=1.62,95%CI:1.10-2.62,P<0.05)和无疾病进展生存(HR=3.53,95%CI:1.62-7.69,P<0.05),显著低于低表达者;CCNB1表达水平与B淋巴细胞(r=-0.099,P>0.05),CD8+T细胞(r=-0.036,P>0.05)、CD4+T细胞(r=0.065,P>0.05)、巨噬细胞(r=-0.79,P>0.05)、中性粒细胞(r=0.1,P>0.05)及树突状细胞浸润无关(r=0.8,P>0.05)。结论:CCNB1在宫颈癌中高表达,并参与了宫颈癌的发生发展,其高表达与患者的预后不良有关,可能成为宫颈癌靶向治疗的新靶点。 展开更多
关键词 宫颈癌 ccnb1 数据挖掘 功能富集 信号通路
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川楝素对人胃癌MGC-803细胞增殖的影响 被引量:3
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作者 杜洋 邵淑丽 +5 位作者 刘畅 刘祥露 黄鑫 张伟伟 张珍珠 李铁 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2021年第9期3337-3343,共7页
本研究利用不同浓度的川楝素处理人胃癌MGC-803细胞,以探究其对细胞增殖的影响。首先,采用台盼蓝拒染法检测川楝素对细胞生长的抑制作用;利用EdU法检测药物处理后细胞增殖情况;然后利用流式细胞术检测川楝素对细胞周期的影响;最后应用RT... 本研究利用不同浓度的川楝素处理人胃癌MGC-803细胞,以探究其对细胞增殖的影响。首先,采用台盼蓝拒染法检测川楝素对细胞生长的抑制作用;利用EdU法检测药物处理后细胞增殖情况;然后利用流式细胞术检测川楝素对细胞周期的影响;最后应用RT-qPCR和Western blot分别检测药物处理后细胞周期调控因子CCND1和CCNB1基因在mRNA和蛋白水平的表达情况。台盼蓝染色和EdU实验结果显示,在一定浓度范围内,川楝素对人胃癌MGC-803细胞的生长具有明显的抑制作用且呈时间和剂量依赖性;不同浓度川楝素处理MGC-803细胞48 h后,其细胞增殖率显著降低。流式细胞术结果显示,药物处理后,G1期细胞所占比例明显升高,S期细胞所占比例显著降低,细胞被阻滞在G1期。RT-qPCR和Western blot结果显示,细胞周期调控因子CCND1和CCNB1在mRNA和蛋白水平的表达量均显著降低。综上所述,在一定浓度范围内,川楝素通过下调人胃癌MGC-803细胞中CCND1和CCNB1基因的表达,将细胞周期阻滞在G1期,进而抑制细胞增殖。 展开更多
关键词 川楝素 MGC-803细胞 细胞增殖 CCND1 ccnb1
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CDK1、CCNB1和NDC80与乙型肝炎相关肝细胞癌的预后和进展相关:基于生物信息学方法 被引量:4
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作者 李玉杰 吴登强 +2 位作者 韦常宏 杨雪佳 周素芳 《南方医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第10期1509-1518,共10页
目的探讨HBV转化为HCC相关的关键基因,并探索相关的分子机制。方法分析基因表达综合(GEO)数据库中GSE55092、GSE84044和GSE121248的mRNA微阵列数据,其中包括119个HBV相关的HCC组织和252个HBV相关的非肿瘤组织。“sva”R包用于去除批间... 目的探讨HBV转化为HCC相关的关键基因,并探索相关的分子机制。方法分析基因表达综合(GEO)数据库中GSE55092、GSE84044和GSE121248的mRNA微阵列数据,其中包括119个HBV相关的HCC组织和252个HBV相关的非肿瘤组织。“sva”R包用于去除批间差。进行整合分析,获取HBV相关肝癌和HBV组织中的差异表达基因(DEGs),通过基因本体论(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)分析对差异表达基因进行功能注释。使用相互作用基因搜索工具(STRING)构建蛋白质-蛋白质相互作用网络,挖掘最重要的模块和关键基因。cBioportal用于分析hub基因的相关性。利用Kaplan-Meier和Oncomine数据库对TCGA数据库中肝癌基因表达数据进行验证,探讨hub基因与肝癌发生、发展和预后的关系。通过逆转录定量PCR(RT-qPCR)实验验证17对临床肝细胞癌样本与邻近非肿瘤组织中hub基因的表达。结果共获得121个DEGs(P<0.01),鉴定出3个遗传标记,细胞周期素依赖性激酶1(CDK1)、细胞周期蛋白B1(CCNB1)和核分裂周期蛋白80(NDC80),与细胞周期、嘧啶代谢和DNA复制有关,这3个基因高度相关(P<0.05)。UALCAN数据库证实这些基因在肝癌组织中高表达并获得相关预后信息。Kaplan-Meier表明,它们与HCC患者的低存活率相关。CDK1、CCNB1和NDC80与肝癌分级相关(P<0.05),RT-qPCR实验证实CDK1、CCNB1和NDC80的mRNA在肝细胞癌中的表达明显高于癌旁组织。结论CDK1、CCNB1和NDC80基因可作为HBV相关肝细胞癌的预后标志物,在肝癌的基础研究和临床治疗方面有一定的应用价值。 展开更多
