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植物内生细菌在辣椒体内的定殖动态及对辣椒疫病的防治效果 被引量:16
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作者 付思娅 陈双林 闫淑珍 《中国生物防治学报》 CSCD 北大核心 2013年第4期561-568,共8页
为了探讨具生防作用的植物内生细菌在辣椒体内的定殖动态与其防治辣椒疫病的关系,采用对峙培养法和盆栽苗防效法筛选生防菌株,依据菌体形态、生理生化性质和16SrDNA序列鉴定菌种,用抗利福平标记研究菌株在辣椒苗中的定殖动态,在同... 为了探讨具生防作用的植物内生细菌在辣椒体内的定殖动态与其防治辣椒疫病的关系,采用对峙培养法和盆栽苗防效法筛选生防菌株,依据菌体形态、生理生化性质和16SrDNA序列鉴定菌种,用抗利福平标记研究菌株在辣椒苗中的定殖动态,在同时接入植物内生细菌和灌根接种辣椒疫霉菌的条件下分析生防菌株的定殖数量与防效的关系。结果表明,菌株G9、R15和J13对辣椒疫病防效最好,经鉴定均为荧光假单胞菌Pseudomonasfluorescens。菌株G9和R15在辣椒根部定殖量高于菌株J13;定殖周期均在30-40d,呈“先增后减”的变化趋势;菌株G9和R15在接种第15d时定殖量最高,菌株J13在根、茎和叶中定殖量达到最高的天数分别为第9、15和15-20d,定殖数量的变化为根〉茎〉叶。菌株G9定殖量达到9.73×10^5cfu·g-1时辣椒疫病的防效达到100%,保持该数量的时间约6d;菌株R15定殖量达到6.30×10^5cfu·g-1以上时对辣椒疫病的防效达到100%,保持该数量的时间约14d。研究结果展现了植物内生细菌在辣椒疫病生物防治上的应用潜力,为制定植物内生细菌防治辣椒疫病的施用技术提供了科学依据。 展开更多
关键词 辣椒疫病 内生细菌 定殖动态 生物防治
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棕榈科植物种子内生细菌群落多样性的高通量测序分析 被引量:16
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作者 刘媛 渠露露 +4 位作者 叶美迪 黄曹生 朱月丹 王俏然 李淑彬 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第3期554-565,共12页
【目的】探究棕榈科种子内生细菌群落组成及其随物种的差异。【方法】运用MiSeq高通量方法测定蒲葵、棕榈、加拿利海枣、山棕、软叶刺葵、短穗鱼尾葵及三药槟榔7种棕榈科种子内生细菌群落16S rRNA基因V3–V4区序列并进行生物信息学分析... 【目的】探究棕榈科种子内生细菌群落组成及其随物种的差异。【方法】运用MiSeq高通量方法测定蒲葵、棕榈、加拿利海枣、山棕、软叶刺葵、短穗鱼尾葵及三药槟榔7种棕榈科种子内生细菌群落16S rRNA基因V3–V4区序列并进行生物信息学分析。【结果】7种测试种子中获得的V3–V4区有效序列数在2341–40671条之间,聚成97–590个操作分类单元(OTU),Shannon指数计算为1.35–2.94,以加拿利海枣种子最高,山棕种子最低;种群归类结果显示不同种子中测得的各级细菌分类阶层总数及组成不同,总丰度以厚壁菌门的肠球菌属最高,同为厚壁菌门的芽孢杆菌属次之;属级水平上,第一优势细菌属分别为:蒲葵种子(芽孢杆菌属,45.8%),棕榈种子(肠球菌属,51.2%),山棕种子(肠球菌属,12.1%),短穗鱼尾葵种子(肠球菌属,32.6%),三药槟榔种子(肠球菌属,42.9%),软叶刺葵种子(肠球菌属,28.3%),加拿利海枣种子(糖多孢菌属,31.2%)。各种子中次优势细菌属分别为:蒲葵种子(乳球菌属),棕榈、山棕及三药槟榔种子(类芽孢杆菌属),加拿利海枣种子(戈登氏菌属),软叶刺葵和短穗鱼尾葵种子(鞘脂单胞菌属);PICRUST基因预测显示各种子均包含多个与人体器官及人类疾病相关的KEGG功能模块。此外,各种子中均产生了丰度较高的外源物质降解、萜和聚酮合成、多糖合成等有益功能信息。【结论】棕榈科植物种子内生细菌群落多样性较为丰富,群落组成随物种不同而异。各种子内生细菌群体中普遍含多个与人和动物体相关的种群和功能信息,也定殖多种具有益功能性状的细菌类群,值得进一步研究。 展开更多
