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芒果AP1同源基因的克隆及其生物信息学分析
被引量：
17
1
作者
罗聪
何新华
+3 位作者
陈虎
蒋雅琴
高美萍
李杨瑞
《基因组学与应用生物学》
CAS
CSCD
北大核心
2009年第5期851-858,共8页
我们采用RT-PCR方法克隆了2个A州同源基因全长cDNA，分别命名为MAPl—1（GenBankac—cession No．FJ529206）和MAPl—2（GenBankaccession No．FJ529207）。MAPl—1编码247个氨基酸，开放阅读框长度为741bp，蛋白质分子量为28．54kD，...
我们采用RT-PCR方法克隆了2个A州同源基因全长cDNA，分别命名为MAPl—1（GenBankac—cession No．FJ529206）和MAPl—2（GenBankaccession No．FJ529207）。MAPl—1编码247个氨基酸，开放阅读框长度为741bp，蛋白质分子量为28．54kD，等电点为8．31；MAPl—2编码248个氨基酸，开放阅读框长度为744bp，蛋白质分子量为28．78kD，等电点为8．70。同源性分析表明，它们的核苷酸序列与其它木本植物A纠同源基因的一致性为72％～81％。实验分析表明，MAPl—1和MAPl—2第1至第61个氨基酸含有一个MADS盒结构域，第88至第178个为K盒结构域；两个基因均定位于细胞核，且功能位点分布存在着不同，推测这两个基因在花器官发育过程中的功能存在差异。蛋白二级结构预测显示，MAPl—1蛋白有12个α-螺旋，4个8折叠区，14个β-转角；而MAP1—2蛋白有11个α-螺旋，5个B折叠区，15个β-转角；其大多数氨基酸具有亲水性。本研究有助于进一步了解芒果的开花分子机理及成花的生物学发育阶段。
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关键词
芒果
ap
1(
apetala
1)
基因
克隆
生物信息学分析
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职称材料
植物AP1基因研究进展(综述)
被引量：
9
2
作者
丁峰
彭宏祥
+4 位作者
李鸿莉
朱建华
秦献泉
沈庆庆
何新华
《亚热带植物科学》
2011年第1期85-89,共5页
AP1(APETALA1)基因属于植物花分生组织特征基因和花器官形态特征基因,在控制植物花分生组织特性与花器官的形成过程中起着重要的作用。本文综述了近年来植物AP1基因结构、功能、表达调节及其与物种进化关系研究的新进展,并对其在果树上...
AP1(APETALA1)基因属于植物花分生组织特征基因和花器官形态特征基因,在控制植物花分生组织特性与花器官的形成过程中起着重要的作用。本文综述了近年来植物AP1基因结构、功能、表达调节及其与物种进化关系研究的新进展,并对其在果树上的应用研究进行分析和展望。
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关键词
ap
1(
apetala
1)
基因
花分生组织特征
基因
花器官形态特征
基因
同源
基因
克隆
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职称材料
Y系山定子AP1同源基因的克隆及序列分析
被引量：
6
3
作者
王娟
田建保
+4 位作者
杜俊杰
杨廷桢
王骞
孙俊杰
弓桂花
《华北农学报》
CSCD
北大核心
2014年第5期66-70,共5页
以Y系山定子为试材研究AP1基因,试图为缩短果树童期提供理论依据。根据已登录的苹果AP1基因保守序列设计引物,以Y系山定子的基因组DNA为模板进行PCR扩增,获得1 010 bp的基因片段;PCR产物纯化后,将其连接到pMD18-T载体上,连接产物转化大...
