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2012-2023年882例重症手足口病病例病原谱及CV-A6基因特征分析
被引量：
2
1
作者
路环环
肖金波
+4 位作者
严冬梅
冀天娇
杨倩
祝双利
张勇
《病毒学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第2期383-391,共9页
为了解重症手足口病(Hand,foot,and mouth disease,HFMD)病原谱变化情况以及重症HFMD相关柯萨奇病毒A组6型(Coxsackievirus A6, CVA6)的基因特征,本研究收集了2012-2023年各省级HFMD监测网络实验室送检的882份重症HFMD病例病毒分离物,...
为了解重症手足口病(Hand,foot,and mouth disease,HFMD)病原谱变化情况以及重症HFMD相关柯萨奇病毒A组6型(Coxsackievirus A6, CVA6)的基因特征,本研究收集了2012-2023年各省级HFMD监测网络实验室送检的882份重症HFMD病例病毒分离物,通过扩增病毒的VP1编码区进行分子分型以确定肠道病毒的血清型,并对其中的CVA6进行全长VP1区扩增和核苷酸序列测定分析,进行最大似然法系统进化树和氨基酸置换熵值等生物信息学分析。结果发现,2018年开始,以CVA6和CVA10为主的肠道病毒逐渐取代EV-A71和CV-A16成为导致重症HFMD的主要病原体,在每年检出的病原体中的比例均超过50.0%。除2013年重症HFMD中分离的CVA6属于D2基因亚型外,2013年后重症HFMD中分离的CVA6均属于D3a基因亚型,但2019年以后分离的CVA6序列与以往分离株序列的进化距离明显增大。此外,针对氨基酸位点的置换熵值研究表明,参与构成构象表位的VP1-283易发生突变,该位点从2017年开始由亲水的苏氨酸突变成疏水的丙氨酸,导致其可能分别与VP3-57N、VP3-66R之间形成氢键,这可能会影响到病毒的感染过程。本研究明确了2012-2023年中国重症HFMD病原谱的变化特征,探究了导致重症HFMD的CVA6的进化特点以及重要氨基酸变异特征,为重症HFMD的预防控制策略的制定提供了理论依据。
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关键词
重症手足口病
病原谱
柯萨奇病毒A组6型
系统进化
氨基酸置换熵值
原文传递
题名
2012-2023年882例重症手足口病病例病原谱及CV-A6基因特征分析
被引量：
2
1
作者
路环环
肖金波
严冬梅
冀天娇
杨倩
祝双利
张勇
机构
传染病溯源预警和智能决策全国重点实验室
国家脊髓灰质炎实验室
国家卫生健康委员会生物安全重点实验室
出处
《病毒学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第2期383-391,共9页
基金
北京市自然科学基金-昌平创新联合基金(项目号:L234052)
题目:我国手足口病病原谱及重要肠道病毒变异变迁规律。
文摘
为了解重症手足口病(Hand,foot,and mouth disease,HFMD)病原谱变化情况以及重症HFMD相关柯萨奇病毒A组6型(Coxsackievirus A6, CVA6)的基因特征,本研究收集了2012-2023年各省级HFMD监测网络实验室送检的882份重症HFMD病例病毒分离物,通过扩增病毒的VP1编码区进行分子分型以确定肠道病毒的血清型,并对其中的CVA6进行全长VP1区扩增和核苷酸序列测定分析,进行最大似然法系统进化树和氨基酸置换熵值等生物信息学分析。结果发现,2018年开始,以CVA6和CVA10为主的肠道病毒逐渐取代EV-A71和CV-A16成为导致重症HFMD的主要病原体,在每年检出的病原体中的比例均超过50.0%。除2013年重症HFMD中分离的CVA6属于D2基因亚型外,2013年后重症HFMD中分离的CVA6均属于D3a基因亚型,但2019年以后分离的CVA6序列与以往分离株序列的进化距离明显增大。此外,针对氨基酸位点的置换熵值研究表明,参与构成构象表位的VP1-283易发生突变,该位点从2017年开始由亲水的苏氨酸突变成疏水的丙氨酸,导致其可能分别与VP3-57N、VP3-66R之间形成氢键,这可能会影响到病毒的感染过程。本研究明确了2012-2023年中国重症HFMD病原谱的变化特征,探究了导致重症HFMD的CVA6的进化特点以及重要氨基酸变异特征,为重症HFMD的预防控制策略的制定提供了理论依据。
关键词
重症手足口病
病原谱
柯萨奇病毒A组6型
系统进化
氨基酸置换熵值
Keywords
Severe
hand,foot,and
mouth
disease
Pathogenic
spectrum
Coxsackievirus
A6
Phylogenetic
analysis
amino
acid
substitution
entropy
分类号
R373.2 [医药卫生—病原生物学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
2012-2023年882例重症手足口病病例病原谱及CV-A6基因特征分析
路环环
肖金波
严冬梅
冀天娇
杨倩
祝双利
张勇
《病毒学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024
2
原文传递
已选择
0
条
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引用分析
参考文献
引证文献
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