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半夏-陈皮“异病同治”咳嗽和冠心病的网络药理学作用机制研究 被引量：5
1
作者 万阳 杨奕 +3 位作者 刘慧莹 蔡恒斌 李金根 毛祥坤 《实用中西医结合临床》 2021年第14期1-5,共5页
目的:通过网络药理学探讨中药药对半夏-陈皮治疗咳嗽、冠心病的分子机制,以探究该药对“异病同治”的共同作用机制。方法:从TCMSP、BATMAN-TCM数据库得出半夏-陈皮的活性成分及潜在靶标,从DisGeNET、OMIM、Drug Bank数据库得出与咳嗽、... 目的:通过网络药理学探讨中药药对半夏-陈皮治疗咳嗽、冠心病的分子机制,以探究该药对“异病同治”的共同作用机制。方法:从TCMSP、BATMAN-TCM数据库得出半夏-陈皮的活性成分及潜在靶标,从DisGeNET、OMIM、Drug Bank数据库得出与咳嗽、冠心病相关的疾病基因,并与半夏-陈皮潜在靶标进行映射,得出药对治疗两种疾病的共同靶标,将其输入String数据库及DAVID数据库,分别构建PPI网络、GO分析及KEGG PATHWAY分析。将半夏-陈皮治疗咳嗽、冠心病的活性成分及疾病基因输入Cytoscape软件,分别构建半夏-陈皮治疗咳嗽、冠心病的“重要活性成分-靶标”网络图。结果:半夏-陈皮治疗咳嗽的基因有49个、有效成分69个,治疗冠心病的基因有342个,有效成分87个,其中治疗两种疾病的交集靶标共有24个。构建PPI网络发现,交集靶标中排名前3的靶标蛋白为人白介素1B、肿瘤坏死因子、白细胞介素8。DAVID分析发现,治疗咳嗽的作用机制与TNF通路、T细胞受体信号通路、Toll样受体通路等25个通路相关。药对治疗冠心病的主要通路涉及HIF-1通路、TNF通路、AMPK通路等127个通路。“异病同治”的主要信号通路涉及NOD样受体信号通路、TNF通路、NF-κB通路、TGF-β通路等30个信号通路。结论:通过此次分析发现,半夏-陈皮药对“异病同治”的作用机制可能与NOD样受体信号通路、TNF通路、NF-κB通路、TGF-β通路等炎症通路相关。 展开更多
关键词 咳嗽 冠心病 半夏-陈皮 网络药理学 异病同治
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基于网络药理学和分子对接探究半夏-陈皮-天南星治疗血管性痴呆的机制
2
作者 田澳凯 孙阳龙 +3 位作者 崔浩洋 赵鹏鸿 李彦霖 黄春元 《中医临床研究》 2024年第14期22-29,共8页
目的:基于网络药理学探究半夏-陈皮-天南星治疗血管性痴呆的作用机制。方法:使用中药系统药理学数据库分析平台(TCMSP)获取药物有效成分并且预测靶点。获取2D结构图,并录入PhramMapper数据库获得成分靶点。使用4种数据库,包括PharmGKb、... 目的:基于网络药理学探究半夏-陈皮-天南星治疗血管性痴呆的作用机制。方法:使用中药系统药理学数据库分析平台(TCMSP)获取药物有效成分并且预测靶点。获取2D结构图,并录入PhramMapper数据库获得成分靶点。使用4种数据库,包括PharmGKb、GeneCards、DrugBank、Therapeutic Target Database来预测疾病靶点。使用Venny 2.1韦恩图绘制平台获取药物疾病交集靶点。使用STRING数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用网络。使用R语言和CytoScape软件中CytoNCA APP获取核心靶点。通过R语言中BiocManager包和OrgDb包等和R Studio软件进行京都基因与基因组百科全书(KEGG)和基因本体论(GO)富集分析。使用CytoScape软件,建立“药物-成分-靶点-通路”网络关系图。结果:获得药物核心成分8个,为β-谷甾醇、谷甾醇、黄芩苷、豆甾醇、黄芩素、贡多酸、10,13-二十碳二烯酸和分生孢子素。核心靶点14个,主要为细胞肿瘤抗原p53(Cellular Tumor Antigen p53,TP53)、前列腺素G/H合酶2(Prostaglandin G/H Synthase 2,PTGS2)、MAP激酶活化蛋白激酶3(MAP kinase-activated Protein Kinase 3,MAPK3)、半胱氨酸天冬氨酸蛋白酶3(Caspase-3,CASP3)、转录因子Jun(Transcription Factor Jun,JUN)、RAC-α丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶(RAC-alphaserine/threonine-protein Kinase,AKT1)、白蛋白(Albumin,ALB)和缺氧诱导因子1α(Hypoxia-inducible Factor 1-alpha,HIF1A)等。GO富集分析中的生物过程主要为对氧气水平降低的反应、蛋白质定位建立的调节、对异生素刺激的反应和磷代谢过程的正向调节等;细胞组分主要为蛋白激酶复合物、受体复合物、谷氨酸能突触和血液微粒等;分子功能主要为激酶调节剂活性、一氧化氮合酶调节剂活性和MAP激酶活性等。KEGG富集主要包括等癌症通路、脂质和动脉粥样硬化、糖尿病性心肌病、血清素能突触、长寿调节途径和多巴胺能突触等前20个信号通路。结论:半夏-陈皮-天� 展开更多
关键词 血管性痴呆 半夏-陈皮-天南星 网络药理学 作用机制
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基于网络药理学探究半夏-陈皮-石菖蒲治疗缺血性卒中的机制 被引量：1
3
作者 赵莹 孙阳龙 +3 位作者 金晶 郑雅方 崔浩洋 黄春元 《中医临床研究》 2023年第32期15-22,共8页
