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水牛卵泡不同发育阶段差异表达基因分析
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作者 徐晓晛 蒋晗偲 +4 位作者 李志鹏 崔奎青 罗西尔 杨春艳 刘庆友 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2024年第5期853-863,共11页
本研究旨在利用转录组测序技术探究摩拉水牛(Bubalus bubalis)发情期不同大小卵泡的基因表达谱,并进一步了解其对卵泡发育过程中相关激素的影响。通过对摩拉水牛进行Ovsynch法同期发情处理,B超检测卵泡大小并按照大、中、小3种类型(>... 本研究旨在利用转录组测序技术探究摩拉水牛(Bubalus bubalis)发情期不同大小卵泡的基因表达谱,并进一步了解其对卵泡发育过程中相关激素的影响。通过对摩拉水牛进行Ovsynch法同期发情处理,B超检测卵泡大小并按照大、中、小3种类型(>8 mm、4~7 mm、0~3 mm)区分,活体采集卵泡液后提取RNA送单细胞转录组测序。将获得的数据进行组间两两比较,以|log2fold change|≥1且P<0.05为标准筛选差异转录本,并取各组差异表达转录本并集共1473个转录本做表达趋势筛选,其中587个转录本符合牛卵泡发育过程中的转录调控规律,通过GO和KEGG富集分析并筛选得到了33条通路,各通路主要与细胞间相互作用、类固醇生成和激素产生、细胞分化和发育、细胞运动、代谢调节、生理适应性等过程相关。通过对通路上的基因进行蛋白质互作网络分析,进一步获得了可能影响水牛卵泡发育过程中激素调节的关键基因,如BAMBI、FST、INHA、INHBA、INHBB、GATA6和GFAP。综上,该研究结果为进一步探究水牛卵泡发育过程中的关键基因及可能的分子调控机制提供了参考。 展开更多
关键词 水牛(Bubalus bubalis) 卵泡大小 卵母细胞 激素调节 转录组测序
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水牛泌乳期与干乳期差异血清生化指标及代谢物研究
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作者 丁子旭 徐祎雪 +5 位作者 冯彤 王艳 崔奎青 李志鹏 杨春艳 刘庆友 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2024年第6期1054-1065,共12页
本研究旨在比较泌乳期与干乳期水牛(Bubalus bubalis)差异血清生化指标及差异血清代谢物的组成,探讨血清生化指标与代谢物的相互关联,进一步了解水牛营养代谢过程的调控机制。选取泌乳期(泌乳第100~200天)健康水牛9头和干乳期(停乳后第3... 本研究旨在比较泌乳期与干乳期水牛(Bubalus bubalis)差异血清生化指标及差异血清代谢物的组成,探讨血清生化指标与代谢物的相互关联,进一步了解水牛营养代谢过程的调控机制。选取泌乳期(泌乳第100~200天)健康水牛9头和干乳期(停乳后第30~60天)健康水牛9头,每头牛采血清样本两份,一份用生化分析仪进行20项指标检测;另一份用超高效液相色谱-串联质谱法(ultra-high performance liquid chromatography-tandem mass spectrometry,UPLC-MS/MS)检测分析水牛血清中内源性代谢物。在生化指标检测结果中,泌乳期的谷草转氨酶/谷丙转氨酶(P<0.05)、甘油三酯(P<0.01)显著低于干乳期的,说明水牛在泌乳期时对酯类物质的利用效率更高;而泌乳期的胆固醇(P<0.01)、低密度脂蛋白(P<0.01)、高密度脂蛋白(P<0.001)、尿素氮(P<0.01)、葡萄糖(P<0.01)和免疫球蛋白A(P<0.0001)等指标显著高于干乳期的,说明泌乳期时水牛的物质代谢更高。对于血清代谢物进行分析得出共有183种代谢产物在2个时期中存在显著差异(P<0.05,VIP>1),这些代谢产物共富集到8条显著不同的代谢途径,分别是D-谷氨酰胺和D-谷氨酸代谢,精氨酸和脯氨酸代谢,色氨酸代谢,卟啉和叶绿素代谢,甘氨酸、丝氨酸和苏氨酸代谢,组氨酸代谢,不饱和脂肪酸的生物合成,以及氮代谢(P<0.05)。这些结果说明在泌乳期时,水牛吸收的营养物质主要用于参与多种氨基酸的合成及脂肪酸的合成与利用。 展开更多
关键词 水牛(Bubalus bubalis) 血清生化指标 代谢组学 泌乳期 干乳期
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Comparative antimicrobial activity in Murrah buffalo (Bubalus bubalis) Heifers’ urine and urine distillate
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作者 Bhoj R Singh Himani Agri +2 位作者 Dayanath Balusamy Akanksha Yadav Varsha Jayakumar 《Infectious Diseases Research》 2024年第1期32-39,共8页
Background:Murrah buffalo is a breed of water buffalo(Bubalus bubalis)reared for milk and meat,especially in Northern India.There are so many studies on the antimicrobial potential of the cow(Bos indicus)urine but buf... Background:Murrah buffalo is a breed of water buffalo(Bubalus bubalis)reared for milk and meat,especially in Northern India.There are so many studies on the antimicrobial potential of the cow(Bos indicus)urine but buffalo urine has rarely been studied.This study was aimed to evaluate the antimicrobial activity in whole buffalo urine and its distillate.Methods:Urine specimens were collected from seven Murrah buffalo heifers in the morning over three days from all seven heifers and distillated to prepare urine distillate(UD).The antimicrobial activity was determined through 96 well microplate method diluting(1:1)urine and UD in Mueller Hinton liquid medium against 919 microbial strains belonging to 148 species of 49 genera(Candia,11 genera of Gram+ve bacteria,37 genera of Gram-ve bacteria).The test strains were taken from the repository,revived and tested for purity before testing.The test strains were of clinical origin(372),environmental origin(496)and also from reference strain repositories(51).Results:Of the 919 test strains,a total of 57.89%and 56.04%of the tested strains were susceptible to UD and urine,respectively.There was a no significant(p>0.4)difference in the antimicrobial activity of UD and urine against 919 strains of microbes,regardless of their genus,species,and