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基于双目立体视觉的植物三维重建系统 被引量:14
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作者 殷悦 张慧春 郑加强 《中国农机化学报》 北大核心 2021年第3期129-135,共7页
为推进农林业科技发展,将虚拟现实的三维重建技术进一步应用于农林业领域将受到更加广泛的关注。本文通过拍摄两幅不同视角的拟南芥图片来获得二维图像信息转换为三维信息,重建出三维模型,并建立人机交互系统。选择双目立体视觉系统来... 为推进农林业科技发展,将虚拟现实的三维重建技术进一步应用于农林业领域将受到更加广泛的关注。本文通过拍摄两幅不同视角的拟南芥图片来获得二维图像信息转换为三维信息,重建出三维模型,并建立人机交互系统。选择双目立体视觉系统来进行拍摄不同视角的拟南芥图片,采用相机标定参数对获取的图像进行畸变校正和极线校正,同时对图像进行图像分割。然后选择SURF特征检测算法和SIFT特征匹配算法进行特征检测匹配,将匹配后得到的拟南芥的二维数据转换为空间三维坐标,使用三角剖分算法和纹理映射方法得到了拟南芥三维逼真模型。最终得到了具有592个空间点的拟南芥的三维模型,并建立了基于机器视觉技术的模式植物虚拟生长模型的人机交互系统。通过对多盆拟南芥进行建模和参数验证,拟南芥叶片长度、宽度和茎秆长度的软件测量值与真实值之间的相关系数R 2分别为0.9404,0.974,0.9862,且软件测量值都在真实值的5%误差线范围以内。表明本文重建的拟南芥模型稳定性和可靠度都较高。 展开更多
关键词 三维重建 双目立体视觉 表型 拟南芥
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Gene mutations and clinical phenotypes in 15 Chinese children with cryopyrin-associated periodic syndrome(CAPS) 被引量:10
2
作者 Caifeng Li Xiaohua Tan +6 位作者 Junmei Zhang Shipeng Li Wenxiu Mo Tongxin Han Weiying Kuang Yifang Zhou Jianghong Deng 《Science China(Life Sciences)》 SCIE CAS CSCD 2017年第12期1436-1444,共9页
The aim of our study is to explore the features of clinical manifestations and genetic mutations in Chinese CAPS patients. Fifteen confirmed patients with CAPS were enrolled. The onset time ranges from 2 days after bi... The aim of our study is to explore the features of clinical manifestations and genetic mutations in Chinese CAPS patients. Fifteen confirmed patients with CAPS were enrolled. The onset time ranges from 2 days after birth to 6 years and 1 month. Recurrent urticaria rash(93.3%) with fever(100%) were two dominant characteristics of these patients that were presented as either acute or chronic process. Systemic involvements were found in all patients except for one with only rash and fever. The top three symptoms were fever(100%), rash(93.3%) and myalgia(76%). Other clinical manifestations include arthritis(11 cases), lung involvement(seven cases), optical dysfunction(seven cases), nerve deafness(six cases), nervous system involvement(five cases), hepatomegaly, splenomegaly and lymphadenectasis(five cases). Also, four patients had heart involvement and one patient suffered kidney involvement. The laboratory inflammation index such as leukocyte counts, platelet counts, erythrocyte sedimentation rate(ESR), C-reactive protein(CRP), serum amyloid A(SAA) and fibrinogen(FIB) increased significantly at initial stage, but decreased after therapy. As for gene mutation detection, Twelve out of 15 patients were confirmed with mutation in NLRP3, including 11 mutant site: c1789 A>G, c.1703 T>A, c.913 G>A, c.1710 G>C, c.1057 G >T, c.2335 C>T, c.932 T>C,c.296 G>C, c.663 C>T, t.1702 T>A, 299 G>A. Mutation sites c.1703 T>A, c.2335 C>T, c.296 G>C, c.663 C>T, and 299 G>A were newly identified. The association between gene mutation and