2个尼罗罗非鱼群体GHSR基因5＇侧翼序列的多态性及其遗传多样性分析 被引量：3

1

作者 王春晓 高风英 +3 位作者 卢迈新 刘志刚 朱华平 叶星 《南方水产科学》 CAS CSCD 北大核心 2015年第1期18-25,共8页

该试验以快长尼罗罗非鱼(Oreochromis niloticus)和普通尼罗罗非鱼2个群体为研究对象,通过PCR扩增与测序,获得GHSR基因5'侧翼区序列77条,片段大小为1 217 bp。共检测出变异位点57个,包括12个插入/缺失位点和45个多态性位点。共发现1... 该试验以快长尼罗罗非鱼(Oreochromis niloticus)和普通尼罗罗非鱼2个群体为研究对象,通过PCR扩增与测序,获得GHSR基因5'侧翼区序列77条,片段大小为1 217 bp。共检测出变异位点57个,包括12个插入/缺失位点和45个多态性位点。共发现16种单倍型,其中Hap2可能为原始单倍型。16种单倍型在进化树中聚为A和B 2支,A支中有11种单倍型,在普通群体和快长群体中均有分布,但快长群体中所占比例较高;B支中有5种单倍型,均分布于普通群体中。遗传多样性参数显示普通尼罗罗非鱼群体的核苷酸多样性(Pi)、单倍型多样性(Hd)和平均核苷酸差异数(K)都高于快长尼罗罗非鱼群体。AMOVA分析结果显示快长和普通尼罗罗非鱼2个群体之间的Fst为-0.200 0(P>0.1),表明2个群体间遗传分化不明显,且2个群体的遗传差异主要来自群体内(120%)。 展开更多

关键词 尼罗罗非鱼 GHSR基因 5'侧翼区 多态性 遗传多样性

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猪POU1F1基因5’侧翼区克隆及序列分析 被引量：3

2

作者 宋成义 赵芹 +5 位作者 高波 孙丽亚 王宵燕 吴晗 谢飞 李碧春 《生物信息学》 2009年第3期186-189,共4页

POU1F1基因是POU基因家族的成员之一,对哺乳动物的早期发育和相关基因启动表达起重要的调控作用。本文利用染色体步移技术,从长白猪基因组中首次克隆到了约1.5kb的POU1F1基因5’侧翼区序列,并利用相关软件对其进行了序列分析和物种间POU... POU1F1基因是POU基因家族的成员之一,对哺乳动物的早期发育和相关基因启动表达起重要的调控作用。本文利用染色体步移技术,从长白猪基因组中首次克隆到了约1.5kb的POU1F1基因5’侧翼区序列,并利用相关软件对其进行了序列分析和物种间POU1F1基因5’侧翼区序列比对及进化树构建。结果表明所克隆的片段中含典型的TATA盒(-57)和类CAAT盒序列(-87)。TESS软件分析发现在启动子附近有一系列潜在的重要的转录因子结合位点。序列比对结果表明不同物种POU1F1基因的转录起始点上游-150bp区域保守性较强,可能是启动子的核心序列。其中猪与牛的同源性最高,其次是黑猩猩、人、狗,与大鼠、小鼠和鸡同源性较低,与斑马鱼序列同源性最低。同源序列主要集中在转录起始点上游-150bp至-1000bp区域。Vista中的MLAGAN程序构建的系统进化树真实反应了物种间进化关系。 展开更多

关键词 猪 POU1F1基因 5’侧翼区 克隆 序列比对

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斑鳜胃蛋白酶原C及其5′侧翼区的克隆及序列特征分析 被引量：3

3

作者 邓燕飞 赵金良 吴雪峰 《上海海洋大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第6期641-648,共8页