关键词 棕榈科植物种子 内生细菌 多样性 MiSeq高通量测序
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柑橘内生细菌YS45的鉴定、抗菌物质分析及其对油菜菌核病的防治作用 被引量:15
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作者 张翼 白晨 +3 位作者 冉国华 张志元 陈耀辉 吴刚 《植物病理学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第6期638-645,共8页
从柑橘枝条中分离到26株对油菜菌核病菌(Sclerotinia sclerotiorum)具有拮抗作用的内生细菌,其中YS45菌株的拮抗活性最强。16S rRNA基因序列分析及形态学和生理生化鉴定结果表明YS45菌株为枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)。高效液相色... 从柑橘枝条中分离到26株对油菜菌核病菌(Sclerotinia sclerotiorum)具有拮抗作用的内生细菌,其中YS45菌株的拮抗活性最强。16S rRNA基因序列分析及形态学和生理生化鉴定结果表明YS45菌株为枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)。高效液相色谱及质谱分析结果显示其主要的抑菌活性物质为一组fengycin同系物,包括fengycins A、fengycins B和一种稀少fengycin类型化合物。油菜离体叶片接种试验中,YS45菌株发酵液对油菜菌核病的防效在70%以上,与五氯硝基苯相当;田间小区接种试验表明,YS45菌株发酵液对油菜菌核病的防效也在50%以上。 展开更多
关键词 内生细菌 柑橘 抑菌物质 油菜菌核病 生物防治
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南药植物高良姜内生细菌多样性及其促生潜力 被引量:11
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作者 李淑彬 黄娟 +4 位作者 周仁超 李泽恩 徐诗如 阮婷 庞启华 《生态学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第10期3204-3213,共10页
以道地产地高良姜为材料,对该药用植物内生细菌种群组成、组织分布及其促生潜力进行了研究。采用组织块分离法,从高良姜根、根茎、茎和叶4个组织共计分离得到细菌136株,分属于16个16S r DNA基因型、12个细菌属、15个细菌种,其中,芽孢杆... 以道地产地高良姜为材料,对该药用植物内生细菌种群组成、组织分布及其促生潜力进行了研究。采用组织块分离法,从高良姜根、根茎、茎和叶4个组织共计分离得到细菌136株,分属于16个16S r DNA基因型、12个细菌属、15个细菌种,其中,芽孢杆菌、甲基杆菌分别为其最、次优势种群。各种群分离比随组织不同而异;采用Hha I消化的末端限制性片段多态性(TRFLP)免培养方法,从高良姜4个组织共计检测到36个不同的末端限制性酶切片段(T-RFs)。种群对应分析表明其免培养内生细菌群体主要包括芽孢杆菌、甲基杆菌等高抗性细菌,海洋螺菌、红杆菌、交替假单胞菌等海洋细菌及热带根瘤菌、沼泽考克氏菌等热带相关细菌,说明高良姜内生细菌群体与其宿主植物生长环境密切相关。不同组织其总T-RFs数目、优势T-RFs及其对应细菌种群明显不同;在所分离的细菌菌株中,36.36%、51.52%、54.55%和27.27%的菌株分别显示了胞外几丁质酶、β-葡聚糖酶,生长素及其1-氨基环丙烷-1-羧酸(ACC)脱氨酶产生能力。其中,泛菌L-2、芽孢杆菌S-16所测4个指标均为阳性,热带根瘤菌菌株R-1和R-3显示了较高的ACC脱氨酶及生长素产生能力,这些菌株是促生菌剂的良好候选。 展开更多
关键词 道地高良姜 内生细菌 分离培养 T-RFLP 植物促生作用
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三叶鬼针草内生细菌群体多样性及重金属耐受和吲哚乙酸产生潜力 被引量:10