以Y系山定子为试材研究AP1基因,试图为缩短果树童期提供理论依据。根据已登录的苹果AP1基因保守序列设计引物,以Y系山定子的基因组DNA为模板进行PCR扩增,获得1 010 bp的基因片段;PCR产物纯化后,将其连接到pMD18-T载体上,连接产物转化大肠杆菌DH5α菌株感受态细胞,通过蓝白斑筛选、质粒长度和酶切鉴定,获得重组质粒并测序。测序结果表明,该序列有2个外显子、1个内含子及2个内含子的一部分,编码区共编码81个氨基酸;对氨基酸序列保守性分析发现,第13-81个氨基酸为MADS-box基因家族特有的K区域;其氨基酸序列在GenBank中同源性检索表明,Y系山定子与其他植物AP1同源基因的氨基酸序列同源性为67.9%-100%。研究结果为揭示Y系山定子早花现象的分子机制奠定了基础,对果树育种具有重要的理论价值和实际意义。
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关键词
Y系山定子
ap
1(
apetala
1)
基因
PCR
克隆
序列分析
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职称材料
题名
芒果AP1同源基因的克隆及其生物信息学分析
被引量：
17
1
作者
罗聪
何新华
陈虎
蒋雅琴
高美萍
李杨瑞
机构
广西大学农学院
广西作物遗传改良与生物技术重点实验室
出处
《基因组学与应用生物学》
CAS
CSCD
北大核心
2009年第5期851-858,共8页
基金
广西自然科学基金(桂科自0542022)
广西科学基金应用基础研究专项(桂科基0731040)
广西大学科研基金(20090042)共同资助
文摘
我们采用RT-PCR方法克隆了2个A州同源基因全长cDNA，分别命名为MAPl—1（GenBankac—cession No．FJ529206）和MAPl—2（GenBankaccession No．FJ529207）。MAPl—1编码247个氨基酸，开放阅读框长度为741bp，蛋白质分子量为28．54kD，等电点为8．31；MAPl—2编码248个氨基酸，开放阅读框长度为744bp，蛋白质分子量为28．78kD，等电点为8．70。同源性分析表明，它们的核苷酸序列与其它木本植物A纠同源基因的一致性为72％～81％。实验分析表明，MAPl—1和MAPl—2第1至第61个氨基酸含有一个MADS盒结构域，第88至第178个为K盒结构域；两个基因均定位于细胞核，且功能位点分布存在着不同，推测这两个基因在花器官发育过程中的功能存在差异。蛋白二级结构预测显示，MAPl—1蛋白有12个α-螺旋，4个8折叠区，14个β-转角；而MAP1—2蛋白有11个α-螺旋，5个B折叠区，15个β-转角；其大多数氨基酸具有亲水性。本研究有助于进一步了解芒果的开花分子机理及成花的生物学发育阶段。
关键词
芒果
ap
1(
apetala
1)
基因
克隆
生物信息学分析
Keywords
Mango （Mangifera indica）, A Pl （A PETA LAl） gene, Cloning, Bioinformatic analysis
分类号
S667.7 [农业科学—果树学]
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职称材料
题名
植物AP1基因研究进展(综述)
被引量：
9
2
作者
丁峰
彭宏祥
李鸿莉
朱建华
秦献泉
沈庆庆
何新华
机构
广西大学农学院
广西农业科学院园艺研究所
出处
《亚热带植物科学》
2011年第1期85-89,共5页
基金
国家荔枝产业技术体系育种岗位(nycytx-32)
农业部热带作物种质资源保护项目(09RZZY-26)
文摘
AP1(APETALA1)基因属于植物花分生组织特征基因和花器官形态特征基因,在控制植物花分生组织特性与花器官的形成过程中起着重要的作用。本文综述了近年来植物AP1基因结构、功能、表达调节及其与物种进化关系研究的新进展,并对其在果树上的应用研究进行分析和展望。
关键词
ap
1(
apetala
1)
基因
花分生组织特征
基因
花器官形态特征
基因
同源
基因
克隆
Keywords
ap
I（
apetala
1） genes
floral meristem spcific genes
floral organ morphology genes
homologous gene cloning
分类号
Q812 [生物学—生物工程]
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职称材料
题名
Y系山定子AP1同源基因的克隆及序列分析
被引量：
6
3
作者
王娟
田建保
杜俊杰
杨廷桢
王骞
孙俊杰
弓桂花
机构
山西省农业科学院果树研究所
山西农业大学园艺学院
出处
《华北农学报》
CSCD
北大核心
2014年第5期66-70,共5页
文摘
以Y系山定子为试材研究AP1基因,试图为缩短果树童期提供理论依据。根据已登录的苹果AP1基因保守序列设计引物,以Y系山定子的基因组DNA为模板进行PCR扩增,获得1 010 bp的基因片段;PCR产物纯化后,将其连接到pMD18-T载体上,连接产物转化大肠杆菌DH5α菌株感受态细胞,通过蓝白斑筛选、质粒长度和酶切鉴定,获得重组质粒并测序。测序结果表明,该序列有2个外显子、1个内含子及2个内含子的一部分,编码区共编码81个氨基酸;对氨基酸序列保守性分析发现,第13-81个氨基酸为MADS-box基因家族特有的K区域;其氨基酸序列在GenBank中同源性检索表明,Y系山定子与其他植物AP1同源基因的氨基酸序列同源性为67.9%-100%。研究结果为揭示Y系山定子早花现象的分子机制奠定了基础,对果树育种具有重要的理论价值和实际意义。
关键词
Y系山定子
ap
1(
apetala
1)
基因
PCR
克隆
序列分析
Keywords
Y series Malus baccata
ap
1（
apetala
1） gene
PCR
Cloning
Sequence analysis
分类号
Q78 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
芒果AP1同源基因的克隆及其生物信息学分析
罗聪
何新华
陈虎
蒋雅琴
高美萍
李杨瑞
《基因组学与应用生物学》
CAS
CSCD
北大核心
2009
17
下载PDF
职称材料
2
植物AP1基因研究进展(综述)
丁峰
彭宏祥
李鸿莉
朱建华
秦献泉
沈庆庆
何新华
《亚热带植物科学》
2011
9
下载PDF
职称材料
3
Y系山定子AP1同源基因的克隆及序列分析
王娟
田建保
杜俊杰
杨廷桢
王骞
孙俊杰
弓桂花
《华北农学报》
CSCD
北大核心
2014
6
下载PDF
职称材料
已选择
0
条
导出题录
引用分析
参考文献
引证文献
统计分析
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