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一株野鸭源禽副黏病毒6型的基因组特征分析
1
作者
丁雨
李旭勇
+5 位作者
陈璐
张昕悦
于晓慧
周婉婷
王静静
刘华雷
《中国动物检疫》
CAS
2024年第6期32-37,65,共7页
为了解我国野生水禽中禽副黏病毒6型(APMV-6)的生物学特性,对2020年分离的1株野鸭源APMV-6(Wild duck/Shandong/W683/2020)进行了基因组测序及序列分析。结果显示:该APMV-6分离株基因组为单股负链RNA,基因组长度为16230 nt,基因组结构为...
为了解我国野生水禽中禽副黏病毒6型(APMV-6)的生物学特性,对2020年分离的1株野鸭源APMV-6(Wild duck/Shandong/W683/2020)进行了基因组测序及序列分析。结果显示:该APMV-6分离株基因组为单股负链RNA,基因组长度为16230 nt,基因组结构为3'-N-P-M-F-SH-HN-L-5',3'前导序列和5'尾随序列长度分别为55、54 nt,各基因间隔序列长度不等(2~63 nt);与APMV-1疫苗株La Sota的R值为0.167,抗原性存在较大差异;F蛋白裂解位点为^(104)IREPR↓L^(109),具有典型低致病性APMV分子特征。同源性分析发现,与台湾分离株(MZ802803)同源性最高(96.0%),与其他血清型APMV同源性仅为63.1%~70.2%,与我国雁形目APMV-6分离株(MZ802803)位于同一分支。本研究为进一步了解我国野鸟源APMV-6基因组和生物学特性奠定了基础。
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关键词
禽副黏病毒
6
型
野鸭
基因组序列
下载PDF
职称材料
针对血清6型副黏病毒(APMV-6)快速荧光定量PCR检测方法的建立与初步应用
被引量:
1
2
作者
陶志
刘新鑫
+6 位作者
丁壮
杨莹莹
费亦东
陈严玉
李俊姣
鲁承
尹仁福
《中国兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第4期645-649,共5页
根据GenBank发表的6型副黏病毒(APMV6)参考毒株(KF267717.1)M基因序列,利用Oligo7设计合成1对引物,以重组阳性质粒为标准品,建立了APMV-6SYBRGreen实时荧光定量PCR检测方法。结果显示,建立的检测方法经优化后,线性关系良好,...
根据GenBank发表的6型副黏病毒(APMV6)参考毒株(KF267717.1)M基因序列,利用Oligo7设计合成1对引物,以重组阳性质粒为标准品,建立了APMV-6SYBRGreen实时荧光定量PCR检测方法。结果显示,建立的检测方法经优化后,线性关系良好,标准曲线R^2=0.998,扩增效率107.322%。本方法敏感度高,特异性强,重复性好,最低检出拷贝数为2.78×10^2copies/μL,与NDV和APMV-4不发生特异性反应,比常规检测方法检出率高18%,可将其用于APMV-6的定量检测以及临床早期快速诊断。
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关键词
禽副黏病毒
6
型
M基因
高效荧光定量PCR
原文传递
野鸭源6型副黏病毒V蛋白在DF-1细胞中的定位
3
作者
田志革
柴洪亮
+2 位作者
李凤勇
孙晶
华育平
《黑龙江畜牧兽医》
CAS
北大核心
2014年第9期5-7,226,共4页
为了研究副黏病毒V蛋白在DF-1细胞中的表达及定位情况,试验采用2011年对吉林省某湿地野鸭进行流行病学监测时分离、鉴定出的1株6型禽副黏病毒(APMV6),分析该病毒的全基因组序列,并通过融合PCR方法扩增V基因片段,并将该片段与pCDNA3.1载...