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作者 胡泽瑞 刘媛 +1 位作者 彭长连 李淑彬 《微生物学通报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第1期29-41,共13页
【背景】定殖于植物的多样内生细菌与宿主生长和抗逆能力密切相关。三叶鬼针草(Bidenspilosa L.)极具入侵性且抗逆性强,但目前该植物内生细菌相关研究报道极少。【目的】探究三叶鬼针草内生细菌群体多样性,筛选获得兼具重金属耐受性及... 【背景】定殖于植物的多样内生细菌与宿主生长和抗逆能力密切相关。三叶鬼针草(Bidenspilosa L.)极具入侵性且抗逆性强,但目前该植物内生细菌相关研究报道极少。【目的】探究三叶鬼针草内生细菌群体多样性,筛选获得兼具重金属耐受性及吲哚乙酸(Indoleacetic acid,IAA)产生潜力的内生细菌菌株。【方法】采用MiSeq高通量方法分析三叶鬼针草内生细菌群体多样性,可培养方法测定内生细菌菌株对重金属Pb、Cd、Ni、Hg的耐受能力及产生IAA的潜力。【结果】从三叶鬼针草内生细菌群体中共测得4 031个操作分类单元(OTU),可归属于25个门51个纲76个目182个科及536个属。属级水平上,三叶鬼针草根、茎、叶和种子中分别以肠杆菌属(Enterobacter)、不动杆菌属(Acinetobacter)、鞘脂单胞菌属(Sphingomonas)及假单胞菌属(Pseudomonas)丰度最高,伯克氏菌属(Burkholderia)、甲基杆菌属(Methylobacterium)、假单胞菌属、泛菌属(Pantoea)次之;从三叶鬼针草分离得到34株内生细菌,所有菌株均至少对1种测试的重金属具有耐受性。其中,GF-1、GF-8、YF-1、YF-2、JF-1、GF-2和JF-8这7个菌株能够产生IAA,其产率为57.48-312.22μg/mL;基于16S rRNA基因序列分析,初步鉴定菌株GF-1、GF-8、YF-1、YF-2、JF-1为芽孢杆菌(Bacillus spp.),菌株GF-2为假单胞菌(Pseudomonas sp.),菌株JF-8为伯克氏菌(Burkholderia sp.)。【结论】三叶鬼针草内生细菌群体具有丰富的种群多样性。三叶鬼针草内生细菌菌株GF-1、GF-8、YF-1、YF-2、JF-1、GF-2和JF-8兼具多重金属耐受性及高产IAA潜力,是重金属复合污染土壤生物修复的优良候选菌株。 展开更多
关键词 三叶鬼针草 内生细菌 种群多样性 重金属耐受 IAA产生
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黄龙病罹病柑橘叶片内生细菌和内生真菌群落结构多样性分析 被引量:6
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作者 刘晓菲 甘芸 +3 位作者 刘利华 赵建伟 黄建成 郑宇 《福建农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第1期59-66,共8页
【目的】比较健康、罹病柑橘叶片在温室条件下内生菌群落结构差异,以及同一植株不同罹病程度叶片的内生菌群落结构差异,分析黄龙病侵染相关的内生细菌和内生真菌种群动态变化,为柑橘黄龙病菌的共培养和病原学研究提供依据。【方法】通... 【目的】比较健康、罹病柑橘叶片在温室条件下内生菌群落结构差异,以及同一植株不同罹病程度叶片的内生菌群落结构差异,分析黄龙病侵染相关的内生细菌和内生真菌种群动态变化,为柑橘黄龙病菌的共培养和病原学研究提供依据。【方法】通过引物对OI1/OI2c对植株染黄龙病的状态进行检验,以健康和不同罹病程度(无症绿色、斑驳黄化、均匀黄化)的柑橘叶片为样本,通过对细菌16S rRNA和真菌rDNA-ITS序列的高通量测序,将得到的内生细菌和内生真菌的数据进行聚类和多样性分析。【结果】4组样品分别通过聚类获得13个门类、22个纲、57个目、101个科、208个属的细菌,以及2个门类、12个纲、24个目、43个科、43个属的真菌。黄龙病菌的相对丰度随着叶片罹病程度的加深而增加。健康组和罹病组共有的细菌优势菌属为甲基细胞菌属、1174-901-12属。