为探究藏羊(Ovis aries)BMPR-ⅠB基因的序列特征、表达特征及其多态性对产羔性状的影响,本研究利用RT-qPCR、克隆测序、生物信息学方法和iMLDR技术等检测藏羊BMPR-ⅠB基因的组织表达特性,克隆了藏羊BMPR-ⅠB基因的编码区,分析了BMPR-Ⅰ...为探究藏羊(Ovis aries)BMPR-ⅠB基因的序列特征、表达特征及其多态性对产羔性状的影响,本研究利用RT-qPCR、克隆测序、生物信息学方法和iMLDR技术等检测藏羊BMPR-ⅠB基因的组织表达特性,克隆了藏羊BMPR-ⅠB基因的编码区,分析了BMPR-ⅠB理化性质和蛋白质结构,并检测了其在臧羊群体中的多态性。RT-qPCR结果表明,BMPR-ⅠB基因在下丘脑、垂体、心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏、卵巢、输卵管、子宫、瘤胃、十二指肠、臂三头肌、半腱肌、股四头肌和背最长肌等16个组织中均有表达,其中在卵巢、输卵管和子宫中的表达量高于其他组织的,在肌肉组织中的表达量最低。生物信息学分析结果表明,藏羊BMPR-ⅠB基因包含1个长为1509 bp的开放阅读框,编码502个氨基酸,其编码区氨基酸序列与绵羊的关系最近;BMPR-ⅠB蛋白的分子式为C_(2511)H_(3986)N_(694)O_(747)S_(33),分子量为56907.45 Da,总原子数为7971,理论等电点为7.78,T_(1/2)为30 h,不稳定指数为54.07,亲水性均值(grand average of hydropa-thicity,GRAVY)为-0.357;BMPR-ⅠB蛋白含信号肽,1个跨膜区,属于跨膜蛋白;存在87个潜在的磷酸化位点、2个N-糖基化修饰位点;α-螺旋、延伸链、β-转角和无规卷曲所占的比例分别为34.86%、13.15%、3.39%和48.61%,属于混合性蛋白。基因分型结果表明,藏羊BMPR-ⅠB基因编码区FecB位点存在A>G突变,且存在3种基因型,分别为野生++型、杂合突变B+型和纯合突变BB型,多态信息含量为0.07,属于低度多态,且该位点处于Hardy-Weinberg平衡状态。藏羊平均产羔数在野生++型和杂合突变+型之间差异显著(P<0.05)。本研究结果为进一步研究BMPR-ⅠB基因对藏羊繁殖性能的调控作用提供参考数据。展开更多
试验旨在研究不同品系大白猪骨形态发生蛋白受体ⅠB(bone morphogenetic protein receptor-ⅠB,BMPR-ⅠB)基因多态性及其与繁殖性状的相关性。采用Hi-SNP中高通量基因分型技术对BMPR-ⅠB基因多态位点进行分型,利用SPSS统计软件,采用最...试验旨在研究不同品系大白猪骨形态发生蛋白受体ⅠB(bone morphogenetic protein receptor-ⅠB,BMPR-ⅠB)基因多态性及其与繁殖性状的相关性。采用Hi-SNP中高通量基因分型技术对BMPR-ⅠB基因多态位点进行分型,利用SPSS统计软件,采用最小二乘法将各位点不同基因型与总产仔数、产活仔数、死胎数、畸形头数进行相关性分析。结果显示,不同品系大白猪在BMPR-ⅠB基因746A>G和852G>A位点均未检测到多态性,804G>C位点上均表现为GG基因型为优势基因型,G为优势等位基因;960C>T位点在美系大白猪中以CC基因型频率较高,而在英系大白猪中以TT基因型频率较高,在加系大白猪中CT基因型频率较高,3个不同品系大白猪群体在804G>C和960C>T位点均处于Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05)。804G>C位点在3个不同品系大白猪中对总产仔数、产活仔数、死胎数、畸形数等繁殖性状均无显著影响(P>0.05)。960C>T位点在美系大白猪群体中TT基因型死胎数极显著低于CC基因型1.027头(P<0.01);英系大白猪群体中TT基因型总产仔数显著高于CC基因型1.976头(P<0.05),极显著高于CT基因型2.118头(P<0.01);加系大白猪中TT基因型产活仔数显著高于CC基因型0.886头(P<0.05),死胎数、畸形头数显著低于CC基因型0.707和0.337头(P<0.05)。960C>T位点中TT基因型可作为3个不同品系大白猪繁殖性状的标记基因型。展开更多