clinical manifestation shows that D305 N was highly associated with severe organs involvements, and therefore, the time of therapy and regimen were critical for the prognosis of disease. As the largest cohort study of Chinese CAPS patients, we confirmed that all patients presented typical clinical manifestations, identified five new mutation sites on NLRP3 and analyzed the correlation between the genotypes and phenotypes. We also raise concerns for one case with serious conditions that only had two nonsen 展开更多
关键词 CAPS genetic mutation clinical phenotTpe NLRP3
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桥粒芯糖蛋白抗体与天疱疮临床表型和疾病活动度的关系及其变化规律 被引量:9
3
作者 李锁 李志量 +4 位作者 荆可 向睿宇 张寒梅 冯素英 林麟 《中华皮肤科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2019年第5期297-301,共5页
目的评估酶联免疫吸附试验(ELISA)检测桥粒芯糖蛋白1(Dsg1)、Dsg3抗体与天疱疮患者临床表型、疾病活动度的关系及变化规律。方法收集2015年1月至2018年1月在中国医学科学院皮肤病医院就诊的天疱疮患者111例,按临床分型,采用ELISA测定患... 目的评估酶联免疫吸附试验(ELISA)检测桥粒芯糖蛋白1(Dsg1)、Dsg3抗体与天疱疮患者临床表型、疾病活动度的关系及变化规律。方法收集2015年1月至2018年1月在中国医学科学院皮肤病医院就诊的天疱疮患者111例,按临床分型,采用ELISA测定患者初发时、控制阶段、维持阶段及复发时血清Dsg1、Dsg3抗体水平变化,并分析其变化规律。采用SPSS22软件,多组间比较采用单因素方差分析,组间两两比较采用LSD-t检验,结果天疱疮初发时、控制阶段、维持阶段及复发时分别有92例、53例、33例、9例患者完成检测。92例初发患者中,36例落叶型天疱疮患者Dsg1和Dsg3抗体水平阳性率分别为100%277%,10例黏膜型寻常型天疱疮分别为20%、80%,46例黏膜皮肤型寻常型天疱疮分别为97.82%、95.65%。初发时、控制阶段、维持阶段和复发时落叶型天疱疮患者Dsg1抗体水平分别为(137.43±77.74)/13.94±14.81),(21.50±58.33)、(121.13±86.89)U/ml;黏膜型寻常型天疱疮患者Dsg3抗体水平分别为(125.61±94.81),(34.5±16.26)、0.6、258U/ml;黏膜皮肤型寻常型天疱疮患者Dsg1抗体水平分别为(115.39±70.62)、(15.74±25.10)、(3.62±12.09)、(78.60±92.25)U/ml;Dsg3抗体水平分别为(137.98±81.25)、(58.14±63.46)、(29.26±64.70)、(136.9±101.47)U/ml。落叶型天疱疮Dsg1抗体水平和黏膜型寻常型天疱疮、黏膜皮肤型寻常型天疱疮Dsg3抗体水平在控制阶段、维持阶段均低于初发时、复发时(P<0.05),治疗过程中2例患者出现表位扩展现象,4例患者病情稳定期时出现Dsg抗体高滴度现象:结论Dsg抗体谱与天疱疮临床表型相关,其ELISA值可用于监测疾病活动,并可对治疗的有效性作出评价。 展开更多
关键词 天疱疮 桥粒芯糖蛋白质1 桥粒芯糖蛋片质3 临床表型 疾病活动度
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CADASIL的临床和影像学特征 被引量:7
4
作者 侯晓夏 孙美 程虹 《国际脑血管病杂志》 2017年第8期739-744,共6页
伴皮质下梗死和白质脑病的常染色体显性遗传性脑动脉病( cerebral autosomal dominant arteriopathy with subcortical infarcts and leukoencephalopathy, CADASIL)是最常见的单基因遗传性脑小血管病,以偏头痛、反复发作性皮质下缺... 伴皮质下梗死和白质脑病的常染色体显性遗传性脑动脉病( cerebral autosomal dominant arteriopathy with subcortical infarcts and leukoencephalopathy, CADASIL)是最常见的单基因遗传性脑小血管病,以偏头痛、反复发作性皮质下缺血、进行性认知功能减退和情感障碍为主要特征。CADASIL的诊断依赖于典型的临床症状和神经影像学表现,并通过皮肤活检和基因检测确诊。近年来,在CADASIL的临床和影像学特征方面获得了一些新的认识,文章就此方面的研究进展进行了综述。 展开更多
关键词 CADASIL 卒中 受体 Notch3 突变 表型 磁共振成像 神经影像
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A糖基转移酶基因变异所致A_(3)表型1例的遗传学分析
5
作者 李敏曦 章旭 樊华 《中华医学遗传学杂志》 CAS CSCD 2024年第7期862-865,共4页
目的探讨1例A3表型个体的血清学特性和分子机制。方法选取2022年5月12日就诊于中国医科大学附属第四医院的1名27岁汉族女性作为研究对象。使用标准血清学方法检测其ABO血型,通过PCR扩增产物直接测序法鉴定ABO基因及第6~7外显子的单链序... 目的探讨1例A3表型个体的血清学特性和分子机制。方法选取2022年5月12日就诊于中国医科大学附属第四医院的1名27岁汉族女性作为研究对象。使用标准血清学方法检测其ABO血型,通过PCR扩增产物直接测序法鉴定ABO基因及第6~7外显子的单链序列,并使用生物信息学软件对变异位点进行分析。结果检测结果提示该个体为A3表型,其第6、7外显子存在c.261delG、c.467C>T和c.745C>T杂合变异。单链测序结果提示样本存在ABO*A3.07和ABO*O.01.01等位基因,其中ABO*A3.07等位基因在ABO*A1.02等位基因的背景下存在c.745C>T(p.R249W)变异。生物信息学分析预测c.745C>T(p.R249W)为可能有害变异,自由能变化(ΔΔG)值预测其可能影响蛋白稳定性。蛋白模拟模型提示p.R249W可造成α-1,3-N-乙酰半乳糖胺转移酶局部氢键网格的改变。结论α-1,3-N-乙酰半乳糖胺转移酶基因的c.745C>T(p.R249W)变异可能造成酶蛋白结构和功能的失稳,进而导致A抗原表达减弱。 展开更多