Sphingomonas属为健康组的优势菌属。AlphaI cluster属和Hymenobacter属的相对丰度随黄龙病的入侵增加。健康组和罹病组共有的真菌优势菌属为横断孢属,Zasmidium属和Trichomerium属只为罹病组的次优势菌属。Zymoseptoria属的相对丰度与黄龙病菌呈正相关。【结论】黄龙病菌的侵入改变了植株内生细菌和内生真菌的群落结构和多样性,健康组和罹病组的内生细菌、内生真菌群落结构多样性存在明显差异,其优势及次优势菌属及其相对丰度也有存在差异。高通量测序对植物样本的直接检测能有效避开前人使用传统检测的短板,获得包括难培养、低丰度菌群在内更完整的内生菌群落结构,为更系统分析与黄龙病菌入侵生长相关内生菌和寻找其潜在伴生菌的研究提供依据。 展开更多
关键词 黄龙病 内生细菌 内生真菌 群落多样性
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濒危药用植物沙冬青内生细菌分离及其抑菌活性初步分析 被引量:7
7
作者 毕江涛 杨薇 +2 位作者 李萍 吕雯 贺达汉 《天然产物研究与开发》 CAS CSCD 北大核心 2013年第12期1621-1626,1652,共7页
为探明濒危药用植物沙冬青内生细菌资源多样性及其抑菌活性,采用组织均浆法对内生细菌进行了分离,并选择枸杞黑果病菌、小麦全蚀病菌、番茄灰霉病菌、黄瓜枯萎病菌、黄瓜立枯病菌5种供试植物病原真菌和枯草芽孢杆菌、大肠杆菌、金黄色... 为探明濒危药用植物沙冬青内生细菌资源多样性及其抑菌活性,采用组织均浆法对内生细菌进行了分离,并选择枸杞黑果病菌、小麦全蚀病菌、番茄灰霉病菌、黄瓜枯萎病菌、黄瓜立枯病菌5种供试植物病原真菌和枯草芽孢杆菌、大肠杆菌、金黄色葡萄球菌、铜绿假单胞菌4种供试细菌为指示菌,采用平板对峙法、生长速率法和纸片扩散法进行抑菌活性测定。结果显示,从濒危药用植物沙冬青根茎叶中共分离到内生细菌32株,叶部最多,其次为根部,茎部最少。按菌落形态和革兰氏染色反应,分离内生细菌中革兰氏阳性菌28株,占分离菌株总数的87.5%;采用平板对峙法内生细菌拮抗活性初筛结果显示,21株内生细菌对2种或多种供试植物病原真菌具有不同程度的拮抗作用,占分离菌株总数的65.6%,2株菌AMEBR007、AMEBR008对枸杞黑果病菌和小麦全蚀病菌具有明显拮抗活性,采用生长速率法进行复筛,菌株AMEBR007抑菌活性较好,对枸杞黑果病菌的抑制率为31.26%,对小麦全蚀病抑制率为11.56%;对部分活性菌株采用滤纸片扩散法进行供试细菌抑菌活性测定,菌株AMEBR007对枯草芽孢杆菌和金黄色葡萄球菌具有明显抑菌作用。沙冬青拥有较为丰富的内生菌资源,菌株AMEBR007抑菌活性值得进一步研究。 展开更多
关键词 药用植物 沙冬青 内生细菌 分离 抑菌活性
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Isolation and Identification of Shoot-Tip Associated Endophytic Bacteria from Banana cv. Grand Naine and Testing for Antagonistic Activity against <i>Fusarium oxysporum</i>f. sp. <i>cubense</i> 被引量:3
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作者 Aparna Chandra Sekhar Pious Thomas 《American Journal of Plant Sciences》 2015年第7期943-954,共12页