Gram staining reaction.Similarly,there was no significant(p>0.4)difference between the susceptibility of bacterial and Candida strains to UD or urine.However,strains of clinical origin were more often resistant to buffalo UD and urine(p<0.01)than strains isolated from environmental sources irrespective of their Gram staining characteristics(p>0.05).A significantly(p<0.01)higher proportion of reference strains was susceptible to UD and urine than microbial strains of clinical and environmental origin.For buffalo urine and UD,the most susceptible strains were Stenotrophomonas maltophilia(13/13)followed by Citrobacter freundii(8/10);Salmonella enterica ssp.enterica(21/27),Geobacillus stearothermophilus(23/30),Staphylococcus aureus(13/17),and P 展开更多
关键词 Bubalus bubalis Edwardsiella tarda Entereococcus faecium Escherichia coli Klebsiella pneumoniae Raoultella terrigena Salmonella enteric
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Functional Genes in Relation to Residual Feed Intake in Murrah Buffalo Heifers
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作者 Poonam Sikka Shyam Sunder Paul +4 位作者 Andonissamy Jerome Dwijesh Mishra Krishna Kumar Chaturvedi Inderjeet Singh Anil Rai 《Advances in Bioscience and Biotechnology》 2023年第4期210-236,共27页
High Feed efficiency (FE) in growing heifers has economic importance in dairy, but remains less understood in buffaloes. Feed conversion efficiency is defined as dry matter intake (DMI) per unit body weight gain and i... High Feed efficiency (FE) in growing heifers has economic importance in dairy, but remains less understood in buffaloes. Feed conversion efficiency is defined as dry matter intake (DMI) per unit body weight gain and is determined as residual feed intake (RFI), i.e., the difference between actual and predicted feed intake to gain unit body weight during a feed trial run for 78 days under control feeding. A large variation was identified ranging between -0.42 to 0.35 in growing buffalo heifers (n = 40) of age between 11 to 15 months. An average daily weight gain (ADG) varied between 382.0 and 807.6 g/day when compared with the control-fed heifers at an organized buffalo farm. The whole blood transcriptome data obtained from the selected growing heifers from extremes of estimated high and low RFI efficiency were compared with the reference assembly generated from the transcriptome of multiparous buffaloes (n = 16) of diverse age of maturity, period of regaining post partum cyclicity and level of milk production. Differentially expressed genes (DEGs) were identified using the reference genome of Mediterranean water buffalo. GO: terms (Padj 0.05, FDR 0.05) enriched by annotated DEGs and biological pathways in gene network for RFI efficiency trait were identified. GO: terms specific to pre-transcriptional regulation of nucleus and Chromatin organization under Nucleoplasm, Energy balancing, Immunity, Cell signaling, ROS optimization, ATP generation through the Electron Transport chain and cell proliferation were determined. The study reveals the indicators targeting the actual metabolic changes and molecular functions underlying the feed utilization capacity of buffaloes. Estimated RFI efficiency revealed a large variation over heifers which may lower the DMI even up to 13.6% thus, enabling an increase in ADG up to 16% by involving efficient heifers in breeding plan. The study revealed a scope of high gain by selective breeding for FE in heifers. FE variants catalogued in the study are useful breed-specific RFI markers 展开更多
关键词 Bubalus bubalis Feed Efficiency Residual Feed Intake Blood Transcriptome Differentially Expressed Genes
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Detection of Babesia bovis and Babesia bigemina in Water Buffaloes (Bubalus bubalis) in Endemic Areas of São Paulo State, Brazil