采用RT-PCR和RACE等技术克隆了斑鳜(Siniperca scherzeri)胃蛋白酶原C(pepsinogen C,PGC)的cDNA全长和部分DNA序列,结果表明:PGC cDNA序列全长1 505 bp,5′端非翻译区37 bp,3′端非翻译区304 bp,开放阅读框架(ORF)1 164 bp,共编码含有38... 采用RT-PCR和RACE等技术克隆了斑鳜(Siniperca scherzeri)胃蛋白酶原C(pepsinogen C,PGC)的cDNA全长和部分DNA序列,结果表明:PGC cDNA序列全长1 505 bp,5′端非翻译区37 bp,3′端非翻译区304 bp,开放阅读框架(ORF)1 164 bp,共编码含有387个氨基酸的蛋白质,包括由16个氨基酸组成的信号肽、39个氨基酸的激活肽和332个氨基酸的成熟肽。斑鳜PGC氨基酸序列与斜带石斑鱼、伯氏豚虾虎鱼、狼鲈、美洲红点鲑4种鱼的相似度分别为92.0%、91.5%、90.2%、89.1%,与非洲爪蟾、鸡、人、兔、褐家鼠的序列相似度分别为76.8%、72.8%、72.5%、69.9%、67.3%,表明PGC基因在长期的进化中较为保守。PGC基因由9个外显子和8个内含子组成,内含子剪切位点符合GT-AG规则,在第7含子中发现(GACA)6、(CA)6类型的微卫星序列,第8内含子中发现(TG)5类型的微卫星序列。采用锚定PCR方法获得了PGC 5′侧翼区长1 924 bp的序列,启动子区域位于-40^+10 bp,包含TATA盒以及GATA-1、CdxA、Hand1/E47、AP-1、Nkx-2、S8、FOX J2等转录因子的结合位点。结果为进一步研究该基因的表达、功能及其转录调控特征奠定了分子基础。 展开更多

关键词 斑鳜 胃蛋白酶原C 5’侧翼区 启动子

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蛋白磷酸酶2A-Aα亚基基因5'侧翼区多态性在广东汉族人群中的分布 被引量：3

4

作者 陈慧峰 罗洁 +6 位作者 林丽娜 李文 张树江 万建新 陈雯 林忠宁 林育纯 《癌变．畸变．突变》 CAS CSCD 2011年第2期93-97,共5页

目的:探讨蛋白磷酸酶2A-Aα亚基基因PPP2RIA启动子区的遗传多态性在中国南方汉族人群中的分布特征。方法:随机选取部分广东汉族人群,获取全血基因组DNA。PCR扩增获得PPP2RIA基因5′-侧翼区的目的片段产物直接再测序,筛查并确证潜在的基... 目的:探讨蛋白磷酸酶2A-Aα亚基基因PPP2RIA启动子区的遗传多态性在中国南方汉族人群中的分布特征。方法:随机选取部分广东汉族人群,获取全血基因组DNA。PCR扩增获得PPP2RIA基因5′-侧翼区的目的片段产物直接再测序,筛查并确证潜在的基因多态性位点,采用HaploView软件进行该人群多态性等位基因分布频率的分析、并与HapMap结果进行分布特征比较。结果:PCR扩增和成功测序63例健康人(126条染色体)PPP2RIA基因-1 844～+201nt的目的片段,序列比对发现该人群中6个已知多态性位点及其人群最小等位基因频率分别为-1 039 G>T(+Ins)(rs10414793,但其中T等位基因型含有29个碱基片段的插入)(8.73%)、-568 G>A(rs1864007)(25.40%)、-241 -/G(rsl 1453459)(26.90%)、+87 T>C(rs13344984)(7.94%)、+107 -/C(rs3833207)(30.16%)和+108 A>G(rs1 7554825)(7.94%);且其中2个位点在该人群中的分布与HapMap公布的国外人群数据存在不同(P<0.05);同时,该人群中还发现-512 G>A(2.38%)的潜在新多态性位点。结论:筛查PPP2RIA基因5′-侧翼区在中国广东汉族人群中多态性位点的等位基因分布,为进一步开展多态性功能性分析提供基础。 展开更多

关键词 蛋白磷酸酶2A 支架亚基Aα PPP2R1A基因 5'侧翼区 多态性

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广东省氡辐射地区人群hOGG1基因5'侧翼区遗传多态性分布 被引量：1

