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基于Topomer CoMFA技术的AKR1C3选择性抑制剂的研究
1
作者
吴峥
吴伟俊
+3 位作者
覃文亭
覃馨玉
邵侃
何温靖
《化学研究与应用》
CAS
北大核心
2023年第2期370-378,共9页
醛酮还原酶(AKR1C3)是治疗去势抵抗性前列腺癌(CRPC)的重要靶点,寻找高选择性的AKR1C3抑制剂是该靶点研究的热点和难点。本文采用Topomer CoMFA技术,对46个AKR1C3选择性抑制剂进行三维定量构效关系研究,得到3D-QSAR模型,其交互验证系数q...
醛酮还原酶(AKR1C3)是治疗去势抵抗性前列腺癌(CRPC)的重要靶点,寻找高选择性的AKR1C3抑制剂是该靶点研究的热点和难点。本文采用Topomer CoMFA技术,对46个AKR1C3选择性抑制剂进行三维定量构效关系研究,得到3D-QSAR模型,其交互验证系数q2为0.59,非交叉相关系数r^(2)为0.918,主成分数N为5,q^(2)_(p red)为0.98,结果表明该模型有较好的预测能力。采用Topomer Search技术在Decoy数据库中进行R基团的筛选,选择RN值最大的10个Ra片段和8个Rb片段进行拼接,获得7个活性预测值高于模板分子,3个活性预测值与模板分子相当的化合物。最后,用分子对接技术研究所设计的新化合物与AKR1C3的作用模式,发现化合物N05和N06可以同时与关键酶催化位点(OS)和选择性口袋SP1中的氨基酸残基Tyr55和Asn167发生作用,说明所设计的AKR1C3抑制剂具有较高的AKR1C3选择性。
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关键词
akr
1
c
3
抑制剂
Topomer
c
oMFA
Topomer
Sear
c
h
分子对接
下载PDF
职称材料
3-氨磺酰苯甲酸类AKR1C3抑制剂的3D-QSAR和分子对接研究
被引量：
3
2
作者
吴建军
马玉卓
+1 位作者
戴雪娥
刘鹰翔
《化学通报》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第8期709-709,共1页
醛酮还原酶1C3(AKR1C3)作为治疗前列腺癌的新靶点已成为研究热点,3-氨磺酰苯甲酸衍生物对其具有高效的选择性和抑制活性。本文采用比较分子场分析(COMFA)和比较分子相似性指数分析(COMSIA)方法,将经分子对接后的34个优势构象组成训练集...
醛酮还原酶1C3(AKR1C3)作为治疗前列腺癌的新靶点已成为研究热点,3-氨磺酰苯甲酸衍生物对其具有高效的选择性和抑制活性。本文采用比较分子场分析(COMFA)和比较分子相似性指数分析(COMSIA)方法,将经分子对接后的34个优势构象组成训练集和11个优势构象组成测试集,构建三维定量构效关系(3D-QSAR)模型。COMFA模型的交叉验证系数(q2),非交叉验证系数(R2),标准偏差(SEE)和F值分别为0.761,0.973,0.122,185.963;自举法回归系数为R2bs=0.98。最佳组合COMSIA模型的q2,R2,SEE,F和R2bs分别为0.734,0.984,0.097,147.850,0.994。COMFA和COMSIA模型的系统外部测试R2pred分别为0.864和0.756,r2m分别为0.8127和0.5377。这些结果表明,所建立的QSAR模型具有较高的可靠性和较强预测能力。经三维等势图分析可知,在2、5或6位适当增加取代基体积,或在5位引入氢键受体,或在7位引入负电性取代基则能提高化合物的生物活性。该模型为进一步设计具有更优选择性和活性的化合物提供了理论依据。
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关键词
3
-氨磺酰基苯甲酸衍生物
akr
1
c
3
抑制剂
分子对接
c
OMFA
c
OMSIA
原文传递
题名
基于Topomer CoMFA技术的AKR1C3选择性抑制剂的研究
1
作者
吴峥
吴伟俊
覃文亭
覃馨玉
邵侃
何温靖
机构
广西医科大学药学院
出处
《化学研究与应用》
CAS
北大核心
2023年第2期370-378,共9页
基金
