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巨魾食性初步研究
被引量:
7
1
作者
冷云
田树魁
+4 位作者
刘跃天
邱家荣
薛晨江
易勇
李晓双
《现代农业科技》
2011年第19期329-330,共2页
2007年1月至2009年8月共采集65尾巨魾,对其食性及摄食器官的形态结构进行了观察,其肠内含物初步分析结果表明,巨魾食物组成主要为小鱼、虾、泥鳅、水生昆虫等。
关键词
巨魾
食性
摄食器官
下载PDF
职称材料
基于12SrRNA和ND3基因序列分析巨[鱼丕]遗传多样性及系统进化
被引量:
2
2
作者
杜民
牛宝珍
+5 位作者
雷美榕
普文华
彭跃颖
施来凤
周甜
古金华
《淡水渔业》
CSCD
北大核心
2021年第2期29-39,共11页
为从分子水平研究巨[鱼丕](Bagarius yarrelli Sykes)的遗传多样性和系统进化关系,本实验对采集于怒江、澜沧江、元江3河流5种群中的60个个体进行12S rRNA和ND3基因序列的PCR扩增,同时与红河河口群体12个个体的12S rRNA和ND3基因序列进...
为从分子水平研究巨[鱼丕](Bagarius yarrelli Sykes)的遗传多样性和系统进化关系,本实验对采集于怒江、澜沧江、元江3河流5种群中的60个个体进行12S rRNA和ND3基因序列的PCR扩增,同时与红河河口群体12个个体的12S rRNA和ND3基因序列进行比对分析,采用Mega5.02软件对碱基组成、Kimura-2 parameter遗传距离、可变位点等进行分析。应用DnaSP软件进行遗传多样性相关参数的计算。结果显示:12S rRNA和ND3基因序列长度分别为954 bp和346 bp(349 bp),分别定义了51个单倍型和42个单倍型,12S rRNA和ND3序列中的碱基平均含量分别为:T为20.8%、C为25.7%、A为32.1%、G为21.4%和T为29.5%、C为28.2%、A为28.1%、G为14.1%,表现出明显的A+T偏倚性;6个群体的群体内和群体间的遗传距离分别为0.003~0.284(12S rRNA),0.009~0.059(ND3)和0.004~1.062(12S rRNA),0.008~0.143(ND3);12S rRNA基因的51个单倍型和ND3基因的42个单倍型序列总的单倍型多样性(Hd)、核苷酸多样性(Pi)及核苷酸平均差异数(K)分别为0.972和0.937、0.035和0.079、31.414和27.176,均显示出丰富的遗传多样性。结合从GenBank中下载的12S rRNA和ND3基因同源序列的[鱼丕]科9属10种鱼类进行系统发育树的构建,结果表明巨[鱼丕]独自汇聚成一大单系群,怒江潞江坝群体、怒江三江口群体及澜沧江临沧群体间关系较近,澜沧江景洪群体可单独构成一个单系种群,红河河口群体、红河曼耗群体与其它巨[鱼丕]构成一单系种群后再同澜沧江景洪群体汇聚成一支。
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关键词
巨[鱼丕](
bagarius
yarrelli
sykes
)
12S
rRNA基因
ND3基因
遗传多样性
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职称材料
巨魾线粒体12S rRNA和16S rRNA基因克隆及多态性分析
被引量:
3
3
作者
杜民
牛宝珍
+2 位作者
贾梦应
刘艳红
艾加林
《西南大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第5期83-89,共7页
运用酚-氯仿方法提取12尾采集于云南省境内河口县的巨魾DNA,利用GenBank中鮡科种类设计特异性引物进行PCR扩增和克隆,利用DNAMAN软件进行序列比对以及采用软件MEGA 4.0来分析巨魾的碱基含量、遗传距离和系统进化树.结果显示:(1)得到954b...
运用酚-氯仿方法提取12尾采集于云南省境内河口县的巨魾DNA,利用GenBank中鮡科种类设计特异性引物进行PCR扩增和克隆,利用DNAMAN软件进行序列比对以及采用软件MEGA 4.0来分析巨魾的碱基含量、遗传距离和系统进化树.结果显示:(1)得到954bp的12S rRNA基因序列和535bp的16S rRNA基因序列各12条;(2)12尾巨魾的12S rRNA基因、16S rRNA基因以及12S rRNA基因和16S rRNA的合并基因序列的相似性分别为99.89%,99.95%,99.89%;(3)12尾巨魾的12S rRNA,16S rRNA均表现出A+T碱基含量高于G+C碱基含量;(4)12尾巨魾的平均遗传距离为0.002,转换比颠换的平均值为3.065;(5)利用Neighbor-Joining(NJ)法构建的系统进化树表明魾属单独成一支,支持率达到99%,这一结果与传统的形态学分类基本相似.