5

作者 陈慧峰 闫雪华 +3 位作者 赵雷 蔡学立 陈惠清 王烁 《中国职业医学》 CAS 北大核心 2017年第6期671-676,共6页

目的筛查广东省氡辐射地区汉族人群中8-羟基鸟嘌呤DNA糖苷酶(hOGG1)基因5'侧翼区遗传多态性位点,并分析其遗传分布特征。方法采用单纯随机抽样方法,选择60名广东氡辐射地区汉族人群作为研究对象,采集肘静脉血抽提其基因组DNA,采用... 目的筛查广东省氡辐射地区汉族人群中8-羟基鸟嘌呤DNA糖苷酶(hOGG1)基因5'侧翼区遗传多态性位点,并分析其遗传分布特征。方法采用单纯随机抽样方法,选择60名广东氡辐射地区汉族人群作为研究对象,采集肘静脉血抽提其基因组DNA,采用聚合酶链式反应法扩增获得hOGG1基因5'侧翼区(-1721 nt^+164 nt)目的片段产物后纯化直接测序,筛查并确证潜在的单核苷酸多态性(SNP)位点,对SNP位点进行遗传特征分析,并与人类基因组单体型图(Hap Map)数据库中报道的不同人群分布数据进行比较。结果 PCR扩增和成功测序60名(120条染色体)氡辐射地区汉族人群hOGG1基因5'侧翼区目的片段。序列比对发现该人群中8个SNP位点;其中,3个已知位点-1493 G>A、-834 G>C和-18 G>T的最小等位基因频率分别为4.2%、0.8%和3.3%;5个新位点-1455 G>A、-1293 A>T、-1187 C>A、-337 C>A和-323 G>A的最小等位基因频率分别为0.8%、23.3%、7.5%、36.7%和0.8%。-1493 G>A的等位基因频率在氡辐射地区汉族人群的分布与Hap Map数据库中欧洲高加索人种/人群的分布比较,差异有统计学意义(P<0.05)。结论筛查出广东氡辐射地区汉族人群中hOGG1基因5'侧翼区共8个SNP位点,并获得其等位基因遗传分布特征,为后续目标人群多态性单体型构建及其功能分析提供基础。 展开更多

关键词 氡辐射地区 8-羟基鸟嘌呤DNA糖苷酶 5'侧翼区 单核苷酸多态性

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天然放射性高本底辐射地区汉族人群MGMT基因遗传多态性单体型分析 被引量：1

6

作者 陈慧峰 赵雷 +2 位作者 闫雪华 高学挺 戴思泽 《中国预防医学杂志》 CAS 2015年第12期904-908,共5页

目的探讨MGMT基因5'侧翼区及第一编码区多态性单体型在天然放射性高本底地区汉族人群中的分布特征。方法随机选取60例广东高本底地区汉族人群为研究对象,以人MGMT基因目的片段(-875nt^+362nt)中-797G>A、-245T>G、-177T>G... 目的探讨MGMT基因5'侧翼区及第一编码区多态性单体型在天然放射性高本底地区汉族人群中的分布特征。方法随机选取60例广东高本底地区汉族人群为研究对象,以人MGMT基因目的片段(-875nt^+362nt)中-797G>A、-245T>G、-177T>G、-19C>T、+73C>T和+336G>A共6个多态性位点纳入本研究,采用HaploView软件分析其遗传学特征、连锁不平衡和单体型分布。结果60例高本底地区人群中各遗传多态性位点基因型频率均符合Hardy-Weinberg平衡(P>0.05);各位点在该人群的杂合度不同,分别为-797G>A(0.208)、-245T>G(0.017)、-177T>G(0.049)、-19C>T(0.269)、+73C>T(0.269)和+336G>A(0.417),且-245T>G和-177T>G均不存在变异纯合基因型;连锁不平衡分析结果表明-797G>A与-19C>T、-797G>A与+73C>T均呈较强的连锁不平衡关系,-19C>T与+73C>T之间呈完全连锁不平衡关系。构建了该人群中5种多态性单体型,其中最主要的野生单体型(H1)频率为51.4%,其他4种为变异单体型(H2~H5),频率为46.3%。-19C>T与+73C>T之间形成1个单体型域,构成2种代表性域内单体型(CC/TT)。结论首次确认并报道广东天然放射性高本底地区汉族人群中MGMT基因5'侧翼区和第一编码区6个遗传多态性位点及其单体型(域)分布。 展开更多

关键词 高本底地区 O6甲基鸟嘌呤-DNA甲基转移酶 5'侧翼区 多态性单体型

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贵州矮马与伊犁马生长激素基因5’侧翼区的结构特征 被引量：1

7

作者 王三铭 王嘉福 +3 位作者 田松军 王荣明 党珍 冉雪琴 《贵州农业科学》 CAS 北大核心 2012年第4期151-155,共5页

为了摸索贵州矮马生长发育的调控机制,探明贵州矮马与伊犁马生长激素基因5’侧翼区的结构特征,以4～5龄的贵州矮马和7～8龄的新疆伊犁马为研究对象,采用直接测序法从两种马基因组中克隆了生长激素(GH)基因5’侧翼区的DNA序列,并进行生... 为了摸索贵州矮马生长发育的调控机制,探明贵州矮马与伊犁马生长激素基因5’侧翼区的结构特征,以4～5龄的贵州矮马和7～8龄的新疆伊犁马为研究对象,采用直接测序法从两种马基因组中克隆了生长激素(GH)基因5’侧翼区的DNA序列,并进行生物信息学分析。结果表明:1)从基因组中克隆的711bp片段为GH基因5’侧翼区序列;2)两个马品种的GH基因5’侧翼区中都存在TATA box、CAATbox、GC box和Octamer位点等真核生物启动子结构;3)从伊犁马GH基因5’侧翼区中检测到1个位于30bp处的突变位点发生了G→C颠换,由此新增了1个转录因子upstream stimulatory factor(USF)结合位点;4)从贵州矮马和伊犁马GH基因的5’侧翼区序列中发现了MZF1、CdxA、Nkx-2、AML-1a和c-Myc等19种共58个转录因子的结合位点。结论:克隆的711bp基因序列中存在大量的转录调控元件。 展开更多

