国内外生物医学领域本体研究与实践进展 被引量：8

1

作者 赵洁 司莉 《数字图书馆论坛》 CSSCI 2020年第8期7-14,共8页

本文通过文献调查法归纳总结近十年(2010—2019年)国内外生物医学领域本体文献,简要介绍国内外重要生物医学领域本体,从构建、整合、扩展3个方面归纳总结生物医学领域本体的相关研究,以及其在医学信息描述、查询扩展、知识库构建、术语... 本文通过文献调查法归纳总结近十年(2010—2019年)国内外生物医学领域本体文献,简要介绍国内外重要生物医学领域本体,从构建、整合、扩展3个方面归纳总结生物医学领域本体的相关研究,以及其在医学信息描述、查询扩展、知识库构建、术语相似度计算等方面的相关实践,并对未来发展趋势进行展望,以期为我国生物医学领域本体的构建与应用提供借鉴。 展开更多

关键词 生物医学领域 本体 本体构建 本体整合 本体扩展 本体应用

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基于知识图谱和预训练语言模型深度融合的可解释生物医学推理

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作者 徐寅鑫 杨宗保 +2 位作者 林宇晨 胡金龙 董守斌 《北京大学学报（自然科学版）》 EI CAS CSCD 北大核心 2024年第1期62-70,共9页

基于预训练语言模型(LM)和知识图谱(KG)的联合推理在应用于生物医学领域时,因其专业术语表示方式多样、语义歧义以及知识图谱存在大量噪声等问题,联合推理模型并未取得较好的效果。基于此,提出一种面向生物医学领域的可解释推理方法DF-... 基于预训练语言模型(LM)和知识图谱(KG)的联合推理在应用于生物医学领域时,因其专业术语表示方式多样、语义歧义以及知识图谱存在大量噪声等问题,联合推理模型并未取得较好的效果。基于此,提出一种面向生物医学领域的可解释推理方法DF-GNN。该方法统一了文本和知识图谱的实体表示方式,利用大型生物医学知识库构造子图并进行去噪,改进文本和子图实体的信息交互方式,增加对应文本和子图节点的直接交互,使得两个模态的信息能够深度融合。同时,利用知识图谱的路径信息对模型推理过程提供了可解释性。在公开数据集MedQA-USMLE和MedMCQA上的测试结果表明,与现有的生物医学领域联合推理模型相比,DF-GNN可以更可靠地利用结构化知识进行推理并提供解释性。 展开更多

关键词 生物医学 预训练语言模型 知识图谱 联合推理

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基于Bi-LSTM的生物医学文本语义消歧研究 被引量：3

3

作者 罗曜儒 李智 《软件导刊》 2019年第4期57-59,63,共4页

生物医学文本语义消歧研究中,上下文语义表示存在精度不高、忽略语言特性等问题,对此提出一种基于Bi-LSTM的新型语言模型。该模型通过考虑上下文词序将整个句义信息以无监督学习方式嵌入低维连续空间,并以此生成高质量的上下文表示,然... 生物医学文本语义消歧研究中,上下文语义表示存在精度不高、忽略语言特性等问题,对此提出一种基于Bi-LSTM的新型语言模型。该模型通过考虑上下文词序将整个句义信息以无监督学习方式嵌入低维连续空间,并以此生成高质量的上下文表示,然后利用该方法构建歧义向量,最终计算cosine相似度,完成对歧义词的分类。实验表明,相比传统线性语言模型,基于Bi-LSTM生成的语义向量能更好地表示歧义词的语义信息,并在不同生物医学文本数据集中达到高准确度(95.01/91.27)。 展开更多

关键词 语义消歧 Bi-LSTM 无监督学习 生物医学 上下文表示

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基于生物医学领域本体语义Web的构建探讨

4

作者 马骏涛 宋欣 李光伟 《科技情报开发与经济》 2011年第8期138-140,共3页

语义Web能让计算机理解人类的信息需求,从而使搜索和检索更加准确和全面。探讨了如何以生物医学的主题词表为基础构建生物医学的领域本体,并利用半自动化辅以人工信息标注的方法来完成生物医学语义Web的构建。

