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一种DNA扩增的新技术:利用热稳定的Bst DNA聚合酶驱动跨越式滚环等温扩增反应 被引量:13
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作者 孟兆祥 张伟 +1 位作者 檀建新 马晓燕 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第9期892-898,共7页
Bst DNA聚合酶具有热稳定性、链置换活性及聚合酶活性,在体外DNA等温扩增反应中起重要作用.本文利用Bst DNA聚合酶的5'→3'聚合酶、核苷酸(末端)转移酶及链置换酶活性发展了一种新的体外环式DNA扩增技术跨越式滚环等温扩增(salt... Bst DNA聚合酶具有热稳定性、链置换活性及聚合酶活性,在体外DNA等温扩增反应中起重要作用.本文利用Bst DNA聚合酶的5'→3'聚合酶、核苷酸(末端)转移酶及链置换酶活性发展了一种新的体外环式DNA扩增技术跨越式滚环等温扩增(saltatory rolling circle amplification,SRCA).在SRCA反应中,Bst DNA聚合酶以上游引物P1为模板合成其互补链RcP1,并和P1形成双链DNA;之后,Bst DNA聚合酶用其核苷酸转移酶活性在其P1的3'末端沿5'→3'方向随机掺入脱氧核糖核苷酸聚合形成寡聚核苷酸(dNMP)m序列,即DNA的合成反应跨越了RcP1与下游引物P2之间的缺口;然后,以下游引物P2为模板形成互补序列(RcP2);接着,Bst DNA聚合酶继续将脱氧核糖核苷酸随机添加到RcP2的3'末端,形成(dNMP)n序列.继而,Bst DNA聚合酶以RcP1为模板,继续催化聚合反应合成互补新链,并通过其链置换酶活性替换P1;如此往复,形成[P1-(dNMP)m-RcP2-(dNMP)n-…]序列.本文通过电泳、酶切、测序等方法对扩增产物进行分析,演绎出上述扩增过程,并就工作原理进行了讨论.该反应可能对开发等温扩增技术检测微生物有一定助益,也为解释环介导等温扩增技术中假阳性反应和滚环等温扩增反应中的背景信号提供了线索. 展开更多
关键词 bst dna聚合酶 跨越式滚环等温扩增 dna扩增
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环介导等温扩增技术改进及在动物病原检测中的应用 被引量:6
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作者 陈秋慧 李政志 +7 位作者 张海艳 严蕊 杨晶涵 陈洁 陈曦 陈颖钰 郭爱珍 胡长敏 《中国兽医科学》 CAS CSCD 北大核心 2022年第5期633-639,共7页
环介导等温扩增(LAMP)技术是一种能在恒温设备下对靶基因进行扩增的技术,具有精确、快速、简单及低成本的优点,已广泛应用于食品安全、医疗卫生及农业现场检测等多个领域。本文主要从环介导等温技术的原理、反应体系改进、产物检测方法... 环介导等温扩增(LAMP)技术是一种能在恒温设备下对靶基因进行扩增的技术,具有精确、快速、简单及低成本的优点,已广泛应用于食品安全、医疗卫生及农业现场检测等多个领域。本文主要从环介导等温技术的原理、反应体系改进、产物检测方法的改进、LAMP与其他技术的联用,以及目前LAMP在动物病原检测方面的应用进行了分析,并展望了LAMP技术的应用前景,以期为同仁提供参考。 展开更多
关键词 环介导等温扩增 环引物 bst dna聚合酶 LAMP体系 动物病原检测
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改良LAMP法检测转基因作物 被引量:5
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作者 熊槐 吴凡 +5 位作者 冯雪梅 黄昱阳 杜正平 周毅 田文武 曹以诚 《食品安全质量检测学报》 CAS 2012年第3期177-181,共5页
目的建立简易的可视化环介导等温扩增(LAMP)检测转基因作物的方法。方法通过一对特异的能识别一段正义链和一段反义链的内引物和一对链置换引物,在Bst DNA聚合酶作用下,以等温条件实现对外源转基因成分的扩增,反应液和高浓度的显色液SYB... 目的建立简易的可视化环介导等温扩增(LAMP)检测转基因作物的方法。方法通过一对特异的能识别一段正义链和一段反义链的内引物和一对链置换引物,在Bst DNA聚合酶作用下,以等温条件实现对外源转基因成分的扩增,反应液和高浓度的显色液SYBR GREENⅠ同时置于特殊设计的反应管中,反应后可实现闭管可视化检测。结果对转基因作物中常见的外源基因元件胭脂碱合成酶终止子(T-NOS)和烟草花叶病毒35S启动子(P-CaMV35S)进行了LAMP检测。T-NOS LAMP对大米品系BT63,玉米品系BT11,MON810,大豆品系GTS40-3-2的检测结果呈阳性,P-CaMV35S LAMP对大米品系BT63,玉米品系BT11,MON810,MON863,大豆品系GTS40-3-2的检测结果呈阳性,二者对非转基因大米,玉米,大豆的检测结果均呈阴性。上述结果表明,本文中建立的T-NOS和P-CaMV35S LAMP检测方法特异性高。另外,通过对大豆品系GTS40-3-2模拟样品的检测,证明T-NOS LAMP能检出转基因成分含量为0.5%的样品,P-CaMV35S LAMP能检出转基因成分含量为0.1%的样品,检测灵敏度较高。结论改良LAMP法灵敏度高,特异性好,能用于快速初筛转基因作物。 展开更多