关键词 生长激素基因 5’侧翼区 结构特征 贵州矮马 伊犁马

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北极狐CBD103基因序列生物信息学分析及启动子预测 被引量：1

8

作者 郭敏 牛迪 +6 位作者 刘艳军 彭永东 张文香 刘铮铸 冯敏山 李祥龙 巩元芳 《黑龙江畜牧兽医》 CAS 北大核心 2018年第1期52-56,251-252,共7页

为了研究北极狐CBD103基因核心启动子活性区、转录因子结合位点、CBD103基因编码蛋白结构及功能,同时探究该基因的表达调控机制,试验通过RT-PCR扩增及测序技术从北极狐皮肤组织中获得CBD103基因cDNA序列,并利用生物信息学方法对所得序... 为了研究北极狐CBD103基因核心启动子活性区、转录因子结合位点、CBD103基因编码蛋白结构及功能,同时探究该基因的表达调控机制,试验通过RT-PCR扩增及测序技术从北极狐皮肤组织中获得CBD103基因cDNA序列,并利用生物信息学方法对所得序列进行预测分析。结果表明:获得序列全长2 327 bp(包括5’侧翼区2 071 bp、CDs区204 bp、3’侧翼区52 bp),编码67个氨基酸残基。北极狐CBD103基因5’侧翼区存在潜在的启动子区域和CpG岛,且发现GC框、TATA框、CAAT框等调控元件及Sp1、Ets、Mef-2、ERE、Myc等多种转录因子。CBD103基因编码的蛋白是定位于细胞核和线粒体的不稳定疏水性蛋白质,此蛋白无规卷曲所占比例较大,使得蛋白构象多样化,主要参与信号转导和转录,存在跨膜区域和信号肽。北极狐与家犬的遗传亲缘关系最近。说明CBD103基因在不同物种间具有一定的保守性,且各物种间亲缘关系与生物进化观点基本一致,同时符合动物分类学。 展开更多

关键词 北极狐 CBD103基因 5’侧翼区 启动子 转录因子结合位点 结构功能 生物信息学分析

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广东省高本底地区汉族人群MGMT基因遗传多态性分布 被引量：1

9

作者 陈慧峰 李晓杰 +5 位作者 赵雷 温薇 李小亮 刘明 闫雪华 苏世标 《中国职业医学》 CAS 北大核心 2015年第6期615-619,625,共6页

目的探讨O6-甲基鸟嘌呤-DNA-甲基转移酶(MGMT)基因遗传多态性位点在广东省高本底地区(HBRA)汉族人群中的分布特征。方法采用单纯随机抽样方法,选择60名广东省HBRA汉族人群,获取其周围血基因组DNA,通过聚合酶链式反应(PCR)扩增获得MGMT基... 目的探讨O6-甲基鸟嘌呤-DNA-甲基转移酶(MGMT)基因遗传多态性位点在广东省高本底地区(HBRA)汉族人群中的分布特征。方法采用单纯随机抽样方法,选择60名广东省HBRA汉族人群,获取其周围血基因组DNA,通过聚合酶链式反应(PCR)扩增获得MGMT基因5'侧翼区和第一编码区目的片段产物后纯化直接测序,筛选并确证潜在的单核苷酸多态性(SNP)位点,对SNP位点进行遗传特征分析,并与人类基因组单体型图(Hap Map)数据库中的不同人群分布数据进行比较。结果 PCR扩增和成功测序60名HBRA汉族人群(120条染色体)MGMT基因-875 nt^+362 nt的目的片段,序列比对发现该人群中6个已知SNP位点-797 G>A、-245 T>G、-177 T>G、-19 C>T、+73 C>T和+336 G>A,其最小等位基因频率分别为11.7%、0.8%、2.5%、15.8%、15.8%和29.2%。其中+336 G>A的等位基因频率在该人群的分布与Hap Map数据库中Hap Map-JPT和Hap MapCEU人种/人群的分布差异有统计学意义(P<0.05)。结论筛选出广东省HBRA汉族人群中MGMT基因5'侧翼区和第一编码区共6个SNP位点并提供其等位基因分布特征数据,为后续DNA多态性功能分析提供基础。 展开更多