Endophytic bacteria colonizing the shoot-tips of banana cv. Grand Naine were isolated and tested for the antagonistic activity against the Panama wilt pathogen Fusarium oxysporum f. sp. cubense (Foc). Pre-isolation, t... Endophytic bacteria colonizing the shoot-tips of banana cv. Grand Naine were isolated and tested for the antagonistic activity against the Panama wilt pathogen Fusarium oxysporum f. sp. cubense (Foc). Pre-isolation, the suckers were given extensive disinfection treatments and the homogenate from the excised shoot-tip portion was plated on nutrient agar (NA) and trypticase soy agar (TSA). This yielded altogether 47 isolates: 26 on NA and 21 on TSA, respectively, from the 10 suckers collected during August to February. The number of bacterial isolates obtained per sucker varied from one to 15 based on colony characteristics registering up to 10 distinct species per shoot-tip based on 16S rRNA sequence analysis. The 47 isolates belonged to 19 genera and 25 species under the phylogenetic classes of Actinobacteria, α- and γ-Proteobacteria and Firmicutes. Actinobacteria constituted the predominant phylum (55% isolates) with the constituent genera of Arthrobacter, Brevibacterium, Corynebacterium, Curtobacterium, Kocuria, Kytococcus, Micrococcus, Naumanella, Rothia and Tessaracoccus spp. and an unidentified isolate belonging to the family Frankiaceae. Proteobacteria constituted the second major phylum (Brevundimonas, Enterobacter, Klebsiella, Pseudomonas, Serratia and Sphingomonas spp.) followed by Firmicutes (Bacillus and Staphylococcus spp.). Antagonistic activity of the endophytes against Foc was tested through agar plate assays (pit and spot applications on fungal lawn) employing potato dextrose agar and NA. Endophytic Pseudomonas aeruginosa (isolate GNS.13.2a) which was associated with a single sucker showed significant growth inhibition effect on Foc while Klebsiella variicola (GNS.13.3a) and Enterobacter cloacae (GNS13.4a) exhibited moderate inhibition. The study brings out considerable sucker to sucker variation in the associated cultivable endophytic bacteria in “Grand Naine” banana and identifies a few bacterial endophytes with biocontrol potential against the devastating Foc pathogen. 展开更多