关键词 生物医学领域 语义WEB 领域本体 语义标注 医学主题词表

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基于本体分类结构计算医疗领域语义相似度的方法

5

作者 张莹 《信息技术与信息化》 2013年第6期134-135,139,共3页

相似度计算能提高从医疗源数据进行信息检索的效率并使得异构临床数据的集成变得更加容易。不同学者基于单个医疗本体,将经典的相似度计算方法用于医疗术语的相似性评估。本文选定基于距离的LCH方法,依据Pederson基准,对比该算法在基于M... 相似度计算能提高从医疗源数据进行信息检索的效率并使得异构临床数据的集成变得更加容易。不同学者基于单个医疗本体,将经典的相似度计算方法用于医疗术语的相似性评估。本文选定基于距离的LCH方法,依据Pederson基准,对比该算法在基于MeSH、SNOMEDCT、UMLS本体时的相关度值,并就计算结果进行分析和解释。 展开更多

关键词 LCH算法 医疗本体 语义相似度计算 Pederson基准

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光声成像研究进展 被引量：17

6

作者 苗少峰 杨虹 +3 位作者 黄远辉 宫睿 邵晓鹏 毕祥丽 《中国光学》 CAS CSCD 2015年第5期699-713,共15页

本文阐述了光声成像的工作原理,光声信号的产生,传播和探测过程,并总结了光声成像的研究进展,包括时域光声成像和频率域光声成像的研究进展、以及各自的特点,为光声成像领域的研究起到一定的借鉴作用。分析认为光声成像技术有着其他医... 本文阐述了光声成像的工作原理,光声信号的产生,传播和探测过程,并总结了光声成像的研究进展,包括时域光声成像和频率域光声成像的研究进展、以及各自的特点,为光声成像领域的研究起到一定的借鉴作用。分析认为光声成像技术有着其他医学成像技术没有的诸多优点,如高分辨率、高对比度、成像深度深等具有广阔的应用前景和较高应用价值,是未来生物医学领域最重要的实时医学成像技术之一,因此得到了国际上的广泛关注。 展开更多

关键词 光声成像 生物医学成像 时域光声成像 频率域光声成像

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脑血氧饱和度的无创伤测量和脑思维功能的研究 被引量：3

7

作者 姚鹏 李胜利 +3 位作者 张爱玉 刘煜 徐敏 金泰义 《生物医学工程学杂志》 EI CAS CSCD 2001年第2期260-264,共5页

利用近红外光谱法 (NIRS) ,根据广义郎伯特—比尔定律 (L am bert- Beer)可以实现活体脑血氧浓度的无创伤测量。在本论文中 ,通过将脑血氧饱和度和脑功能相结合的实验 ,讨论研究高级脑功能的可能性。利用事件相关实验可以检测脑的思维... 利用近红外光谱法 (NIRS) ,根据广义郎伯特—比尔定律 (L am bert- Beer)可以实现活体脑血氧浓度的无创伤测量。在本论文中 ,通过将脑血氧饱和度和脑功能相结合的实验 ,讨论研究高级脑功能的可能性。利用事件相关实验可以检测脑的思维功能。实验结果的时域曲线差别不大。然而 ,利用 DFT,五个被实验者的实验数据表明2 0 Hz或 40 Hz频率的信号与困难的智力工作有关。 展开更多

关键词 近红外光谱法 脑血氧饱和度 脑思维功能 事件相关性实验 DFT

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基于知识图谱的国内生物医学工程研究可视化分析 被引量：3

8

作者 沈同平 阚红星 +1 位作者 董尹 俞磊 《安庆师范大学学报（自然科学版）》 2019年第2期55-61,共7页

采用文献计量和知识图谱可视化的方法,以《中国生物医学工程学报》为研究对象,利用网络分析工具CiteSpace对1982—2017年该杂志发表的3235篇中文文献的载文量、研究机构、基金资助和关键词等进行可视化分析。研究表明,生物医学工程领域... 采用文献计量和知识图谱可视化的方法,以《中国生物医学工程学报》为研究对象,利用网络分析工具CiteSpace对1982—2017年该杂志发表的3235篇中文文献的载文量、研究机构、基金资助和关键词等进行可视化分析。研究表明,生物医学工程领域热点和学术前沿包括生物材料、生物力学、医学图像和生物信号等4个方面,以期对生物医学工程相关研究和实践创新提供借鉴和参考。 展开更多

