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人A-to-I RNA编辑事件对外显子剪接增强子潜在影响的生物信息学分析 被引量：1
1
作者 艾鼎伦 何涛 +2 位作者 何涛涛 汪莉 王玉民 《生物技术通讯》 CAS 2010年第6期757-761,共5页
目的:研究人A-to-I RNA编辑事件对外显子剪接增强子(ESE)的潜在影响。方法:搜集文献报道的人A-to-I RNA编辑位点,并筛选包含有A-to-I RNA编辑位点的ESE,分析人A-to-I RNA编辑前后单碱基变化对ESE的潜在影响。结果:3640个A-to-I RNA编辑... 目的:研究人A-to-I RNA编辑事件对外显子剪接增强子(ESE)的潜在影响。方法:搜集文献报道的人A-to-I RNA编辑位点,并筛选包含有A-to-I RNA编辑位点的ESE,分析人A-to-I RNA编辑前后单碱基变化对ESE的潜在影响。结果:3640个A-to-I RNA编辑位点可能使其所在的ESE功能发生潜在改变;A-to-I RNA编辑事件对不同类型ESE的潜在影响不同。结论:A-to-I RNA编辑事件可能潜在影响ESE的功能,对ESE的潜在影响为量的调节,而非质的改变。 展开更多
关键词 A-to-irna编辑 外显子剪接增强子 潜在影响 生物信息学
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肿瘤中GLI1 RNA编辑的下调及其潜在功能分析 被引量：1
2
作者 张颖 胡亚欧 +4 位作者 何涛 侯小强 汪莉 张部昌 王玉民 《军事医学》 CAS CSCD 北大核心 2012年第4期267-271,275,共6页
目的检测癌相关基因GLI1编码区发生的A-to-I RNA编辑,比较编辑水平在肿瘤与正常细胞系中的差异,并分析编辑事件的潜在影响,以期揭示其与癌症发生发展的关联。方法通过PCR、RT-PCR及测序的方法检测GLI1编码区DNA和RNA序列上的差异,以此... 目的检测癌相关基因GLI1编码区发生的A-to-I RNA编辑,比较编辑水平在肿瘤与正常细胞系中的差异,并分析编辑事件的潜在影响,以期揭示其与癌症发生发展的关联。方法通过PCR、RT-PCR及测序的方法检测GLI1编码区DNA和RNA序列上的差异,以此来识别该区域上的A-to-I RNA编辑事件和比较肿瘤与正常细胞系中编辑位点的编辑水平差异。使用多种生物信息学工具分析编辑事件的潜在功能影响。结果在人脑、乳腺、小肠组织及多种细胞系中均检测到GLI1转录本上对应染色体12∶56150891的位置发生A-to-I RNA编辑,该编辑事件导致GLI1第701位氨基酸由精氨酸转变为谷氨酸。与相应的正常细胞系相比,肝癌细胞系及乳腺癌细胞系中该位点的编辑水平明显降低。生物信息学分析表明此编辑事件能改变编码的氨基酸,并可能破坏外显子剪接增强子及影响蛋白质高级结构。结论 GLI1编码区发生的A-to-I RNA编辑在人脑、乳腺、小肠组织及多种细胞系中普遍存在。该编辑事件在肝癌和乳腺癌细胞系中的下调提示其可能与癌症的发生发展相关。 展开更多
关键词 GLI1 编码区 A-to-irna编辑 生物信息学 肿瘤
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内毒素对小鼠多种组织中A—to—I RNA编辑酶活性和mRNA中肌苷的诱导
3
作者 罗晓星 杨静华 等 《中国药理通讯》 2002年第4期49-50,共2页
关键词 内毒素 小鼠 A-to-irna编辑 酶活性 MRNA 肌苷
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