为了研究副黏病毒V蛋白在DF-1细胞中的表达及定位情况,试验采用2011年对吉林省某湿地野鸭进行流行病学监测时分离、鉴定出的1株6型禽副黏病毒(APMV6),分析该病毒的全基因组序列,并通过融合PCR方法扩增V基因片段,并将该片段与pCDNA3.1载体连接,获得pCDNA-6V重组表达质粒,转染DF-1细胞,经Western-blot分析和激光共聚焦显微镜观察。结果表明:pCDNA-6V融合蛋白在DF-1细胞中获得表达,且主要分布于细胞质中。说明副黏病毒V蛋白定位于宿主细胞质中。
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关键词
6
型副黏病毒
V蛋白
表达
定位
天然免疫
原文传递
题名
一株野鸭源禽副黏病毒6型的基因组特征分析
1
作者
丁雨
李旭勇
陈璐
张昕悦
于晓慧
周婉婷
王静静
刘华雷
机构
宁夏大学
中国动物卫生与流行病学中心
聊城大学
山东农业大学
河北工程大学
浙江农林大学
农业农村部动物生物安全风险预警及防控重点实验室(南方)
出处
《中国动物检疫》
CAS
2024年第6期32-37,65,共7页
基金
国家重点研发计划项目(2022YFD1800600)。
文摘
为了解我国野生水禽中禽副黏病毒6型(APMV-6)的生物学特性,对2020年分离的1株野鸭源APMV-6(Wild duck/Shandong/W683/2020)进行了基因组测序及序列分析。结果显示:该APMV-6分离株基因组为单股负链RNA,基因组长度为16230 nt,基因组结构为3'-N-P-M-F-SH-HN-L-5',3'前导序列和5'尾随序列长度分别为55、54 nt,各基因间隔序列长度不等(2~63 nt);与APMV-1疫苗株La Sota的R值为0.167,抗原性存在较大差异;F蛋白裂解位点为^(104)IREPR↓L^(109),具有典型低致病性APMV分子特征。同源性分析发现,与台湾分离株(MZ802803)同源性最高(96.0%),与其他血清型APMV同源性仅为63.1%~70.2%,与我国雁形目APMV-6分离株(MZ802803)位于同一分支。本研究为进一步了解我国野鸟源APMV-6基因组和生物学特性奠定了基础。
关键词
禽副黏病毒
6
型
野鸭
基因组序列
Keywords
apmv
-
6
wild duck
genome sequence
分类号
S855.3 [农业科学—临床兽医学]
下载PDF
职称材料
题名
针对血清6型副黏病毒(APMV-6)快速荧光定量PCR检测方法的建立与初步应用
被引量:
1
2
作者
陶志
刘新鑫
丁壮
杨莹莹
费亦东
陈严玉
李俊姣
鲁承
尹仁福
机构
延边大学农学院
吉林大学食品科学与工程学院
吉林大学动物医学学院
出处
《中国兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第4期645-649,共5页
基金
国家自然科学基金资助项目(31402195,31472195)
文摘
根据GenBank发表的6型副黏病毒(APMV6)参考毒株(KF267717.1)M基因序列,利用Oligo7设计合成1对引物,以重组阳性质粒为标准品,建立了APMV-6SYBRGreen实时荧光定量PCR检测方法。结果显示,建立的检测方法经优化后,线性关系良好,标准曲线R^2=0.998,扩增效率107.322%。本方法敏感度高,特异性强,重复性好,最低检出拷贝数为2.78×10^2copies/μL,与NDV和APMV-4不发生特异性反应,比常规检测方法检出率高18%,可将其用于APMV-6的定量检测以及临床早期快速诊断。
关键词
禽副黏病毒
6
型
M基因
高效荧光定量PCR
Keywords
apmv
-
6
M gene
efficient fluorescent quantitative PCR
分类号
S852.65 [农业科学—基础兽医学]
原文传递
题名
野鸭源6型副黏病毒V蛋白在DF-1细胞中的定位
3
作者
田志革
柴洪亮
李凤勇
孙晶
华育平
机构
东北林业大学野生动物资源学院
出处
《黑龙江畜牧兽医》
CAS
北大核心
2014年第9期5-7,226,共4页
基金
中央高校基本科研业务费专项(2572014AA03)
林业公益性行业科研专项(201404404)
国家林业局野生动物疫原疫病监测项目(201003)
文摘
为了研究副黏病毒V蛋白在DF-1细胞中的表达及定位情况,试验采用2011年对吉林省某湿地野鸭进行流行病学监测时分离、鉴定出的1株6型禽副黏病毒(APMV6),分析该病毒的全基因组序列,并通过融合PCR方法扩增V基因片段,并将该片段与pCDNA3.1载体连接,获得pCDNA-6V重组表达质粒,转染DF-1细胞,经Western-blot分析和激光共聚焦显微镜观察。结果表明:pCDNA-6V融合蛋白在DF-1细胞中获得表达,且主要分布于细胞质中。说明副黏病毒V蛋白定位于宿主细胞质中。
关键词
6
型副黏病毒
V蛋白
表达
定位
天然免疫
Keywords
avian paramyxovirus type
6
(
apmv
6
)
V protein
expression
localization
innate immune
分类号
S852.659.5 [农业科学—基础兽医学]
S858.32 [农业科学—兽医学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
一株野鸭源禽副黏病毒6型的基因组特征分析
丁雨
李旭勇
陈璐
张昕悦
于晓慧
周婉婷
王静静
刘华雷
《中国动物检疫》
CAS
2024
0
下载PDF
职称材料
2
针对血清6型副黏病毒(APMV-6)快速荧光定量PCR检测方法的建立与初步应用
陶志
刘新鑫
丁壮
杨莹莹
费亦东
陈严玉
李俊姣
鲁承
尹仁福
《中国兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2018
1
原文传递
3
野鸭源6型副黏病毒V蛋白在DF-1细胞中的定位
田志革
柴洪亮
李凤勇
孙晶
华育平
《黑龙江畜牧兽医》
CAS
北大核心
2014
0
原文传递
已选择
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