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Caspase 3-like蛋白酶和TaeMCAⅡ基因对小麦胚乳细胞PCD的影响
1
作者
郭月静
杨文丽
+3 位作者
周竹青
俞敏
梅方竹
周广生
《华中农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第4期1-7,共7页
对正常生长和淹水处理的华麦8号胚乳细胞发育过程中Caspase 3-like蛋白酶活性和TaeMCAⅡ基因表达量进行了研究。结果显示,正常生长条件下,在胚乳细胞发生PCD早期(花后12d),Caspase 3-like蛋白酶活性较强,且该酶主要定位于胚乳细胞中的...
对正常生长和淹水处理的华麦8号胚乳细胞发育过程中Caspase 3-like蛋白酶活性和TaeMCAⅡ基因表达量进行了研究。结果显示,正常生长条件下,在胚乳细胞发生PCD早期(花后12d),Caspase 3-like蛋白酶活性较强,且该酶主要定位于胚乳细胞中的淀粉质体上;整个胚乳细胞PCD过程中TaeMCAⅡ基因表达量变化不大。在淹水胁迫处理下,胚乳TaeMCAⅡ基因表达量和Caspase 3-like蛋白酶活性比同期正常处理高。上述研究结果表明,Caspase 3-like蛋白酶参与了正常生长的胚乳细胞PCD过程;淹水胁迫会导致TaeMCAⅡ基因超表达和Caspase 3-like蛋白酶活性升高,这可能是胚乳细胞PCD进程提前的原因之一。
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关键词
小麦
淹水
胚乳PCD
CASPASE
3
-
like
蛋白酶
TaeMCAⅡ基因
下载PDF
职称材料
3C-like蛋白酶抑制剂的构效关系、分子对接和分子动力学
被引量：
5
2
作者
林峰
付新梅
+5 位作者
王超
蒋思宇
王景辉
张述伟
杨凌
李燕
《物理化学学报》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2016年第11期2693-2708,共16页
3C-like蛋白酶是中东呼吸综合征冠状病毒(MERS-Co V)等其它冠状病毒的繁殖过程中极为重要的蛋白酶。它已成为人类在抗冠状病毒领域中的研究热点。本文基于计算生物学方法对与MERS-Co V同属的蝙蝠冠状病毒HKU4(HKU4-Co V)的43个肽类3C-l...
3C-like蛋白酶是中东呼吸综合征冠状病毒(MERS-Co V)等其它冠状病毒的繁殖过程中极为重要的蛋白酶。它已成为人类在抗冠状病毒领域中的研究热点。本文基于计算生物学方法对与MERS-Co V同属的蝙蝠冠状病毒HKU4(HKU4-Co V)的43个肽类3C-like蛋白酶抑制剂分子,建立三维定量构效关系(3D-QSAR)模型。在基于配体叠合的基础上,发现比较分子相似性指数分析法(Co MSIA)中的四个场组合(位阻场、静电场、氢键供体场与氢键受体场)为最优的模型(Q2=0.522,R2ncv=0.996,R2pre=0.904;Q2:交叉验证相关系数,R2ncv:非交叉验证相关系数,R2pre:验证集分子的预测值相关系数),并借助该模型通过分子对接(docking)与分子动力学(MD)方法阐明了配受体结合作用。实验结果表明:(1)基于最优的Co MSIA模型基础上的三维等势图形象地说明了分子基团的位阻作用、静电作用、氢键供体与氢键受体作用对分子生物活性的影响;(2)分子对接研究结果显示了疏水性以及结晶水、氨基酸His166和Glu169在配体和受体结合过程中产生重要作用;(3)分子动力学模拟进一步验证了分子对接模型的可靠性,并发现了两个新的关键氨基酸Ser24与Gln192,它们与配体产生了两个较强的氢键。此外,根据这些结果,一些新的具有潜在抑制活性的肽类化合物作为3C-like蛋白酶抑制剂被获得。以上结果能够帮助深入了解3C-like蛋白酶与肽类抑制剂的作用机理,并且能够为今后的抗MERS-Co V药物设计提供有价值的参考。
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关键词
中东呼吸综合征冠状病毒
3
C-
like
蛋白酶
肽类抑制剂
三维定量构效关系
分子对接
分子动力学
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职称材料
题名
Caspase 3-like蛋白酶和TaeMCAⅡ基因对小麦胚乳细胞PCD的影响
1
作者
郭月静
杨文丽
周竹青
俞敏
梅方竹
周广生
机构
华中农业大学生命科学技术学院
华中农业大学科学技术发展研究院
华中农业大学植物科学技术学院
出处
《华中农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第4期1-7,共7页