关键词 A_(3)亚型 α-1 3-N-乙酰半乳糖胺转移酶 分子机制 生物信息学分析
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基于单细胞测序数据分析养阴活胃合剂下调AQP3对MC细胞表型的影响及机制
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作者 智勇 谢姗珊 +1 位作者 邵昌明 曾斌芳 《新疆医科大学学报》 CAS 2024年第3期314-321,328,共9页
目的 观察养阴活胃合剂对MC细胞(MNNG诱导人胃黏膜上皮细胞GES-1恶性转化)增殖、迁移、侵袭及凋亡的影响,探讨其下调AQP3抑制IL-10/JAK1/STAT3信号通路激活进而阻断或逆转慢性萎缩性胃炎(CAG)病变的作用机制。方法 选取GEO数据库中的CA... 目的 观察养阴活胃合剂对MC细胞(MNNG诱导人胃黏膜上皮细胞GES-1恶性转化)增殖、迁移、侵袭及凋亡的影响,探讨其下调AQP3抑制IL-10/JAK1/STAT3信号通路激活进而阻断或逆转慢性萎缩性胃炎(CAG)病变的作用机制。方法 选取GEO数据库中的CAG单细胞转录组测序数据,绘制数据的表达矩阵。采用R语言的Seurat 4.3.0包进行处理后分群绘制UMAP可视化图谱。将MC细胞分为养阴活胃合剂组(YYHWM组)、AQP3低表达慢病毒转染组(AQP3低表达组)、养阴活胃合剂+AQP3高表达慢病毒转染组(YYHWM+AQP3高表达组)并以MC细胞和正常人胃黏膜上皮细胞GES-1分别作为模型组(MC组)和空白对照组(Control组)。采用平板克隆、划痕实验、Transwell及流式细胞术检测细胞表型变化情况,采用ELISA检测细胞培养上清IL-10表达水平,Western blot检测酪氨酸激酶1(JAK1)、信号转导和转录激活因子3(STAT3)蛋白表达水平。结果 单细胞测序数据集分析显示AQP3在CAG样本及上皮细胞群中表达升高,AQP3可能通过IL-10抗炎性信号通路影响胃癌前病变病理进程。与MC组相比,AQP3低表达组和YYHWM组细胞侵袭、迁移、增殖能力减弱,凋亡率增加,细胞培养上清中的IL-10水平降低,细胞中JAK1、STAT3蛋白表达下调(P<0.05或P<0.01),YYHWM+AQP3高表达组差异均不显著(P>0.05)。结论 养阴活胃合剂可通过下调AQP3表达抑制IL-10/JAK1/STAT3信号通路激活进而减弱MC细胞侵袭、迁移及增殖能力,促进细胞凋亡进而阻断或逆转CAG病理进程。 展开更多
关键词 养阴活胃合剂 MC细胞 细胞表型 AQP3 单细胞RNA测序
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MEX3A对结肠癌细胞恶性表型的影响及其机制研究
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作者 周俊邑 沙晓锋 +5 位作者 柳叶 韩卓莹 丁姝 黄豪 罗超 仲小敏 《现代肿瘤医学》 CAS 2024年第2期226-233,共8页
目的:探讨MEX3A在结肠癌组织中的表达及其对结肠癌细胞恶性表型的影响并探索其机制。方法:TCGA数据库分析MEX3A在结肠癌组织及正常组织中的差异表达及其与患者临床病理分期和预后的相关性,并通过免疫组化进一步验证。采用慢病毒对结肠... 目的:探讨MEX3A在结肠癌组织中的表达及其对结肠癌细胞恶性表型的影响并探索其机制。方法:TCGA数据库分析MEX3A在结肠癌组织及正常组织中的差异表达及其与患者临床病理分期和预后的相关性,并通过免疫组化进一步验证。采用慢病毒对结肠癌细胞中MEX3A的表达进行敲低,检测细胞的增殖、凋亡、迁移及侵袭能力。裸鼠皮下荷瘤后对肿瘤生长进行测量记录。Flag融合表达质粒过表达MEX3A后进行COIP实验。采用质谱进行蛋白质定性检测(Shotgun)与MEX3A互作的蛋白质。生物信息学分析后进行COIP验证,对互作蛋白表达进行挽救实验验证。结果:MEX3A在结肠癌组织中表达显著上调且与患者临床病理特征及预后相关。采用慢病毒敲减MEX3A表达后,结肠癌细胞增殖能力显著被抑制,凋亡则显著增加。细胞转移能力检测结果显示,结肠癌细胞的迁移及侵袭能力显著被抑制。小鼠体内实验结果表明,敲减MEX3A表达后,肿瘤在体内的生长明显被抑制。蛋白质定性检测及COIP验证结果显示,EIF2AK2、LAMB3及MSI2与MEX3A蛋白存在相互作用。在敲减MEX3A表达后分别过表达EIF2AK2、LAMB3及MSI2后细胞增殖能力被不同程度恢复,其中MSI2过表达后细胞增殖能力恢复最明显。MTT及细胞迁移能力验证结果显示过表达MSI2后,细胞增殖及迁移能力显著恢复。结论:MEX3A在结肠癌组织中表达上调且与患者预后呈负相关,其通过与MSI2相互作用促进结肠癌细胞的恶性表型。 展开更多
关键词 MEX3A 结肠癌 预后 恶性表型
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基于视觉三维重建的作物表型分析 被引量:6
8
作者 史维杰 张吴平 +3 位作者 郝雅洁 赵明霞 吕致 李富忠 《湖北农业科学》 2019年第16期125-128,共4页
采用基于图像序列的三维重建技术对作物小麦进行三维重建,通过对比不同处理下的三维点云,选择合适的处理方式对同一品种的不同植株进行三维重建;最后通过获取的作物三维模型对其进行表型测量。结果表明,重建出的三维模型在一定程度上可... 采用基于图像序列的三维重建技术对作物小麦进行三维重建,通过对比不同处理下的三维点云,选择合适的处理方式对同一品种的不同植株进行三维重建;最后通过获取的作物三维模型对其进行表型测量。结果表明,重建出的三维模型在一定程度上可以还原作物的真实结构,说明利用计算机视觉技术对作物进行表型测量是切实可行的,利用三维模型测量作物的表型对于育种是省时有效的。 展开更多
关键词 三维重建 植物表型 叶面积 SFM MVS
