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牛布鲁氏杆菌2308和羊布鲁氏杆菌16M全基因组种属特异性序列的筛选与鉴定 被引量：2
1
作者 胡明月 高汛 +3 位作者 刘正喜 史露露 闫守庆 张英 《黑龙江畜牧兽医》 CAS 北大核心 2020年第22期62-66,共5页
为了探讨不同种属布鲁氏杆菌宿主特异性的分子遗传基础以及获得分子生物学种属鉴别的靶位点,试验采用相关生物信息学软件对GenBank中牛布鲁氏杆菌2308(B.abortus 2308)和羊布鲁氏杆菌16M(B.melitensis 16M)进行了全基因组范围内的单核... 为了探讨不同种属布鲁氏杆菌宿主特异性的分子遗传基础以及获得分子生物学种属鉴别的靶位点,试验采用相关生物信息学软件对GenBank中牛布鲁氏杆菌2308(B.abortus 2308)和羊布鲁氏杆菌16M(B.melitensis 16M)进行了全基因组范围内的单核苷酸多态性(SNPs)、插入缺失长度多态性(InDels)以及获得与缺失多态性(PAVs)分析。结果表明:B.abortus 2308和B.melitensis 16M之间存在SNPs 6 271个,InDels 2 799个;B.abortus 2308和B.melitensis 16M之间含有32个PAVs片段(大于100 bp),长度共计约57.5 kb。随机选取5个PAVs片段进行PCR扩增和测序,核酸序列结果与生物信息学分析结果一致,扩增长度与生物信息学分析结果之间的差异与PAVs片段两端存在的正向重复序列有关。说明本试验获得了B.abortus 2308和B.melitensis 16M全基因组范围内的SNPs、InDels以及PAVs,以利于下一步解析牛和羊布鲁氏杆菌种属生物学差异的遗传基础以及建立种属鉴别方法。 展开更多
关键词 牛布鲁氏杆菌2308 羊布鲁氏杆菌16M 比较基因组学 获得与缺失多态性 单核苷酸多态性 插入缺失长度多态性
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流产布鲁氏菌2308株磷酸甘露糖变位酶pmm基因缺失株构建及鉴定
2
作者 李亚 张辉 +6 位作者 郭飞 陈创夫 张科 桂丹 温书香 纪太旺 张欢 《西北农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第6期29-32,共4页
旨在构建流产布鲁氏菌2308株pmm基因缺失株。PCR扩增流产布鲁氏菌2308株pmm基因的上、下游同源臂片段,并与枯草芽孢杆菌上SacB基因片段融合。连接至自杀载体PGEM-7Zf+,构建自杀载体PGEM-7Zf+Δpmm-SacB。电转化至流产布鲁氏菌2308株感... 旨在构建流产布鲁氏菌2308株pmm基因缺失株。PCR扩增流产布鲁氏菌2308株pmm基因的上、下游同源臂片段,并与枯草芽孢杆菌上SacB基因片段融合。连接至自杀载体PGEM-7Zf+,构建自杀载体PGEM-7Zf+Δpmm-SacB。电转化至流产布鲁氏菌2308株感受态细胞内,通过氨苄抗性和蔗糖敏感性筛选,获得基因缺失株2308Δpmm,对其进行PCR鉴定和稳定性检测。成功构建可稳定遗传的2308Δpmm基因缺失株,并在15代内未发生回复。在此基础上可以对2308Δpmm进行深入研究。 展开更多
关键词 流产布鲁氏菌2308株 pmm基因 基因缺失株
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