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题名卵巢癌发生发展关键基因的生物信息学筛选
被引量：2
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作者
余展鹏
彭亮
姜巧
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机构
广州医科大学附属第五医院检验科
广州医科大学金域检验学院
广东三九脑科医院重症监护病区
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出处
《中国临床新医学》
2021年第2期174-180,共7页
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文摘
目的筛选影响卵巢癌发生发展的关键基因,并分析其作用机制。方法利用高通量基因表达(GEO)数据库、癌症基因图谱(TCGA)数据库及KMplot数据库筛选卵巢癌关键基因,分析其与患者临床病理学特征的关系,同时使用GESA进行信号通路聚类分析,并使用TIMER数据库确定与之密切相关的基因,通过STRING数据库绘制互作网络图,预测其作用机制。结果通过筛选共得到13个差异基因,其中ARX和FAM150B与患者预后有关,且其表达量越低,患者总生存期越短(P<0.01)。进一步分析发现ARX和FAM150B的表达量还与IL-6、PIK3R2、PIK3CD、VAV1、PIK3CA、RAC2、PIK3R1及MAPK1的表达量相关(P<0.05)。使用STRING数据库分析发现ARX和FAM150B通过TUBA1A、EGFR、PLXNA2对以上基因进行调控。结论ARX和FAM150B在卵巢癌组织中呈低表达状态,它们的表达量和患者的预后密切相关。ARX和FAM150B可对一系列基因进行调控,从而减弱机体的抗肿瘤免疫反应,促进卵巢癌的发生发展。
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关键词
卵巢癌
高通量基因表达数据库
差异基因
arx
FAM150B
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Keywords
Ovarian cancer
Gene Expression Omnibus(GEO)Database
Differentially expressed genes(DEGs)
aristaless related homeobox(arx)
Family with Sequence Similarity 150 Member B(FAM150B)
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分类号
R737.31
[医药卫生—肿瘤]
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