关键词 高本底地区 O^6-甲基鸟嘌呤-DNA-甲基转移酶 5'侧翼区 单核苷酸多态性

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小尾寒羊MyoG外显子2和MyoD 5'侧翼区的多态性研究 被引量：1

10

作者 王旭 白俊艳 +7 位作者 杨又兵 雷雪芹 庞有志 李宏伟 王欢玲 汤昱琳 邵俊红 阴怀源 《河南农业科学》 CSCD 北大核心 2017年第6期138-141,共4页

采用PCR-SSCP技术分析了小尾寒羊肌细胞生成素Myo G基因外显子2和生肌决定基因Myo D 5'侧翼区的多态性,结果表明:Myo D 5'侧翼区在小尾寒羊中检测到2种基因型(BB、AB),BB和AB基因型频率分别为0.975 0和0.025 0,A和B等位基因频... 采用PCR-SSCP技术分析了小尾寒羊肌细胞生成素Myo G基因外显子2和生肌决定基因Myo D 5'侧翼区的多态性,结果表明:Myo D 5'侧翼区在小尾寒羊中检测到2种基因型(BB、AB),BB和AB基因型频率分别为0.975 0和0.025 0,A和B等位基因频率分别为0.012 5和0.987 5;小尾寒羊的Myo G外显子2不存在多态性。对Myo D 5'侧翼区的BB基因型测序分析发现,其与牛的Myo D1基因序列(XM_592330.2)相比,发生了2处突变,分别是第960位发生了T→C突变、第972位发生了C→A突变。 展开更多

关键词 小尾寒羊 MyoG外显子2 MYOD 5'侧翼区 PCR-SSCP

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人趋化因子受体5基因5′侧翼区功能分析

11

作者 靳静 赵国新 +3 位作者 冯龙 马云云 卫艳萍 赵国强 《郑州大学学报（医学版）》 CAS 北大核心 2008年第5期915-917,共3页

目的:分析人趋化因子受体5(CCR5)基因5′侧翼区的调控序列。方法:构建CCR5基因不同长度5′侧翼区的萤光素酶报告基因载体,分别转染入Jurkat细胞中,检测分析其萤光素酶活性。结果:CCR5基因5′侧翼区-1006bp至-1bp、-804bp至-1bp、-586bp... 目的:分析人趋化因子受体5(CCR5)基因5′侧翼区的调控序列。方法:构建CCR5基因不同长度5′侧翼区的萤光素酶报告基因载体,分别转染入Jurkat细胞中,检测分析其萤光素酶活性。结果:CCR5基因5′侧翼区-1006bp至-1bp、-804bp至-1bp、-586bp至-1bp和-478bp至-1bp区段的pGL3重组质粒在Jurkat细胞中能表现出明显的萤光素酶活性。结论:CCR5基因5′侧翼区-478bp至-1bp序列中存在基因转录的主要上调元件。 展开更多

关键词 趋化因子受体5 5’侧翼区 报告基因

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鲤IGF2b基因5'侧翼区序列克隆及不同鲤该区域GC富集区的甲基化分析

12

作者 张成锋 苏胜彦 +3 位作者 朱健 朱文彬 刘珊 董在杰 《动物学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2012年第2期98-104,共7页

鲤(Cyprinus carpio)胰岛素样生长因子2b(insulin-like growth factor 2b,IGF2b)基因为鲤IGF基因家族重要的成员,已有的研究表明5'侧翼区序列对其功能的发挥有重要作用。因此,采用基因组步移法获取5'侧翼区序列,通过亚硫酸盐修... 鲤(Cyprinus carpio)胰岛素样生长因子2b(insulin-like growth factor 2b,IGF2b)基因为鲤IGF基因家族重要的成员,已有的研究表明5'侧翼区序列对其功能的发挥有重要作用。因此,采用基因组步移法获取5'侧翼区序列,通过亚硫酸盐修饰的方法分析不同品种该区域GC富集区的甲基化状况。本文成功从鲤基因组DNA中获得695 bp的IGF2b 5'侧翼区序列。已获取的IGF2b 5'侧翼区序列经过TFSEARCH分析后发现了多个转录因子结合位点和TATA框,通过BLAST比对发现,鲤IGF2b 5'侧翼区DNA序列与斑马鱼(Danio rerio)IGF2b基因相比,相似性为87%。检测该区域富含GC的序列17个位点,发现建鲤(C.c.var.jian)有2个个体的3个位点出现甲基化,而黄河鲤(C.c.haematopterus)只有1个个体1个位点出现甲基化,这说明2个品种鲤在这个区域出现甲基化修饰的几率低,也验证了这2品种在该基因该区域GC富集区是稳定的。 展开更多