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罕见的A3亚型的血清学和分子生物学研究 被引量:5
9
作者 李茵 赵倩 +5 位作者 苏蔓 钱明明 乔芳 王远花 郭霞 王振雷 《临床血液学杂志》 CAS 2021年第2期109-111,共3页
目的:对罕见的A3亚型进行血清学检测和ABO基因测序,探讨其分子生物学特性以及血清型表型和基因型的关系。方法:应用常规血清学定型方法进行ABO正反定型;对4例正反定型不符样本的第6、7外显子运用PCR扩增后直接测序,确定其基因型。结果:... 目的:对罕见的A3亚型进行血清学检测和ABO基因测序,探讨其分子生物学特性以及血清型表型和基因型的关系。方法:应用常规血清学定型方法进行ABO正反定型;对4例正反定型不符样本的第6、7外显子运用PCR扩增后直接测序,确定其基因型。结果:3例血清学表型为A亚B,1例为A亚的样本其中一条单链序列与ABO*A1.01比对,发现其在467位和745位碱基均存在C>T的突变。结论:血清学和直接测序结果表明,此4例标本均包含罕见的ABO*A3.07等位基因。 展开更多
关键词 ABO亚型 A3亚型 血清型表型 基因测序
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小鼠脾细胞CD4^+ CD25^+调节性T细胞的表型特征 被引量:4
10
作者 杨滨燕 沈二霞 吴长有 《现代免疫学》 CAS CSCD 北大核心 2006年第3期208-212,共5页
观察CD4+CD25+T和CD4+CD25-T细胞的表型和细胞因子的表达。自小鼠脾脏制备单个细胞悬液,分离CD4+T细胞、CD4+CD25+和CD4+CD25-T细胞,进行细胞表面标记,激活后进行细胞内细胞因子染色,利用流式细胞仪在单个细胞水平上分析细胞表面分子、... 观察CD4+CD25+T和CD4+CD25-T细胞的表型和细胞因子的表达。自小鼠脾脏制备单个细胞悬液,分离CD4+T细胞、CD4+CD25+和CD4+CD25-T细胞,进行细胞表面标记,激活后进行细胞内细胞因子染色,利用流式细胞仪在单个细胞水平上分析细胞表面分子、转录因子和细胞因子表达之间的关系。结果:在CD4+T细胞中,约有7.8%的细胞同时表达CD25分子。与CD4+CD25-T细胞相比,CD4+CD25+T细胞CD44的表达略有增加,CD45RB的表达明显下降,CTLA-4和Foxp3明显增加。以同时表达CTLA-4和Foxp3的细胞为主,其次为单独表达Foxp3的细胞。细胞因子的研究结果表明,与CD4+CD25-T细胞相比,CD4+CD25+T细胞IL-2、IFN-γ明显减少,而只产生IL-10的细胞略有增加。CD4+CD25+调节性T细胞无论在表型、转录因子的表达以及细胞因子表达方面均于非调节性T细胞不同。 展开更多
关键词 CD4^+CD25^+T细胞 调节性T细胞 细胞表型 Foxp3 细胞因子
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Role of Whole-exome Sequencing in Phenotype Classification and Clinical Treatment of Pediatric Restrictive Cardiomyopathy 被引量:4
11
作者 Wen-Hong Ding Ling Han +4 位作者 Yah-Yah Xiao Ying Mo Jing Yang Xiao-Fang Wang Mei Jin 《Chinese Medical Journal》 SCIE CAS CSCD 2017年第23期2823-2828,共6页
Background: Restrictive cardiomyopathy (RCM) is the least common cardiomyopathy in which the walls are rigid and the heart is restricted from stretching and filling properly. Cardiac troponin I (cTnI) mutation-ca... Background: Restrictive cardiomyopathy (RCM) is the least common cardiomyopathy in which the walls are rigid and the heart is restricted from stretching and filling properly. Cardiac troponin I (cTnI) mutation-caused myofibril Ca2+ hypersensitivity has been shown to be associated with impaired diastolic function. This study aimed to investigate the linkage between the genotype and clinical therapy of RCM. Methods: Five sporadic pediatric RCM patients confirmed by echocardiography were enrolled in this study.Whole-exome sequencing (WES) was performed for the cohort to find out candidate causative gene variants. Sanger sequencing confirmed the WES-identified variants. Results: TNNI3 variants were found in all of the five patients. R192H mutation was shared in four patients while R204H mutation was found only in one patient. Structure investigation showed that the C terminus of TNNI3 was flexible and mutation on the C terminus was possible to cause the RCM. Catechins were prescribed for the five patients once genotype was confirmed. Ventricular diastolic function was improved in three patients during the follow-up. Conclusions: Our data demonstrated that TNNI3 mutation-induced RCM1 is the most common type of pediatric RCM in this study. In addition, WES is a reliable approach to identify likely pathogenic genes of RCM and might be useful for the guidance of clinical treatment scheme. 展开更多