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作者 T. A. Néo R. Giglioti +8 位作者 D. Obregón T. B. Bilhassi H. N. Oliveira R. Z. Machado F. de F. Aníbal L. G. Brito W. Malagó Jr. F. A. Bressani M. C. S. Oliveira 《Open Journal of Veterinary Medicine》 2016年第5期75-84,共10页
Babesiosis is a tick-transmitted disease that causes severe economic losses to the cattle industry in Brazil. Water buffaloes (Bubalus bubalis) are often carriers of Babesia spp., but there are no studies that provide... Babesiosis is a tick-transmitted disease that causes severe economic losses to the cattle industry in Brazil. Water buffaloes (Bubalus bubalis) are often carriers of Babesia spp., but there are no studies that provide an accurate estimation of this infection in animals raised in regions of endemic stability. This study was conducted to investigate Babesia bovis and B. bigemina infections in 108 water buffaloes (50 calves and 58 adult females) located in areas of S&atildeo Paulo state, where the animals were continuously exposed to Rhipicephalus microplus ticks. B. bovis and B. bigemina infections were screened by microscopic examination of blood smears, nested PCR (nPCR) and quantitative real-time PCR (qPCR), which were also used to estimate the number of copies (NC) of the cytochrome b (mt-cytB) gene in the blood samples. B. bigemina was found in blood smears of three calves from Alambari herd (all with less than 0.1% parasitemia). Molecular techniques were more sensitive than blood smears to diagnose piroplasms in water buffaloes: 20.37% and 100.00% for B. bovis-infected animals and 59.26% and 100.00% for B. bigemina-infected animals, respectively for nPCR and qPCR. The NC of mt-cytB gene of B. bovis and B. bigemina in blood samples revealed significant effects (p p ≤ 0.05) for B. bigemina (2.80 ± 0.06) than for B. bovis (2.61 ± 0.05). Within each herd-age, differences between the species’ NC values were found only in Alambari calves, which showed significantly higher (p ≤ 0.05) NC of B. bigemina (3.48 ± 0.13). The calves and cows from Ibaté showed the lowest NC of B. bigemina (2.29 ± 0.13 and 2.63 ± 0.14) and B. bovis (2.54 ± 0.11 and 2.37 ± 0.12), respectively. These data suggest a high prevalence of B. bovis and B. bigemina infection in the buffalo population in endemic areas of S&atildeo Paulo state. 展开更多
关键词 Bubalus bubalis BABESIOSIS DIAGNOSIS nPCR qPCR
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Influence of Concentrate in the Diet on the Metabolic, Biochemical, and Endocrine Profile of Buffalo Heifers
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作者 Caio Alves da Costa Rafael Artur da Silva Júnior +7 位作者 Bruna Higino de Souza Silva Rebeka Pontes Menezes Ayna Arramis Apolinário Da Silva Felipe Rosendo Correia Emanuel Felipe de Oliveira Filho Ricardo Alexandre Silva Pessoa Cláudio Coutinho Bartolomeu Pierre Castro Soares 《Open Journal of Veterinary Medicine》 2019年第7期79-90,共12页
The objective of this study was to evaluate the profile of the main serum biochemical variables in buffalo heifers receiving diets with different concentrations of concentrate. Twenty buffalo heifers of the Murrah bre... The objective of this study was to evaluate the profile of the main serum biochemical variables in buffalo heifers receiving diets with different concentrations of concentrate. Twenty buffalo heifers of the Murrah breed, aged six to eight months, were randomly assigned to four groups, with five replicates each, to be adapted to levels of 20%, 40%, 60%, and 80% of concentrate in the diet, composed of sugarcane (bulk) and concentrated feed based on wheat, corn, and soybean meal. The experimental diets were constituted in the proportion “bulk: concentrate”, based on dry matter, of “80:20” (Treatment 1), “60:40” (Treatment 2), “40:60” (Treatment 3), and “20:80” (Treatment 4). Biomarkers were evaluated for energy, protein, mineral, and endocrine