关键词 LAMP 转基因作物 bst dna聚合酶 CaMV35S启动子 NOS终止子
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转cry1Ab/c水稻环介导等温扩增快速检测方法 被引量:3
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作者 王镓璇 胡昱萱 +1 位作者 吴海星 檀建新 《食品工业》 CAS 北大核心 2020年第5期215-219,共5页
为快速检测水稻中是否含有crylAb/c抗虫基因,利用LAMP在线引物设计软件针对目的基因的6个区域设计筛选4条特异性引物,利用Bst DNA聚合酶在65℃条件下恒温扩增1 h,通过肉眼观察浑浊度、凝胶电泳法和荧光染料法三种方法来显示检测结果,并... 为快速检测水稻中是否含有crylAb/c抗虫基因,利用LAMP在线引物设计软件针对目的基因的6个区域设计筛选4条特异性引物,利用Bst DNA聚合酶在65℃条件下恒温扩增1 h,通过肉眼观察浑浊度、凝胶电泳法和荧光染料法三种方法来显示检测结果,并对LAMP反应体系中各影响因素进行优化,并确定LAMP最佳反应体系。通过对LAMP方法与PCR方法检出限的比较,证明其检出限比PCR方法低1/10。同时用2种转基因作物和4种非转基因作物检测LAMP方法的特异性,结果显示其特异性与PCR检测一致。说明LAMP方法检出限低、特异性好,适用于转基因水稻中crylAb/c基因的检测。 展开更多
关键词 转基因抗虫水稻 环介导等温扩增 检测 cry1Ab/c bst dna聚合酶
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Bst DNA聚合酶的纯化及等温扩增检测体系的构建 被引量:1
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作者 谭拥军 吴莎莎 +1 位作者 谭桂湘 向勤 《湖南大学学报(自然科学版)》 EI CAS CSCD 北大核心 2019年第12期98-106,共9页
Bst DNA聚合酶是等温扩增反应中的一个关键酶,但由于专利限制,目前国内实验室所使用的Bst DNA聚合酶大多需要从国外进口,价格昂贵且长途运输影响酶活性,因此亟需自主生产出Bst DNA聚合酶应用于等温扩增检测技术.通过构建Bst Fragement... Bst DNA聚合酶是等温扩增反应中的一个关键酶,但由于专利限制,目前国内实验室所使用的Bst DNA聚合酶大多需要从国外进口,价格昂贵且长途运输影响酶活性,因此亟需自主生产出Bst DNA聚合酶应用于等温扩增检测技术.通过构建Bst Fragement的原核表达质粒,采用原核蛋白表达系统和His-Tag亲和纯化手段,制备成本低,活性高,特异性强的Bst DNA聚合酶.同时,针对特定的模板,对自制Bst DNA聚合酶的扩增反应进行了进一步优化,用不同的产物鉴定方法对扩增效果进行检测,并最终筛选出该酶最优的扩增反应条件为60 mM K^+、30 mM(NH4)2SO4、pH为9.0.最后,验证了Bst DNA聚合酶能用于快速准确检测肺炎支原体、肺炎衣原体,降低了相关病原体核酸检测的成本,为之后核酸检测在基层医疗的更广泛应用提供了条件. 展开更多
关键词 bst dna聚合酶 重组蛋白 扩增 核酸检测
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Bst DNA聚合酶大片段在全基因组扩增中的应用 被引量:2
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作者 张心愿 邓佳 +3 位作者 刘馨 陈琳 林峻 蔡伟文 《中国生物工程杂志》 CAS CSCD 北大核心 2016年第7期48-54,共7页
Bst DNA聚合酶大片段作为一种常用的DNA聚合酶,因其独特的特点:能引发链置换反应、高保真、耐高温等,而成为一种重要的DNA多重置换扩增酶。目的:为减少成本,设计一种高产,方便且扩增活性高的Bst DNA聚合酶大片段表达体系;探究该酶应用... Bst DNA聚合酶大片段作为一种常用的DNA聚合酶,因其独特的特点:能引发链置换反应、高保真、耐高温等,而成为一种重要的DNA多重置换扩增酶。目的:为减少成本,设计一种高产,方便且扩增活性高的Bst DNA聚合酶大片段表达体系;探究该酶应用于胃癌石蜡包埋组织基因组DNA的扩增条件。方法:采用p TWIN1质粒作为载体克隆表达Bst DNA聚合酶大片段,应用几丁质亲和层析柱纯化该酶,使用该酶对人类基因组DNA进行不同温度下扩增,探究其最适反应温度,并据此对胃癌石蜡包埋组织基因组DNA进行扩增。结果:由此得到的Bst DNA聚合酶大片段能运用于胃癌石蜡包埋组织基因组DNA的扩增,扩增效率可达200倍,并能应用于a CGH芯片。结论:扩增得到保真性高,覆盖基因组范围大的DNA扩增产物。该应用与a CGH结合,使得对少量的癌症石蜡包埋组织DNA样本进行全基因组扩增,并进行其基因拷贝数变异研究成为可能。 展开更多
关键词 bst dna聚合酶大片段 多重置换扩增 石蜡包埋组织 全基因组扩增
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