关键词 Pediatric Restrictive Cardiomyopathy phenotype Classification TNNI3 Whole-exome Sequcncing
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α-1,3-N-乙酰半乳糖胺等位基因421T〉C突变导致A抗原弱表达 被引量:4
12
作者 王满妮 陈利萍 +3 位作者 吴大洲 左琴琴 叶世辉 徐华 《中华医学遗传学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2015年第1期105-108,共4页
目的探讨1例ABO血型系统A变异型的分子遗传学背景。方法采用血清学方法鉴定ABO血型,测定血浆α-1,3-N-乙酰半乳糖胺转移酶的活性,用PCR扩增AB0基因的7个外显子及启动子序列,测序分析第7外显子单倍体。结果先证者红细胞ABO血型为A弱... 目的探讨1例ABO血型系统A变异型的分子遗传学背景。方法采用血清学方法鉴定ABO血型,测定血浆α-1,3-N-乙酰半乳糖胺转移酶的活性,用PCR扩增AB0基因的7个外显子及启动子序列,测序分析第7外显子单倍体。结果先证者红细胞ABO血型为A弱表现型,AB0基因全编码区测序发现8处核苷酸杂合位点,分别为第6外显子的261delG缺失和297A/G、第7外显子的421c/T、467C/T、646T/A、681G/A、771C/T以及829G/A杂合变异。单链测序分析提示,其中1条为002等位基因,另一个等位基因除421T〉C和467C〉T突变外,其他变异位点与A101等位基因一致。421T〉C突变可导致A糖基转移酶第141位丝氨酸替换为脯氨酸(Serl41Pro)。结论产生弱A表型的原因可能是由于A糖基转移酶基因421T〉C突变引起编码的氨基酸改变,使α-1,3-N乙酰半乳糖胺转移酶活性减弱,导致A抗原弱表达。 展开更多
关键词 ABO血型 弱表现型 α-1 3 N-乙酰半乳糖胺基转移酶
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四种基因位点多态性与运动员耐力表型的关联 被引量:4
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作者 魏琦 范家成 杜亚雯 《中国组织工程研究》 CAS 北大核心 2018年第16期2508-2513,共6页
背景:研究表明至少有155个DNA位点多态性都与精英运动员的运动能力表型例如速度和耐力、肌肉力量等有关。目的:分析辅肌动蛋白3(ACTN3)基因、核呼吸因子2(NRF2)基因、β2肾上腺素能受体(ADRB2)基因及过氧化物酶体增殖受体γ共激活剂(PPA... 背景:研究表明至少有155个DNA位点多态性都与精英运动员的运动能力表型例如速度和耐力、肌肉力量等有关。目的:分析辅肌动蛋白3(ACTN3)基因、核呼吸因子2(NRF2)基因、β2肾上腺素能受体(ADRB2)基因及过氧化物酶体增殖受体γ共激活剂(PPARGC1A)基因4个基因位点多态性与赛艇运动员有氧能力表型关联及其相互效应,为探讨基因多态性位点作用于耐力表型的机制提供依据。方法:应用Case-Control实验设计,分析4个基因多态性位点在15名优秀赛艇运动员和50名普通大学新生对照组中的分布特征。运用基因型累加分值分析4个基因位点多态性与赛艇运动员有氧能力表型指标的关联。结果与结论:运动员组的辅肌动蛋白3基因、过氧物酶体受体γ共激活剂基因及核呼吸因子2基因位点耐力表现优势基因位点频率均高于对照组,且核呼吸因子2基因位点运动员组与对照组间有显著性差异。3组不同基因型总分运动员组的最大摄氧量均值之间有显著性差异。因此推论研究中3个基因位点多态性可能是预测优秀耐力运动员运动表型的分子标记,作用机制需要进一步验证探讨。 展开更多
关键词 基因 表型 组织工程 基因多态性 赛艇 辅肌动蛋白3基因 Β2肾上腺素能受体基因 过氧化物酶体增殖受体γ共激活剂基因 组织构建 核呼吸因子2基因 耐力表型 最大摄氧量 ACTN3 NRF2 ADRB2 PPARGC1A
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肥厚型心肌病家系中MYBPC3-D1149fs*40新发突变的基因型及临床表型研究
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作者 陆晓晨 曹鑫南 +4 位作者 许培曙 刘虎 顾漪 陈雨枫 盛红专 《同济大学学报(医学版)》 2023年第6期813-816,共4页
目的探讨肥厚型心肌病(hypertrophic cardiomyopathy,HCM)家系中新发现的MYBPC-D1149fs*40突变的基因型与临床表型关系。方法应用全外显子测序技术检测先证者与HCM相关的基因,采用Sanger测序验证可疑突变并筛查家系成员,进行基因型和临... 目的探讨肥厚型心肌病(hypertrophic cardiomyopathy,HCM)家系中新发现的MYBPC-D1149fs*40突变的基因型与临床表型关系。方法应用全外显子测序技术检测先证者与HCM相关的基因,采用Sanger测序验证可疑突变并筛查家系成员,进行基因型和临床表型共分离分析。利用ClustalX软件分析突变在不同物种间的保守性,使用SIFT、Polyphen_2等生物信息学软件预测该突变位点的致病性。结果本家系共筛查亲属7位,其中经临床确诊HCM患者3人,均表现为不对称性室间隔肥厚,平均室间隔厚度(16.1+1.2)mm,均不伴有流出道梗阻。确诊的3例均携带突变MYBPC3 c.3445(exon31)delG(p.Asp1149fs*40),在该家系的另4位临床表型正常的成员中未检测到相同突变位点。该突变在dbSNP、千人基因组等中均未见报道,种间保守性分析表明该突变氨基酸在多物种中高度保守,生物信息学分析预测此为有害突变。结论该家系中携带MYBPC3-D1149fs*40的成员均为HCM患者,另4位临床表型正常的成员未检测到该突变位点,推测该突变可能是该HCM家系的致病突变。 展开更多