关键词 鲤 IGF2b 5’侧翼区 甲基化

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中国荷斯坦牛C4A基因5'侧翼区功能分析

13

作者 杨岳 袁海 +4 位作者 龙筱晔 董宪君 翟丽娜 李永双 王长法 《畜牧与兽医》 北大核心 2015年第6期54-59,共6页

利用在线预测软件对牛C4A基因的5'侧翼区序列进行生物信息学分析,成功构建了一系列表达载体,利用双荧光素酶报告基因检测系统分析牛C4A基因的5'侧翼区启动活性。分别通过定点突变技术构建突变质粒,研究调控C4基本表达和诱导表... 利用在线预测软件对牛C4A基因的5'侧翼区序列进行生物信息学分析,成功构建了一系列表达载体,利用双荧光素酶报告基因检测系统分析牛C4A基因的5'侧翼区启动活性。分别通过定点突变技术构建突变质粒,研究调控C4基本表达和诱导表达的转录因子结合位点。利用EMSA技术验证转录因子在研究细胞系中存在与否。结果显示,C4A基因启动子序列转录起始位点上游169 bp为报告基因荧光值最高的片段,即为启动子核心区;其中SP1(-169^-158)、E-box(-122^-117)和AP-1(-80^-71)是调控C4基本表达的主要转录因子结合位点,且3个转录因子在Hep G2细胞系中真实存在。 展开更多

关键词 中国荷斯坦牛 C4A基因 5'侧翼区

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奶牛乳铁蛋白基因5′侧翼区遗传多态性及其与乳腺炎关联性分析 被引量：14

14

作者 王洪梅 孔振兴 +5 位作者 王长法 黄金明 李秋玲 侯明海 李建斌 仲跻峰 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2009年第4期393-399,共7页

牛乳铁蛋白(Lactoferrin,LF)是保护乳腺组织的防御因子之一,是具有多种功能的糖蛋白。关于牛LF基因的多态性研究的报道较多,但其多态性与奶牛乳腺炎相关性的研究较少。文章采用PCR-RFLP、CRS-PCR对268头中国荷斯坦牛LF基因启动子区的-92... 牛乳铁蛋白(Lactoferrin,LF)是保护乳腺组织的防御因子之一,是具有多种功能的糖蛋白。关于牛LF基因的多态性研究的报道较多,但其多态性与奶牛乳腺炎相关性的研究较少。文章采用PCR-RFLP、CRS-PCR对268头中国荷斯坦牛LF基因启动子区的-926(G/A)、-915(T/G)、-478(/G)、+72(T/C)突变进行基因型分型,应用最小二乘线性模型分析LF基因多态性与体细胞评分(Somaticcellscore,SCS)的相关性。结果表明,新发现+72(T/C)和-478(/G)对SCS有显著影响,而其他两个位点对SCS影响不显著(P>0.05)。+72(T/C)的AB基因型是优良基因型,其个体的SCS值均显著低于AA型(P<0.01)、BB型个体(P<0.05)。-478(/G)位点的C等位基因是优良的等位基因,CC基因型个体的SCS值极显著低于CD、DD基因型个体(P<0.01)。因此,LF基因+72(T/C)的AB基因型和-478(/G)位点的CC基因型均是奶牛乳腺炎抗性的优良基因型,可作为分子标记应用于奶牛乳腺炎抗性筛选。 展开更多

关键词 乳铁蛋白基因5’侧翼区 遗传多态性 乳腺炎 体细胞评分 中国荷斯坦牛

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野桑蚕、家蚕海藻糖酶基因5′侧翼区的克隆与序列分析 被引量：5