大学生创新创业训练项目(X2022210598280)资助
广西医科大学“未来学术之星”项目(WLXSZX22078)资助。
文摘
醛酮还原酶(AKR1C3)是治疗去势抵抗性前列腺癌(CRPC)的重要靶点,寻找高选择性的AKR1C3抑制剂是该靶点研究的热点和难点。本文采用Topomer CoMFA技术,对46个AKR1C3选择性抑制剂进行三维定量构效关系研究,得到3D-QSAR模型,其交互验证系数q2为0.59,非交叉相关系数r^(2)为0.918,主成分数N为5,q^(2)_(p red)为0.98,结果表明该模型有较好的预测能力。采用Topomer Search技术在Decoy数据库中进行R基团的筛选,选择RN值最大的10个Ra片段和8个Rb片段进行拼接,获得7个活性预测值高于模板分子,3个活性预测值与模板分子相当的化合物。最后,用分子对接技术研究所设计的新化合物与AKR1C3的作用模式,发现化合物N05和N06可以同时与关键酶催化位点(OS)和选择性口袋SP1中的氨基酸残基Tyr55和Asn167发生作用,说明所设计的AKR1C3抑制剂具有较高的AKR1C3选择性。
关键词
akr
1
c
3
抑制剂
Topomer
c
oMFA
Topomer
Sear
c
h
分子对接
Keywords
akr
1
c
3
inhibitors
Topomer
c
oMFA
Topomer
sear
c
h
mole
c
ular
do
c
king
分类号
O641 [理学—物理化学]
下载PDF
职称材料
题名
3-氨磺酰苯甲酸类AKR1C3抑制剂的3D-QSAR和分子对接研究
被引量：
3
2
作者
吴建军
马玉卓
戴雪娥
刘鹰翔
机构
广东药学院药科学院
广州中医药大学中药学院
出处
《化学通报》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第8期709-709,共1页
文摘
醛酮还原酶1C3(AKR1C3)作为治疗前列腺癌的新靶点已成为研究热点,3-氨磺酰苯甲酸衍生物对其具有高效的选择性和抑制活性。本文采用比较分子场分析(COMFA)和比较分子相似性指数分析(COMSIA)方法,将经分子对接后的34个优势构象组成训练集和11个优势构象组成测试集,构建三维定量构效关系(3D-QSAR)模型。COMFA模型的交叉验证系数(q2),非交叉验证系数(R2),标准偏差(SEE)和F值分别为0.761,0.973,0.122,185.963;自举法回归系数为R2bs=0.98。最佳组合COMSIA模型的q2,R2,SEE,F和R2bs分别为0.734,0.984,0.097,147.850,0.994。COMFA和COMSIA模型的系统外部测试R2pred分别为0.864和0.756,r2m分别为0.8127和0.5377。这些结果表明,所建立的QSAR模型具有较高的可靠性和较强预测能力。经三维等势图分析可知,在2、5或6位适当增加取代基体积,或在5位引入氢键受体,或在7位引入负电性取代基则能提高化合物的生物活性。该模型为进一步设计具有更优选择性和活性的化合物提供了理论依据。
关键词
3
-氨磺酰基苯甲酸衍生物
akr
1
c
3
抑制剂
分子对接
c
OMFA
c
OMSIA
Keywords
3
-Sulfamoylbenzoi
c
a
c
id
derivatives,
akr
1
c
3
inhibitors
,
Mole
c
ular
do
c
king,
c
OMFA,
c
OMSIA
分类号
R91 [医药卫生—药学]
O621.13 [理学—有机化学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于Topomer CoMFA技术的AKR1C3选择性抑制剂的研究
吴峥
吴伟俊
覃文亭
覃馨玉
邵侃
何温靖
《化学研究与应用》
CAS
北大核心
2023
0
下载PDF
职称材料
2
3-氨磺酰苯甲酸类AKR1C3抑制剂的3D-QSAR和分子对接研究
吴建军
马玉卓
戴雪娥
刘鹰翔
《化学通报》
CAS
CSCD
北大核心
2015
3
原文传递
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统计分析
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