关键词 肝细胞癌 慢性乙型肝炎病毒 关键基因 CDK1 ccnb1 NDC80
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基于生物信息学分析细胞周期蛋白B1与肺腺癌患者预后及浸润性免疫细胞的关系
11
作者 李兰 余军林 +5 位作者 鲁涵 舒思松 雷林屏 刘梦圆 常莉 李文辉 《医药论坛杂志》 2023年第20期1-7,共7页
目的通过生物信息学探索细胞周期蛋白B1(CCNB1)与肺腺癌患者预后及浸润性免疫细胞的关系。方法从TCGA下载肺腺癌患者CCNB1基因转录表达数据及临床信息。通过临床蛋白质组学肿瘤分析联盟(CPTAC)进一步研究肺腺癌中的CCNB1蛋白表达情况。... 目的通过生物信息学探索细胞周期蛋白B1(CCNB1)与肺腺癌患者预后及浸润性免疫细胞的关系。方法从TCGA下载肺腺癌患者CCNB1基因转录表达数据及临床信息。通过临床蛋白质组学肿瘤分析联盟(CPTAC)进一步研究肺腺癌中的CCNB1蛋白表达情况。受试者工作特征(ROC)曲线获取区分肺腺癌与邻近正常组织的CCNB1基因最佳截断值。利用单因素及多因素COX及Kaplan-Meier方法评估CCNB1与预后的关系。利用STRING构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络。利用肿瘤免疫估计资源(TIMER)评估CNNB1基因与肿瘤浸润性免疫细胞的关系。结果CNNB1基因及蛋白在肺腺癌组织中的表达显著上调。CCNB1在男性、淋巴结转移、高TNM分期、吸烟、吸烟超过40年的患者中高表达,在年龄超过60岁的患者中低表达(P均<0.05)。Kaplan-Meier曲线表明,CCNB1高表达组的肺腺癌患者的预后比低表达组的患者更差[42.2个月vs 54.4个月,HR(95%CI):1.586(1.186~2.120),P=0.002],各亚组分析也显示了相同的结果。ROC曲线表明,区分肺腺癌与正常组织的最佳CCNB1值为3.483,AUC值为0.980(95%CI:0.967~0.993),其敏感性、特异性、阳性预测值、阴性预测值及约登指数分别为98.3%、93.5%、62.4%、99.8%、91.8%。相关分析表明,CCNB1表达与CD4^(+)T细胞(r=-0.2,P<0.001)、B细胞(r=-0.255,P<0.001)及树突状状细胞(r=-0.124,P=0.006)的浸润丰度具有负相关性,与中性粒细胞(r=0.173,P<0.001)及CD8^(+)T细胞(r=0.109,P=0.015)浸润丰度具有正相关性。结论高表达的CCNB1与肺腺癌预后不良和免疫浸润显著相关,可作为预后生物标志物及免疫治疗的潜在靶点。 展开更多
关键词 细胞周期蛋白B1 肺腺癌 预后 浸润性免疫细胞
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Prediction and validation of molecular biological mechanism of Fuzheng Huayu capsule in the treatment of liver cancer
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作者 Zi-Ning Wang Ayesha T.Tahir +2 位作者 Saba Waris Wen-Bo Cheng Jun Kang 《Cancer Advances》 2023年第7期1-9,共9页