15

作者 赵巧玲 唐顺明 +1 位作者 张志芳 何家禄 《中国蚕业》 2003年第4期91-93,共3页

海藻糖是一种双糖,广泛存在于包括细菌、酵母、植物和无脊椎动物在内的生物体内,主要功能是储备生物代谢所需的能源.在昆虫血液中,海藻糖是一种最重要的糖类,具有供给能量和提供合成生物大分子的底物等功能.其功能主要是通过海藻糖酶(Tr... 海藻糖是一种双糖,广泛存在于包括细菌、酵母、植物和无脊椎动物在内的生物体内,主要功能是储备生物代谢所需的能源.在昆虫血液中,海藻糖是一种最重要的糖类,具有供给能量和提供合成生物大分子的底物等功能.其功能主要是通过海藻糖酶(Trehalase)的作用来实现的.家蚕海藻糖酶有可溶型和膜固定型两种类型,可溶型主要存在于蛹期中肠,而膜固定型存在于包括卵巢在内的多种组织.这两种类型酶是由同一个基因表达而形成不同的成熟海藻糖酶.海藻糖酶膜固定型存在于向血液面的卵巢膜内,该基因的表达是由滞育激素诱导调控.卵母细胞通过位于膜内的海藻糖酶,将血液中海藻糖降解成葡萄糖,然后吸收到胞内,最后合成糖原,从而导致蚕卵的滞育.从而海藻糖酶基因是从分子水平来解明家蚕滞育机理的一个重要途径.本实验从野桑蚕、家蚕苏@菊×明@虎基因组中分别克隆了野桑蚕和家蚕的海藻糖酶基因的5′侧翼区片段并进行了测序分析,以供进一步的启动子功能研究,现报道如下. 展开更多

关键词 野桑蚕 家蚕 海藻糖酶基因 基因5’侧翼区 基因克隆 序列分析 滞育机理 海藻糖

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EOLA1基因5′侧翼区的克隆及调控功能初步研究 被引量：5

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作者 梁自文 杨宗城 +1 位作者 陈建 陈渝 《第三军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第10期1001-1003,共3页

目的研究内皮细胞高表达脂多糖相关因子1(endothelial overexpressedlipopolysaccharide associatedfactor1,EOLA1)基因5′侧翼区的调控序列。方法通过基因组步移克隆EOLA1基因5′侧翼区不同长度的片段,插入β半乳糖苷酶(βgal)报告基... 目的研究内皮细胞高表达脂多糖相关因子1(endothelial overexpressedlipopolysaccharide associatedfactor1,EOLA1)基因5′侧翼区的调控序列。方法通过基因组步移克隆EOLA1基因5′侧翼区不同长度的片段,插入β半乳糖苷酶(βgal)报告基因载体,分析各片段在ECV304细胞中的βgal调节活性。结果含EOLA1基因5′侧翼区-1～-2659bp和-1～-1951bp序列的重组质粒在ECV304细胞中能明显表现βgal上调活性,而-1～-361bp序列的重组质粒活性无明显变化。结论EOLA1基因5′侧翼区-361～-1951bp内存在基因转录启动子元件。 展开更多

关键词 EOLA1基因 启动子 报告基因 活性分析 克隆 调控功能 EOLA1基因5’侧翼区

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马生长激素基因的克隆与5′侧翼区序列分析 被引量：3

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作者 张焱如 乌尼尔夫 芒来 《养殖与饲料》 2007年第12期5-8,共4页

利用PCR技术首次扩增、克隆了6个具有不同生长速度马的生长激素基因。6个品种分别为:1个体格高大健壮的引入品种英纯血马,1个中等体高的中国驰名培育品种三河马,3个中等体高的蒙古马(乌审马、乌珠穆沁马、锡尼河马),1个体格矮小的广西... 利用PCR技术首次扩增、克隆了6个具有不同生长速度马的生长激素基因。6个品种分别为:1个体格高大健壮的引入品种英纯血马,1个中等体高的中国驰名培育品种三河马,3个中等体高的蒙古马(乌审马、乌珠穆沁马、锡尼河马),1个体格矮小的广西矮马。马GH基因大小1923bp,包括了转录起始位点5′侧翼区序列250bp、1个可能的TATA框,组织特异性转录因子结合位点,全部5个外显子和4个内含子及部分3′侧翼区序列。分析6个品种马GH基因5′侧翼区序列并与乌审马序列相比,均在第210位出现由胞嘧啶C颠换为腺嘌呤A,在249位由胞嘧啶C颠换为鸟嘌呤G。6个品种之间的比较显示,马GH基因5′侧翼区具有极高的保守性,体格和体高具有显著差异的马品种间几乎未有差异。说明不同品种马生长速度和成年体重的差异,并非是其GH基因5′侧翼区变异造成的,马GH基因表达的差异可能受到内含子或3′侧翼区序列的影响。 展开更多

关键词 马 生长激素基因 克隆 5’侧翼区序列

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一个新的马铃薯GBSS基因5'侧翼序列克隆及调控活性研究 被引量：3

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作者 李淑洁 张金文 +2 位作者 王煜 郭志鸿 陈正华 《中国马铃薯》 2005年第3期129-133,共5页