基金
国家自然科学基金面上项目(31071347
31471428)
文摘
对正常生长和淹水处理的华麦8号胚乳细胞发育过程中Caspase 3-like蛋白酶活性和TaeMCAⅡ基因表达量进行了研究。结果显示,正常生长条件下,在胚乳细胞发生PCD早期(花后12d),Caspase 3-like蛋白酶活性较强,且该酶主要定位于胚乳细胞中的淀粉质体上;整个胚乳细胞PCD过程中TaeMCAⅡ基因表达量变化不大。在淹水胁迫处理下,胚乳TaeMCAⅡ基因表达量和Caspase 3-like蛋白酶活性比同期正常处理高。上述研究结果表明,Caspase 3-like蛋白酶参与了正常生长的胚乳细胞PCD过程;淹水胁迫会导致TaeMCAⅡ基因超表达和Caspase 3-like蛋白酶活性升高,这可能是胚乳细胞PCD进程提前的原因之一。
关键词
小麦
淹水
胚乳PCD
CASPASE
3
-
like
蛋白酶
TaeMCAⅡ基因
Keywords
wheat
waterlogging
endosperm PCD
Caspase
3
-
like
protease
TaeMCAⅡgene
分类号
Q945.78 [生物学—植物学]
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职称材料
题名
3C-like蛋白酶抑制剂的构效关系、分子对接和分子动力学
被引量：
5
2
作者
林峰
付新梅
王超
蒋思宇
王景辉
张述伟
杨凌
李燕
机构
大连理工大学化工学院
大连理工大学精细化工国家重点实验室
中国科学院大连化学物理研究所
出处
《物理化学学报》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2016年第11期2693-2708,共16页
基金
国家自然科学基金(11201049)资助项目~~
文摘
3C-like蛋白酶是中东呼吸综合征冠状病毒(MERS-Co V)等其它冠状病毒的繁殖过程中极为重要的蛋白酶。它已成为人类在抗冠状病毒领域中的研究热点。本文基于计算生物学方法对与MERS-Co V同属的蝙蝠冠状病毒HKU4(HKU4-Co V)的43个肽类3C-like蛋白酶抑制剂分子,建立三维定量构效关系(3D-QSAR)模型。在基于配体叠合的基础上,发现比较分子相似性指数分析法(Co MSIA)中的四个场组合(位阻场、静电场、氢键供体场与氢键受体场)为最优的模型(Q2=0.522,R2ncv=0.996,R2pre=0.904;Q2:交叉验证相关系数,R2ncv:非交叉验证相关系数,R2pre:验证集分子的预测值相关系数),并借助该模型通过分子对接(docking)与分子动力学(MD)方法阐明了配受体结合作用。实验结果表明:(1)基于最优的Co MSIA模型基础上的三维等势图形象地说明了分子基团的位阻作用、静电作用、氢键供体与氢键受体作用对分子生物活性的影响;(2)分子对接研究结果显示了疏水性以及结晶水、氨基酸His166和Glu169在配体和受体结合过程中产生重要作用;(3)分子动力学模拟进一步验证了分子对接模型的可靠性,并发现了两个新的关键氨基酸Ser24与Gln192,它们与配体产生了两个较强的氢键。此外,根据这些结果,一些新的具有潜在抑制活性的肽类化合物作为3C-like蛋白酶抑制剂被获得。以上结果能够帮助深入了解3C-like蛋白酶与肽类抑制剂的作用机理,并且能够为今后的抗MERS-Co V药物设计提供有价值的参考。
关键词
中东呼吸综合征冠状病毒
3
C-
like
蛋白酶
肽类抑制剂
三维定量构效关系
分子对接
分子动力学
Keywords
MERS-CoV
3
C-
like
protease
Peptidomimetic inhibitor
3
D-QSAR
Molecular docking Molecular dynamics
分类号
R978.7 [医药卫生—药品]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
Caspase 3-like蛋白酶和TaeMCAⅡ基因对小麦胚乳细胞PCD的影响
郭月静
杨文丽
周竹青
俞敏
梅方竹
周广生
《华中农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2015
0
下载PDF
职称材料
2
3C-like蛋白酶抑制剂的构效关系、分子对接和分子动力学
林峰
付新梅
王超
蒋思宇
王景辉
张述伟
杨凌
李燕
《物理化学学报》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2016
5
下载PDF
职称材料
已选择
0
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