Background:Fuzheng Huayu capsule(FZHY)combined with antiviral treatment has been shown to significantly reduce the risk of liver cancer in patients with hepatitis B cirrhosis.However,the potential of FZHY to directly ... Background:Fuzheng Huayu capsule(FZHY)combined with antiviral treatment has been shown to significantly reduce the risk of liver cancer in patients with hepatitis B cirrhosis.However,the potential of FZHY to directly treat liver cancer remains largely unknown.This study aims to investigate the molecular mechanism underlying the potential of FZHY in treating liver cancer.Methods:A network pharmacological analysis was performed using the Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology database to identify FZHY compounds and targets.Disease targets were searched using the Genecards database,and transcriptome data was downloaded from the NCBI database.Gene Ontology analysis was conducted using the DAVID database,and Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes analysis was based on KOBAS and bioinformatics methods.The Swissdock database was used for molecular docking.In cell experiments,the half inhibitory concentration(IC50)of FZHY was determined using the CCK8 method.The effects of FZHY on cell viability,apoptosis,and mitochondrial membrane potential were evaluated using a fluorescence microscope and flow cytometry.The molecular mechanism of FZHY in treating liver cancer was verified using quantitative polymerase chain reaction.Results:A total of 127 compounds and 184 proteins were identified as potential active ingredients and putative liver cancer-related targets.Additionally,1,899 liver cancer targets,279 transcriptome targets,and 3 pathways(p53 signaling pathway,apoptosis and PI3K-Akt pathway)were collected.The FZHY-targets-liver cancer interaction network was constructed.IC50 of FZHY lyophilized powder solution to liver cancer was 5.13 mg/mL(IC50=5.13 mg/mL).FZHY treatment led to an increase in the ratio of cell apoptosis and induced mitochondrial membrane potential damage,resulting in an increase in the number of dead cells.The expression levels of CCNB1 and BIRC5 were induced with FZHY treatment,while the expression levels of AKR1C3 and IGF2 were reduced.Conclusion:FZHY promotes apoptosis of liver cancer cells 展开更多