采用PCR技术,从马铃薯叶片基因组DNA中扩增到了约0.6kb的马铃薯GBSS基因的5'侧翼序列,经序列同源性分析所克隆的序列与已知序列同源性为97.41%,含有启动基因表达所需的主要调控元件CAAT盒和TATA盒。构建该序列与GFP的融合基因植物... 采用PCR技术,从马铃薯叶片基因组DNA中扩增到了约0.6kb的马铃薯GBSS基因的5'侧翼序列,经序列同源性分析所克隆的序列与已知序列同源性为97.41%,含有启动基因表达所需的主要调控元件CAAT盒和TATA盒。构建该序列与GFP的融合基因植物表达载体pBIGGFP,并用基因枪转化法将pBIGGFP导入马铃薯无菌苗茎段、叶片和微型薯薯片,用荧光显微镜观察转化组织中GFP的瞬时表达,结果表明GFP在上述器官中都得到了表达,说明所克隆的约0.6kbGBSS基因的5'侧翼序列是具有启动基因表达的功能。 展开更多

关键词 马铃薯 GBSS基因5’侧翼区 克隆 GFP 调控

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扩展青霉碱性脂肪酶基因5’端侧翼区域的克隆与鉴定 被引量：3

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作者 杨月梅 江贤章 +4 位作者 张娟梅 谢必峰 杨欣伟 林琳 黄建忠 《工业微生物》 CAS CSCD 北大核心 2007年第1期14-19,共6页

应用衔接头PCR技术,扩增得到约2000 bp的扩展青霉碱性脂肪酶基因5’端侧翼区域的单一产物。对该产物测序并提交GenBank数据库(GenBank accession DQ677520),经序列比对分析,发现该序列具有真核启动子序列的基本结构特征,含有TATA盒、CAA... 应用衔接头PCR技术,扩增得到约2000 bp的扩展青霉碱性脂肪酶基因5’端侧翼区域的单一产物。对该产物测序并提交GenBank数据库(GenBank accession DQ677520),经序列比对分析,发现该序列具有真核启动子序列的基本结构特征,含有TATA盒、CAAT盒、GC盒等元件。将扩增得到的脂肪酶基因5’端侧翼序列,连接到含有绿色荧光蛋白(GFP)报告基因的质粒中,构建了一个重组表达质粒,转化大肠杆菌细胞。荧光显微观察大肠杆菌阳性转化子发出荧光,侧翼序列含有启动子功能得到确认。 展开更多

关键词 扩展青霉 脂肪酶 5’端侧翼区 衔接头PCR 启动子 GFP

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广东人群PP2A-B亚基基因5′-侧翼区多态性连锁不平衡和单体型分析 被引量：2

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作者 张树江 林育纯 +6 位作者 陈慧峰 万建新 林丽娜 罗洁 李文 陈雯 林忠宁 《华南预防医学》 2011年第3期1-4,10,共5页

目的探讨蛋白磷酸酶2A（PP2A）的调节B／PR558亚基基因5’-侧翼区多态性的连锁不平衡和人群单体型分布特征。方法选取经体检排除急慢性疾病的50例广东汉族健康人群为调查对象，以人胱舵D基因5’-侧翼区中-1684A〉G（rslll46169）、-1196... 目的探讨蛋白磷酸酶2A（PP2A）的调节B／PR558亚基基因5’-侧翼区多态性的连锁不平衡和人群单体型分布特征。方法选取经体检排除急慢性疾病的50例广东汉族健康人群为调查对象，以人胱舵D基因5’-侧翼区中-1684A〉G（rslll46169）、-1196C〉T（rs9419202）、-462G〉A（rs7074421）和-1610A〉T为4个纳入的多态性位点，采用HaploView软件分析遗传特征、连锁不平衡（LD）和单体型分布，进行人群分布的x2检验。结果50例广东汉族人群中各多态性位点基因型频率均符合Hardy—Weinberg平衡（P〉0．05）；杂合度（π）分别为-1684A〉G（0．020）、-1610A〉T（0．132）、-1196C〉T（0．059）和-462G〉A（0．059），且均不存在变异纯合型，其中在-1196C〉T和-462G〉A位点明显低于HapMap人群（P〈0．05）；-1196C〉T和-462G〉A位点之间呈完全LD，但其他位点间未见LD关系；构建了该人群的3种单体型（HI～H3），频率分布主要是野生单体型（H1，89．0％），其余2种变异单体型分别为H2（7．0％）和H3（3．0％）；筛选出的3个标签SNP为-1684A〉G、-1610A〉T和-462G〉A。结论确定并报道中国南方广东汉族人群PPP2R2D基因5’-侧翼区中相对保守的标签SNP和单体型分布，为进行该基因启动子区的功能分析提供依据。 展开更多

关键词 蛋白磷酸酶2A B8亚基 PPJp2舵D基因 5’-侧翼区 单体型

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