关键词 《中国生物医学工程学报》 文献计量学 CITESPACE 知识图谱

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基于主元分析的超声多普勒栓子信号检测 被引量：2

9

作者 徐达 汪源源 《声学学报》 EI CSCD 北大核心 2006年第3期228-232,共5页

提出基于主元分析的超声多普勒栓子信号检测方法,先从超声多普勒信号中提取出主元成分并获得相应的特征参数, 再结合时域的特征参数对栓子、干扰噪声和正常血流信号进行分类。通过对300例仿真超声多普勒信号和168例临床采集的脑动脉超... 提出基于主元分析的超声多普勒栓子信号检测方法,先从超声多普勒信号中提取出主元成分并获得相应的特征参数, 再结合时域的特征参数对栓子、干扰噪声和正常血流信号进行分类。通过对300例仿真超声多普勒信号和168例临床采集的脑动脉超声多普勒血流信号进行分析,结果表明:主元分析方法对仿真信号和临床信号的最小误判率分别为2％和5％,其分类的准确率相比常规的时域检测方法有了较大提高。可见,基于主元分析的超声多普勒栓子检测方法具有较高的检测率,克服了常规的时域和频域检测方法中由于干扰噪声的影响和频谱分析中时频分辨率的矛盾导致的灵敏度不高的局限,有望用于栓子的临床自动检测。 展开更多

关键词 超声多普勒信号 主元分析方法 信号检测 时域检测 特征参数 干扰噪声 时频分辨率 频谱分析 自动检测 脑动脉

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知识增强的生物医学文本生成式摘要研究 被引量：1

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作者 邓露 胡珀 李炫宏 《数据分析与知识发现》 CSSCI CSCD 北大核心 2022年第11期1-12,共12页

【目的】将生物医学文本映射到生物医学领域超级叙词表以获得文本中包含的生物医学术语及其对应概念,并将术语和概念作为背景知识融入文本摘要模型中,提高文本摘要模型在生物医学文本上的摘要生成质量。【方法】通过抽取式摘要技术获取... 【目的】将生物医学文本映射到生物医学领域超级叙词表以获得文本中包含的生物医学术语及其对应概念,并将术语和概念作为背景知识融入文本摘要模型中,提高文本摘要模型在生物医学文本上的摘要生成质量。【方法】通过抽取式摘要技术获取文本的重要内容,然后结合生物医学领域知识库将文本重要内容中包含的术语与其对应的知识库概念一并抽取出来,作为背景知识融入神经网络生成式摘要模型的注意力机制中,使模型在领域知识引导下既可聚焦文本内部的重要信息,又可抑制因外部信息引入而可能产生的噪音问题,显著改善摘要的生成质量。【结果】在三个生物医学领域数据集上的实验结果验证了本文方法的有效性,本文所提模型PG-meta在三个数据集上的ROUGE均值达到31.06,比原PG模型ROUGE均值高1.51。【局限】未探索不同的生物医学领域背景知识获取方式对于模型增强效果的影响。【结论】本文方法可帮助模型更好地学习生物医学文本深层含义,提高摘要生成质量。 展开更多

关键词 生物医学文本挖掘 生成式摘要 领域知识 知识增强

原文传递

具有在线形貌矫正能力的组织体光学参数测量系统 被引量：2

11

作者 赵会娟 闫盼盼 +4 位作者 戚彩霞 李同心 陈玮婷 赵宽心 高峰 《光子学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2017年第8期135-142,共8页