目的:基于网络药理学的方法探讨半夏-陈皮-石菖蒲治疗缺血性卒中病的有效成分、靶点、网络通路以及潜在的分子机制。方法:引用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP),将半夏-陈皮-石菖蒲药组的有效成分进行靶点预测,并在数据库内取得2... 目的:基于网络药理学的方法探讨半夏-陈皮-石菖蒲治疗缺血性卒中病的有效成分、靶点、网络通路以及潜在的分子机制。方法:引用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP),将半夏-陈皮-石菖蒲药组的有效成分进行靶点预测,并在数据库内取得2D结构图,导进Phrammarpper数据库内获得半夏-陈皮-石菖蒲成分靶点。通过PharmGKb、GeneCard、DrugBank、Therapeutic Target Database四个数据库预测疾病的靶点。利用Venny 2.1制作韦恩图取得药物与疾病交集靶点。在STRING数据库内构建蛋白质-蛋白质相互作用网络。利用R语言和Cytoscape软件中CytoNCA APP取得核心靶点。通过R语言的BiocManager包和OrgDb包等和R Studio软件进行京都基因与基因组百科全书(KEGG)和基因本体论(GO)富集分析。利用Cytoscape软件,构成“药物-成分-靶点-通路”网络关系图。使用Autodock vina 1.1.2将半夏-陈皮-石菖蒲的核心成分与核心靶点进行分子对接。结果:获得药物的核心成分7个,分别为异戊烯基山柰酚、冈多酸、松柏苷、β-谷甾醇、桉脂素、山柰酚、黄芩苷。核心靶点20个,主要为丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶1(Akt Serine/Threonine Kinase 1,AKT1)、血管内皮生长因子A(Vascular Endothelial Growth Factor A,VEGFA)、肿瘤蛋白p53(Tumor Protein p53,TP53)、半胱氨酸蛋白酶3(Caspase 3,CASP3)、丝裂原活化蛋白激酶3(Mitogen-Activated Protein Kinase 3,MAPK3)因子等。GO富集主要是活性氧依赖物质、细胞外刺激、脂多糖等的反应在突触前膜、膜筏和突触后膜等细胞组分上进行作用。KEGG富集主要有环磷酸腺苷(cyclic Adenosine Monophosphate,c AMP)、白细胞介素-17(Interleukin-17,IL-17)、肿瘤坏死因子(Tumor Necrosis Factor,TNF)等排名前30条信号通路。分子对接的结果也表明半夏、陈皮、石菖蒲的主要活性成分分别与选取的核心靶点CASP3、前列腺素氧化环化酶2(Prostaglandin-Endoperoxide Synthase2,PTGS 展开更多
关键词 缺血性卒中 半夏-陈皮-石菖蒲 网络药理学 作用机制 分子对接
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基于网络药理学探究半夏-陈皮-茯苓治疗帕金森病的机制
4
作者 孙阳龙 史秀禄 黄春元 《中医临床研究》 2023年第34期8-14,共7页
目的:基于网络药理学探究半夏-陈皮-茯苓治疗帕金森病的作用机制。方法:使用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)获取药物有效成分并预测靶点。获取2D结构图,并录入Phrammarpper数据库获得成分靶点。使用PharmGKb数据库、GeneCard数... 目的:基于网络药理学探究半夏-陈皮-茯苓治疗帕金森病的作用机制。方法:使用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)获取药物有效成分并预测靶点。获取2D结构图,并录入Phrammarpper数据库获得成分靶点。使用PharmGKb数据库、GeneCard数据库、DrugBank数据库、Therapeutic Target Database数据库预测疾病靶点。使用Venny 2.1在线制作平台获取药物疾病交集靶点。使用STRING数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用网络。使用R语言和Cytoscape软件中CytoNCA APP获取核心靶点。通过R语言中BiocManager包和OrgDb包等和R Studio软件进行京都基因与基因组百科全书(KEGG)和基因本体论(GO)富集分析。使用Cytoscape软件建立“药物-成分-靶点-通路”网络关系图。结果:获得药物核心成分8个,核心靶点11个。GO富集共得到1 959条项目,包括生物进程1 731条、细胞组分80条、分子功能148条。京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集结果主要包括磷脂酰肌醇3激酶(Phosphatidylinositol 3-kinase, PI3K)-蛋白激酶B(Akt)、环磷酸腺苷(Cyclic Adenosine Monophosphate,cAMP)、丝裂原活化蛋白激酶(Mitogen-Activated Protein Kinase,MAPK)、白细胞介素(Interleukin,IL)-17、肿瘤坏死因子(Tumor Necrosis Factor,TNF)等信号通路。结论:半夏-陈皮-茯苓具有多种成分、多个靶点、多条通路治疗帕金森病的特点,为治疗帕金森病提供了基础研究。 展开更多
关键词 帕金森病 半夏-陈皮-茯苓 网络药理学 作用机制预测
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