profiles, as well as enzymatic activity. A positive linear effect was observed for Final Body Weight. In the energy profile, there was a positive linear effect for total cholesterol and HDL cholesterol and a quadratic effect for plasma glucose. In the protein profile, a quadratic effect was observed for the urea: creatinine ratio and a positive linear effect for total protein and albumin. For the enzymatic activity, only the variable gamma-glutamyltransferase presented a quadratic effect. In the mineral profile, a quadratic effect was observed for calcium levels and a positive linear effect for phosphorus levels and negative for chlorine levels. In the endocrine profile, no statistical differences were observed. Diet with until 80% of concentrate does not negatively influence biochemical parameters that represent the profile of energy, protein, mineral and thyroid hormones for growing buffalo heifers and favors the performance of the animals. 展开更多
关键词 Animal Nutrition Clinical Pathology Bubalus bubalis Energy PROFILE
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Tissue-specific Temporal Exome Capture Revealed Muscle-specific Genes and SNPs in Indian Buffalo(Bubalus bubalis)
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作者 Subhash J.Jakhesara Viral B.Ahir +3 位作者 Ketan B.Padiya Prakash G.Koringa Dharamshibhai N.Rank Chaitanya G.Joshi 《Genomics, Proteomics & Bioinformatics》 CAS CSCD 2012年第2期107-113,共7页
Whole genome sequencing of buffalo is yet to be completed, and in the near future it may not be possible to identify an exome (coding region of genome) through bioinformatics for designing probes to capture it. In t... Whole genome sequencing of buffalo is yet to be completed, and in the near future it may not be possible to identify an exome (coding region of genome) through bioinformatics for designing probes to capture it. In the present study, we employed in solution hybridization to sequence tissue specific temporal exomes (TST exome) in buffalo. We utilized cDNA prepared from buffalo muscle tissue as a probe to capture TST exomes from the buffalo genome. This resulted in a prominent reduction of repeat sequences (up to 40%) and an enrichment of coding sequences (up to 60%). Enriched targets were sequenced on a 454 pyro-sequencing platform, generating 101,244 reads contain- ing 24,127,779 high quality bases. The data revealed 40,100 variations, of which 403 were indels and 39,218 SNPs containing 195 nonsyn- onymous candidate SNPs in protein-coding regions. The study has indicated that 80% of the total genes identified from capture data were expressed in muscle tissue. The present study is the first of its kind to sequence TST exomes captured by use of cDNA molecules for SNPs found in the coding region without any prior sequence information of targeted molecules. 展开更多
关键词 HYBRIDIZATION EXOME SNP Bubalus bubalis Temporal gene expression 454 Sequencing
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水牛角与羚羊角的HPLC法鉴别 被引量:14
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作者 李晓蒙 何新荣 《广东药学院学报》 CAS 2003年第2期97-98,共2页
建立一种鉴别水牛角与羚羊角药材的质控方法。采用OPA柱前衍生反相高效液相色谱法,色谱柱为HP Hypersil ODS柱(125 mm×4.6mm×5μm),以十八烷基硅烷键合硅胶为填充剂。流动相A:8.0 mmol/L磷酸盐缓冲液(pH7.2),含φ=0.3%四氢呋... 建立一种鉴别水牛角与羚羊角药材的质控方法。采用OPA柱前衍生反相高效液相色谱法,色谱柱为HP Hypersil ODS柱(125 mm×4.6mm×5μm),以十八烷基硅烷键合硅胶为填充剂。流动相A:8.0 mmol/L磷酸盐缓冲液(pH7.2),含φ=0.3%四氢呋喃;流动相B:8.0 mmol/L磷酸盐缓冲液(pH7.2)+甲醇+乙腈(50+35+15)。线性梯度洗脱;荧光检测器,Ex=340nm,Em=450 nm。结果水牛角与羚羊角药材在氨基酸的含量上有明显差异。本文所建立的方法简便,重现性好,可用于水牛角与羚羊角药材的鉴别。 展开更多
关键词 水牛角 羚羊角 HPLC法 鉴别 中药
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德宏水牛和摩拉水牛红细胞免疫功能研究及其意义 被引量:7
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作者 王旭东 王生奎 +2 位作者 谭荣新 饶家荣 尹正发 《云南农业大学学报》 CAS CSCD 1992年第1期18-22,T001,共6页
通过对36例德宏水牛和7例摩拉水牛 C_3bRR 和 ICR 的检测,证实这两种水牛的红细胞具有补体 C_3b 受体.表明红细胞疫系统(red cell immune system,RCIS)的概念也适用于这两类动物,文中还对 C_3bRR 率和 ICR 率的含意作出了新的解释.
