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全细胞高通量筛选α-氨基酸酯水解酶突变体的方法
被引量:
2
1
作者
叶丽娟
王佳珉
+1 位作者
王辂
曹毅
《微生物学通报》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第2期264-271,共8页
【目的】建立高效敏感的高通量筛选方法,用于筛选头孢克洛合成活性提高或热稳定性提高的α-氨基酸酯水解酶。【方法】根据头孢克洛在碱性条件下水解生成的衍生物在340 nm处有特征吸收峰的原理,制作出标准曲线。采用全细胞96孔板紫外分...
【目的】建立高效敏感的高通量筛选方法,用于筛选头孢克洛合成活性提高或热稳定性提高的α-氨基酸酯水解酶。【方法】根据头孢克洛在碱性条件下水解生成的衍生物在340 nm处有特征吸收峰的原理,制作出标准曲线。采用全细胞96孔板紫外分光光度法高通量测定α-氨基酸酯水解酶突变体的头孢克洛合成活性。【结果】头孢克洛含量与△A340?405在(0.1?0.6)×10?3 mol/L浓度范围内有良好的线性关系,服从朗伯-比尔定律,平均回收率为99.8%?101.3%。一轮定点饱和突变产生的2 300个克隆经该方法的筛选,获得3株kcat提高40%以上,4株半失活温度较野生型提高5°C以上的突变体酶。【结论】该方法准确可靠,每天筛选量可达到2 000个反应,达到高通量筛选的要求。
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关键词
α-氨基酸酯水解酶
头孢克洛
紫外分光光度法
全细胞高通量筛选
定向进化
原文传递
红纹黄单胞菌α-氨基酸酯水解酶的克隆、序列分析及热稳定性提高
被引量:
2
2
作者
王辂
叶丽娟
曹毅
《微生物学通报》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第10期1447-1456,共10页
【目的】克隆红纹黄单胞菌α-氨基酸酯水解酶基因全序列,对序列进行生物信息学分析,并提高酶的热稳定性。【方法】利用多聚酶链式反应(PCR)克隆α-氨基酸酯水解酶基因全序列;应用生物信息学软件对获得的基因序列及编码的蛋白序列进行分...
【目的】克隆红纹黄单胞菌α-氨基酸酯水解酶基因全序列,对序列进行生物信息学分析,并提高酶的热稳定性。【方法】利用多聚酶链式反应(PCR)克隆α-氨基酸酯水解酶基因全序列;应用生物信息学软件对获得的基因序列及编码的蛋白序列进行分析;通过同源建模,预测红纹黄单胞菌α-氨基酸酯水解酶的三维结构;通过定点突变替换氨基酸序列中高度柔性的位点,提高该酶的热稳定性。【结果】从红纹黄单胞菌(Xanthomonas rubrillineans)中扩增得到α-氨基酸酯水解酶基因aeh(GenBank登录号JF744990),核苷酸序列长度1 917 bp,编码638个氨基酸。序列比对和同源性分析显示,该酶与白纹黄单胞菌Xanthomonas albilineans str.GPE PC73的肽酶及地毯草黄单胞菌Xanthomonas axono-podis pv. citri str. 306的戊二酰-7-氨基头孢烷酸酰化酶氨基酸序列相似性最高,分别为91%和83%,系统进化分析表明,该酶与白纹黄单胞菌Xanthomonas albilineans str. GPEPC73的肽酶亲缘性最高。基于预测的三维模型,对高度柔性的位点进行饱和突变,从282株突变体中筛选得到3株T50较野生型高5°C以上的突变体。【结论】对红纹黄单胞菌AEH的氨基酸序列分析有助于探索同源蛋白的进化过程。对高度柔性位点进行饱和突变的策略可以用于提高热稳定性。
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关键词
α-氨基酸酯水解酶
红纹黄单胞菌
序列分析
热稳定性
定点饱和突变
原文传递
题名
全细胞高通量筛选α-氨基酸酯水解酶突变体的方法
被引量:
2
1
作者
叶丽娟
王佳珉
王辂
曹毅
机构
四川大学生命科学院
中国医药集团总公司四川抗菌素工业研究所
出处
《微生物学通报》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第2期264-271,共8页
基金
"十二五"重大新药创制科技重大专项项目(No.2011ZX09401-403)
四川省国际科技合作与交流研究计划项目(No.2010HH0036)
