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应用mtDNA-COⅠ基因序列研究我国大劣按蚊A、D群体的遗传差异
被引量:
11
1
作者
王冬
马雅军
周红宁
《中国寄生虫学与寄生虫病杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2007年第5期368-371,375,共5页
目的应用线粒体DNA细胞色素氧化酶亚单位Ⅰ(mtDNA-COⅠ)基因序列特征阐明我国大劣按蚊A、D群体的遗传差异和分化水平。方法研究样本包括大劣按蚊A海南群体(n=13),大劣按蚊D云南江城群体(n=17)和勐腊群体(n=17),所有样本均以rDNA-ITS2序...
目的应用线粒体DNA细胞色素氧化酶亚单位Ⅰ(mtDNA-COⅠ)基因序列特征阐明我国大劣按蚊A、D群体的遗传差异和分化水平。方法研究样本包括大劣按蚊A海南群体(n=13),大劣按蚊D云南江城群体(n=17)和勐腊群体(n=17),所有样本均以rDNA-ITS2序列差异为依据,进行分子鉴别确认;扩增和测定mtDNA-COⅠ基因片段,用MEGA(Version2.1)、TCS(Version1.12)、ARLEQUIN(Version2.0)等软件对基因序列进行生物信息学分析。结果分析mtDNA-COⅠ基因中长度为959bp的片段,显示大劣按蚊A的单倍型共3个,大劣按蚊D的单倍型共6个,均匀分布于3个群体。勐腊群体内错配平均数(7.4412)明显大于江城群体(1.2794)和海南群体(1.0513),表明勐腊群体内个体间分化程度最大。分步AMOVA的计算结果显示群体间基因交流有限(Fst=0.7999),群体间变异(79.99%)明显大于群体内变异(20.01%)。结论我国大劣按蚊A、D群体之间的遗传差异较小,个体间的分化水平较高。
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关键词
大劣按蚊(广义)
mtDNA—CO
Ⅰ
群体遗传
下载PDF
职称材料
题名
应用mtDNA-COⅠ基因序列研究我国大劣按蚊A、D群体的遗传差异
被引量:
11
1
作者
王冬
马雅军
周红宁
机构
第二军医大学病原生物学教研室
云南省寄生虫病防治所
出处
《中国寄生虫学与寄生虫病杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2007年第5期368-371,375,共5页
基金
国家自然科学基金(No.30271161)~~
文摘
目的应用线粒体DNA细胞色素氧化酶亚单位Ⅰ(mtDNA-COⅠ)基因序列特征阐明我国大劣按蚊A、D群体的遗传差异和分化水平。方法研究样本包括大劣按蚊A海南群体(n=13),大劣按蚊D云南江城群体(n=17)和勐腊群体(n=17),所有样本均以rDNA-ITS2序列差异为依据,进行分子鉴别确认;扩增和测定mtDNA-COⅠ基因片段,用MEGA(Version2.1)、TCS(Version1.12)、ARLEQUIN(Version2.0)等软件对基因序列进行生物信息学分析。结果分析mtDNA-COⅠ基因中长度为959bp的片段,显示大劣按蚊A的单倍型共3个,大劣按蚊D的单倍型共6个,均匀分布于3个群体。勐腊群体内错配平均数(7.4412)明显大于江城群体(1.2794)和海南群体(1.0513),表明勐腊群体内个体间分化程度最大。分步AMOVA的计算结果显示群体间基因交流有限(Fst=0.7999),群体间变异(79.99%)明显大于群体内变异(20.01%)。结论我国大劣按蚊A、D群体之间的遗传差异较小,个体间的分化水平较高。
关键词
大劣按蚊(广义)
mtDNA—CO
Ⅰ
群体遗传
Keywords
anopheles
dirus
s.
l
.
mtDNA-CO
Ⅰ
Popu
l
ation
genetic
分类号
R384.111 [医药卫生—医学寄生虫学]
R392.13 [医药卫生—基础医学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
应用mtDNA-COⅠ基因序列研究我国大劣按蚊A、D群体的遗传差异
王冬
马雅军
周红宁
《中国寄生虫学与寄生虫病杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2007
11
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