文摘为探究藏羊(Ovis aries)BMPR-ⅠB基因的序列特征、表达特征及其多态性对产羔性状的影响,本研究利用RT-qPCR、克隆测序、生物信息学方法和iMLDR技术等检测藏羊BMPR-ⅠB基因的组织表达特性,克隆了藏羊BMPR-ⅠB基因的编码区,分析了BMPR-ⅠB理化性质和蛋白质结构,并检测了其在臧羊群体中的多态性。RT-qPCR结果表明,BMPR-ⅠB基因在下丘脑、垂体、心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏、卵巢、输卵管、子宫、瘤胃、十二指肠、臂三头肌、半腱肌、股四头肌和背最长肌等16个组织中均有表达,其中在卵巢、输卵管和子宫中的表达量高于其他组织的,在肌肉组织中的表达量最低。生物信息学分析结果表明,藏羊BMPR-ⅠB基因包含1个长为1509 bp的开放阅读框,编码502个氨基酸,其编码区氨基酸序列与绵羊的关系最近;BMPR-ⅠB蛋白的分子式为C_(2511)H_(3986)N_(694)O_(747)S_(33),分子量为56907.45 Da,总原子数为7971,理论等电点为7.78,T_(1/2)为30 h,不稳定指数为54.07,亲水性均值(grand average of hydropa-thicity,GRAVY)为-0.357;BMPR-ⅠB蛋白含信号肽,1个跨膜区,属于跨膜蛋白;存在87个潜在的磷酸化位点、2个N-糖基化修饰位点;α-螺旋、延伸链、β-转角和无规卷曲所占的比例分别为34.86%、13.15%、3.39%和48.61%,属于混合性蛋白。基因分型结果表明,藏羊BMPR-ⅠB基因编码区FecB位点存在A>G突变,且存在3种基因型,分别为野生++型、杂合突变B+型和纯合突变BB型,多态信息含量为0.07,属于低度多态,且该位点处于Hardy-Weinberg平衡状态。藏羊平均产羔数在野生++型和杂合突变+型之间差异显著(P<0.05)。本研究结果为进一步研究BMPR-ⅠB基因对藏羊繁殖性能的调控作用提供参考数据。
文摘试验旨在研究不同品系大白猪骨形态发生蛋白受体ⅠB(bone morphogenetic protein receptor-ⅠB,BMPR-ⅠB)基因多态性及其与繁殖性状的相关性。采用Hi-SNP中高通量基因分型技术对BMPR-ⅠB基因多态位点进行分型,利用SPSS统计软件,采用最小二乘法将各位点不同基因型与总产仔数、产活仔数、死胎数、畸形头数进行相关性分析。结果显示,不同品系大白猪在BMPR-ⅠB基因746A>G和852G>A位点均未检测到多态性,804G>C位点上均表现为GG基因型为优势基因型,G为优势等位基因;960C>T位点在美系大白猪中以CC基因型频率较高,而在英系大白猪中以TT基因型频率较高,在加系大白猪中CT基因型频率较高,3个不同品系大白猪群体在804G>C和960C>T位点均处于Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05)。804G>C位点在3个不同品系大白猪中对总产仔数、产活仔数、死胎数、畸形数等繁殖性状均无显著影响(P>0.05)。960C>T位点在美系大白猪群体中TT基因型死胎数极显著低于CC基因型1.027头(P<0.01);英系大白猪群体中TT基因型总产仔数显著高于CC基因型1.976头(P<0.05),极显著高于CT基因型2.118头(P<0.01);加系大白猪中TT基因型产活仔数显著高于CC基因型0.886头(P<0.05),死胎数、畸形头数显著低于CC基因型0.707和0.337头(P<0.05)。960C>T位点中TT基因型可作为3个不同品系大白猪繁殖性状的标记基因型。
文摘为提高山羊产羔性能提供更多的基因信息,筛选出与山羊产羔性状相关的分子标记,本研究以努比亚山羊为试验材料,颈静脉采血后,提取血液全基因组DNA,根据NCBI GenBank山羊BMPRⅠB基因序列(NC-030813.1)设计引物,采用DNA池法结合PCR产物测序方法检测BMPRⅠB基因的多态性,结果发现BMPRⅠB基因5'UTR第469位发生T→C突变。采用限制性内切酶片段长度多态性(restriction fragment length polymorphism,RFLP)方法对BMPRⅠB基因5'UTR的序列进行基因分型并与产羔性状进行关联分析。结果表明,该位点对产羔数、初生重和断奶重的影响都不显著。