针对具有复杂形貌的大面积组织体,基于空间频率域方法,提出并搭建了一种具有在线形貌矫正能力的绝对光学参数测量系统.首先利用相位轮廓术获取组织体三维表面轮廓,用余弦辐射公式法矫正由组织体表面复杂形貌引起的光照度的差异.然后,采... 针对具有复杂形貌的大面积组织体,基于空间频率域方法,提出并搭建了一种具有在线形貌矫正能力的绝对光学参数测量系统.首先利用相位轮廓术获取组织体三维表面轮廓,用余弦辐射公式法矫正由组织体表面复杂形貌引起的光照度的差异.然后,采用漫反射板代替传统方法中的参考仿体,基于空间频率域测量模式进行绝对光学参数测量,并利用提出的光学参数反演方法实现组织体吸收系数的重建.组织仿体实验结果表明,对于表面高度小于29mm的仿体,经矫正后,吸收系数的测量相对误差从60%下降到13%. 展开更多

关键词 生物医学光子学 光学系统 相位轮廓术 空间频率域 绝对测量 复杂形貌 光学参数

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采用频域光延迟线的光学相干层析成像 被引量：1

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作者 戴丽娟 王惠南 钱志余 《量子电子学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第4期456-460,共5页

频域光延迟线是一种光学扫描结构,其基本组成是一个衍射光栅、一个透镜和一个扫描镜．把频域光延迟线应用到光学相干层析成像系统中,可以使参考臂扫描速率至少达到数m／s以上,从而实现视频速率的图像获取．从几何光学的角度分析了频域... 频域光延迟线是一种光学扫描结构,其基本组成是一个衍射光栅、一个透镜和一个扫描镜．把频域光延迟线应用到光学相干层析成像系统中,可以使参考臂扫描速率至少达到数m／s以上,从而实现视频速率的图像获取．从几何光学的角度分析了频域光延迟线的工作原理,分析结果表明在扫描角很小的情况下,入射光的光程或相位变化频率与扫描角频率有较好的线性关系。基于这一结构的光学相干层析成像的结果证明可以避免活体生物组织位移引入的图像模糊。另外,还提出了一种基于微执行器的新扫描装置。 展开更多

关键词 生物医学光子学 光学相干层析成像 频域光延迟线 集合力阵

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听觉通道语音冲突大脑皮层电位的听觉认知控制特征提取方法

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作者 于波 李海峰 +1 位作者 马琳 王勋达 《声学学报》 EI CSCD 北大核心 2016年第6期870-880,共11页

认知心理学发现,视觉、听觉接收到信息有冲突时,大脑皮层电位会发生扰动,由此可探索认知冲突控制的“刺激-反应”机制。视觉认知冲突实验较多,成果丰硕,而相应的听觉实验很少,并且得到不一样的结论。本研究利用冲突和非冲突的语音信号刺... 认知心理学发现,视觉、听觉接收到信息有冲突时,大脑皮层电位会发生扰动,由此可探索认知冲突控制的“刺激-反应”机制。视觉认知冲突实验较多,成果丰硕,而相应的听觉实验很少,并且得到不一样的结论。本研究利用冲突和非冲突的语音信号刺激,分析研究脑电信号,提出基于三阶段听觉认知控制的时域特征模型。研究人脑听觉通道在出现语音认知冲突时的认知控制的规律下的单次试验脑电数据特征提取方法。根据得到的认知规律,单次试验脑电样本被分成3个部分。被分割的每个阶段使用时域上的平均幅值和Lempel-Ziv复杂度（LZC）进行计算,从而联合3个阶段的特征作为听觉认知脑电样本的特征。结果表明：（1）先发现的认知冲突相关的混合脑电成分“N1-P2＆N2＆Late-SW”分别体现了听觉认知控制的3个阶段;（2）一个更完整的听觉认知控制过程应包括3个阶段的时域特征：感知阶段：110~140 ms,识别阶段：260~320 ms,解决阶段：500~700 ms;（3）提出针对单次听觉认知控制脑电样本的特征提取方法,联合使用平均幅度和LZC可以获得最好的识别率（99.33%）。实验结果证明了提出的方法能够有效地检测听觉认知控制脑电数据,进而提供人脑认知控制能力评价的声学方法。 展开更多

关键词 认知控制 特征提取 听觉刺激 认知冲突 认知心理学 识别阶段 皮层电位 视觉认知 STROOP 脑电信号

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