成都市科技计划项目(No.10GGYB297SW-182)
文摘
【目的】建立高效敏感的高通量筛选方法,用于筛选头孢克洛合成活性提高或热稳定性提高的α-氨基酸酯水解酶。【方法】根据头孢克洛在碱性条件下水解生成的衍生物在340 nm处有特征吸收峰的原理,制作出标准曲线。采用全细胞96孔板紫外分光光度法高通量测定α-氨基酸酯水解酶突变体的头孢克洛合成活性。【结果】头孢克洛含量与△A340?405在(0.1?0.6)×10?3 mol/L浓度范围内有良好的线性关系,服从朗伯-比尔定律,平均回收率为99.8%?101.3%。一轮定点饱和突变产生的2 300个克隆经该方法的筛选,获得3株kcat提高40%以上,4株半失活温度较野生型提高5°C以上的突变体酶。【结论】该方法准确可靠,每天筛选量可达到2 000个反应,达到高通量筛选的要求。
关键词
α-氨基酸酯水解酶
头孢克洛
紫外分光光度法
全细胞高通量筛选
定向进化
Keywords
alpha
-
amino
acid
ester
hydrolase
Cefaclor
Ultra-violet
spectrophotometry
Cell-based
high
throughput
screening
Directed
evolution
分类号
R96 [医药卫生—药理学]
原文传递
题名
红纹黄单胞菌α-氨基酸酯水解酶的克隆、序列分析及热稳定性提高
被引量:
2
2
作者
王辂
叶丽娟
曹毅
机构
四川大学生命科学院
中国医药集团总公司四川抗菌素工业研究所
出处
《微生物学通报》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第10期1447-1456,共10页
基金
"十二五"重大新药创制科技重大专项(No.2011ZX09401-403)
四川省国际科技合作与交流研究计划项目(No.2010HH0036)
+1 种基金
四川省国际合作计划项目(No.2011HH0013)
成都市科技计划项目(No.10GGYB297SW-182)
文摘
【目的】克隆红纹黄单胞菌α-氨基酸酯水解酶基因全序列,对序列进行生物信息学分析,并提高酶的热稳定性。【方法】利用多聚酶链式反应(PCR)克隆α-氨基酸酯水解酶基因全序列;应用生物信息学软件对获得的基因序列及编码的蛋白序列进行分析;通过同源建模,预测红纹黄单胞菌α-氨基酸酯水解酶的三维结构;通过定点突变替换氨基酸序列中高度柔性的位点,提高该酶的热稳定性。【结果】从红纹黄单胞菌(Xanthomonas rubrillineans)中扩增得到α-氨基酸酯水解酶基因aeh(GenBank登录号JF744990),核苷酸序列长度1 917 bp,编码638个氨基酸。序列比对和同源性分析显示,该酶与白纹黄单胞菌Xanthomonas albilineans str.GPE PC73的肽酶及地毯草黄单胞菌Xanthomonas axono-podis pv. citri str. 306的戊二酰-7-氨基头孢烷酸酰化酶氨基酸序列相似性最高,分别为91%和83%,系统进化分析表明,该酶与白纹黄单胞菌Xanthomonas albilineans str. GPEPC73的肽酶亲缘性最高。基于预测的三维模型,对高度柔性的位点进行饱和突变,从282株突变体中筛选得到3株T50较野生型高5°C以上的突变体。【结论】对红纹黄单胞菌AEH的氨基酸序列分析有助于探索同源蛋白的进化过程。对高度柔性位点进行饱和突变的策略可以用于提高热稳定性。
关键词
α-氨基酸酯水解酶
红纹黄单胞菌
序列分析
热稳定性
定点饱和突变
Keywords
alpha
-
amino
acid
ester
hydrolase
Xanthomonas
rubrillineans
Sequence
analysis
Thermostability
Site-directed
saturated
mutagenesis
分类号
R914 [医药卫生—药物化学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
全细胞高通量筛选α-氨基酸酯水解酶突变体的方法
叶丽娟
王佳珉
王辂
曹毅
《微生物学通报》
CAS
CSCD
北大核心
2012
2
原文传递
2
红纹黄单胞菌α-氨基酸酯水解酶的克隆、序列分析及热稳定性提高
王辂
叶丽娟
曹毅
《微生物学通报》
CAS
CSCD
北大核心
2012
2
原文传递
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