关键词 liver cancer Fuzheng Huayu capsule traditional Chinese medicine ccnb1 BIRC5 AKR1C3 IGF2
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基于生物信息学方法筛选乙型肝炎病毒相关肝癌的关键基因和临床预后 被引量:3
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作者 李玉杰 杨雪佳 +3 位作者 吴登强 吕玥茜 李茵佳 周素芳 《海南医学》 CAS 2020年第24期3129-3134,共6页
目的基于基因芯片和生物信息学相关的分析方法,筛选与慢性乙型肝炎(HBV)相关肝细胞癌(HCC)发病的差异表达基因,为有HBV感染史的肝癌患者提供新的分子治疗靶点。方法本研究对来自基因表达数据库(GEO)的GSE55092和GSE121248的mRNA微阵列... 目的基于基因芯片和生物信息学相关的分析方法,筛选与慢性乙型肝炎(HBV)相关肝细胞癌(HCC)发病的差异表达基因,为有HBV感染史的肝癌患者提供新的分子治疗靶点。方法本研究对来自基因表达数据库(GEO)的GSE55092和GSE121248的mRNA微阵列数据进行分析,获得HBV相关性肝癌和正常组织的差异表达基因(DEGs),利用DAVID数据库对DEGs进行了GO功能分析和KEGG通路富集分析,利用String数据库构建了蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,hub基因使用Cytoscape软件进行筛选,cBioportal分析hub基因的相关性,使用GEPIA和Kaplan-Meier数据库并结合TCGA数据库中肝癌基因表达数据进行验证,探讨hub基因与肝癌发生、发展和预后的关系。结果共获得了129个DEGs,鉴定了三个hub基因,细胞周期素依赖性激酶1(CDK1)、细胞周期蛋白B1(CCNB1)和DNA拓扑异构酶(TOP2A)与细胞周期、嘧啶代谢和DNA复制有关,并且三个基因高度相关,GEPIA数据库证实这些基因在肝癌组织中高度表达,并获得了相关的预后信息,Kaplan-Meier显示其与HCC患者的低生存率相关。结论CDK1、CCNB1和TOP2A与肝癌分级高度相关,肝细胞癌中hub基因的mRNA表达明显高于癌旁组织,hub基因为HBV相关肝癌的研究提供了新方向,有可能成为新的治疗靶点。 展开更多
关键词 肝细胞癌 慢性乙肝病毒 基因芯片 差异表达基因 细胞周期素依赖性激酶1 细胞周期蛋白B1 拓扑异构酶
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基于数据库探讨细胞周期蛋白B1(CCNB1)表达对胃癌预后的影响 被引量:2
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作者 杨生辉 黄琰菁 +7 位作者 邱纯 李向璐 李赛 孙达统 盛莉 陈邓林 邢雪花 王琳 《中国数字医学》 2020年第1期37-40,共4页
目的:细胞周期蛋白B1(CCNB1)是控制细胞周期G2/M转换阶段所必需的。在多种癌症中均检测到CCNB1的高表达。研究旨在探讨CCNB1在胃癌中的表达及预后意义。方法:通过检索Oncomine数据库分析胃癌及正常或癌旁组织的CCNB1表达水平,并通过胃... 目的:细胞周期蛋白B1(CCNB1)是控制细胞周期G2/M转换阶段所必需的。在多种癌症中均检测到CCNB1的高表达。研究旨在探讨CCNB1在胃癌中的表达及预后意义。方法:通过检索Oncomine数据库分析胃癌及正常或癌旁组织的CCNB1表达水平,并通过胃癌患者的Kaplan-MeierPlotter数据库研究其预后价值。结果:Oncomine数据库检索到445项不同研究记录,在胃癌中高表达的有2项,低表达的有0项。10项研究涉及CCNB1在胃癌组织和正常组织中的转录水平的表达,共包含478个样本,与正常胃组织相比,胃癌组织中CCNB1的表达水平更高(P=0.013)。此外,生存分析结果表明,CCNB1的表达水平与胃癌总体生存率存在明显的相关性,即高表达的患者总体生存率较好,低表达患者预后较差(P=8.6×10-7).结论:CCNB1在胃癌中的高表达与胃癌患者预后相关,为更准确预测预后和早期临床治疗提供一条新途径。 展开更多
关键词 胃癌 预后 ccnb1 Oncomine Kaplan-Meier
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细胞周期蛋白B1的泛癌分析及在膀胱癌中的表达与临床特征的相关性 被引量:1
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作者 万正强 李成 +1 位作者 郑冬冰 王英磊 《滨州医学院学报》 2022年第5期329-343,共15页