关键词 bacterial endophytes bacterial-Fungal Antagonism Biological Control Fusarium OXYSPORUM f. sp. cubense Musa sp. Plantains Pseudomonas aeruginosa
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4株桫椤内生细菌的分离鉴定及系统发育分析 被引量:5
9
作者 宋培勇 李林 +1 位作者 肖仲久 李小霞 《应用与环境生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第3期528-531,共4页
为了探索植物桫椤内生细菌及其进化关系,对用植物内生菌一般分离培养方法获得的4株内生细菌,从形态学、生理生化特征以及16S rDNA PCR扩增、测序和BLAST比对等进行了综合鉴定和系统发育分析.根据形态学和生理生化特征以及16S rDNA相似... 为了探索植物桫椤内生细菌及其进化关系,对用植物内生菌一般分离培养方法获得的4株内生细菌,从形态学、生理生化特征以及16S rDNA PCR扩增、测序和BLAST比对等进行了综合鉴定和系统发育分析.根据形态学和生理生化特征以及16S rDNA相似性比对,将内生细菌ASP17和ASL21初步鉴定为苏云金芽孢杆菌(Bacillus thuringiensis);将ASL24初步鉴定为Lysinibacillus属,而ASL23可能为与Lysinibacillus相近但不同的属.系统发育分析表明:4株内生细菌中ASP17和ASL21聚为一支,亲缘关系较近;ASL23和ASL24聚为一支,亲缘关系较近. 展开更多
关键词 桫椤 内生细菌 16S RDNA 分离鉴定 系统发育分析
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高通量测序分析紫萍内生细菌多样性 被引量:3
10
作者 李越 郜庭 +2 位作者 董佳鑫 周涛 俞烨华 《湖南生态科学学报》 2021年第3期54-60,共7页
【目的】研究紫萍内生细菌群落特征,为揭示其生态功能提供全面的遗传信息。【方法】以宿州市新汴河中的紫萍为研究对象,采用Illumina MiSeq高通量测序技术测定紫萍内生细菌16S rDNA的V5~V7变异区序列,使用FLASH、UCHIME和UPARSE等软件... 【目的】研究紫萍内生细菌群落特征,为揭示其生态功能提供全面的遗传信息。【方法】以宿州市新汴河中的紫萍为研究对象,采用Illumina MiSeq高通量测序技术测定紫萍内生细菌16S rDNA的V5~V7变异区序列,使用FLASH、UCHIME和UPARSE等软件整理和统计样品序列数目和操作分类单元(OTUs)数量。【结果】紫萍内生细菌主要包括4大类群,最优势类群为变形菌门,其中包括β–变形菌纲、α–变形菌纲、γ–变形菌纲和δ–变形菌纲;其次为拟杆菌门、放线菌门和酸杆菌门。主要菌属包括污泥单胞菌属、黄杆菌属、红长命菌属、氢噬菌属、水库杆菌属、根瘤菌属、艾德昂菌属、嗜甲基菌属、红细菌属、生丝微菌属、食酸菌属、甲基娇养杆菌属、芽单胞菌属、不粘柄菌属、纤维弧菌属、鞘氨醇单胞菌属等,这些菌属与水体中氮、碳、磷等生物地球化学循环关系密切。【结论】紫萍内生细菌对增强浮叶植物净化水体能力和维持淡水生态平衡发挥重要作用,其群落特征将为选育具有增强植物修复潜力的功能菌株提供有效工具。 展开更多
关键词 高通量测序 紫萍 内生细菌 微生物多样性
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猕猴桃果实内生菌株的鉴定及其发酵液抑菌活性初探 被引量:2
11
作者 陈帮丹 魏洪 +3 位作者 黄亚励 冯丽 李俞亭 王芳胜 《中国病原生物学杂志》 CSCD 北大核心 2018年第4期372-378,共7页