关键词 心肌病 肥厚性 MYBPC3 基因型 表型
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Clinical features and genotype-phenotype correlation analysis in patients with ATL1 mutations:A literature reanalysis 被引量:4
15
作者 Guo-hua Zhao Xiao-min Liu 《Translational Neurodegeneration》 SCIE CAS 2017年第1期92-97,共6页
Background:The hereditary spastic paraplegias(HSPs)are a group of clinically and genetically heterogeneous disorders.Approximately 10% of the autosomal dominant(AD)HSPs(ADHSPs)have the spastic paraplegia 3A(SPG3A)geno... Background:The hereditary spastic paraplegias(HSPs)are a group of clinically and genetically heterogeneous disorders.Approximately 10% of the autosomal dominant(AD)HSPs(ADHSPs)have the spastic paraplegia 3A(SPG3A)genotype which is caused by ATL1 gene mutations.Currently there are more than 60 reported ATL1 gene mutations and the genotype-phenotype correlation remains unclear.The study aims to investigate the genotypephenotype correlation in SPG3A patients.Methods:We performed a reanalysis of the clinical features and genotype-phenotype correlations in 51 reported studies exhibiting an ATL1 gene mutation.Results:Most HSPs-SPG3A patients exhibited an early age at onset(AAO)of<10 years old,and showed an autosomal dominant pure spastic paraplegia.We found that 14% of the HSPs-SPG3A patients presented complicated phenotypes,with distal atrophy being the most common complicated symptom.The AAO of each mutation group was not statistically significant(P>0.05).The mutational spectrum associated with ATL1 gene mutation is wide,and most mutations are missense mutations,but do not involve the functional motif of ATL1 gene encoded atlastin-1 protein.Conclusions:Our findings indicate that there is no clear genotype-phenotype correlation in HSPs-SPG3A patients.We also find that exons 4,7,8 and 12 are mutation hotspots in ATL1 gene. 展开更多
关键词 Hereditary spastic paraplegia SPG3A Age at onset ATL1 MUTATION Genotype-phenotype correlation
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Effects of“Moxibustion Serum”on Proliferation and Phenotypes of Tumor Infiltrating Lymphocytes 被引量:4
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作者 陈云飞 赵粹英 +3 位作者 陈汉平 秦慧莲 方舫 王友京 《Journal of Traditional Chinese Medicine》 SCIE CAS CSCD 2003年第3期225-229,共5页
Tumor infiltrating lymphocytes (TIL) were cultured with “moxibustion serum”(MS), and the results were examined by flow cytometry. The results indicated that MS could enhance the proliferation of TIL,accelerate it to... Tumor infiltrating lymphocytes (TIL) were cultured with “moxibustion serum”(MS), and the results were examined by flow cytometry. The results indicated that MS could enhance the proliferation of TIL,accelerate it to reach the exponential