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玉米B3基因家族全基因组鉴定及表达模式
1
作者
仝帧翰
张严玲
+6 位作者
王雷立
李安然
王闻琦
王盼盼
刘洪畅
刘青青
王翠玲
《草业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第10期2556-2570,共15页
B3基因家族是植物中特有的转录因子家族,在植物生长发育及胁迫响应中有重要作用。为探究B3基因家族在玉米(Zea mays)中的基本信息及生长发育和逆境胁迫中的生物学功能,本研究对玉米全基因组B3家族成员进行鉴定并分析相关信息,依据转录...
B3基因家族是植物中特有的转录因子家族,在植物生长发育及胁迫响应中有重要作用。为探究B3基因家族在玉米(Zea mays)中的基本信息及生长发育和逆境胁迫中的生物学功能,本研究对玉米全基因组B3家族成员进行鉴定并分析相关信息,依据转录组数据分析B3基因家族组织特异性表达及胁迫处理下的表达响应。结果显示,玉米B3基因家族包含88个成员,分为ABI、ARF、HSI、RAV和REM 5个亚家族,均含有B3结构域,同一个亚族成员的基因结构及保守基序(数量、类型)相似。分析发现,B3成员基因的启动子区域中均富含激素及逆境响应等功能元件。组织特异性表达分析结果显示,大部分B3基因在分生组织中优势表达。对B3家族成员在冷、热、盐、紫外和干旱这5种胁迫因子的响应表达分析显示,5个亚家族成员均可不同程度参与响应冷、热、盐、紫外和干旱胁迫因子,其中HSI亚家族中的所有成员均参与了对紫外胁迫因子的响应途径。以上结果阐明了B3基因家族在玉米全基因组中的分布、结构和系统发育特征,并依据玉米转录组数据,初步推测其在生长发育和胁迫应激响应中发挥重要作用,为深入研究B3基因家族在玉米中的功能与分子机制提供了数据基础。
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关键词
玉米
b
3
家族
生物信息学
系统进化分析
生长发育
非生物胁迫
表达分析
下载PDF
职称材料
水稻B3转录因子OsL1的生信分析及表达模式
2
作者
李磊
邱牡丹
+8 位作者
董皓
沈泓
宋书锋
李懿星
王天抗
黎燕霞
张龙辉
李莉
王建龙
《分子植物育种》
CAS
北大核心
2021年第15期4880-4886,共7页
B3转录因子是植物特有的转录因子,与植物花形态建成、激素信号转导、种子生长发育及植物逆境胁迫响应密切相关。前期研究中,利用穗发育芯片筛选到一个OsL1基因。生物信息学分析发现,OsL1基因位于水稻4号染色体,基因全长4262 bp,编码433...
B3转录因子是植物特有的转录因子,与植物花形态建成、激素信号转导、种子生长发育及植物逆境胁迫响应密切相关。前期研究中,利用穗发育芯片筛选到一个OsL1基因。生物信息学分析发现,OsL1基因位于水稻4号染色体,基因全长4262 bp,编码433个氨基酸,蛋白分子量为48.7 kD,序列比对和系统发育分析表明OsL1属于B3家族转录因子,不含信号肽剪切位点和跨膜结构域,亚细胞定位于细胞核。启动子序列分析发现,该基因启动子中含有8个光响应元件及部分激素响应元件。实时PCR分析发现OsL1在水稻根、茎、叶、和穗中均有表达,其中在根和穗发育7期表达量较高,进一步克隆OsL1启动子区域,构建pCAMBIA1301-OsL1-GUS表达载体,遗传转化并鉴定获得转基因植株,The previous study在水稻根、茎、叶、和穗中均检测到了GUS信号,表明OsL1属于组成型表达。以上结果为深入研究OsL1基因在水稻生长发育过程的生物学功能提供了科学依据。
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关键词
水稻
b
3
家族
亚细胞定位
表达模式
原文传递
拟南芥AT4G32010基因缺失突变体对非生物胁迫的响应
被引量：
2
3
作者
赵彦敏
瓮巧云
《湖北农业科学》
2018年第13期94-97,共4页
B3家族基因是植物中特有的转录因子,参与到植物生长发育、抗逆境胁迫等过程。拟南芥HSI基因(AT4G32010基因)是B3家族中成员之一。以拟南芥野生型和突变体hsi为材料,利用PCR和实时荧光定量PCR技术获得HSI基因表达量发生变化、纯合突变体...