目的从新鲜猕猴桃果实中分离鉴定内生细菌并分析其生物学特性及抑菌谱。方法采用平板对峙法初筛选猕猴桃株发酵液对链格孢菌有明显拮抗作用的内生菌、打孔法复筛猕猴桃菌株发酵液对铜绿假单胞菌的抑菌活性,采用平板倾注法测定不同浓度... 目的从新鲜猕猴桃果实中分离鉴定内生细菌并分析其生物学特性及抑菌谱。方法采用平板对峙法初筛选猕猴桃株发酵液对链格孢菌有明显拮抗作用的内生菌、打孔法复筛猕猴桃菌株发酵液对铜绿假单胞菌的抑菌活性,采用平板倾注法测定不同浓度内生菌对标准菌株和临床菌株的抑菌活性。基于内生菌的形态特征、生化特性、电镜扫描结果及16SrDNA基因序列同源性分析,采用MEGA5.0软件N-J法建立系统发育树,进行遗传进化分析。结果从猕猴桃果实分离获得3株内生细菌。平板对峙生长初筛试验显示其中一株具有抑菌活性,该菌株发酵液对链格孢菌有抑制作用;打孔法复筛实验显示发酵液对铜绿假单胞菌的抑菌活性最明显,其发酵液能抑制标准菌株大肠埃希菌、金黄色葡萄球菌及临床菌株中的革兰阴性菌大肠埃希菌、阴沟肠杆菌、肺炎克雷柏菌生长,不能抑制临床革兰阳性菌金黄色葡萄球菌、溶血性葡萄球菌及肺炎链球菌的生长。该菌株被鉴定为粪肠碱杆菌(16rDNA同源性为99%)。结论获得了一株对部分临床革兰阴性菌有抑制作用的猕猴桃果实内生菌,鉴定为粪肠碱杆菌,为主要抑菌成分有待进一步研究。 展开更多
关键词 猕猴桃 内生菌 抑菌活性 发酵液 鉴定
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不同水稻组织内生细菌的群落多样性 被引量:22
12
作者 沙月霞 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第12期2216-2228,共13页
【目的】为详细了解水稻不同组织内生细菌群落多样性。【方法】对宁粳43号内生细菌的总DNA提取后,采用高通量测序技术对水稻内生细菌的16S rRNA基因进行了序列测定,分析了水稻不同组织部位内生细菌群落结构特征。【结果】叶部共获得内... 【目的】为详细了解水稻不同组织内生细菌群落多样性。【方法】对宁粳43号内生细菌的总DNA提取后,采用高通量测序技术对水稻内生细菌的16S rRNA基因进行了序列测定,分析了水稻不同组织部位内生细菌群落结构特征。【结果】叶部共获得内生细菌OTUs610个,茎部411个,根部174个。物种分类显示,叶部内生细菌种类隶属于22门40纲103目198科399属,其中优势类群是红球菌属(Rhodococcus)和乳酸杆菌属(Lactobacillus),它们的相对丰度分别为21.00%和9.19%;茎部内生细菌种类隶属于19门31纲85目169科306属,其中优势类群是红球菌属和罗尔斯通菌属(Ralstonia),它们的相对丰度分别为19.25%和13.52%;根部内生细菌种类隶属于9门19纲44目82科140属,其中优势类群是肠杆菌属(Enterobacter)和埃希氏杆菌属(Escherichia),它们的相对丰度分别为81.13%和10.89%。根茎叶中相同的OTU有78个,放线菌门(Actinobacteria)与大多数细菌具有相关性。根系内生细菌中具有调控各种代谢网络功能的物种丰度高于茎部和叶部。【结论】不同水稻组织内生细菌具有丰富的群落多样性,其中叶部的内生细菌物种最丰富,根系参与各种代谢调控的细菌丰度最高,各个组织部位的优势菌属各不相同,变形菌门是最重要的水稻内生细菌。 展开更多
关键词 多样性 内生细菌群落 不同水稻组织 高通量测序 微生物生态学
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内生细菌在植物修复中的应用 被引量:6
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作者 李安明 邓青云 +1 位作者 李德华 汪宜宇 《湖北农业科学》 北大核心 2011年第19期3893-3896,共4页
环境污染是严重威胁人类健康的全球性问题,植物修复就是利用植物吸收、富集以除去环境中的污染物尤其是重金属污染物或者将其转变成毒性较低的物质的过程,植物修复以其廉价、安全与环境友好的特点,为重金属环境污染的修复提供了新的途... 环境污染是严重威胁人类健康的全球性问题,植物修复就是利用植物吸收、富集以除去环境中的污染物尤其是重金属污染物或者将其转变成毒性较低的物质的过程,植物修复以其廉价、安全与环境友好的特点,为重金属环境污染的修复提供了新的途径。内生细菌是植物组织内的正常菌群,它们的存在不会使植物出现可见的伤害或者功能的改变,在植物修复中具有重要的作用,它们可以促进植物生长、加速有机污染物降解、提高植物对重金属的抗性以及增加植物对重金属的吸收、促进重金属在植物体内的转运过程。对内生细菌在植物修复中的应用进行了综述,并对其研究前景进行了展望。 展开更多