目的从泛癌角度研究细胞周期蛋白B1(CCNB1)的表达模式、免疫相关性和预后潜力。方法在ONCOMINE数据库和GEPIA数据库分析CCNB1在泛癌组织和正常组织中的差异表达情况,通过Kaplan-Meier Plotter和PrognoScan研究CCNB1在泛癌中的差异生存曲... 目的从泛癌角度研究细胞周期蛋白B1(CCNB1)的表达模式、免疫相关性和预后潜力。方法在ONCOMINE数据库和GEPIA数据库分析CCNB1在泛癌组织和正常组织中的差异表达情况,通过Kaplan-Meier Plotter和PrognoScan研究CCNB1在泛癌中的差异生存曲线,在人类蛋白表达图谱数据库(HPA)分析CCNB1蛋白在多种肿瘤中免疫组化及预后情况,在TIMER数据库和CIBERSORT数据库研究CCNB1表达与6种肿瘤的22种免疫浸润细胞的相关性,在UALCAN数据库进一步探究CCNB1表达与膀胱癌临床病理特征的相关性,并利用TCGA数据库408例膀胱癌患者的公共数据分析和验证CCNB1表达与临床表型的相关性,并通过单因素和多因素回归分析,分析CCNB1是否为膀胱癌预后的独立危险因素,最后通过GSEA富集分析探究与CCNB1表达相关的信号通路,并联合miRNACancer数据库、TargetScan Human数据库和ENCORI数据库进一步分析CCNB1在膀胱癌发生、发展的作用机制。结果CCNB1在泛癌中普遍高表达,且与正常组织差异表达,同时CCNB1可以预测多种肿瘤患者的生存状况。CCNB1与多种肿瘤免疫浸润细胞显著相关,包括B细胞、CD8^(+)T细胞、CD4^(+)T细胞、中性粒细胞、巨噬细胞和树突状细胞,其与Act-CD4^(+)T细胞显著负相关,而与Mast Acting细胞显著正相关。CCNB1是膀胱癌独立预后因子,其可能是通过hsa-miR-139-5p负向调控CCNB1激活P53信号通路和细胞周期通路两条癌症通路来实现的。结论CCNB1是至关重要的肿瘤预后预测因子,并在一定程度上调节多种肿瘤相关的免疫反应,可能为免疫治疗的新靶点,同时,CCNB1表达是膀胱癌预后的独立危险因素,可作为膀胱癌的新监测位点。 展开更多
关键词 ccnb1 泛癌分析 膀胱癌 肿瘤免疫微环境 预后因子 临床病理特征 分子机制
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桃叶珊瑚苷对乳腺癌细胞恶性生物学行为的影响及机制
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作者 司运辉 蒋凯 +2 位作者 钱立全 陈永顺 别会杰 《中国药房》 CAS 北大核心 2024年第8期918-924,共7页
目的探讨桃叶珊瑚苷(Auc)调节周期蛋白依赖性激酶1(CDK1)/周期蛋白B1(CCNB1)/Polo样激酶1(PLK1)信号通路对乳腺癌细胞恶性生物学行为的影响。方法以人乳腺癌细胞MCF-7为对象,将其分为对照组,Auc低、中、高浓度组(Auc-L、Auc-M、Auc-H组... 目的探讨桃叶珊瑚苷(Auc)调节周期蛋白依赖性激酶1(CDK1)/周期蛋白B1(CCNB1)/Polo样激酶1(PLK1)信号通路对乳腺癌细胞恶性生物学行为的影响。方法以人乳腺癌细胞MCF-7为对象,将其分为对照组,Auc低、中、高浓度组(Auc-L、Auc-M、Auc-H组,20、40、80μmol/L的Auc),Auc-H+pcDNA-NC组(80μmol/L的Auc+转染pcDNA-NC质粒),Auc-H+pcDNA-CDK1组(80μmol/L的Auc+转染pcDNA-CDK1质粒),检测各组细胞的增殖、克隆形成、侵袭、迁移能力,凋亡情况及周期分布,凋亡、上皮-间充质转化(EMT)、CDK1/CCNB1/PLK1信号通路相关蛋白的表达情况。以BALB/c裸鼠为对象,通过皮下接种MCF-7细胞悬液建立移植瘤模型,并将其分为对照组和Auc组(每组12只),检测各组裸鼠肿瘤体积、质量及肿瘤组织中CDK1/CCNB1/PLK1信号通路相关蛋白的表达情况。结果与对照组细胞相比,Auc各浓度组的细胞克隆形成数、增殖率、细胞侵袭数、划痕愈合率、G1/G0期和S期细胞占比以及B细胞淋巴瘤2(Bcl-2)、神经钙黏素、纤维连接蛋白、CDK1、CCNB1、PLK1蛋白的表达水平均显著降低(P<0.05),细胞凋亡率、G2/M期细胞占比以及Bcl-2相关X蛋白、上皮钙黏素蛋白的表达水平均显著增加(P<0.05),呈浓度依赖性(P<0.05);与Auc-H+pcDNA-NC组细胞相比,Auc-H组细胞上述指标的差异均无统计学意义(P>0.05),而Auc-H+pcDNA-CDK1组细胞上述指标则显著逆转(P<0.05)。与对照组裸鼠相比,Auc组裸鼠肿瘤体积、质量以及肿瘤组织中CDK1、CCNB1、PLK1蛋白的表达水平均显著降低(P<0.05)。结论Auc能抑制乳腺癌细胞的增殖、侵袭和迁移,诱导细胞周期阻滞,抑制EMT进程,该作用可能与抑制CDK1/CCNB1/PLK1信号通路激活有关。 展开更多