growth phase, and assist recombinant interleukin 2 (rIL-2) to enhance successively the percentage of CD3^+ positive cells, maintain the number of CD4^+ positive T cells, promote greatly the percentage of CD8^+ positive T cells among TILs, and reverse the CD4^+/CD8^+ ratio. Such cooperative effects rely on relative specificity of acupoints. It is suggested that MS is beneficial to the growth of TIL both in the aspects of proliferation and phenotypes. 展开更多
关键词 ARTEMISIA Moxibustion Animals Antigens CD3 Blood CD4-CD8 Ratio Cell Division Culture Media Conditioned Drugs Chinese Herbal Female INTERLEUKIN-2 Lymphocytes Tumor-Infiltrating MICE Mice Inbred C57BL phenotype Recombinant Proteins Thymus Neoplasms Tumor Cells Cultured
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心脏型肌球蛋白结合蛋白C基因缺失突变导致肥厚型心肌病特点分析 被引量:4
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作者 王继征 张茵 +6 位作者 王怡璐 孙凯 王志民 周宪梁 宋雷 惠汝太 邹玉宝 《中国分子心脏病学杂志》 CAS 2012年第2期92-94,共3页
目的观察肥厚型心肌病(HCM)患者心脏型肌球蛋白结合蛋白C基因(MYBPC3)缺失突变及其表型的特点。方法在100例HCM患者中对MYBPC3的所有外显子及其侧翼内含子序列进行基因扫描,聚合酶链反应(PCR)扩增目的片段,双脱氧末段终止法测序。对突... 目的观察肥厚型心肌病(HCM)患者心脏型肌球蛋白结合蛋白C基因(MYBPC3)缺失突变及其表型的特点。方法在100例HCM患者中对MYBPC3的所有外显子及其侧翼内含子序列进行基因扫描,聚合酶链反应(PCR)扩增目的片段,双脱氧末段终止法测序。对突变患者进行家系调查,分析其表型特点。结果在两例先证者中分别发现两个缺失突变14262_14264delAAG和14364delG,均位于外显子25。表型分析发现两例先证者均有劳力性胸闷、胸痛和晕厥史,超声心动图表现为不对称性肥厚(室间隔/左室后壁分别为2.5、3.2),但SAM征阴性,发病年龄分别为38岁和29岁。结论缺失突变是MYBPC3基因突变的常见形式,14262_14264delAAG或14364delG突变导致的HCM表现为不对称性心肌肥厚,患者容易出现晕厥等症状,应该警惕心源性猝死的发生。 展开更多
关键词 肥厚型心肌病 心脏型肌球蛋白结合蛋白C 缺失突变 表型
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Involvement of micro RNA-718,a new regulator of EGR3,in regulation of malignant phenotype of HCC cells 被引量:3
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作者 Zhong-dong WANG Fan-yong QU +3 位作者 Yuan-yuan CHEN Zhang-shen RAN Hai-yan LIU Hai-dong ZHANG 《Journal of Zhejiang University-Science B(Biomedicine & Biotechnology)》 SCIE CAS CSCD 2017年第1期27-36,共10页
Objective: Hepatocellular carcinoma (HCC) is still one of the most common death-related malignancies worldwide. Because the way onset and progression are hidden most, HCC diagnoses are made at an advanced stage, wh... Objective: Hepatocellular carcinoma (HCC) is still one of the most common death-related malignancies worldwide. Because the way onset and progression are hidden most, HCC diagnoses are made at an advanced stage, when they are unsuitable for surgical resection. MicroRNAs are a class of small non-coding RNAs, participating in many aspects of cancers. In this study, we tried to establish the role of micreRNA-718 (miR-718) in the malignant phenotype of HCC cells and its possible role in HCC diagnosis. Methods: Here we first used a methylthiazolyldiphenyl- tetrazolium bromide (MTT) assay, Transwell migration and invasion assays, and colony formation assay to evaluate the impact of miR-718 on the malignant phenotypes of HCC cells. Then, we