B3家族基因是植物中特有的转录因子,参与到植物生长发育、抗逆境胁迫等过程。拟南芥HSI基因(AT4G32010基因)是B3家族中成员之一。以拟南芥野生型和突变体hsi为材料,利用PCR和实时荧光定量PCR技术获得HSI基因表达量发生变化、纯合突变体。在模拟干旱和盐胁迫下,野生型和突变体his发芽率随甘露醇和盐浓度的增加而下降。同一浓度下,突变体hsi发芽率均低于野生型,两者之间差异明显。表明拟南芥HSI基因在种子发芽过程中起正调控作用。在模拟干旱和不同盐浓度胁迫下,野生型和突变体根长度差异不明显。表明该基因参与根的生长过程,关于其调控作用还需要进一步分析。
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关键词
拟南芥
b
3
家族基因
HSI基因
干旱胁迫
盐胁迫
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职称材料
题名
玉米B3基因家族全基因组鉴定及表达模式
1
作者
仝帧翰
张严玲
王雷立
李安然
王闻琦
王盼盼
刘洪畅
刘青青
王翠玲
机构
河南科技大学农学院
出处
《草业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第10期2556-2570,共15页
基金
国家自然科学基金河南省联合基金项目(U2004153)
国家自然科学基金青年基金项目(31901561)
河南省重点研发与推广专项(222102110002)。
文摘
B3基因家族是植物中特有的转录因子家族,在植物生长发育及胁迫响应中有重要作用。为探究B3基因家族在玉米(Zea mays)中的基本信息及生长发育和逆境胁迫中的生物学功能,本研究对玉米全基因组B3家族成员进行鉴定并分析相关信息,依据转录组数据分析B3基因家族组织特异性表达及胁迫处理下的表达响应。结果显示,玉米B3基因家族包含88个成员,分为ABI、ARF、HSI、RAV和REM 5个亚家族,均含有B3结构域,同一个亚族成员的基因结构及保守基序(数量、类型)相似。分析发现,B3成员基因的启动子区域中均富含激素及逆境响应等功能元件。组织特异性表达分析结果显示,大部分B3基因在分生组织中优势表达。对B3家族成员在冷、热、盐、紫外和干旱这5种胁迫因子的响应表达分析显示,5个亚家族成员均可不同程度参与响应冷、热、盐、紫外和干旱胁迫因子,其中HSI亚家族中的所有成员均参与了对紫外胁迫因子的响应途径。以上结果阐明了B3基因家族在玉米全基因组中的分布、结构和系统发育特征,并依据玉米转录组数据,初步推测其在生长发育和胁迫应激响应中发挥重要作用,为深入研究B3基因家族在玉米中的功能与分子机制提供了数据基础。
关键词
玉米
b
3
家族
生物信息学
系统进化分析
生长发育
非生物胁迫
表达分析
Keywords
Zea
mays
b
3
family
b
ioinformatics
phylogenetic
analysis
growth
and
development
a
b
iotic
stress
expression
analysis
分类号
S513 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
水稻B3转录因子OsL1的生信分析及表达模式
2
作者
李磊
邱牡丹
董皓
沈泓
宋书锋
李懿星
王天抗
黎燕霞
张龙辉
李莉
王建龙
机构
湖南农业大学农学院
湖南杂交水稻研究中心
出处
《分子植物育种》
CAS
北大核心
2021年第15期4880-4886,共7页
基金
国家自然科学基金项目(31901530)资助。
文摘
B3转录因子是植物特有的转录因子,与植物花形态建成、激素信号转导、种子生长发育及植物逆境胁迫响应密切相关。前期研究中,利用穗发育芯片筛选到一个OsL1基因。生物信息学分析发现,OsL1基因位于水稻4号染色体,基因全长4262 bp,编码433个氨基酸,蛋白分子量为48.7 kD,序列比对和系统发育分析表明OsL1属于B3家族转录因子,不含信号肽剪切位点和跨膜结构域,亚细胞定位于细胞核。启动子序列分析发现,该基因启动子中含有8个光响应元件及部分激素响应元件。实时PCR分析发现OsL1在水稻根、茎、叶、和穗中均有表达,其中在根和穗发育7期表达量较高,进一步克隆OsL1启动子区域,构建pCAMBIA1301-OsL1-GUS表达载体,遗传转化并鉴定获得转基因植株,The previous study在水稻根、茎、叶、和穗中均检测到了GUS信号,表明OsL1属于组成型表达。以上结果为深入研究OsL1基因在水稻生长发育过程的生物学功能提供了科学依据。
关键词
水稻
b
3
家族
亚细胞定位
表达模式
Keywords
Rice
b
3
family
Su
b
cellular
localization
Expression
pattern
分类号
S511 [农业科学—作物学]
原文传递
题名
拟南芥AT4G32010基因缺失突变体对非生物胁迫的响应
被引量：
2
3
作者
赵彦敏
瓮巧云
机构
张家口广播电视大学
河北北方学院农林科技学院
出处
《湖北农业科学》
2018年第13期94-97,共4页
基金
河北北方学院重大项目(ZD201407)
文摘
B3家族基因是植物中特有的转录因子,参与到植物生长发育、抗逆境胁迫等过程。拟南芥HSI基因(AT4G32010基因)是B3家族中成员之一。以拟南芥野生型和突变体hsi为材料,利用PCR和实时荧光定量PCR技术获得HSI基因表达量发生变化、纯合突变体。在模拟干旱和盐胁迫下,野生型和突变体his发芽率随甘露醇和盐浓度的增加而下降。同一浓度下,突变体hsi发芽率均低于野生型,两者之间差异明显。表明拟南芥HSI基因在种子发芽过程中起正调控作用。在模拟干旱和不同盐浓度胁迫下,野生型和突变体根长度差异不明显。表明该基因参与根的生长过程,关于其调控作用还需要进一步分析。
关键词
拟南芥
b
3
家族基因
HSI基因
干旱胁迫
盐胁迫
Keywords
Ara
b
idopsis
thaliana
b
3
family
gene
HSL1
gene
drought
stress
salt
stress
分类号
Q789 [生物学—分子生物学]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
玉米B3基因家族全基因组鉴定及表达模式
仝帧翰
张严玲
王雷立
李安然
王闻琦
王盼盼
刘洪畅
刘青青
王翠玲
《草业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2023
0
下载PDF
职称材料
2
水稻B3转录因子OsL1的生信分析及表达模式
李磊
邱牡丹
董皓
沈泓
宋书锋
李懿星
王天抗
黎燕霞
张龙辉
李莉
王建龙
《分子植物育种》
CAS
北大核心
2021
0
原文传递
3
拟南芥AT4G32010基因缺失突变体对非生物胁迫的响应
赵彦敏
瓮巧云
《湖北农业科学》
2018
2
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职称材料
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