关键词 RCIS C3B受体 水牛 沼泽型 江河型
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不同发情阶段水牛唾液的DIA定量蛋白组学分析
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作者 余洲 杨柏高 +5 位作者 李崇阳 张培培 曹建华 牛一凡 覃广胜 赵学明 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第11期5072-5084,共13页
旨在利用高通量DIA定量蛋白组学分析不同发情阶段水牛唾液中蛋白的差异。本研究将15头体况相近(平均体重为650~750 kg),发情正常,健康状态良好的2~5胎次的尼里-拉菲母水牛作为研究对象,在相同的管理条件下,对其注射氯前列醇并计为第0天... 旨在利用高通量DIA定量蛋白组学分析不同发情阶段水牛唾液中蛋白的差异。本研究将15头体况相近(平均体重为650~750 kg),发情正常,健康状态良好的2~5胎次的尼里-拉菲母水牛作为研究对象,在相同的管理条件下,对其注射氯前列醇并计为第0天,分别在发情前期(第1天)、发情期(第3天)、发情后期(第6天)早上饲喂之前(08:00-11:00)进行唾液的采集,唾液样本每个发情时期分组相同,每3头牛分为一组,共分为5组,样品处理后进行DIA定量蛋白组学检测。结果显示,不同发情阶段水牛的唾液中共定量到1982个蛋白质,分别在发情期/发情前期和发情期/发情后期比较组中鉴定到59和38个差异丰度蛋白。功能分析发现,CBL、SOD1、SPP1和ARPC1B等蛋白质可能在细胞调控和抗氧化、维持细胞间相互作用等方面发挥作用。KEGG通路分析显示,发情前期、发情期和发情后期水牛唾液差异丰度蛋白被富集到mTOR信号通路、孕酮介导的卵母细胞成熟等通路上。综上,通过不同发情阶段的对比,获得与繁殖相关的差异蛋白4个,CBL、ARPC1B、SOD1和SPP1。这些唾液中的差异丰度蛋白可能作为水牛发情生物标志物的关键蛋白,进而为开发水牛发情检测诊断试剂盒提供数据支撑。 展开更多
关键词 水牛 发情鉴定 唾液 蛋白组学
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饲喂水牛不同部位脂肪组织对金黄地鼠健康的影响
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作者 冯偞 何琴 +4 位作者 卢晓雨 邓晶 龚思思 吴璋伟 黄洁萍 《中国牛业科学》 2024年第4期24-29,34,共7页
本研究旨在探究饲喂水牛胸部皮下脂(不饱和脂肪酸含量高)和肾周脂(饱和脂肪酸含量高)对金黄地鼠健康的影响。本试验以成年摩拉水牛胸部皮下脂肪和肾周脂肪组织为材料,将30只6周龄雌性金黄地鼠随机平均分为3组:普通饲喂组(含油量10%)、... 本研究旨在探究饲喂水牛胸部皮下脂(不饱和脂肪酸含量高)和肾周脂(饱和脂肪酸含量高)对金黄地鼠健康的影响。本试验以成年摩拉水牛胸部皮下脂肪和肾周脂肪组织为材料,将30只6周龄雌性金黄地鼠随机平均分为3组:普通饲喂组(含油量10%)、胸部皮下脂高脂饲喂组(含油量45%)、肾周脂高脂饲喂组(含脂量45%)。适应性饲喂1周,正式饲喂试验为期8周。在第0、4、8周采集血液样本,饲喂结束时采集肝脏和腹股沟脂肪组织,试验期间每周称重,每天称量采食量。结果表明:与普通饲喂组相比,肾周脂高脂饲喂8周金黄地鼠终末体重、平均日增重、Lee’s指数、血脂浓度(甘油三酯、胆固醇等)、体脂沉积、肝脏损伤及脂代谢等均显著升高(P<0.05或P<0.01),提示高脂饲喂可引起金黄地鼠肥胖;同样是高脂饲喂,胸部皮下脂饲喂组金黄地鼠终末体重、平均日增重、Lee’s指数、血脂浓度(胆固醇、动脉硬化指数等)、体脂沉积、肝脏损伤及脂代谢等均显著均低于肾周脂饲喂组(P<0.05或P<0.01)。综上所述,富含不饱和脂肪酸的水牛胸部皮下脂可缓解高脂饲喂带来的健康风险,这为水牛不饱和脂肪酸生成的调控提供重要基础信息和材料。 展开更多
关键词 水牛 胸部皮下脂 肾周脂 不饱和脂肪酸
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西林水牛遗传资源现状
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作者 邹芳芳 奚玉莲 +2 位作者 韦科龙 石德顺 黄洁萍 《黑龙江动物繁殖》 2024年第6期24-27,共4页
我国水牛资源丰富,历史上以役用为主。近年来,随着农业机械化水平的提高,水牛役用价值降低,导致水牛存栏量急剧下降,且正向乳用或乳肉兼用方向转型。西林水牛是广西壮族自治区优良地方品种,为全国13个地方良种水牛之一,属大型役肉兼用... 我国水牛资源丰富,历史上以役用为主。近年来,随着农业机械化水平的提高,水牛役用价值降低,导致水牛存栏量急剧下降,且正向乳用或乳肉兼用方向转型。西林水牛是广西壮族自治区优良地方品种,为全国13个地方良种水牛之一,属大型役肉兼用型水牛,具有适应性强、肉质优良、抗病能力强、耐高温高湿等特点。目前,受引进品种生长快、产肉率高、繁殖性能强、产奶量高的影响,西林水牛生存现状堪忧。文章综述了西林水牛历史沿革、体型外貌、生产性能等方面内容,并针对当前西林水牛产业发展存在的问题提出了相应建议,以期为我国水牛遗传资源保护及产业转型提供参考。 展开更多