关键词 桃叶珊瑚苷 乳腺癌 恶性生物学行为 CDK1/ccnb1/PLK1信号通路
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CCNB1基因通过调控PI3K/Akt信号通路对口腔鳞癌细胞增殖、侵袭和迁移的影响 被引量:6
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作者 王璞 韦丽宾 倪广晓 《实用肿瘤学杂志》 CAS 2020年第2期144-149,共6页
目的探讨细胞周期蛋白B1(CCNB1)基因对口腔鳞癌细胞增殖、侵袭和迁移的影响及作用机制。方法实时荧光定量PCR(qRT-PCR)检测人正常口腔上皮细胞系HOK和人口腔鳞癌细胞系SCC-15、SCC-4、Cal-27中CCNB1基因的表达量,将CCNB1 siRNA(si-CCNB1... 目的探讨细胞周期蛋白B1(CCNB1)基因对口腔鳞癌细胞增殖、侵袭和迁移的影响及作用机制。方法实时荧光定量PCR(qRT-PCR)检测人正常口腔上皮细胞系HOK和人口腔鳞癌细胞系SCC-15、SCC-4、Cal-27中CCNB1基因的表达量,将CCNB1 siRNA(si-CCNB1)和阴性对照(si-NC)转染至SCC-15细胞,同时设置空白对照(Control),qRT-PCR和Western blot检测各组SCC-15细胞中CCNB1的表达,MTT实验、Transwell实验和划痕实验分别检测沉默CCNB1对SCC-15细胞增殖、侵袭和迁移能力的影响。Western blot检测细胞中MMP-2、MMP-9、PI3K、Akt和p-Akt蛋白的表达。结果CCNB1在口腔鳞癌细胞系中的表达显著高于正常口腔上皮细胞(P<0.05),si-NC组SCC-15细胞中CCNB1 mRNA和蛋白的表达与Control组无统计学差异(P>0.05);si-CCNB1组中CCNB1 mRNA和蛋白的表达明显低于si-NC组和Control组(P<0.05),si-NC组SCC-15细胞增殖、侵袭和迁移能力及MMP-2、MMP-9、PI3K、Akt、p-Akt蛋白表达与Control组无统计学差异(P>0.05);si-CCNB1组细胞增殖、侵袭和迁移能力及MMP-2、MMP-9、PI3K、p-Akt蛋白表达均明显低于si-NC组和Control组(P<0.05),两组间Akt蛋白表达无统计学差异(P>0.05)。结论CCNB1在口腔鳞癌细胞系中呈高表达,沉默CCNB1基因能够抑制人口腔鳞癌SCC-15细胞增殖、侵袭和迁移,其作用机制可能与抑制PI3K/Akt信号通路的激活有关。 展开更多
关键词 ccnb1基因 PI3K/AKT信号通路 口腔鳞癌细胞 增殖 侵袭 迁移
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CCNB1基因在口腔鳞状细胞癌中的表达及意义 被引量:6
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作者 崔宇平 马洪 +1 位作者 段晓峰 孙昆俊 《实用口腔医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2019年第3期395-397,共3页
目的:研究细胞周期蛋白B1(CCNB1)mRNA在口腔鳞状细胞癌(OSCC)组织中的表达及其临床意义。方法:利用实时荧光定量聚合酶链反应(Real-time PCR)检测CCNB1 mRNA在42例OSCC组织和17例口腔正常黏膜组织中的表达,并分析其相对表达量与临床特... 目的:研究细胞周期蛋白B1(CCNB1)mRNA在口腔鳞状细胞癌(OSCC)组织中的表达及其临床意义。方法:利用实时荧光定量聚合酶链反应(Real-time PCR)检测CCNB1 mRNA在42例OSCC组织和17例口腔正常黏膜组织中的表达,并分析其相对表达量与临床特征的关系。结果:CCNB1 mRNA在OSCC中高表达(P<0.05),高分化组织中表达量低于中低分化者(P<0.05),临床Ⅰ、Ⅱ期组低于Ⅲ、Ⅳ期(P<0.05)。不同年龄、不同性别组间差异无统计学意义(P>0.05)。结论:CCNB1基因表达的增高可能在OSCC增殖过程中起到重要作用。 展开更多
关键词 细胞周期蛋白B1(ccnb1) 口腔鳞状细胞癌(OSCC) 实时定量荧光聚合酶链反应
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基于生物信息学分析CCNB1在肺腺癌组织中的表达及其与预后的关系
