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河北省石家庄市番茄黄化曲叶病毒及其伴随DNAβ的分子鉴定及序列分析
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作者 韩旭良 康忱 +6 位作者 田哲娟 王鹏 李亚栋 赵雪芳 闫洪波 刘美霞 吴志明 《河北农业科学》 2023年第2期74-82,共9页
在河北石家庄市的番茄上分离得到番茄黄化曲叶病毒(tomato yellow leaf curl virus,TYLCV)及其伴随卫星DNA(Betasatellite DNA,又称DNAβ),对其进行分子鉴定及序列分析,明确TYLCV石家庄分离物及其伴随DNAβ分子结构特征及其进化起源。... 在河北石家庄市的番茄上分离得到番茄黄化曲叶病毒(tomato yellow leaf curl virus,TYLCV)及其伴随卫星DNA(Betasatellite DNA,又称DNAβ),对其进行分子鉴定及序列分析,明确TYLCV石家庄分离物及其伴随DNAβ分子结构特征及其进化起源。根据已报道的TYLCV及其伴随DNAβ序列设计引物,分别扩增TYLCV石家庄分离物及其伴随DNAβ的全长序列并测序。在NCBI上选取国内外有代表性的TYLCV序列和DNAβ序列,使用MEGA 6.0软件和DNAMAN软件对石家庄TYLCV分离物及其伴随DNAβ进行遗传变异分析。结果表明:TYLCV石家庄分离物全长为2781 bp,共有6个ORFs,将该分离物定名为TYLCV-SJZ2021。基因组序列比对发现,TYLCV-SJZ2021与山东省的分离物同源性最高(99%);与2015年本实验室报道的TYLCV石家庄分离物相似度为98.67%,存在37处碱基差异,均属于TYLCV以色列株系。TYLCV-SJZ2021的伴随DNAβ全长1343 bp,其上有病毒在细胞间移动相关蛋白的BC1编码区,序列比对发现该DNAβ与河南TYLCV伴随DNAβ分子最为相似(98%)。从分子水平上鉴定了TYLCV-SJZ2021及其伴随DNAβ的分类地位,为防治该病毒病害及其抗病育种奠定了基础。 展开更多
关键词 番茄黄化曲叶病毒 dnaΒ 分子鉴定 序列分析
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