关键词 植物修复 环境污染 内生细菌 有机污染物 重金属
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生防菌R-4的鉴定及其对玉米南方锈病的防效 被引量:5
14
作者 赵晨晨 焦铸锦 +5 位作者 庞发虎 王坦 王潞 李森 陶爱丽 黄思良 《玉米科学》 CAS CSCD 北大核心 2017年第2期136-141,共6页
对分离自玉米植株的内生细菌R-4进行鉴定,测试其对玉米南方锈病(SCR)的防病增产效果。用盆栽方法测定菌株R-4对玉米植株的促生效果,根据16S r DNA序列对菌株R-4进行鉴定,采用自然发病方式测试其对SCR的防病增产效果。结果表明,菌株R-4... 对分离自玉米植株的内生细菌R-4进行鉴定,测试其对玉米南方锈病(SCR)的防病增产效果。用盆栽方法测定菌株R-4对玉米植株的促生效果,根据16S r DNA序列对菌株R-4进行鉴定,采用自然发病方式测试其对SCR的防病增产效果。结果表明,菌株R-4处理玉米的发芽率、播种后18 d株高、播种后28 d株高、植株地上部干重及根干重比对照分别增加17.19%、32.03%、41.80%、92.53%和37.03%。通过16S r DNA序列分析,将菌株R-4鉴定为蜡样芽孢杆菌(Bacillus cereus)。菌株R-4在先玉335、银糯1号、浚单20上对SCR的防效达39.2%~92.1%(平均为65.7%),经该菌处理后玉米增产2.58%~9.02%(平均为6.66%)。 展开更多
关键词 玉米 内生细菌 蜡样芽孢杆菌 南方锈病
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一株水稻内生菌久留里副伯克霍尔德(Paraburkholderia kururiensis)的分离鉴定及促生功能的评价
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作者 王星 孟炯放 +3 位作者 马荣 何山文 郭鹤宝 张晓霞 《中国土壤与肥料》 CAS CSCD 北大核心 2022年第4期218-228,共11页
从水稻根中分离出的内生细菌HMC50通过16S rRNA基因和全基因组序列分析鉴定为久留里副伯克霍尔德菌(Paraburkholderia kururiensiss)。在基因组水平预测到该菌株具有与促进植物生长、鞭毛介导的运动性和解毒作用相关的主要特征,发现与... 从水稻根中分离出的内生细菌HMC50通过16S rRNA基因和全基因组序列分析鉴定为久留里副伯克霍尔德菌(Paraburkholderia kururiensiss)。在基因组水平预测到该菌株具有与促进植物生长、鞭毛介导的运动性和解毒作用相关的主要特征,发现与固氮相关的18个基因中包括关键基因nifH以及色氨酸合酶α链(EC 4.2.1.20)基因和色氨酸合酶β链(EC 4.2.1.20)基因,因此推测该菌株具有固定N_(2)和分泌生长素(IAA)的能力;通过植物促生特性试验的验证,发现HMC50的确具有分泌IAA的能力(29.57 mg/L)并且具有较高的固氮酶活性11.9nmol/(mL·h),除此之外,该菌株同时具有产铁载体的能力,定量检测A/Ar是0.29,1-氨基环丙烷羧酸脱氨酶活性为0.35 U/mg,溶解无机磷的能力较强(菌落溶磷透明圈直径HD与菌落直径CD的比值为3.97);盆栽试验发现该菌株对水稻有促进生长的潜能,接菌后水稻幼苗的根长、茎长、根重以及总鲜重上都优于空白对照组(P<0.05)。以上研究结果表明,Paraburkholderia kururiensis HMC50具有优良的功能特性,可以显著促进水稻幼苗生长,该研究结果可为水稻特用的微生物肥料研制提供优良的菌株资源。 展开更多
关键词 久留里副伯克霍尔德菌 促生功能 内生细菌 全基因组序列分析
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