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关键词
巨魾
12S
RRNA基因
16S
RRNA基因
系统进化
下载PDF
职称材料
题名
巨魾食性初步研究
被引量:
7
1
作者
冷云
田树魁
刘跃天
邱家荣
薛晨江
易勇
李晓双
机构
云南省渔业科学研究院
云南省水产技术推广站
云南省动物疫病预防控制中心
出处
《现代农业科技》
2011年第19期329-330,共2页
基金
云南省科技攻关项目(2006GNG33)
文摘
2007年1月至2009年8月共采集65尾巨魾,对其食性及摄食器官的形态结构进行了观察,其肠内含物初步分析结果表明,巨魾食物组成主要为小鱼、虾、泥鳅、水生昆虫等。
关键词
巨魾
食性
摄食器官
Keywords
bagarius
yarrelli
(
sykes
)
feeding
habits
feeding
organ
分类号
S917.4 [农业科学—水产科学]
Q174 [生物学—水生生物学]
下载PDF
职称材料
题名
基于12SrRNA和ND3基因序列分析巨[鱼丕]遗传多样性及系统进化
被引量:
2
2
作者
杜民
牛宝珍
雷美榕
普文华
彭跃颖
施来凤
周甜
古金华
机构
湖南文理学院/生命与环境科学学院
红河学院
出处
《淡水渔业》
CSCD
北大核心
2021年第2期29-39,共11页
基金
湖南文理学院博士启动项目(19BSQD39)
国家自然科学基金(31360638)。
文摘
为从分子水平研究巨[鱼丕](Bagarius yarrelli Sykes)的遗传多样性和系统进化关系,本实验对采集于怒江、澜沧江、元江3河流5种群中的60个个体进行12S rRNA和ND3基因序列的PCR扩增,同时与红河河口群体12个个体的12S rRNA和ND3基因序列进行比对分析,采用Mega5.02软件对碱基组成、Kimura-2 parameter遗传距离、可变位点等进行分析。应用DnaSP软件进行遗传多样性相关参数的计算。结果显示:12S rRNA和ND3基因序列长度分别为954 bp和346 bp(349 bp),分别定义了51个单倍型和42个单倍型,12S rRNA和ND3序列中的碱基平均含量分别为:T为20.8%、C为25.7%、A为32.1%、G为21.4%和T为29.5%、C为28.2%、A为28.1%、G为14.1%,表现出明显的A+T偏倚性;6个群体的群体内和群体间的遗传距离分别为0.003~0.284(12S rRNA),0.009~0.059(ND3)和0.004~1.062(12S rRNA),0.008~0.143(ND3);12S rRNA基因的51个单倍型和ND3基因的42个单倍型序列总的单倍型多样性(Hd)、核苷酸多样性(Pi)及核苷酸平均差异数(K)分别为0.972和0.937、0.035和0.079、31.414和27.176,均显示出丰富的遗传多样性。结合从GenBank中下载的12S rRNA和ND3基因同源序列的[鱼丕]科9属10种鱼类进行系统发育树的构建,结果表明巨[鱼丕]独自汇聚成一大单系群,怒江潞江坝群体、怒江三江口群体及澜沧江临沧群体间关系较近,澜沧江景洪群体可单独构成一个单系种群,红河河口群体、红河曼耗群体与其它巨[鱼丕]构成一单系种群后再同澜沧江景洪群体汇聚成一支。
关键词
巨[鱼丕](
bagarius
yarrelli
sykes
)
12S
rRNA基因
ND3基因
遗传多样性
Keywords
bagarius
yarrelli
sykes
12S
rRNA
gene
ND3
gene
genetic
diversity
分类号
S917.4 [农业科学—水产科学]
Q75 [生物学—分子生物学]
下载PDF
职称材料
题名
巨魾线粒体12S rRNA和16S rRNA基因克隆及多态性分析
被引量:
3
3
作者
杜民
牛宝珍
贾梦应
刘艳红
艾加林
机构
红河学院云南省高校农作物优质高效栽培与安全控制重点实验室
红河学院生命科学与技术学院
出处
《西南大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第5期83-89,共7页
基金
国家自然科学基金(31360638)
云南省教育厅科学研究基金重大专项项目(ZD2013009)
+2 种基金
云南省中青年学术带头人后备人才项目(2015HB087)
红河学院中青年学术带头人后备人才项目(2014HB0203)
红河学院博士专项项目(14bs11)
文摘
运用酚-氯仿方法提取12尾采集于云南省境内河口县的巨魾DNA,利用GenBank中鮡科种类设计特异性引物进行PCR扩增和克隆,利用DNAMAN软件进行序列比对以及采用软件MEGA 4.0来分析巨魾的碱基含量、遗传距离和系统进化树.结果显示:(1)得到954bp的12S rRNA基因序列和535bp的16S rRNA基因序列各12条;(2)12尾巨魾的12S rRNA基因、16S rRNA基因以及12S rRNA基因和16S rRNA的合并基因序列的相似性分别为99.89%,99.95%,99.89%;(3)12尾巨魾的12S rRNA,16S rRNA均表现出A+T碱基含量高于G+C碱基含量;(4)12尾巨魾的平均遗传距离为0.002,转换比颠换的平均值为3.065;(5)利用Neighbor-Joining(NJ)法构建的系统进化树表明魾属单独成一支,支持率达到99%,这一结果与传统的形态学分类基本相似.
关键词
巨魾
12S
RRNA基因
16S
RRNA基因
系统进化
Keywords
bagarius
yarrelli
sykes
12S
rRNA
16S
rRNA
phylogenic
evolution
分类号
Q959.4 [生物学—动物学]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
巨魾食性初步研究
冷云
田树魁
刘跃天
邱家荣
薛晨江
易勇
李晓双
《现代农业科技》
2011
7
下载PDF
职称材料
2
基于12SrRNA和ND3基因序列分析巨[鱼丕]遗传多样性及系统进化
杜民
牛宝珍
雷美榕
普文华
彭跃颖
施来凤
周甜
古金华
《淡水渔业》
CSCD
北大核心
2021
2
下载PDF
职称材料
3
巨魾线粒体12S rRNA和16S rRNA基因克隆及多态性分析
杜民
牛宝珍
贾梦应
刘艳红
艾加林
《西南大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2017
3
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