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作者 常思思 高付彦 +4 位作者 朱亚辉 卢娟娟 闫俊涛 马纯政 李洪霖 《华西医学》 CAS 2023年第3期444-453,共10页
目的评估细胞周期蛋白B1(cyclin B1,CCNB1)基因表达与肺腺癌预后的相关性。方法使用Oncomine、STRING、人类蛋白质图谱、癌症基因组图谱等数据库以及Kaplan-Meier、Cox回归分析、受试者操作特征(receiver operating characteristic,ROC... 目的评估细胞周期蛋白B1(cyclin B1,CCNB1)基因表达与肺腺癌预后的相关性。方法使用Oncomine、STRING、人类蛋白质图谱、癌症基因组图谱等数据库以及Kaplan-Meier、Cox回归分析、受试者操作特征(receiver operating characteristic,ROC)曲线、Spearman相关分析等方法来验证CCNB1对肺腺癌患者的影响。结果CCNB1在肺腺癌组织中高表达,且与肺腺癌患者的T分期(P=0.001)、N分期(P<0.001)、病理分期(P<0.001)以及性别(P=0.008)等临床特征相关。单因素Cox回归分析结果显示CCNB1的表达、T分期、N分期、M分期、病理分期是影响肺腺癌患者总生存率的因素(P<0.05),多因素Cox回归分析显示CCNB1的表达、T分期是肺腺癌患者总生存率的独立危险因素(P<0.05)。Kaplan-Meier分析得出,CCNB1高表达与较短的总生存期[风险比(hazard ratio,HR)=1.60,95%置信区间(confidence interval,CI)(1.20,2.14),P=0.002]、疾病特异性生存期[HR=1.68,95%CI(1.16,2.44),P=0.006]、无进展间期[HR=1.42,95%CI(1.09,1.85),P=0.009]相关。ROC曲线表明CCNB1可能是肺腺癌的诊断分子[曲线下面积=0.980,95%CI(0.967,0.993)]。Spearman相关分析显示,CCNB1的表达与T辅助细胞2(r_(s)=0.805,P<0.001)及T辅助细胞(r_(s)=0.103,P=0.017)的浸润呈正相关,与自然杀伤细胞(r_(s)=-0.195,P<0.001)、巨噬细胞(r_(s)=-0.134,P=0.002)、T细胞(r_(s)=-0.092,P=0.033)的浸润呈负相关。结论与正常组织相比,CCNB1在肺腺癌中高表达,与不良预后具有相关性,可能为肺腺癌患者提供潜在的治疗靶点。 展开更多
关键词 肺腺癌 ccnb1基因 预后 免疫细胞浸润
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miR-150、CCNB1及MFN2参与调控肝癌细胞Huh-7凋亡并抑制其侵袭迁移的机制研究 被引量:5
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作者 文峰 向燕 《海南医学院学报》 CAS 2019年第9期650-653,共4页
目的:探究miR-150、细胞周期蛋白B1(CCNB1)及线粒体融合蛋白2(MFN2)参与调控肝癌细胞Huh-7凋亡并抑制其侵袭迁移的机制。方法:将肝癌细胞Huh-7分为对照组(control组)、阴性对照组(NC组)和miR-150过表达组(mimic组),通过质粒转染构建miR-... 目的:探究miR-150、细胞周期蛋白B1(CCNB1)及线粒体融合蛋白2(MFN2)参与调控肝癌细胞Huh-7凋亡并抑制其侵袭迁移的机制。方法:将肝癌细胞Huh-7分为对照组(control组)、阴性对照组(NC组)和miR-150过表达组(mimic组),通过质粒转染构建miR-150过表达细胞系。CCK-8和流式细胞术应用于检测细胞活力的凋亡,细胞划痕实验和Transwell应用于检测迁移和侵袭,qPCR检测miRNA和mRNA水平,WB检测蛋白的相对表达水平。结果:miR-150可显著抑制Huh-7的细胞活力而促进凋亡(P<0.01)。培养24 h后mimic组迁移率、侵袭率均显著低于control组和NC组(P<0.01)。Mimic组的CCNB1蛋白和mRNA的表达水平显著低于control组和NC组(P<0.01),MFN2显著高于control组和NC组(P<0.01)。结论:在肝癌细胞Huh-7中,miR-150可能通过下调CCNB1或上调MFN-2的水平抑制肝癌细胞的增殖、迁移、侵袭,并促进其凋亡。 展开更多
关键词 肝癌 miR-150 细胞周期蛋白B1(ccnb1) 线粒体融合蛋白2(MFN2)
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