关键词 水牛 西林水牛 生存现状 遗传资源 保护
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水牛α-乳清蛋白基因的克隆及序列分析 被引量:4
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作者 刘建忠 田为宇 +3 位作者 敖敬 周卫 陈俊 鲁礼林 《西北农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第5期31-34,共4页
根据报道的奶牛α-乳清蛋白基因核苷酸序列设计和合成4对引物,采用PCR扩增的方法克隆并测定了水牛α-乳清蛋白全基因的核苷酸序列。结果表明,克隆的水牛α-乳清蛋白基因全长3 038 bp,包括5′侧翼区,3′侧翼区,3个内含子和4个外显子(该... 根据报道的奶牛α-乳清蛋白基因核苷酸序列设计和合成4对引物,采用PCR扩增的方法克隆并测定了水牛α-乳清蛋白全基因的核苷酸序列。结果表明,克隆的水牛α-乳清蛋白基因全长3 038 bp,包括5′侧翼区,3′侧翼区,3个内含子和4个外显子(该序列已被成功提交到GenBank,序列接收号为EU422984)。核苷酸序列比对结果表明,水牛α-乳清蛋白基因与报道的奶牛该基因的核苷酸序列同源性为97.53%。水牛α-乳清蛋白成熟肽的氨基酸序列与奶牛相比有两个氨基酸的差异。与奶牛相比,水牛α-乳清蛋白基因5′调控区发生了多处插入突变和碱基替换突变,这些插入和替换突变可能与水牛乳汁中α-乳清蛋白的高水平表达有关。 展开更多
关键词 中国水牛 α-乳清蛋白基因 PCR扩增 同源性分析
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感染大片形吸虫水牛脊髓全基因组DNA的甲基化及其功能的分析 被引量:2
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作者 钟舒红 盛兆安 +7 位作者 李军 彭昊 吴翠兰 马春霞 彭红艳 黄维义 施维 潘艳 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第3期253-263,共11页
为探究感染大片形吸虫后不同时间水牛脊髓全基因组DNA甲基化的类型、占比及其感染后差异甲基化区域(DMR)涉及的功能及信号通路,本研究将大片形吸虫囊蚴经口灌胃感染8~10月龄水牛,分别于感染后3 d(J01)、10 d(J02)、28 d(J03)、42 d(J04)... 为探究感染大片形吸虫后不同时间水牛脊髓全基因组DNA甲基化的类型、占比及其感染后差异甲基化区域(DMR)涉及的功能及信号通路,本研究将大片形吸虫囊蚴经口灌胃感染8~10月龄水牛,分别于感染后3 d(J01)、10 d(J02)、28 d(J03)、42 d(J04)、70 d(J05)和98 d(J06)采集水牛脊髓,利用全基因组重亚硫酸盐测序技术(WGBS)对基因组DNA的甲基化测序,测序数据经过滤筛选后,采用Bismark软件分析各组水牛脊髓基因组DNA甲基化的类型及其占比(某种类型甲基化序列在该组全部可用测序序列中的占比以及该组某种C类型甲基化的数量在全部C类型甲基化中的占比),并采用weight methylation level对各组水牛脊髓基因组DNA 7个功能区域的甲基化进行聚类分析。WGBS测序结果经过滤后显示,平均每组测序长度为100.29 Gp,Q20%(质量值≥20的碱基占总碱基数的百分比)和Q30%分别达到95%和85%以上,6组样品亚硫酸盐(BS)转化率均大于99%,表明WGBS测序结果准确可靠;各组样品DNA甲基化类型和占比的分析及统计结果显示,J01~J06组基因组分别包含CG、CHG、CHH 3种类型的甲基化(mCG、m CH及m CHH),且以m CG类型占比最多(63.1%~71.7%,80.11%~85.73%),m CHH类型(0.9%~1.2%,11.27%~15.18%)及m CHG类型均较少(1.0%~1.2%,3.00%~4.84%);聚类分析结果显示,上述3种类型的甲基化主要分布在水牛脊髓基因组第1内含子和内部内含子。上述结果表明,感染大片形吸虫后水牛脊髓基因组DNA甲基化类型以m CG为主,且第1内含子和内部内含子的甲基化可能影响该两个区域相关基因的正常表达。利用R软件包分析各组水牛脊髓基因组之间是否存在DMR,并采用基于模型的亚硫酸氢盐测序数据分析(MOABS)筛选并统计各组之间的DMR及DMR的数量;采用DAVID软件分析各组DMR在其相应基因组中的分布;采用R语言对各组的DMR进行GO功能注释和KEEG富集分析。DMR的筛选及统计结果显示,各基因组 展开更多
关键词 水牛 大片形吸虫 脊髓 DNA甲基化 全基因组重亚硫酸盐测序技术 差异甲基化区域