used bioinformatic methods to predict the target gene of miR-718 and used green fluorescence protein (GFP) reporter assay, Western blot, and quantitative real-time polymerase chain reaction (qRT-PCR) to validate the regulation relationship. Finally, we determined the role of the target gene in the HCC phenotype. Results: We found that the expression of miR-718 was significantly reduced in various HCC cell lines and HCC tissues. Re-expression of miR-718 significantly reduced the cellular viability and colony formation ability as well as inhibited the migration and invasion abilities of HCC cell lines. Early growth response protein 3 (EGR3) is a direct target of miR-718 and is negatively regulated by miR-718. EGR3 could increase the via- bility and proliferation of HCC cells, and promot the migration and invasion of HCC cells. Conclusions: miR-718 acts as a tumor suppressive microRNA in HCC via regulating the expression of EGR3, which may provide a new diagnostic 07) found that overexpreget for HCC. 展开更多
关键词 miR-718 MicroRNA Early growth response protein 3 (EGR3 Hepatocellular carcinoma (HCC) Malignant phenotype
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家族性肥厚型心肌病致病突变检测及基因型表型关联分析 被引量:3
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作者 杨坤璂 董雪琪 +7 位作者 肖嫣 张莹 孟旭 范鹏 刘亚欣 卢超霞 张学 周宪梁 《中国心血管杂志》 2017年第6期408-412,共5页
目的研究中国人家族性肥厚型心肌病的致病基因突变位点,分析其基因型与表型的关系。方法利用目标区域重测序技术,对一个中国肥厚型心肌病家系先证者的64个与遗传性心肌病相关的基因进行筛查。Sanger测序验证可疑突变位点并筛查家系成员... 目的研究中国人家族性肥厚型心肌病的致病基因突变位点,分析其基因型与表型的关系。方法利用目标区域重测序技术,对一个中国肥厚型心肌病家系先证者的64个与遗传性心肌病相关的基因进行筛查。Sanger测序验证可疑突变位点并筛查家系成员8例和正常个体100例,同时分析家系突变携带者4例的临床表型特点。结果本家系中包括先证者在内的4例存活家系成员携带MYBPC3基因c.1377del C突变,在100例正常对照中未发现此突变。携带者中有2例确诊为肥厚型心肌病,均表现为室间隔肥厚,另外2例为无症状携带者,心电图和超声心动图均未见异常。家系中有3例猝死,4例有晕厥史,3例发病年龄小于40岁,2例在40岁后发病。结论基因检测在肥厚型心肌病鉴别诊断和家系筛查中有重要的临床意义。 展开更多
关键词 心肌病 肥厚性 目标区域重测序 MYBPC3基因 基因型 表型 MYBPC3
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家族性肥厚型心肌病MYBPC3基因变异及其临床表型分析 被引量:3
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作者 林丽容 卢荔红 +5 位作者 胡雪群 谢张芯 蒋辉 戴佳珍 林宁宁 王热华 《临床心血管病杂志》 CAS 北大核心 2021年第6期557-560,共4页
目的:分析家族性肥厚型心肌病(FHCM)患者心脏肌球蛋白结合蛋白C3(MYBPC3)基因变异及其与临床表型的关系。方法:纳入2016—2018年于福建省立医院就诊的肥厚型心肌病(HCM)10个家系,通过二代测序筛选出携带MYBPC3基因变异的3个家系,收集家... 目的:分析家族性肥厚型心肌病(FHCM)患者心脏肌球蛋白结合蛋白C3(MYBPC3)基因变异及其与临床表型的关系。方法:纳入2016—2018年于福建省立医院就诊的肥厚型心肌病(HCM)10个家系,通过二代测序筛选出携带MYBPC3基因变异的3个家系,收集家系中携带MYBPC3基因变异患者的临床资料,包括家族史、临床表现、心电图及超声心动图,以进行基因型-表型关联分析。结果:3个家系共有19名家系成员,有2名家系成员猝死,8名家系成员携带有MYBPC3基因变异。其中两个家系携带MYBPC3基因c.3624delC杂合缺失变异;1个家系携带MYBPC3基因c.3369_3370insC变异,该家系其他家系成员携带ACTN2、CACNA1C、DTNA、TTN基因变异。在这3个家系中,4例患者在40岁以前发病,其中1例患者23岁时猝死;3例患者以室间隔增厚为主,合并左室流出道梗阻,4例患者室间隔及左室壁均有增厚但程度较轻,无左室流出道梗阻;1例患者合并心房颤动,2例患者有室性期前收缩。结论:MYBPC3基因不同位点的突变可导致FHCM,同一家族的HCM患者可能有不同的基因变异位点。MYBPC3基因c.3369_3370insC变异为首次发现的致病基因变异。与以前的报道不同,本研究发现有MYBPC3基因变异的HCM患者发病早,病情进展快,临床预后差。 展开更多
关键词 肥厚型心肌病 MYBPC3 临床表型 基因变异
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