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黄芩ARF基因家族生物信息学及表达分析 被引量：10
1
作者 陈媞颖 刘娟 +2 位作者 袁媛 周骏辉 黄璐琦 《药学学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第11期1770-1776,共7页
ARF转录因子在植物的生长发育中具有重要意义,是生长素信号传导途径中的重要转录因子。该研究通过生物信息学方法,从黄芩转录组中获得9个具有全长的ARF基因,分别对其核苷酸特性、蛋白质理化性质、亚细胞定位、二级结构、系统发育和基因... ARF转录因子在植物的生长发育中具有重要意义,是生长素信号传导途径中的重要转录因子。该研究通过生物信息学方法,从黄芩转录组中获得9个具有全长的ARF基因,分别对其核苷酸特性、蛋白质理化性质、亚细胞定位、二级结构、系统发育和基因表达情况进行分析。系统进化树结果显示,这9个黄芩的ARF分别与拟南芥、烟草、水稻中的ARF转录因子聚在一起。ARF基因相对表达分析发现:100μmol·L^(-1)赤霉素处理后,ARF1、ARF3、ARF4、ARF8、ARF20、ARF24表达量升高,ARF6、ARF18表达量降低;ARF基因在黄芩的花中具有较高的表达量;ARF基因与黄芩中黄酮类合成及调控基因的表达具有一定的相关性。本研究为进一步探讨ARF基因在黄芩中黄酮类成分积累的调控机制提供依据。 展开更多
关键词 黄芩 arf转录因子 生物信息学 表达分析
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苹果生长素响应因子MdARF5的克隆与功能鉴定 被引量：8
2
作者 安建平 宋来庆 +3 位作者 赵玲玲 由春香 王小非 郝玉金 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2018年第7期1345-1352,共8页
【目的】分离苹果生长素响应因子Md ARF5(Auxin Response Factor 5),分析其对生长素的响应,鉴定其在调节花青苷合成过程中的作用,揭示Md ARF5的生物学功能,为进一步研究生长素对花青苷的调节提供理论依据。【方法】以‘嘎拉’苹果(Malus... 【目的】分离苹果生长素响应因子Md ARF5(Auxin Response Factor 5),分析其对生长素的响应,鉴定其在调节花青苷合成过程中的作用,揭示Md ARF5的生物学功能,为进一步研究生长素对花青苷的调节提供理论依据。【方法】以‘嘎拉’苹果(Malus×domestica‘Royal Gala’)为材料,利用同源克隆技术,克隆得到一个ARF(Auxin Response Factor)转录因子,并将其命名为Md ARF5。利用MEGA5.0软件构建多物种间系统进化树。通过农杆菌介导的遗传转化获得转基因苹果愈伤组织。比较野生型和转基因苹果愈伤组织花青苷积累的差异。利用烟草叶片瞬时转化试验,分析Md ARF5对Md MYB1的转录调控。【结果】克隆获得苹果生长素响应因子Md ARF5(序列号:MDP0000143749),该基因CDS为2 691 bp,编码含有896个氨基酸的蛋白。系统进化树分析表明,苹果Md ARF5与梨Pb ARF5同源性最高。基因表达分析显示,该基因响应生长素处理,并且与花青苷合成相关基因表现出相反的表达模式。在苹果愈伤组织中超表达Md ARF5,其花青苷积累较野生型显著降低,表明Md ARF5在调控花青苷积累过程中发挥重要作用。对苹果Md MYB1启动子序列进行分析,发现其序列包含一个Md ARF5的结合位点。烟草瞬时表达试验显示,Md ARF5能够抑制Md MYB1的表达。【结论】推测苹果Md ARF5可能通过直接抑制Md MYB1的表达负调节花青苷的积累。 展开更多
关键词 苹果 生长素 arf转录因子 花青苷
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桑树ARF基因家族的鉴定与表达分析
3
作者 刘江 黄盖群 +9 位作者 代洁 曾益春 危玲 姚永权 佟万红 唐清霞 郑继川 李永远 莫西 刘刚 《蚕业科学》 CAS CSCD 北大核心 2023年第3期193-200,共8页
生长素响应因子(auxin response factor,ARF)是真核生物中普遍存在的转录因子之一,主要调控生长素应答基因的表达,与植物的生长发育和信号转导等多个生理过程密切相关。从桑树基因组数据库中共鉴定了16个ARF基因家族成员。理化性质分析... 生长素响应因子(auxin response factor,ARF)是真核生物中普遍存在的转录因子之一,主要调控生长素应答基因的表达,与植物的生长发育和信号转导等多个生理过程密切相关。从桑树基因组数据库中共鉴定了16个ARF基因家族成员。理化性质分析表明桑树ARF蛋白的氨基酸个数为606~1144,分子质量为67.35~127.75 kD,等电点为4.86~8.37,大部分表现为酸性且都为亲水蛋白。根据系统发育及蛋白质结构分析,可将桑树ARF成员分为4个亚家族,同一亚族中的成员具有相同保守基序及类似基因结构,ARF蛋白至少具备B3、Auxin_resp、AUX_IAA等结构域中的一种;表达模式分析表明,ARF基因在桑树的根、桑皮、叶、芽、花等组织中的时空表达存在显著差异,在芽中呈现较高的表达,这可能与桑树芽器官的细胞分化程度大密切相关;MnARF9、MnARF10、MnARF11、MnARF12、MnARF15和MnARF16等6个基因在桑芽不同发育阶段的转录水平呈逐渐下调趋势,表明这些基因可能在桑芽前期的生长发育和细胞分化等生理反应中发挥作用。上述结果为后续桑树ARF家族基因的功能和进化分析以及桑树分子育种及良种选育等研究工作提供了一定的理论基础。 展开更多
关键词 桑树 arf转录因子 生物信息学 基因表达
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杜鹃花ARFs转录因子RmARFgn的克隆和生物信息学分析 被引量：1
4
作者 李菲 《种子科技》 2017年第7期53-54,共2页
生长素是重要的植物激素,参与调控植物生长、发育和器官分化等几乎所有生理过程。生长素响应因子家族是生长素发挥调控功能的重要基因,在生长素信号传导过程中起重要的作用。从百里杜鹃景区广泛种植的高山杜鹃中克隆了一个ARF类转录因... 生长素是重要的植物激素,参与调控植物生长、发育和器官分化等几乎所有生理过程。生长素响应因子家族是生长素发挥调控功能的重要基因,在生长素信号传导过程中起重要的作用。从百里杜鹃景区广泛种植的高山杜鹃中克隆了一个ARF类转录因子基因,命名为RmARFgn。该基因编码蛋白含700个氨基酸,与水稻生长素早期响应基因OsARF1高度相似。通过调控RmARFgn基因在杜鹃花内的表达,可以控制杜鹃花的花期和器官形态。该研究为杜鹃花的发育调控打下了基础。 展开更多
关键词 杜鹃花 花器官 arf转录因子
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