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摩杂一代水牛与广西沼泽型水牛垂体组织结构的比较研究 被引量:2
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作者 黎金秀 秦津 +5 位作者 宋小白 韦青妮 潘堂峰 韩涛 潘琼 李瑞明 《广西农业生物科学》 CAS CSCD 2008年第B06期16-20,共5页
对广西摩杂一代水牛的脑垂体进行组织学研究,并和广西沼泽型水牛(Bubalus bubalis)的脑垂体进行比较。将两种水牛的脑垂体做成切片,采用HE染色并通过图像分析仪进行分析。结果显示摩杂一代水牛脑垂体呈长卵圆形,其神经部细胞大小和细胞... 对广西摩杂一代水牛的脑垂体进行组织学研究,并和广西沼泽型水牛(Bubalus bubalis)的脑垂体进行比较。将两种水牛的脑垂体做成切片,采用HE染色并通过图像分析仪进行分析。结果显示摩杂一代水牛脑垂体呈长卵圆形,其神经部细胞大小和细胞密度和广西沼泽型水牛差异不显著,中间部的嫌色细胞较广西沼泽型水牛的多,而远侧部的各种细胞出现率表现出差异显著,其中嗜酸性细胞与广西沼泽型水牛差异极显著。这些结果为培育广西奶水牛提供形态学依据。 展开更多
关键词 摩杂一代水牛 广西沼泽型水牛 垂体
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不同促精子活动剂对水牛卵母细胞体外受精及随后胚胎发育的影响(英文) 被引量:2
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作者 Abdul Rahman SESAY 石德顺 《华南农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第2期95-99,共5页
主要探讨精子活动促进剂对水牛Bubalusbubalis卵母细胞体外受精及随后胚胎发育的影响.来自屠宰场水牛卵巢的卵母细胞和卵丘细胞复合体,在体积分数为5 %CO2 的培养箱中培养2 4~2 6h ,然后通过体外受精测定其受精和胚胎发育能力.试验1:... 主要探讨精子活动促进剂对水牛Bubalusbubalis卵母细胞体外受精及随后胚胎发育的影响.来自屠宰场水牛卵巢的卵母细胞和卵丘细胞复合体,在体积分数为5 %CO2 的培养箱中培养2 4~2 6h ,然后通过体外受精测定其受精和胚胎发育能力.试验1:解冻的精子用5 0g/mL的胰蛋白酶处理30min ,然后进行受精;试验2 :受精在含不同浓度咖啡因(0 ,2 5 ,5 0和10 0mmol/L)的受精液中进行;试验3:在含不同浓度的钙离子载体A2 3187(0 ,0 1,1 0和2 5μmol/L)的受精液中进行体外受精;试验4 :在PHE、咖啡因和A2 3187不同组合(空白,PHE ,PHE +2 5mmol/L咖啡因+2 5 μmol/LA2 3187和PHE +2 5 μmol/LA2 3187)的受精液中进行体外受精.试验结果表明,精子用胰蛋白酶处理后的受精卵囊胚发育率显著下降(12 5 %和2 6 % ,P <0 0 5 ) ,而用咖啡因和钙离子载体A2 3187处理,对卵母细胞的卵裂率和囊胚发育率没有明显影响.在体外受精中PHE和钙离子载体的组合使用能提高受精卵的胚胎发育率。 展开更多
关键词 水牛 体外受精 精子活力促进剂 胚胎发育 卵母细胞
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水牛感染血清免疫筛选日本血吸虫成虫cDNA文库 被引量:2
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作者 张冉 易新元 +2 位作者 曾宪芳 黄跃龙 Larry McReynolds 《中国地方病学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2004年第6期549-552,共4页
目的 筛选新的有潜质的日本血吸虫保护性抗原分子编码基因。方法 用水牛感染血清对日本血吸虫(Schistosoma Japonicum,sj)成虫cDNA文库进行免疫筛选,将阳性克隆的插入片段进行PCR扩增和序列分析。结果 3轮筛选后,将7个阳性克隆经辅助噬... 目的 筛选新的有潜质的日本血吸虫保护性抗原分子编码基因。方法 用水牛感染血清对日本血吸虫(Schistosoma Japonicum,sj)成虫cDNA文库进行免疫筛选,将阳性克隆的插入片段进行PCR扩增和序列分析。结果 3轮筛选后,将7个阳性克隆经辅助噬菌体自动剪切并PCR扩增显示,插入的日本血吸虫cDNA片段大小在0.8-2.0 kb之间,选取其中4个经DNA测序分析,发现2个未曾报道过的日本血吸虫新基因,分别命名为sj-IB1和sj-Rho GTPase-like gene,并在Gene Bank登记注册。结论 水牛感染血清可识别日本血吸虫的特异性抗原分子,这些抗原分子的免疫保护作用值得进一步研究。 展开更多
关键词 水牛 免疫筛选 日本血吸虫 CDNA文库 感染血清 血吸虫病
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水牛角提取液中谷氨酸含量的测定 被引量:2
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作者 李煌 冯俭 +3 位作者 朱晗 张梦云 张煜华 孙川 《现代中药研究与实践》 CAS 2010年第1期61-62,共2页
目的测定水牛角提取液中谷氨酸的含量。方法采用氨基酸分析仪测定水牛角提取液中的谷氨酸含量。结果水牛角提取液中谷氨酸的含量为0.225%。结论本法稳定、可行,为评价水牛角药材质量提供依据。
关键词 水牛角提取液 谷氨酸 舍量测定
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河流型水牛和沼泽型水牛肠道微生物菌群结构比较研究 被引量:1
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作者 罗玉虹 刘自营 +5 位作者 王腾 冯彤 陈卫华 杨春艳 石德顺 刘庆友 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2022年第4期699-709,共11页
沼泽型水牛的主要经济性状是役用,而河流型水牛的主要经济性状是乳用。宿主生产形状的差异常伴随着其肠道微生物群落的变化。本文对成年河流型和沼泽型水牛肠道菌群进行宏基因组比较研究,研究结果表明:沼泽型水牛组样品共获得2192526个... 沼泽型水牛的主要经济性状是役用,而河流型水牛的主要经济性状是乳用。宿主生产形状的差异常伴随着其肠道微生物群落的变化。本文对成年河流型和沼泽型水牛肠道菌群进行宏基因组比较研究,研究结果表明:沼泽型水牛组样品共获得2192526个非冗余基因,河流型水牛组样品获得1686914个非冗余基因,两组共有420452个非冗余基因重叠,由此可见两种水牛肠道特有的基因数量远大于共有的基因数量,在肠道微生物基因组成上差别较大。放线菌门(Actinobacteria)在沼泽型水牛肠道中的相对丰度显著高于河流型水牛的,放线菌门是土壤中主要的细菌,推测沼泽型水牛在野外稻田役用过程中因采食鲜草与土壤密切接触而获得放线菌门。在属水平发现河流型水牛肠道中的罗氏菌属(Roseburia)和Turicibacter相对丰度高于沼泽型水牛的,其产生丁酸和乳酸为合成肉、奶提供了前体物质,推测与河流型水牛生长速度快、产奶量高性状相关。在种水平发现,沼泽型水牛肠道中发现了与免疫力相关的假长双歧杆菌(Bifidobacterium_pseudolongum),河流型水牛肠道中发现与脂质代谢相关的Turicibacter_sanguinis。进一步分析发现KEGG代谢通路网络图也显示河流型水牛肠道微生物组在脂代谢通路比沼泽型水牛的更活跃,推测与水牛乳脂含量高有关。在COG功能基因相对丰度分析中发现,沼泽型水牛肠道菌群的防御机制(defense mechanisms)功能基因相对丰度高于河流型水牛的,说明沼泽型水牛的抗逆性较强。本研究初步阐明了不同类型水牛的肠道微生物丰度和功能的异同,为阐明肠道菌群结构对水牛生产性状的调控机制奠定了基础,亦为通过调控水牛肠道微生物群落改良水牛的经济性状提供了重要参考。 展开更多
关键词 水牛 品种 肠道微生物 宏基因组
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水牛溶菌酶基因家族的鉴定、进化与序列分析
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作者 苏杰 李瑞伽 +4 位作者 高培培 Saif Ur Rehman 刘庆友 李志鹏 崔奎青 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2023年第1期1-12,共12页
溶菌酶是一种天然的抗菌物质,哺乳动物的乳汁、泪液和唾液等都含有溶菌酶。水牛(Bubalus bubalis)奶比奶牛(Bos taurus)奶含有更多的溶菌酶。水牛溶菌酶基因家族共有16位成员。本研究对水牛溶菌酶基因家族进行了系统分析。结果表明,水... 溶菌酶是一种天然的抗菌物质,哺乳动物的乳汁、泪液和唾液等都含有溶菌酶。水牛(Bubalus bubalis)奶比奶牛(Bos taurus)奶含有更多的溶菌酶。水牛溶菌酶基因家族共有16位成员。本研究对水牛溶菌酶基因家族进行了系统分析。结果表明,水牛的溶菌酶基因与奶牛、山羊(Capra hircus)、绵羊(Ovis aries)的亲缘关系近。水牛溶菌酶理化性质分析表明,水牛溶菌酶大部分是碱性的、稳定的、热稳定性好的和亲水的。单核苷酸多态性分析表明,与奶牛溶菌酶相比,水牛溶菌酶基因编码的蛋白质有氨基酸变异和氨基酸序列插入。这些氨基酸的变异和插入可能是水牛溶菌酶与奶牛溶菌酶在抗菌能力上存在差异的原因。水牛乳腺中表达的溶菌酶基因的转录因子结合位点数高于奶牛的,这也可能是水牛乳腺溶菌酶表达量高于奶牛的重要原因。 展开更多
关键词 溶菌酶 水牛 基因家族 生物信息学分析
原文传递
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